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Research Article
Bob A. Hersbach1,2,3, Tatiana Simon2, Giacomo Masserdotti1,2
1Institute of Stem Cell Research, Helmholtz Zentrum München,German Research Center for Environmental Health, 2Department of Physiological Genomics, Biomedical Center Munich,Ludwig-Maximilians University, 3Graduate School of Systemic Neurosciences, BioCenter,Ludwig-Maximilians University
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Nous décrivons ici un protocole détaillé pour générer des cultures hautement enrichies d’astrocytes dérivés de différentes régions du système nerveux central de souris postnatales et leur conversion directe en neurones fonctionnels par l’expression forcée de facteurs de transcription.
La reprogrammation neuronale directe est une approche puissante pour générer des neurones fonctionnels à partir de différentes populations de cellules de départ sans passer par des intermédiaires multipotents. Cette technique est non seulement très prometteuse dans le domaine de la modélisation des maladies, car elle permet de convertir, par exemple, les fibroblastes pour les patients souffrant de maladies neurodégénératives en neurones, mais représente également une alternative prometteuse pour les thérapies de remplacement cellulaires. Dans ce contexte, une percée scientifique majeure a été la démonstration que des cellules non neurales différenciées dans le système nerveux central, telles que les astrocytes, pouvaient être converties en neurones fonctionnels in vitro. Depuis lors, la reprogrammation directe in vitro des astrocytes en neurones a fourni des informations substantielles sur les mécanismes moléculaires sous-jacents à la conversion forcée de l’identité et les obstacles qui empêchent une reprogrammation efficace. Cependant, les résultats d’expériences in vitro réalisées dans différents laboratoires sont difficiles à comparer en raison des différences dans les méthodes utilisées pour isoler, cultiver et reprogrammer les astrocytes. Ici, nous décrivons un protocole détaillé pour isoler et cultiver de manière fiable des astrocytes de haute pureté provenant de différentes régions du système nerveux central de souris à des âges postnatals via le tri de cellules magnétiques. De plus, nous fournissons des protocoles pour reprogrammer les astrocytes cultivés en neurones par transduction virale ou transfection de l’ADN. Ce protocole rationalisé et standardisé peut être utilisé pour étudier les mécanismes moléculaires sous-jacents au maintien de l’identité cellulaire, à l’établissement d’une nouvelle identité neuronale, ainsi qu’à la génération de sous-types neuronaux spécifiques et à leurs propriétés fonctionnelles.
Le système nerveux central (SNC) des mammifères est très complexe, composé de centaines de types cellulaires différents, y compris un grand nombre de sous-types neuronaux différents 1,2,3,4,5,6. Contrairement à d’autres organes ou tissus 7,8,9, le SNC des mammifères a une capacité de régénération très limitée; La perte neuronale à la suite d’un traumatisme crânien ou d’une neurodégénérescence est irréversible et entraîne souvent des déficits moteurs et cognitifs10. Visant à sauver les fonctions cérébrales, différentes stratégies pour remplacer les neurones perdus font l’objet d’une enquête intense11. Parmi eux, la reprogrammation directe des cellules somatiques en neurones fonctionnels émerge comme une approche thérapeutique prometteuse12. La reprogrammation directe, ou transdifférenciation, est le processus de conversion d’un type de cellule différencié en une nouvelle identité sans passer par un état prolifératif ou pluripotent intermédiaire 13,14,15,16. Pionnière par l’identification de MyoD1 comme facteur suffisant pour convertir les fibroblastes en cellules musculaires17,18, cette méthode a été appliquée avec succès pour reprogrammer plusieurs types de cellules en neurones fonctionnels 19,20,21.
