Ce protocole décrit les étapes clés pour générer et caractériser les organoïdes 3D murins oraux-œsophagiens qui représentent les lésions de carcinome épidermoïde normal, prénéoplasique et épidermoïde induites par cancérogenèse chimique.
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Article de méthode
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Ce protocole décrit les étapes clés pour générer et caractériser les organoïdes 3D murins oraux-œsophagiens qui représentent les lésions de carcinome épidermoïde normal, prénéoplasique et épidermoïde induites par cancérogenèse chimique.
Le carcinome épidermoïde de l’œsophage (ESCC) est répandu dans le monde entier, représentant 90% de tous les cas de cancer de l’œsophage chaque année, et est le plus mortel de tous les carcinomes épidermoïdes humains. Malgré les progrès récents dans la définition des changements moléculaires accompagnant l’initiation et le développement de l’ESCC, le pronostic du patient reste sombre. L’annotation fonctionnelle de ces changements moléculaires est la prochaine étape nécessaire et nécessite des modèles qui capturent les caractéristiques moléculaires de l’ESCC et peuvent être manipulés facilement et à peu de frais pour l’annotation fonctionnelle. Les souris traitées avec la fumée de tabac mimétique 4-nitroquinoléine 1-oxyde (4NQO) forment de manière prévisible un ESCC et une prénéoplasie œsophagienne. Il convient de noter que les lésions de 4NQO apparaissent également dans la cavité buccale, le plus souvent dans la langue, ainsi que dans le préestomac, qui partagent tous l’épithélium pavimenteux stratifié. Cependant, ces souris ne peuvent pas être simplement manipulées pour tester des hypothèses fonctionnelles, car la génération de modèles murins isogéniques nécessite beaucoup de temps et de ressources. Ici, nous surmontons cette limitation en générant des organoïdes tridimensionnels (3D) dérivés de cellules uniques à partir de souris traitées avec 4NQO pour caractériser les ESCC murins ou les cellules prénéoplasiques ex vivo. Ces organoïdes capturent les caractéristiques saillantes de l’ESCC et de la prénéoplasie œsophagienne, peuvent être exploités rapidement et à peu de frais pour former des modèles isogéniques et peuvent être utilisés pour des expériences de transplantation syngénique. Nous démontrons comment générer des organoïdes 3D à partir de tissu œsophagien murin normal, prénéoplasique et SCC et maintenir et cryopréserver ces organoïdes. Les applications de ces organoïdes polyvalents sont vastes et comprennent l’utilisation de souris génétiquement modifiées et une caractérisation plus poussée par cytométrie de flux ou immunohistochimie, la génération de lignées organoïdes isogéniques à l’aide des technologies CRISPR et le criblage de médicaments ou la transplantation syngénique. Nous pensons que l’adoption généralisée des techniques démontrées dans ce protocole accélérera les progrès dans ce domaine pour lutter contre le lourd fardeau de la CSC.
Le carcinome épidermoïde œsophagien (ESCC) est le plus mortel des carcinomes épidermoïdes humains, en raison de son diagnostic tardif, de sa résistance au traitement et de ses métastases 1,2. L’ESCC provient de l’épithélium pavimenteux stratifié, qui tapisse la surface luminale de l’œsophage. L’épithélium pavimenteux est composé de cellules basales prolifératives et de cellules différenciées dans la couche de cellules suprabasales. Dans des conditions physiologiques, les cellules basales expriment des marqueurs tels que p63, Sox2 et la cytokératine K5 et K14, tandis que les cellules différenciées expriment K4,....
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Les expériences sur les murins ont été planifiées et réalisées conformément à la réglementation et au protocole animal #AABB1502, examinés et approuvés par le comité institutionnel de soin et d’utilisation des animaux de l’Université Columbia. Les souris ont été hébergées dans une installation de soins aux animaux appropriée qui assure le traitement sans cruauté des souris et fournit des soins vétérinaires appropriés aux souris et une formation en sécurité de laboratoire pour le personnel de laboratoire.
1. Traitement de souris avec 4NQO pour induire des lésions IEN et ESCC œsophagiennes (temps considéré: jusqu’à 28 semaines)....
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Ce protocole décrit le processus de génération d’organoïdes œsophagiens murins (MEO) à partir de tissu œsophagien normal ou de tissu tumoral ESCC à partir de souris traitées par 4NQO selon un schéma thérapeutique spécifique consistant en 16 semaines de 4NQO administré dans l’eau potable, suivies d’une période d’observation de 10 semaines à 12 semaines (Figure 1). Les souris sont ensuite euthanasiées pour la dissection de la langue ou du tissu œsophagien (Figure 2
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Il existe plusieurs étapes et considérations critiques pour la génération et l’analyse des opérateurs en économie de marché dans les protocoles décrits ici. Pour assurer la reproductibilité et la rigueur des expériences MEO, les réplications biologiques et techniques sont toutes deux importantes. Pour les réplications biologiques, deux à trois souris indépendantes portant de l’ESCC sont généralement suffisantes par condition expérimentale. Cependant, le nombre approprié de répétitions biologiques peut varier en fonction .......
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Les auteurs ne déclarent aucun conflit d’intérêts.
