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APTrack est un plugin logiciel à utiliser avec la plateforme Open Ephys. Nous avons choisi cette plate-forme car elle est open-source, flexible et peu coûteuse à mettre en œuvre. Sans compter le coût du stimulateur à courant constant, tout l’équipement nécessaire pour commencer à utiliser le plugin pourrait être acheté pour environ 5 000 USD au moment de la rédaction. Nous espérons que cela permettra aux chercheurs de mettre en œuvre APTrack dans leurs études d’électrophysiologie des nerfs périphériques plus facilement. De plus, les chercheurs peuvent librement modifier le logiciel pour l’adapter à leurs besoins expérimentaux. Il est important de noter que cet outil a permis le suivi du seuil électrique de nocicepteurs à fibre C uniques, pour la première fois, chez l’homme.
Plus le rapport signal sur bruit est élevé, mieux les algorithmes peuvent identifier les potentiels d’action. Le rapport signal sur bruit lors de la microneurographie était suffisant dans la majorité de nos enregistrements, mais les utilisateurs doivent être attentifs au risque de dégradation du signal au fil du temps. Ceci est particulièrement important pour les protocoles expérimentaux plus longs, car si l’amplitude du potentiel d’action suivi tombe en dessous du seuil de détection, l’amplitude de stimulation sera augmentée par erreur; Cela peut être atténué par des expérimentateurs surveillant le plugin, puis ajustant les paramètres si nécessaire. Le rapport signal/bruit est amélioré grâce au filtrage passe-bande, mais les transitoires plus importants peuvent toujours être identifiés à tort comme des potentiels d’action s’ils arrivent pendant la fenêtre temporelle de la zone de recherche. Le risque d’identifier à tort le bruit transitoire comme un potentiel d’action peut être réduit en réduisant la fenêtre de temps pendant laquelle le plugin recherche des potentiels d’action et en optimisant les paramètres de seuil. Cependant, il y a encore des situations que l’on peut rencontrer qui entravent les performances du plugin. L’activité spontanée peut causer des difficultés si des potentiels d’action de plus grande amplitude tombent dans la fenêtre de la boîte de recherche de l’algorithme, car ils seront identifiés à tort comme le potentiel d’action cible. De plus, l’activité spontanée dans le neurone d’intérêt peut signifier que la stimulation électrique tombe pendant sa période réfractaire, ce qui entraîne une incapacité à générer un potentiel d’action. Des difficultés d’utilisation du logiciel peuvent également survenir lorsque les neurones afférents primaires présentent une bascule, par laquelle des branches terminales alternées d’un seul neurone sont stimulées, ce qui fait que le potentiel d’action évoqué a deux (ou plus) latences de base qui s’excluent mutuellement20. Lors d’enregistrements de neurones présentant des bascules avec des rapports signal sur bruit élevés, nous avons effectué avec succès un suivi de latence et de seuil électrique en augmentant la largeur de la boîte de recherche pour encapsuler toutes les vitesses de conduction potentielles présentées par le neurone. Cependant, le seuil électrique peut varier en fonction de la branche terminale du neurone excité, ce qui est probablement dû en partie aux différences de distance entre le site de la stimulation électrique et les bornes nociceptrices alternatives. Des travaux supplémentaires sur le processus d’identification des mesures potentielles pour inclure, par exemple, l’appariement des modèles sont réalisables et pourraient être intégrés à ce logiciel. Les plugins GUI pour la filtrée d’arrêt de bande ou la filtration adaptative du bruit pourraient également être utilisés en amont d’APTrack dans la chaîne de signaux s’ils étaient développés.
Nous considérons que le seuil électrique déterminé est le courant nécessaire pour provoquer un potentiel d’action 50% du temps, sur un nombre défini par l’utilisateur de stimuli électriques, généralement 2-10. La morphologie de la stimulation électrique est de 0,5 ms et des impulsions d’ondes carrées positives. Ce n’est pas la même chose que de déterminer la rhéobase, une mesure couramment utilisée de l’excitabilité neuronale. Le plugin pourrait être adapté pour déterminer la rhéobase. Cependant, nous avons poursuivi une mesure plus simple, car les changements dynamiques de l’excitabilité, tels que ceux supposés se produire pendant le chauffage, auraient été plus difficiles à quantifier avec des changements de rhéobase que notre estimation du seuil électrique.
Ce logiciel peut être utilisé dans les expériences humaines et sur les rongeurs. Ceci est rendu possible par un support flexible pour les systèmes de stimulation électrique. Le logiciel fonctionnera avec n’importe quel stimulateur qui accepte une tension de commande analogique ou peut être interfacé manuellement avec un moteur pas à pas. Pour la micronévographie, nous l’avons utilisé avec un stimulateur à courant constant marqué CE qui a été conçu pour être utilisé dans la recherche humaine et dont la stimulation était contrôlée par un cadran. Les stimulateurs qui acceptent les commandes de tension analogiques peuvent être bruyants car ils ne déconnectent pas le circuit entre les stimuli, ce qui signifie que tout bourdonnement ou bruit 50/60 Hz sur l’entrée analogique sera transmis à l’enregistrement. Un stimulateur qui nécessite un signal de déclenchement TLL supplémentaire pour connecter le circuit, permettant de générer un stimulus à un courant analogue à l’entrée de tension analogique, est idéal pour une utilisation avec le plugin. Cela empêche le bruit d’être transmis à l’enregistrement entre les stimuli.