Les astrocytes, la macroglie la plus abondante du SNC22,23, sont un type cellulaire particulièrement prometteur pour la reprogrammation neuronale directe pour plusieurs raisons. Tout d’abord, ils sont largement et uniformément répartis dans le SNC, fournissant une source abondante en loco pour de nouveaux neurones. Deuxièmement, les astrocytes et les neurones sont étroitement liés sur le plan du développement, car ils partagent un ancêtre commun au cours du développement embryonnaire, les cellules gliales radiales24. L’origine embryonnaire commune des deux types de cellules semble faciliter la conversion neuronale par rapport à la reprogrammation des cellules de différentes couches germinales 19,21. En outre, les informations de modelage héritées par les astrocytes à travers leur origine gliale radiale sont également maintenues dans les astrocytes adultes 25,26,27, et semblent contribuer à la génération de sous-types neuronaux 28,29,30 appropriés à la région. Par conséquent, l’étude et la compréhension de la conversion des astrocytes en neurones sont un élément important pour atteindre le plein potentiel de cette technique pour les stratégies de remplacement cellulaires.
La conversion d’astrocytes cultivés in vitro en neurones a conduit à plusieurs percées dans le domaine de la reprogrammation neuronale directe, notamment : i) l’identification de facteurs de transcription suffisants pour générer des neurones à partir d’astrocytes 15,19,31, ii) le démêlage des mécanismes moléculaires déclenchés par différents facteurs de reprogrammation dans le même contexte cellulaire 32 , et iii) mettre en évidence l’impact de l’origine développementale des astrocytes sur l’induction de différents sous-types neuronaux 28,29,33. En outre, la conversion directe in vitro des astrocytes a permis de surmonter plusieurs obstacles majeurs qui limitent la reprogrammation neuronale directe34,35, tels que l’augmentation de la production d’espèces réactives de l’oxygène (ROS)34 et les différences entre le protéome mitochondrial des astrocytes et des neurones35. Par conséquent, ces observations soutiennent fortement l’utilisation de cultures primaires d’astrocytes comme modèle de reprogrammation neuronale directe pour étudier plusieurs questions fondamentales en biologie12, liées au maintien de l’identité cellulaire, aux obstacles empêchant les changements de destin cellulaire, ainsi qu’au rôle du métabolisme dans la reprogrammation.
Nous présentons ici un protocole détaillé pour isoler les astrocytes de souris à l’âge postnatal (P) avec une très grande pureté, comme démontré en isolant les astrocytes de la moelle épinière murine29. Nous fournissons également des protocoles pour reprogrammer les astrocytes en neurones par transduction virale ou transfection de plasmides d’ADN. Les cellules reprogrammées peuvent être analysées 7 jours après la transduction (7 DPT) pour évaluer divers aspects, tels que l’efficacité de la reprogrammation et la morphologie neuronale, ou peuvent être maintenues en culture pendant plusieurs semaines, pour évaluer leur maturation au fil du temps. Il est important de noter que ce protocole n’est pas spécifique aux astrocytes de la moelle épinière et peut être facilement appliqué pour isoler les astrocytes de diverses autres régions du cerveau, y compris la matière grise corticale, le mésencéphale et le cervelet.
La procédure suivante suit les directives de soins aux animaux du Helmholtz Zentrum Munich conformément à la directive 2010/63/UE sur la protection des animaux utilisés à des fins scientifiques. Veuillez vous assurer de vous conformer aux directives de soins aux animaux de l’établissement où la dissection est effectuée.
1. Préparation du matériel de dissection, de dissociation et de culture
REMARQUE: Préparez tous les réactifs de culture dans une armoire de sécurité biologique et travaillez en utilisant uniquement de l’équipement autoclavé ou stérile. Les réactifs de dissection et de dissociation peuvent être préparés à l’extérieur d’une armoire de sécurité biologique.
2. Isolement des astrocytes
3. Dissection du tissu de la moelle épinière
REMARQUE: La dissection des tissus peut être effectuée à l’extérieur d’une armoire de sécurité biologique.
