Le présent protocole explique la génération d’une monocouche 2D de cellules cérébelleuses à partir de cellules souches pluripotentes induites pour étudier les premiers stades du développement cérébelleux.
Article de méthode
Le présent protocole explique la génération d’une monocouche 2D de cellules cérébelleuses à partir de cellules souches pluripotentes induites pour étudier les premiers stades du développement cérébelleux.
Le développement précis et opportun du cervelet est crucial non seulement pour une coordination motrice et un équilibre précis, mais aussi pour la cognition. En outre, la perturbation du développement cérébelleux a été impliquée dans de nombreux troubles neurodéveloppementaux, notamment l’autisme, le trouble déficitaire de l’attention avec hyperactivité (TDAH) et la schizophrénie. Les études sur le développement cérébelleux chez l’homme n’étaient auparavant possibles que par des études post-mortem ou la neuroimagerie, mais ces méthodes ne sont pas suffisantes pour comprendre les changements moléculaires et cellulaires qui se produisent in vivo au cours du développement précoce, qui est à l’origine de nombreux troubles neurodéveloppementaux. L’émergence de techniques pour générer des cellules souches pluripotentes induites par l’homme (CSPi) à partir de cellules somatiques et la capacité de redifférencier davantage les CSPi en neurones ont ouvert la voie à la modélisation in vitro du développement précoce du cerveau. La présente étude fournit des étapes simplifiées vers la génération de cellules cérébelleuses pour des applications nécessitant une structure monocouche en 2 dimensions (2D). Les cellules cérébelleuses représentant les premiers stades de développement sont dérivées de CSPi humaines via les étapes suivantes: premièrement, les corps embryoïdes sont fabriqués en culture 3 dimensions (3D), puis ils sont traités avec FGF2 et insuline pour promouvoir la spécification du devenir cérébelleux, et enfin, ils sont différenciés en phase terminale en tant que monocouche sur des substrats recouverts de poly-l-ornithine (PLO) / laminine. À 35 jours de différenciation, les cultures de cellules cérébelleuses dérivées de l’iPSC expriment des marqueurs cérébelleux, notamment ATOH1, PTF1α, PAX6 et KIRREL2, ce qui suggère que ce protocole génère des précurseurs neuronaux cérébelleux glutamatergiques et GABAergiques, ainsi que des progéniteurs cellulaires de Purkinje. De plus, les cellules différenciées présentent une morphologie neuronale distincte et sont positives pour les marqueurs d’immunofluorescence de l’identité neuronale tels que TUBB3. Ces cellules expriment des molécules de guidage axonal, y compris la sémaphorine-4C, la plexine-B2 et la neuropiline-1, et pourraient servir de modèle pour étudier les mécanismes moléculaires de la croissance des neurites et de la connectivité synaptique. Cette méthode génère des neurones cérébelleux humains utiles pour des applications en aval, y compris l’expression génique, les études physiologiques et morphologiques nécessitant des formats monocouches 2D.
Comprendre le développement cérébelleux humain et les fenêtres temporelles critiques de ce processus est important non seulement pour décoder les causes possibles des troubles neurodéveloppementaux, mais aussi pour identifier de nouvelles cibles pour une intervention thérapeutique. La modélisation du développement cérébelleux humain in vitro a été difficile, mais au fil du temps, de nombreux protocoles différenciant les cellules souches embryonnaires humaines (CSEh) ou les CSPi avec le destin de la lignée cérébelleuse ont émergé 1,2,3,4,5,6,7,8 . De plus, il est important de développer des protocoles qui génèrent des résultats reproductibles, qui sont relativement simples (pour réduire les erreurs) et qui ne sont pas lourds en coûts monétaires.
Les premiers protocoles de différenciation cérébelleuse ont été générés à partir de cultures 2D de corps embryoïdes plaqués (EB), induisant le devenir cérébelleux avec divers facteurs de croissance similaires au développement in vivo, y compris WNT, BMP et FGF 1,9. Des protocoles publiés plus récents ont induit une différenciation principalement dans la culture organoïde 3D avec FGF2 et insuline, suivie de FGF19 et SDF1 pour les structures rhombiques ressemblant à des lèvres3,4, ou ont utilisé une combinaison de FGF2, FGF4 et FGF85. Les deux méthodes d’induction organoïde cérébelleuse ont abouti à des organoïdes cérébelleux 3D similaires, car les deux protocoles ont rapporté une expression similaire du marqueur cérébelleux à des moments identiques. Holmes et Heine ont étendu leur protocole 3D5 pour montrer que les cellules cérébelleuses 2D peuvent être générées à partir d’hESCs et d’iPSCs, qui commencent sous forme d’agrégats 3D. En outre, Silva et al.7 ont démontré que les cellules représentant des neurones cérébelleux matures en 2D peuvent être générées avec une approche similaire à celle de Holmes et Heine, en utilisant un point temporel différent pour passer de la 3D à la 2D et prolonger le temps de croissance et de maturation.