Nous remercions les ressources partagées (cytométrie en flux, pathologie moléculaire et microscopie confocale et spécialisée) du Herbert Irving Comprehensive Cancer Center de l’Université Columbia pour leur soutien technique. Nous remercions les Drs Alan Diehl, Adam J. Bass et Kwok-Kin Wong (NCI P01 Mechanisms of Esophageal Carcinogenesis) et les membres des laboratoires Rustgi et Nakagawa pour leurs discussions utiles. Cette étude a été soutenue par les subventions NIH suivantes: P01CA098101 (H.N. et A.K.R.), R01DK114436 (H.N.), R01AA026297 (H.N.), L30CA264714 (S.F.), DE031112-01 (F.M.H.), KL2TR001874 (F.M.H.),3R01CA255298-01S1 (J.G.), 2L30DK126621-02
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| Nom | Entreprise | Numéro de catalogue | Commentaires |
|---|---|---|---|
| 0,05 % trypsine-EDTA | Thermo Fisher Scientific | 25-300-120 | |
| 0,25 % trypsine-EDTA | Thermo Fisher Scientific | 25-200-114 | |
| 0,4 % Trypan Blue | Thermo Fisher Scientific | T10282 | |
| Seringue à tuberculine 1 mL sans aiguille | BD | 309659 | |
| 1,5 mL microtube à centrifuger | Thermo Fisher Scientific | 05-408-129 | |
| 100 & micro ; crépine à cellules m | Thermo Fisher Scientific | 22363549 | |
| tubes coniques 15 mL | Thermo Fisher Scientific | 14-959-53A | |
| 200 µ ; Pointes de micropipette à alésage large L | Thermo Fisher Scientific | 212361A | |
| Aiguilles 21 G | BD | 305167 | |
| plaque à 24 puits | Thermo Fisher Scientific | 12-556-006 | |
| 4-Nitroquinoléine-1-oxyde (4NQO) | Tokyo Chemical Industry | NO250 | |
| 50 mL tubes coniques | Thermo Fisher Scientific | 12-565-270 | |
| 6 puits plaque | Thermo Fisher Scientific | 12556004 | |
| 70 & micro ; Filtre à cellules m | Thermo Fisher Scientific | 22363548 | |
| 99,9 % éthylène propylène glycol | SK picglobal | ||
| Advanced DMEM/F12 | Thermo Fisher Scientific | 12634028 | |
| Amphotéricine B | Gibco, Thermo Fisher Scientific | 15290018 | Concentration de stock 250 µ ; g/mL, concentration finale 0,5 & micro ; g/mL |
| Antibiotique-Antimycosique | Thermo Fisher Scientific | 15240062 | Concentration de stock 100x, concentration finale 1x |
| supplément de B-27 | Thermo Fisher Scientific | 17504044 | Concentration de stock 50x, concentration finale 1x |
| Gélose Bacto | BD | 214010 | |
| CO2 incubateur, par exemple Heracell 150i | Thermo Fisher Scientific | 51026406 | ou équivalent |
| Countess II FL Automated Cell Counter | Thermo Fisher Scientific | AMQAX1000 | ou équivalent |
| Cryovials | Thermo Fisher Scientific | 03-337-7D | |
| DietGel 76A | Clear H2O | 72-07-5022 | |
| Dimethyl sulfoxide (DMSO) | MilliporeSigma | D4540 | |
| Dispase | Corning | 354235 | Concentration de la matière 50 U/mL, concentration finale 2,5 &ndash ; 5 U/mL |
| Ciseaux de dissection | VWR | 25870-002 | |
| Solution saline tamponnée au phosphate de Dulbecco (PBS) | Thermo Fisher Scientific | 14190250 | Concentration de stock 1x |
| sérum fœtal de veau (FBS) | HyClone | SH30071.03 | |
| Forceps | VWR | 82027-386 | |
| Conteneur de congélation | Corning | 432002 | ou équivalent |
| Gélatine | Thermo Fisher Scientific | G7-500 | |
| GlutaMAX | Thermo Fisher Scientific | 35050061 | Concentration de stock 100x, concentration finale 1x |
| HEPES | Thermo Fisher Scientific | 15630080 | Concentration de stock 1 M, concentration finale 10 mM |
| Plaque chauffante/agitateur | Corning | PC-420D | ou équivalent |
| Laboratoire Bain de billes d’armure (ou bain-marie) | VWR | 89409-222 | ou équivalent |
| Balance de laboratoire | Ohaus | 71142841 | ou équivalent |
| Extrait de membrane basale Matrigel (BME) | Corning | 354234 | |
| Microcentrifugeuse Minispin | Eppendorf | 22620100 | ou équivalent |
| Rack de tubes de microcentrifugation | Southern Labware | 0061 | |
| Supplément N-2 | Thermo Fisher Scientific | 17502048 | Concentration de stock 100x, concentration finale 1x |
| N-acétylcystéine (NAC) | Sigma-Aldrich | A9165 | Concentration de stock 0,5 M, concentration finale 1 mM |
| Parafilm M wrap | Thermo Fisher Scientific | S37440 | |
| Paraformaldéhyde (PFA) | MilliporeSigma | 158127-500G | |
| Cassette de pathologie | Thermo Fisher Scientific | 22-272416 | |
| Microscope à contraste de phase | Nikon | ou équivalent Facteur de | |
| croissance épidermique (mEGF) de souris recombinantePeprotech | 315-09-1mg | Concentration de stock 500 ng/µ ; L, concentration finale 100 ng/mL | |
| RN Milieu conditionné par cellules exprimant R-Spondin1 et Noggin (RN CM) | N/A | N/A | Disponible sur demande par l’intermédiaire de la carotte de culture organoïde et cellulaire, concentration finale 2 % |
| Centrifugeuse Sorval ST 16R | Thermo Fisher Scientific | 75004380 | ou équivalent |
| Inhibiteur de trypsine de soja (IST) | MilliporeSigma | T9128 | Concentration de stock 250 µ ; g/mL |
| ThermoMixer C | Thermo Fisher Scientific | 14-285-562 PM | ou équivalent |
| Y-27632 | Selleck Chemicals | S1049 | Concentration de stock 10 mM, concentration finale 10 µ ; L |
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