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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Ce protocole décrit l’utilisation de biocapteurs basés sur BRET pour la mesure en temps réel de l’activation de la protéine G dans les cellules vivantes HEK293 lors de la stimulation du ligand du récepteur couplé à la protéine G. Ici, le récepteur β2-adrénergique et le récepteur cannabinoïde de type 1 servent d’exemples pour démontrer l’efficacité des capteurs pour plusieurs sous-types de protéines G et pour divers RCPG.
Les récepteurs couplés aux protéines G (RCPG) constituent la plus grande famille de récepteurs transmembranaires, jouant un rôle crucial dans la signalisation cellulaire en transduisant les stimuli extracellulaires en réponses intracellulaires. L’activation des RCPG conduit à des changements conformationnels qui permettent des interactions avec les protéines G hétérotrimériques. Lors de l’activation, la sous-unité Gα subit un échange GDP-GTP, se dissociant du dimère Gβγ et déclenchant des cascades de signalisation en aval. Pour étudier l’activation de la protéine G médiée par les RCPG, les biocapteurs basés sur le transfert d’énergie par résonance de bioluminescence (BRET) sont une approche très sensible et non invasive. Les capteurs d’activité tricistronique basés sur la protéine G (biocapteurs G-CASE), développés par Schihada et al., détectent la dissociation hétérotrimère comme proxy de l’activation et permettent la surveillance en temps réel de l’activité des RCPG à l’aide d’une transfection plasmidique unique, surmontant ainsi les limites des approches de co-transfection. Les tests BRET offrent plusieurs avantages par rapport aux techniques basées sur la fluorescence, tels qu’un bruit de fond plus faible, un photoblanchiment réduit et une sensibilité améliorée. Dans ce protocole, les biocapteurs G-CASE basés sur BRET ont été utilisés dans des cellules vivantes et des plaques à 96 puits. Plus précisément, nous évaluons l’activité du récepteur β2-adrénergique (β2-AR) et du récepteur cannabinoïde de type 1 (CB1R) en termes d’activation de la protéine G. En utilisant des cellules de type sauvage HEK 293T transfectées transitoirement avec des cellules β2-AR et des cellules HEK293T exprimant de manière stable CB1R, la robustesse des biocapteurs Gs et Gi3 G-CASE est confirmée. Ce protocole soutient l’utilité de cette approche pour les études pharmacologiques et le criblage des RCPG à haut débit afin de mieux comprendre la capacité des ligands à activer des voies spécifiques, par exemple, via une signalisation biaisée et ainsi, facilitant la découverte de nouveaux composés thérapeutiques.
Les récepteurs couplés aux protéines G (RCPG) représentent la plus grande superfamille de récepteurs transmembranaires, responsables de la transduction des stimuli extracellulaires en cascades de signalisation intracellulaires entraînant des réponses biologiques spécifiques. Il s’agit de cibles pharmacologiques pivots, avec environ 30 % des médicaments commercialisés agissant sur les RCPG1. La liaison du ligand GPCR induit des changements conformationnels dans le récepteur, facilitant les interactions avec les protéines G hétérotrimériques et/ou les kinases GPCR (GRK) et les β-arrestines, initiant ainsi la signalisation en aval ou l’internalisation du récepteur2.
Les protéines G hétérotrimériques servent de transducteurs intracellulaires primaires de la signalisation GPCR et se composent de trois sous-unités : Gα, Gβ et Gγ. Ces hétérotrimères sont classés en quatre familles - Gi/o, Gs, Gq et G12/13 - en fonction du sous-type Gα , chacun activant des voies de signalisation distinctes : le sous-type Gi/o inhibe l’adénylate cyclase tandis que Gs la stimule, Gq active la phospholipase C-β et G12/13 régule les GTPases de la famille Rho.
L’activation des RCPG conduit à leurs réarrangements conformationnels, permettant un engagement rapide de la protéine G dans une cinétique inférieure à la seconde. Ce processus induit des changements conformationnels de la protéine G, favorisant l’échange GDP-GTP dans la sous-unité Gα. La liaison GTP modifie davantage la conformation de la sous-unité Gα, entraînant sa dissociation du dimère Gβγ, permettant la propagation du signal. Les protéines G sont donc cruciales dans la modulation de la spécificité et de la dynamique temporelle des réponses cellulaires en régulant diverses protéines effectrices telles que l’adénylate cyclase ou les canaux ioniques 3,4,5.
Ce protocole décrit la mesure de l’activation ou de l’inactivation de la protéine G à l’aide de biocapteurs basés sur le transfert d’énergie par résonance de bioluminescence (BRET) lors de la stimulation de ligands GPCR dans des cellules vivantes. Inspiré par des travaux pionniers sur les biocapteurs de protéines G 6,7,8,9, le système G-CASE (G protein tri-cistronic activity sensors), introduit par Schihada et al.10, est basé sur BRET entre les sous-unités Gα et Gβγ marquées et offre une approche rationalisée ne nécessitant qu’une seule transfection plasmidique. Cette caractéristique améliore la sensibilité et atténue les défis associés à la co-transfection de plusieurs plasmides codant pour les trois sous-unités (Gα, Gβ et Gγ) de la protéine G hétérotrimérique. Ces capteurs ont été mis à la disposition de groupes de recherche académiques à des fins commerciales (voir Table des matériaux).
