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Nous avons décrit le processus de coloration par immunohistochimie par fluorescence cyclique multiplexe. La sélection des anticorps primaires est un aspect crucial du test d’immunohistochimie de fluorescence, et les anticorps monoclonaux sont recommandés pour une meilleure spécificité et répétabilité. Pour optimiser la concentration de travail de l’anticorps primaire, une série de dilutions a été testée par des expériences d’immunohistochimie. Les contrôles positifs (pour évaluer l’expression de l’antigène cible) et négatifs (pas d’incubation primaire d’anticorps) sont essentiels et doivent être mis en place.
Dans ce protocole, les anticorps primaires sont dilués et préparés pour un mélange de différentes espèces. Les anticorps secondaires marqués par fluorescence sont également regroupés et incubés de la même manière, dérivés d’espèces différentes. Ainsi, l’étape critique consiste à choisir l’espèce pour différents anticorps primaires en fonction des antigènes, et l’anticorps monoclonal est préféré à l’anticorps polyclonal. Ceux-ci peuvent garantir que la combinaison entre l’anticorps primaire et l’anticorps secondaire est spécifique. Le liquide mélangé doit atteindre la concentration de travail pour les deux anticorps primaires et la réactivité croisée ne doit pas exister simultanément entre les deux anticorps. Si les anticorps primaires sont de la même espèce, un anticorps secondaire est incubé en premier, puis le second. Lors de la détermination de la séquence d’incubation des anticorps primaires dans un panel, la priorité doit être donnée aux anticorps sensibles à la réaction antigène-anticorps, pour les antigènes à faible expression, l’intensité augmenterait lors de la récupération du deuxième épitope. Avant le deuxième cycle d’incubation des anticorps, la répétition du prélèvement d’antigène prend moins de temps (1 min) que la première opération (2 min). L’intensité de fluorescence de la coloration cyclique précédente ne diminuera pas même si les coupes subissent deux fois une récupération induite par la chaleur. Pour éviter l’immunoréactivité non spécifique, les conditions d’incubation doivent être optimisées, y compris la concentration de travail des anticorps, le temps d’incubation et la température ambiante.
Diverses méthodes de récupération d’épitopes ont été développées au cours des dernières décennies, principalement divisées en récupération d’épitopes induite par la chaleur (HIER) et récupération d’épitopes induite par la protéase (PIER). Le chauffage est une méthode efficace de récupération des antigènes qui expose les épitopes de l’antigène, ce qui les rend plus efficacement détectés par les anticorps13. Les deux principales options de récupération de l’antigène sont basées sur le tampon citrate et le tampon EDTA14 à pH élevé. La condition de récupération optimisée est identifiée en fonction de l’antigène cible.
L’autofluorescence peut interférer avec l’imagerie fluorescente sur les coupes causées par des fluorophores endogènes et des réactifs utilisés dans le traitement des tissus15. L’utilisation d’un réactif associé est nécessaire pour l’élution. Les fluorophores sont sélectionnés avec des pics d’émission évitant les pics d’autofluorescence (environ 490 nm)16,17. Sudan Black B et NaBH4 ont été signalés pour l’extinction de l’autofluorescence tissulaire18,19. La combinaison de Sudan Black B et de NaBH4 a réduit le fond de fluorescence dans un tissu rénal ciblé fixé au formol et inclus dans la paraffine20. Dans ce protocole, le traitement tissulaire de KMnO4 à une concentration de 0,15 M/L permet de gagner du temps pendant 1 min. KMnO4 recouvre une couche sur le tissu pour protéger la fluorescence spontanée et réduit la fluorescence de fond, la coloration spécifique de la protéine détectée est plus visualisée.
L’ensemble des lames est scanné dans quatre canaux de filtres différents, l’analyse de l’alignement des images est nécessaire, c’est un grand défi d’aligner la localisation des structures unicellulaires et subcellulaires. Pour les images multispectrales de cette technique, un équipement professionnel d’imagerie optique et un logiciel d’analyse quantitative sont nécessaires pour éviter la diaphonie spectrale. Le coût élevé de l’instrument limite son application. La co-incubation de deux anticorps permet de gagner du temps, surtout lorsqu’il s’agit d’un panel à 6 marqueurs, qui nécessite 3 cycles d’incubation. Cette technique est utilisée pour visualiser une caractérisation plus détaillée des cellules immunitaires dans les microenvironnements immunitaires tumoraux. À l’avenir, la méthode sera appliquée à l’analyse quantitative des structures lymphoïdes tertiaires associées aux tumeurs.
En résumé, l’immunohistochimie par fluorescence cyclique multiplex permet de colorer plusieurs cibles par des fluorophores marqués individuellement sur une seule lame. Ce test permet de mieux comprendre la distribution spatiale des cellules dans le microenvironnement immunitaire tumoral, et la proximité spatiale des cellules immunitaires tumorales contribue au dépistage des patients qui bénéficieront de l’immunothérapie.