4. Tri des cellules activées magnétiquement (MACS)
5. Ensemencement des astrocytes pour la reprogrammation
REMARQUE: Les étapes suivantes doivent être effectuées sous une armoire de sécurité biologique avec un niveau de sécurité 1 (SL1).
6. Expression forcée des facteurs de transcription
REMARQUE: Avant de procéder au protocole, il est essentiel de bien concevoir l’expérience. En particulier, il est important de toujours inclure un contrôle négatif pour la reprogrammation, à savoir une condition où aucun facteur de reprogrammation n’est exprimé. Par exemple, lors de l’utilisation de vecteurs portant l’ADNc pour le facteur de reprogrammation et d’un rapporteur (par exemple, la protéine fluorescente verte (GFP), DsRed), le contrôle négatif est représenté par le même vecteur portant uniquement le rapporteur. Lors de l’expression de plusieurs facteurs portant différents rapporteurs, le contrôle négatif doit être ajusté en conséquence.
7. Reprogrammation des astrocytes (analyse de 7 jours)
8. Reprogrammation des astrocytes en neurones matures (cultures à long terme)
Les cultures primaires d’astrocytes atteignent généralement une confluence de 80 % à 90 % entre 7 et 10 jours après le tri et le placage de la MAC (figure 1B). Généralement, une seule fiole de culture T25 donne environ 1-1,5 x 106 cellules, ce qui est suffisant pour 20-30 couvertures lors de l’ensemencement de cellules à une densité de 5-5,5 x 104 cellules par puits. Le lendemain du placage, les cellules couvrent généralement 50 % à 60 % de la surface du couvercle (Figure 1C). À ce stade, les cultures sont constituées presque exclusivement d’astrocytes, tandis que d’autres types de cellules, tels que les neuroblastes, sont pratiquement absents (Figure 1D)29.
Les facteurs de reprogrammation peuvent être administrés aux astrocytes soit par transduction rétrovirale ou lentivirale, soit par transfection de plasmides d’ADN. Habituellement, la transduction virale infecte plus de cellules que la transfection. Comme la conversion neuronale directe provoque une quantité substantielle de mort cellulaire34,35, la transduction rétrovirale ou lentivirale est préférée pour maximiser le nombre de cellules à analyser. Différents promoteurs peuvent être utilisés pour contrôler l’expression des facteurs de reprogrammation : constitutifs (p. ex., CMV, CAG)15,32, inductibles (p. ex., éléments sensibles au Tet, Tet-ON)21 ou spécifiques au type de cellule (p. ex., promoteur gfAP)36,37. Lors de l’utilisation de promoteurs constitutifs ou spécifiques au type cellulaire, les astrocytes commencent à exprimer des niveaux détectables des transgènes, évalués par expression de rapporteur fluorescent (par exemple, GFP, DsRed), dans les 24 heures suivant la livraison du gène, chaque cellule étant indépendante des autres. Inversement, les promoteurs inductibles permettent de synchroniser l’expression des transgènes à travers les cellules transduites, car ils sont activés suite à l’ajout d’une petite molécule (par exemple, la doxycycline) au milieu de culture. Les niveaux détectables des facteurs de transcription sont généralement atteints 18-20 h après l’activation du promoteur. Dans la plupart des cas, le pic d’expression du facteur de reprogrammation est atteint vers 48 h, l’expression médiée par le lentivirus prenant un peu plus de temps.
Alors que les changements transcriptionnels suivant l’expression des facteurs de reprogrammation peuvent être détectés dès 4 h32, des changements robustes se produisent après 24 h et plus tard29,32. Les changements morphologiques suivent les changements transcriptionnels, et les premiers signes de conversion peuvent être observés environ 3 jours après la transduction/transfection (3 DPT). À 7 DPT, les cellules neuronales induites se distinguent clairement des astrocytes : leur soma est plus petit que les astrocytes témoins ou non reprogrammés, ils ont de longs processus, et ils sont positifs pour le marqueur neuronal βIII-tub et sont négatifs pour le marqueur astrocytaire GFAP (Figure 1E). Cependant, il convient de noter que certaines cellules peuvent être soit positives pour gfAP et βIII-tub, suggérant que le programme neuronal a été induit mais que l’identité astrocytaire n’a pas été inhibée, soit négative pour les deux marqueurs, indiquant la répression de l’identité astrocytaire mais l’absence d’induction de la cascade neuronale. Dans les deux cas, les cellules maintiennent généralement une morphologie astrocytaire.