Le logiciel utilise une méthode simple de haut en bas pour estimer le seuil électrique. Cela a été utilisé dans les tests de psychophysique pendant de nombreuses décennies25. Conformément à la méthode haut-bas, l’algorithme de suivi du seuil électrique pour moduler l’amplitude de stimulation ne prend en compte que l’amplitude et la réponse de la stimulation précédente lors du calcul de l’amplitude de la stimulation suivante. Cela signifie que l’amplitude de stimulation oscillera autour du seuil électrique réel, produisant ainsi une cadence de tir de 50%, en supposant que le seuil soit stable. La taille minimale d’un incrément ou d’une décrémentation est de 0,01 V; cela équivaut à 0,01 mA en supposant que le stimulateur a un rapport entrée/sortie de 1 V: 1 mA et une résolution suffisante pour obtenir des changements d’étape aussi petits. Le plugin mettra à jour l’estimation en direct du seuil électrique du potentiel d’action cible chaque fois qu’il atteint une cadence de tir de 50% sur un nombre défini par l’utilisateur de stimuli précédents (2-10). Post hoc, nous recommandons d’utiliser une moyenne mobile de l’amplitude de stimulation sur les 2-10 derniers stimuli pour estimer le seuil électrique, et il convient de noter que cette estimation ne sera précise que lorsque la cadence de tir est relativement stable à 50%. Dans les estimations en direct et post hoc du seuil électrique, il y a un équilibre entre résolution, fiabilité et temps à considérer. L’utilisation d’étapes d’incrément et de décrémentation plus petites augmentera la précision de l’estimation du seuil électrique, mais augmentera le temps nécessaire pour trouver le nouveau seuil électrique initialement et après la perturbation. Le calcul du seuil électrique sur un plus grand nombre de stimuli précédents fournira une meilleure fiabilité, mais augmentera le temps nécessaire pour atteindre une estimation précise.
APTrack a été conçu pour être utilisé dans les enregistrements de nerfs périphériques, en particulier pour suivre les seuils électriques des fibres C lors de perturbations expérimentales et pathologiques sur des périodes où la latence du potentiel d’action peut varier en fonction de l’activité neuronale sous-jacente. Cette méthode permettra d’examiner non seulement l’excitabilité axonale, mais aussi les potentiels générateurs de nocicepteurs chez les volontaires et les patients sains. Nous prévoyons que d’autres domaines de l’électrophysiologie pourraient adopter et adapter cet outil pour une utilisation dans toute expérience nécessitant le suivi du seuil électrique d’une activité verrouillée par stimulus. Par exemple, cela pourrait tout aussi bien être adapté à la stimulation optogénétique avec des impulsions lumineuses entraînées par APTrack. Le plugin est open-source et disponible pour les chercheurs sous licence GPLv3. Il est construit sur la plate-forme Open Ephys, qui est un système d’acquisition de données adaptable, peu coûteux et open source. Le plugin fournit des crochets supplémentaires pour les plugins en aval afin d’extraire les informations sur le potentiel d’action et de fournir des interfaces utilisateur supplémentaires ou des paradigmes adaptatifs. Le plugin fournit une interface utilisateur simple pour la visualisation et le suivi de la latence des potentiels d’action en temps réel. Il peut également lire les données précédentes et les visualiser à l’aide du tracé raster temporel. En outre, il peut également effectuer un suivi de la latence lors de la lecture des données précédentes. Bien qu’il existe d’autres logiciels disponibles pour le suivi de la latence en temps réel, ils ne sont pas open-source et ne peuvent pas effectuer de suivi de seuil électrique26,27. APTrack a un avantage par rapport aux méthodes traditionnelles d’identification des potentiels d’action à latence constante à partir de traces de tension, car il utilise un tracé raster temporel pour la visualisation des données. De plus, nos expériences d’utilisation dans des expériences avec de faibles rapports signal sur bruit ont indiqué que la méthode de visualisation du tracé raster temporel permet d’identifier des potentiels d’action de latence constante qui auraient pu être manqués autrement.
Le suivi du seuil du nerf entier est une méthode largement utilisée pour évaluer l’excitabilité axonale13. Le suivi du seuil électrique mononeuronal dans les fibres C de rongeurs a déjà été utilisé pour quantifier l’excitabilité des nocicepteurs14, et son utilité chez l’homme est reconnue10,11; Cependant, jusqu’à présent, cela n’était pas possible. Nous fournissons un nouvel outil open source pour mesurer directement l’excitabilité d’un seul nocicepteur dans les études électrophysiologiques des rongeurs et des nerfs périphériques humains. APTrack permet pour la première fois le suivi en temps réel, open-source, du seuil électrique des potentiels d’action d’un seul neurone chez l’homme. Nous prévoyons qu’il facilitera les études translationnelles des nocicepteurs entre rongeurs et humains.