Le protocole actuel induit le devenir cérébelleux dans les CSPi sans alimentation en générant des corps embryoïdes flottants à l’aide d’insuline et de FGF2, puis en plaquant les EB sur des plats enrobés de PLOL / laminine au jour 14 pour une croissance et une différenciation 2D. Au jour 35, les cellules ayant une identité cérébelleuse sont obtenues. La capacité de récapituler les premières étapes du développement cérébelleux, en particulier dans un environnement 2D, permet aux chercheurs de répondre à des questions spécifiques nécessitant des expériences avec une structure monocouche. Ce protocole se prête également à d’autres modifications telles que des surfaces micropatternées, des tests de croissance axonale et le tri cellulaire pour enrichir les populations cellulaires souhaitées.
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La recherche sur des sujets humains a été approuvée sous le numéro d’approbation 201805995 du comité d’examen institutionnel de l’Université de l’Iowa et le numéro d’approbation 2017-02 du comité des cellules souches pluripotentes humaines de l’Université de l’Iowa. Des biopsies cutanées ont été obtenues des sujets après avoir obtenu un consentement éclairé écrit. Les fibroblastes ont été cultivés dans du DMEM avec 15% de sérum bovin fœtal (FBS) et 1% de solution d’acides aminés MEM non essentiels à 37 °C et 5% de CO2. Les fibroblastes ont été reprogrammés à l’aide d’un kit de reprogrammation épisomique suivant le protocole du fabricant (voir le tableau des matériaux) à l’aide d’un nucléofector pour l’électroporation. Toutes les procédures ont été effectuées dans une enceinte de sécurité biologique de classe II de type A2 (« capot » en abrégé). Tous les milieux de culture cellulaire étaient exempts d’antibiotiques; Par conséquent, chaque composant qui est entré dans la hotte a été nettoyé avec de l’éthanol à 70%. Tous les milieux et composants de culture cellulaire ont été filtrés stériles ou ouverts dans la hotte pour maintenir leur stérilité.
1. Préparation expérimentale
2. Culture iPSC sans alimentation
3. Différenciation cérébelleuse
REMARQUE: Avant de commencer la différenciation, les CSPi sont passées à six boîtes de 35 mm et sont prêtes pour la différenciation lorsqu’elles sont à 70% de confluence. Chaque plaque de 35 mm sera transférée dans un puits de la plaque de 6 puits.
4. Préparation de l’échantillon pour l’isolement de l’ARN
5. Préparation des cellules pour la coloration immunofluorescente
NOTE: Pour une plaque de 24 puits, un EB par puits est suffisant.
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Vue d’ensemble de la différenciation cérébelleuse 3D à 2D
Les cellules cérébelleuses sont générées à partir des CSPi. La figure 1A montre le flux de travail global et l’ajout de composants majeurs pour la différenciation. Le jour 0, les EB sont fabriqués en soulevant doucement les colonies d’iPSC (Figure 1B) à l’aide d’une pipette en verre tiré dans CDM contenant SB431542 et Y-27632 et placés dans des plaques de fixation ultra-basses. FGF2 es...
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La capacité de modéliser le développement cérébelleux humain in vitro est importante pour la modélisation de la maladie ainsi que pour approfondir la compréhension du développement normal du cerveau. Des protocoles moins compliqués et moins rentables créent plus d’opportunités pour la génération de données reproductibles et une large mise en œuvre dans plusieurs laboratoires scientifiques. Un protocole de différenciation cérébelleuse est décrit ici en utilisant une méthode modifiée de génération d’EB qui ne néce...
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Les auteurs n’ont aucun conflit d’intérêts à déclarer.
Nous remercions Jenny Gringer Richards pour son travail approfondi dans la validation de nos sujets témoins, à partir desquels nous avons généré les CSPi de contrôle. Ce travail a été soutenu par NIH T32 MH019113 (à D.A.M. et K.A.K.), le Nellie Ball Trust (à T.H.W. et A.J.W.), NIH R01 MH111578 (à V.A.M. et J.A.W.), NIH KL2 TR002536 (à A.J.W.) et le Roy J. Carver Charitable Trust (à V.A.M., J.A.W. et A.J.W.). Les figurines ont été créées avec BioRender.com.
