La barrière hémato-encéphalique (BHE) est un élément physiologique clé du système nerveux central (SNC), qui maintient les nutriments, élimine les déchets et protège le cerveau des agents pathogènes. Les propriétés barrières inhérentes à la BHE posent un défi pour l’administration de médicaments thérapeutiques dans le SNC pour traiter les maladies neurologiques. L’altération de la fonction BHE a été associée à une maladie neurologique. L’angiopathie amyloïde cérébrale (AAC), le dépôt d’amyloïde dans le système vasculaire cérébral conduisant à une BHE compromise, est une comorbidité dans la plupart des cas de maladie d’Alzheimer (MA), ce qui suggère que le dysfonctionnement ou la dégradation de la BHE peut être impliqué dans la neurodégénérescence. En raison de l’accès limité aux tissus de la BHE humaine, les mécanismes qui contribuent au bon fonctionnement de la BHE et à la dégénérescence de la BHE demeurent inconnus. Pour remédier à ces limitations, nous avons mis au point une BHE dérivée de cellules souches pluripotentes humaines (iBBB) en incorporant des cellules endothéliales, des péricytes et des astrocytes dans une matrice 3D. L’iBBB s’auto-assemble pour récapituler l’anatomie et les interactions cellulaires présentes dans la BHE. L’ensemencement des iBBB avec de l’amyloïde capture les aspects clés de l’ACA. De plus, l’iBBB offre une plate-forme flexible pour moduler les facteurs génétiques et environnementaux impliqués dans les maladies cérébrovasculaires et la neurodégénérescence, afin d’étudier comment la génétique et le mode de vie affectent le risque de maladie. Enfin, l’iBBB peut être utilisé pour le criblage de médicaments et les études de chimie médicinale afin d’optimiser l’administration thérapeutique au SNC. Dans ce protocole, nous décrivons la différenciation des trois types de cellules (cellules endothéliales, péricytes et astrocytes) issues de cellules souches pluripotentes humaines, comment assembler les cellules différenciées dans l’iBBB, et comment modéliser l’AAC in vitro à l’aide de l’amyloïde exogène. Ce modèle permet de relever le défi d’étudier les tissus cérébraux humains vivants avec un système qui a à la fois une fidélité biologique et une flexibilité expérimentale, et permet d’interroger la BHE humaine et son rôle dans la neurodégénérescence.