Pour les analyses plus fonctionnelles, telles que l’électrophysiologie ou l’évaluation des sous-types neuronaux générés, les cultures sont généralement maintenues pour un minimum de 21 DPT et traitées avec un milieu de maturation. À 21 DPT, de nombreux neurones induits sont capables de déclencher des potentiels d’action et sont positifs pour le marqueur neuronal mature NeuN ainsi que pour la protéine pansyaptique Synaptophysine29 (Figure 1F).

Figure 1 : Vue d’ensemble de la culture et de la reprogrammation des astrocytes. (A)Chronologie de la conversion directe des astrocytes en neurones. Chaque ligne noire représente une étape importante du protocole. (B) Images représentatives en champ clair d’astrocytes dérivés de la moelle épinière en culture après 7 jours de culture. Les photos ont été prises à l’aide d’un microscope à fond clair et d’un objectif 10x. La barre d’échelle représente 100 μm. (C) Images représentatives en champ clair des astrocytes de la moelle épinière 1 jour après le replaçage à une densité de 5,5 x 104 cellules par puits dans une plaque de 24 puits. Les images ont été prises à l’aide d’un microscope à fond clair et d’un objectif 10x. La barre d’échelle représente 100 μm. (D) Image d’immunofluorescence d’une triple coloration βIII-tub, Sox9, GFAP sur des astrocytes fixés 1 jour après le placage pour démontrer la pureté de la culture. Les cellules ont été fixées dans du paraformaldéhyde à 4 % pendant 10 min et lavées deux fois avec 1x PBS. Les cellules ont été bloquées à l’aide d’une solution de 3 % de BSA et de Triton-X 100 à 0,5 % dans une solution de PBS à 1x. Les anticorps primaires ont été dilués à la bonne concentration (p. ex., anti-GFAP 1:250; bac anti-βIII 1:250; anti-Syp1 1:500) en solution bloquante et incubés pendant 2 h à température ambiante. Les cellules ont été lavées trois fois avec 1x PBS et incubées avec des anticorps secondaires conjugués au fluorophore pendant 1 h à température ambiante. Les couvercles ont été lavés trois fois avec 1x PBS avant d’être montés avec Aqua Poly / Mount. Les images ont été acquises à l’aide d’un microscope à épifluorescence et d’un objectif 40x. La barre d’échelle représente 20 μm. (E) Image d’immunofluorescence d’une double coloration d’une baignoire βIII, DsRed pour démontrer la conversion des astrocytes en neurones avec Ascl1 après 7 DPT. Le protocole d’immunofluorescence et d’acquisition d’images était tel que décrit ci-dessus. La barre d’échelle représente 20 μm. (F) Images d’immunofluorescence d’une triple coloration de la βIII-tub, DsRed, synaptophysine 1 (Syp1) pour démontrer la maturité neuronale après 21 DPT de reprogrammation avec Ascl1. Le protocole d’immunofluorescence et d’acquisition d’images était tel que décrit ci-dessus. La barre d’échelle représente 20 μm. Veuillez cliquer ici pour afficher une version agrandie de cette figure.
Les auteurs ne déclarent aucun conflit d’intérêts.
Nous décrivons ici un protocole détaillé pour générer des cultures hautement enrichies d’astrocytes dérivés de différentes régions du système nerveux central de souris postnatales et leur conversion directe en neurones fonctionnels par l’expression forcée de facteurs de transcription.