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| Nom | Entreprise | Numéro de catalogue | Commentaires |
|---|---|---|---|
| 10 mL Pipette sérologique | Fisher Scientific | 13-678-26D | |
| 1-thio-glycérol | Sigma | M6145 | |
| 2 mL Pipette sérologique | Fisher Scientific | 13-678-26B | |
| 250 mL Unité de filtration, 0,2 & micro ; m aPES, 50 mm Dia | Fisher Scientific | FB12566502 | |
| 35 mm Plat de culture tissulaire Easy Grip | Falcon | 353001 | |
| 4D Nucleofector unité centrale | Lonza | 276885 | Nucleofector |
| 5 mL Pipette sérologique | Fisher Scientific | 13-678-25D | |
| Plat de culture tissulaire Easy Grip 60 mm | Falcon | 353004 | |
| 6 puits plaques de fixation ultra-basses | Corning | 3471 | |
| 9" Pipettes Pasteur jetables | Fisher Scientific | 13-678-20D | |
| Apo-transferrine | Sigma | T1147 | |
| Albumine sérique bovine (BSA) | Sigma | A9418 | |
| Eau de qualité culture cellulaire | Cytiva | SH30529.02 | |
| Concentré lipidique chimiquement défini | Gibco | 11905031 | |
| Chroman 1 | Cayman | 34681 | |
| Classe II, Type A2, Armoire de sécurité biologique | NuAire, Inc. | Capot NU-540-600 | |
| plaque Costar 24 puits à | Corning | 3526 | |
| plaque Costar 6 puits, | Corning | 3516 | |
| DAPI | Thermo Scientific | 62248 | |
| DMEM | Gibco | 11965092 | |
| DMEM/F12 | Gibco | 11320033 | |
| DMSO (Dimethly sulfoxyde) | Sigma | D2438 | |
| DPBS+/+ | Gibco | 14040133 | |
| Emricasan | Cayman | 22204 | |
| Epi5 episomal iPSC kit de reprogrammation Life | Technologies | A15960 | |
| Essential 8-Flex | Gibco | A2858501 | PSC medium avec système d’imagerie FGF2 |
| EVOS XL Core stable à | Life Technologies | AMEX1000 | |
| Sérum fœtal bovin - Premium Select | Atlanta Biologicals | S11150 | |
| FGF2 | Peprotech | 100-18B | |
| Supplément GlutaMAX | Gibco | 35050061 | Supplément L-alanine-L-glutamine |
| Ham’s F12 Nutrient Mix | Gibco | 11765054 | |
| HERAcell VIOS 160i Incubateur CO2 | Thermo Scientific | 50144906 | |
| Humain Anti-EN2, souris | Santa Cruz Biotechnology | sc-293311 | |
| Humain anti-Ki67/MKI67, lapin | R& D Systems | MAB7617 | |
| Anti-PTF1a humain, lapin | Novus Biologicals | NBP2-98726 | |
| Anti-TUBB3 humain, souris | Biolegend | 801213 | |
| IMDM | Gibco | 12440053 | |
| Insuline | Gibco | 12585 | |
| Laminine Protéine de souris | Gibco | 23017015 | |
| Matrigel Matrix | Corning | 354234 | Matrice de membrane basale |
| MEM-NEAA | Gibco | 11140050 | |
| Mini centrifugeuse | Labnet International | C1310 | Mini centrifugeuse de paillasse |
| Monarch RNA Cleanup Kit (50 µ ; g) | New England BioLabs | T2040 | Colonnes de spin en silice |
| Monarch Total RNA Miniprep Kit | New England BioLabs | T2010 | Colonnes de spin en silice |
| N-2 supplément | Gibco | 17502-048 | |
| Milieu neurobasal | Gibco | 21103049 | |
| PBS, pH 7,4 | Gibco | 10010023 | |
| PFA 16 % | Microscopie électronique Sciences | 15710 | |
| Supplément de polyamine | Sigma | P8483 | |
| Poly-L-Ornithine (PLO) | Sigma | 3655 | |
| Chlorure de potassium | Sigma | 746436 | |
| SB431542 | Sigma | 54317 | |
| Sachets transparents auto-refermables | Steriking | SS-T2 (90x250) | Sachets autoclave |
| Sodium citrate dihydraté ; | Fisher Scientific | S279-500 | |
| Filtres pour seringues, stériles, PES 0.22 & micro ; m, 30 mm Dia | Research Products International | 256131 | |
| Trans-ISRIB | Cayman | 16258 | |
| TRIzol Réactif | Invitrogen | 15596018 | Phénol et guanidine isothiocyanate |
| TrypLE Express Enzyme (1x) | Gibco | 12604039 | Réactif de dissociation cellulaire ; |
| Osmomètre à pression de vapeur | Wescor, Inc. | Modèle 5520 | Osmomètre |
| Y-27632 | Biogems | 1293823 |
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