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Description de l’ensemble de données et analyse exploratoire
L’ensemble de données se compose de plusieurs sources afin d’améliorer la fiabilité et la précision du modèle. Merged_dataset contient 20 620 images provenant des ensembles de données A (3 054), B (3 264), C (10 000) et D (4 292). De plus, 1 425 images de l’ensemble de données Brad ont été ajoutées pour les grades de tumeurs de gliome (HGG, LGG). Cet ensemble de données diversifié garantira une meilleure généralisation, réduira les biais et améliorera les performances du modèle. Le grand ensemble de données permet des évaluations complètes et, par conséquent, il y a une plus grande probabilité d’obtenir les bonnes prédictions dans les applications réelles des tâches de classification.
Deux ensembles de données distincts ont été utilisés dans cette enquête. Entre 2005 et 2010, le premier a été acquis auprès de l’hôpital Nanfang et de l’hôpital général de l’Université de médecine de Tianjing en Chine. Des images pondérées en T1 de 233 personnes atteintes de tumeurs, ainsi que de gliomes de grade II et III, sont incluses dans la collection. L’ensemble de données offre une distribution très complète des catégories de tumeurs et une analyse générale des données. Pour le gliome de haut grade (HGG), il y a 1 050 images disponibles, et pour le gliome de bas grade (LGG), il y a 375 images, ce qui signifie qu’il y a plus d’attention accordée aux cas plus graves (HGG).
La figure 1 montre des IRM classées en trois types de tumeurs cérébrales. Chaque rangée est un type de tumeur, et il y a trois exemples d’images pour chaque catégorie. Les balayages ont des caractéristiques différentes dans diverses orientations et vues, notamment axiales, sagittales et coronales. Les échantillons de gliome ont des structures irrégulières qui s’infiltrent dans les tissus cérébraux. Les échantillons de méningiome apparaissent sous forme de masses localisées près de la surface du cerveau, et les échantillons de tumeurs hypophysaires sont situés près du centre du cerveau. Ces exemples présentent la variabilité de l’apparence des tumeurs, aidant ainsi à former des modèles ML pour une détection précise ainsi que la classification des tumeurs dans l’analyse d’images médicales.

Figure 1 : IRM des tumeurs. IRM du méningiome, du gliome et des tumeurs hypophysaires en vues axiale, sagittale et coronale, mettant en évidence des caractéristiques d’imagerie distinctes. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
Glioma a le plus grand nombre d’images, soit un peu plus de 6 000. Meningioma a environ 6 000 images, tandis que Pituitary a presque autant d’images que Meningioma. Il semble y avoir une répartition presque égale entre les trois catégories, ce qui signifie que chacun des types de tumeurs est bien représenté pour l’entraînement ou toute analyse. Le gliome a la plus grande taille médiane de fichier, bien que le méningiome ait une plage plus restreinte et plus de valeurs aberrantes. La variance modérée de l’hypophyse contient quelques valeurs aberrantes apparentes. Chaque catégorie contient des fichiers de taille vraiment énorme.
La figure 2 montre l’ACP des caractéristiques de l’image pour les trois types de tumeurs. La composante principale 1 capture la plus grande variance et sépare significativement l’hypophyse (groupe droit) des autres. Les gliomes et les méningiomes se chevauchent sur la gauche, indiquant que leurs représentations de caractéristiques sont comparables et que leur séparabilité est diminuée.

Figure 2 : ACP des caractéristiques de l’image. Analyse en composantes principales des caractéristiques extraites différenciant les classes de gliome, de méningiome et de tumeur hypophysaire. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
La carte thermique de corrélation illustrée à la figure 3 illustre les relations entre les attributs de métadonnées d’image : File_Size, hauteur et largeur. File_Size montre une très faible corrélation avec la hauteur (-0,01) et la largeur (0,0039).