Nous tenons à remercier Ines Mühlhahn pour le clonage des constructions pour la reprogrammation, Paulina Chlebik pour la production virale, et Magdalena Götz et Judith Fischer-Sternjak pour les commentaires sur le manuscrit.
| 0,05 % Trypsine/EDTA | Life Technologies | 25300054 | |
| 4', 6-Diamidino-2-phényindole, dilactate (DAPI) | Sigma-Aldrich | D9564 | |
| anti-souris IgG1 Alexa 647 | Thermo Fisher | A21240 | |
| anti-souris IgG1 Biotine | Southernbiotech | Cat# 1070-08 ; RRID : AB_2794413 | |
| anti-souris IgG2b Alexa 488 | Thermo Fisher | A21121 | |
| anti-lapin Alexa 546 | Thermo Fisher | A11010 | |
| Aqua Poly/Mount | Polysciences | Cat# 18606-20 | |
| B27 Supplement | Life Technologies | 17504044 | |
| BDNF | Peprotech | 450-02 | |
| bFGF | Life Technologies | 13256029 | |
| Albumine sérique bovine (BSA) | Sigma-Aldrich | Cat# A9418 | |
| cAMP | Sigma Aldrich | D0260 | |
| C-Tubes | Miltenyi Biotec | 130-093-237 | |
| DMEM/F12 | Life Technologies | 21331020 | |
| Dorsomorphine | Sigma Aldrich | P5499 | |
| EGF | Life Technologies | PHG0311 | |
| Sérum de veau fœtal | PAN Biotech | P30-3302 | |
| Forskolin | Sigma Aldrich | F6886 | |
| GDNF | Peprotech | 450-10 | |
| gentleMACS Octo Dissociator | Miltenyi Biotec | 130-096-427 | |
| GFAP | Dako | Cat# Z0334 ; RRID : AB_100013482 | |
| Glucose | Sigma Aldrich | G8769 | |
| GlutaMax | Life Technologies | 35050038 | |
| HBSS | Life Technologies | 14025050 | |
| Hepes | Life Technologies | 15630056 | |
| Lipofectamine 2000 (réactif de transfection) | Thermo Fisher | Cat# 11668019 | |
| MACS SmartStrainer 70µ ; m | Miltenyi Biotec | 130-098-462 | |
| Séparateur MiniMACS | Miltenyi Biotec | 130-042-102 | |
| Souris anti-ACSA-2 MicroBeat Kit  ; | Miltenyi Biotec | 130-097-678 | |
| Souris IgG1 anti-Synaptophysine 1 | Systèmes Synaptiques | Cat# 101 011 RRID :AB_887824) | |
| Souris IgG2b anti-Tuj-1 (&beta ; III-tub) | Sigma Aldrich | T8660 | |
| MS colonnes | Miltenyi Biotec | 130-042-201 | |
| N2 Supplement | Life Technologies | 17502048 | |
| Neural Tissue Dissociation Kit  ; | Miltenyi Biotec | 130-092-628 | |
| NT3 | Peprotech | 450-03 | |
| Séparateur octoMACS | Miltenyi Biotec | 130-042-109 | |
| OptiMEM &ndash ; GlutaMAX (milieu à sérum réduit) | Thermo Fisher | Cat# 51985-026 | |
| Pénicilline/Streptomycine | Life Technologies | 15140122 | |
| Poly-D-Lysine | Sigma Aldrich | P1149 | |
| Rabbit anti-RFP | Rockland | Cat# 600-401-379 ; RRID :AB_2209751 | |
| Lapin anti-Sox9 | Sigma-Aldrich | Cat# AB5535 ; RRID :AB_2239761 | |
| Streptavidin Alexa 405 | Thermo Fisher | Cat# S32351 | |
| Triton X-100 | Sigma-Aldrich | Cat# T9284 |