Figure 3 : Carte thermique de corrélation des métadonnées. Carte thermique montrant les relations entre les attributs de métadonnées d’image tels que la taille, la hauteur et la largeur du fichier. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
La hauteur et la largeur montrent également une très faible corrélation positive de 0,0039. Les valeurs diagonales sont 1, ce qui indique une corrélation parfaite de chaque variable avec elle-même. En général, les attributs sont pour la plupart non corrélés, ce qui signifie des variations indépendantes entre la taille du fichier, la hauteur de l’image et la largeur.
Méthodologie et architecture proposée
La figure 4 illustre un flux de travail qui détecte, classe et analyse systématiquement les tumeurs cérébrales sur la base des données d’IRM. La méthodologie comprend des techniques avancées de prétraitement, de segmentation et de DL pour obtenir une prédiction et une classification robustes des tumeurs.

Figure 4 : Flux de travail de la méthodologie proposée. Flux de travail par étapes pour la détection, la classification et l’analyse des tumeurs à l’aide de données IRM. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
Le processus commence par l’intégration d’un certain nombre d’ensembles de données (notés A, B, C et D). Ensuite, les ensembles de données sont combinés en un seul ensemble de données complet pour obtenir des données holistiques. Il implique également le jeu de données Brad à des fins de segmentation, de clustering et de classification d’images. L’ensemble de données fusionné implique l’ajout de toutes les images dans chaque ensemble de données et répertoires combinés, garantissant ainsi un ensemble de données complet et unifié pour une analyse plus approfondie et le développement de modèles multi-classifications.
Deuxièmement, le prétraitement est terminé, ce qui constitue une étape importante dans l’amélioration de la qualité et de la variabilité des données. Neuf processus d’augmentation sont appliqués aux images IRM originales pour améliorer les performances du modèle et la variété des ensembles de données. Le redimensionnement de l’image à une taille commune les harmonise, et la conversion RVB en niveaux de gris simplifie le traitement. Le retournement horizontal/vertical améliore la robustesse et la rotation avec zoom imite différentes conditions d’imagerie. L’utilisation du filtrage Sobel améliore l’acuité des caractéristiques et l’ajout de bruit améliore la variabilité. Le masquage flou améliore l’acuité de l’image, et les décalages de hauteur et de largeur ajoutent des variations de position. Chacun d’entre eux, lorsqu’il est combiné, améliore la généralisabilité et la précision de la classification du modèle. Tous ces éléments garantissent que le modèle se généralise sur un large éventail de situations d’imagerie. Il y a un total de 20 620 images IRM, et le post-prétraitement total des images utilisées pour le développement du modèle donne 185 580 images.
Ensuite, l’ensemble de données fusionné est segmenté à l’aide du modèle U-Net, qui est très utilisé en imagerie médicale. L’architecture est affinée et entraînée pour identifier les régions tumorales à partir d’IRM. Cette étape produit des images masquées, qui mettent en évidence la tumeur et éliminent les détails non pertinents. La segmentation des images garantit de meilleures entrées de données pour la classification et l’analyse.
À l’étape suivante, ces modèles sont affinés pour classer les images en différentes classes, en tirant parti de l’apprentissage par transfert pour améliorer la précision tout en réduisant le temps d’entraînement. Pour la classification, un certain nombre de modèles d’apprentissage profond pré-entraînés sont utilisés, chacun présentant des avantages particuliers. En raison de sa facilité d’utilisation et de son efficacité dans la catégorisation des images, VGG16 et VGG19 sont fréquemment utilisés. Avec une efficacité de calcul optimale, EfficientNetB0 et EfficientNetB7 offrent des performances de pointe. L’architecture plus approfondie de ResNet101 améliore la précision de la classification en capturant efficacement des modèles complexes. Ensuite, un diagnostic précis est assuré par la classification des données IRM par les algorithmes entraînés en quatre classifications tumorales. Les cellules gliales sont à l’origine des tumeurs de gliome, qui altèrent la fonction cérébrale. Les tumeurs du méningiome se développent dans les méninges, qui sont des couches protectrices du cerveau et de la moelle épinière. L’hypophyse est le siège des tumeurs hypophysaires, qui affectent l’équilibre hormonal et les processus physiologiques.
Ensuite, pour aider à un diagnostic précis, des techniques de regroupement telles que K-Nearest Neighbors (KNN) sont utilisées pour prévoir les grades tumoraux. Les grades trois et quatre du gliome de haut grade (HGG) dénotent le développement d’une tumeur sévère. Les grades 1 et 2 du gliome de bas grade (LGG) sont des tumeurs à croissance plus lente et moins agressives, respectivement. Cette classification est essentielle pour établir l’agressivité de la tumeur et, par conséquent, une prise en charge clinique directe.
Enfin, pour évaluer l’efficacité des modèles de catégorisation, ils sont contrastés selon des critères importants. Leurs effets sont évalués pour déterminer si les stratégies d’augmentation et de segmentation ont amélioré les performances du modèle. Pour garantir la fiabilité et l’efficacité, les performances sont également examinées sur une variété d’ensembles de données, et la précision de la classification est comparée aux modèles les plus avancés.
Le flux de travail intègre la préparation des données, le prétraitement, la segmentation, la classification et la notation dans un cadre cohérent. Il améliore la précision de la détection et de la classification des tumeurs cérébrales grâce à l’application de méthodes DL de pointe et à un prétraitement rigoureux. L’inclusion de la classification tumorale soutient davantage la prise de décision clinique, ce qui en fait un système complet d’analyse des tumeurs.

Figure 5 : Cadre d’apprentissage profond. Proposition d’un cadre de classification des tumeurs cérébrales à l’aide de modèles d’apprentissage profond. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
La figure 5 est une architecture en relation avec un système de classification d’images médicales qui identifie les tumeurs cérébrales à l’aide de techniques de calcul avancées telles que l’apprentissage profond. Il commence par une collection d’images IRM qui sont en cours de classification. Ainsi, ce sera l’épine dorsale du processus de classification. Ensuite, les données d’entrée entrent dans un module de prétraitement des données dans lequel la normalisation, le redimensionnement et l’augmentation de l’image, ainsi que la suppression du bruit, sont entrepris. Le prétraitement standardise les images d’entrée pour tirer le meilleur parti des phases d’entraînement du modèle. L’ensemble de l’étape consiste à se préparer à subir les étapes ultérieures de calcul intensif. Après l’étape de prétraitement, les données sont transmises au module d’extraction de caractéristiques. Ici, l’utilisation de techniques ou de modèles informatiques, peut-être de modèles DL tels que les CNN, peut être faite pour identifier des caractéristiques dans les images. Les caractéristiques extraites pourraient inclure des motifs indiquant des anomalies ou des caractéristiques tumorales. Ensuite, cet ensemble de caractéristiques est entré dans le modèle de classification. Étant donné que cela viserait probablement à distinguer différentes classes, qui incluent l’existence ou la non-existence d’une tumeur et le type de tumeur, le modèle s’appuie sur une architecture assez complexe, probablement d’Inception-ResNet-v2, entre autres, pour des prédictions précises. Il détermine si une tumeur existe ou non dans l’image cérébrale scannée. Cette étape de classification se trouve en « Tumeur » et « Pas de tumeur ». Lorsqu’une tumeur est détectée, le système classe le type de tumeur comme gliome, méningiome ou hypophyse. Chacun de ces types possède des caractéristiques que le modèle reconnaît à l’aide des fonctions extraites. Pour les tumeurs identifiées, le grade de la tumeur est alors déterminé. Les grades vont de 1 à 4, indiquant la gravité et la progression de la tumeur. Le grade 1 est le moins agressif, tandis que le grade 4 est le plus grave. Cette classification aide au diagnostic médical et à la planification du traitement. Les résultats finaux comprennent l’absence ou la présence de la tumeur, son type et son grade. Ces résultats sont très précieux pour les applications cliniques pour la prise de décision dans les soins et le traitement des patients.
Le processus représente un pipeline intégré pour l’analyse d’images médicales et la classification des types de tumeurs. Commençant par les données brutes, il se succède par les données préparatoires, l’extraction des caractéristiques et la classification. Le système détermine s’il s’agit bien d’une tumeur, spécifie son type et donne la gravité ou le grade. Ce pipeline, qui utilise des formes de calcul plus complexes, rationalise le diagnostic en imagerie médicale afin que les évaluations puissent être plus rapides et plus précises dans les tumeurs cérébrales. Un flux de travail modulaire garantit la flexibilité, où les composants peuvent être optimisés séparément pour des performances améliorées.