BRET offre des avantages significatifs par rapport au transfert d’énergie de résonance de Förster (FRET). Dans BRET, le transfert d’énergie se produit entre un donneur bioluminescent et un accepteur fluorescent sans avoir besoin de sources lumineuses externes. Cette bioluminescence intrinsèque réduit les problèmes associés à la FRET, tels que l’autofluorescence et la diffusion de la lumière, ce qui se traduit par un signal de fond plus faible et une sensibilité de test améliorée 6,7,11.
Cette absence d’excitation externe dans BRET minimise le photoblanchiment et les effets phototoxiques, ce qui entraîne des signaux de fond plus faibles par rapport au FRET. Par conséquent, les tests BRET présentent le plus souvent une sensibilité accrue, permettant de mesurer l’activation de la protéine G des RCPG constitutivement actifs. La sensibilité accrue des tests BRET facilite la détection d’interactions biologiques subtiles, ce qui est particulièrement précieux dans les études pharmacologiques où une mesure précise de l’activité du récepteur est cruciale.
Ces biocapteurs peuvent être traduits en criblage à haut débit dans des plaques de 96 puits ou de 384 puits, comme l’ont récemment démontré Scott-Dennis et al., où une méthode utilisant ces biocapteurs a été développée dans un test membranaire à 384 puits pour analyser l’activité des récepteurs cannabinoïdes CB1R et CB2R12. Cet article décrit l’utilisation de ces biocapteurs dans des plaques à 96 puits dans des cellules vivantes en mesurant l’activité du β2-AR en tant que RCPG prototypique de classe A, qui se lie à la protéine Gs et le CB1R qui appartient aux RCPG de classe A et active la protéine de la famille Gi/o . L’utilisation de deux biocapteurs G-CASE est validée : Gs et Gi3 dans les cellules HEK 293T avec le RCPG soit de manière transitoire (avec le β2-AR), soit exprimée de manière stable (avec le CB1R).
Il est important de noter que cette expérience peut être réalisée dans différentes lignées cellulaires, démontrant la polyvalence et la robustesse de cette technique dans divers contextes cellulaires. Cela garantit que la méthode peut être appliquée à divers modèles expérimentaux, ce qui en fait un outil précieux pour étudier la signalisation des RCPG dans différents contextes physiologiques et pharmacologiques. La figure 1 illustre le principe des capteurs d’activité de la protéine G basés sur BRET.

Figure 1 : Principe des capteurs d’activité de la protéine G basés sur BRET. Les capteurs de protéines G sont constitués de trois sous-unités : Gα, Gβ natif et Gγ. La sous-unité Gα est fusionnée à la petite et brillante NanoLuciférase (Nluc), tandis que la sous-unité Gγ est marquée N-terminalement avec Vénus permutée circulairement (cpVenus173). Les gènes codant pour ces sous-unités de la protéine G modifiées sont combinés en un seul plasmide. La liaison des ligands aux RCPG induit des changements conformationnels des RCPG, favorisant le recrutement de la protéine G et la dissociation ultérieure suivie d’une hydrolyse des RCP. Cette dissociation perturbe le transfert d’énergie entre les partenaires, ce qui entraîne une diminution du signal BRET. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
Les réactifs et l’équipement utilisés dans cette étude sont énumérés dans la table des matériaux.
1. Ensemencement en bonne couche (Jour 1)
REMARQUE : Suivez tous les protocoles de culture cellulaire dans une hotte à flux laminaire stérile pour maintenir des conditions stériles. Des plaques à puits blancs à fond plat transparent sont utilisées pour suivre la croissance et la viabilité des cellules. Utilisez la plaque de puits entièrement blanche pour éviter d’utiliser un autocollant à l’étape 3.2.1.
2. Transfection plasmidique (jour 2)
REMARQUE : La transfection des cellules peut être effectuée le premier jour sur les cellules suspendues avant le placage, lors de l’étape 1.2.7 et l’acquisition des données le 3e jour.
3. Acquisition des données (Jour 3)
4. Analyse des données
REMARQUE : Collectez les données de chaque lecture dans des fichiers de tableur de données distincts.




Figure 2 : Étapes clés de la réalisation du test BRET. Vue d’ensemble des trois principales étapes expérimentales décrites dans ce protocole (ensemencement cellulaire, transfection cellulaire et acquisition du signal BRET) et guide détaillé par étape pour l’acquisition des données. Dispositif expérimental : Le jour 1, les cellules sont ensemencées dans une plaque blanche de 96 puits pré-enduite de PLL avec un fond plat et transparent à une densité de 30 000 cellules/puits. Le jour 2, les cellules sont transfectées avec le capteur de protéine G sélectionné avec les plasmides GPCR ou pcDNA3.1 étudiés. Après 24 h d’incubation, l’activité du capteur de protéine G est mesurée par des lectures de bioluminescence et de fluorescence lors de l’ajout de ligand. Acquisition des données : Après le lavage HBSS des cellules, 80 μL de HBSS sont ajoutés dans les puits, et l’émission de fluorescence de cpVenus173 est mesurée entre 500 nm et 600 nm à l’aide d’un monochromateur 535/30 nm (1). Ensuite, la bioluminescence de Nluc est mesurée entre 400 nm et 600 nm à l’aide d’un monochromateur 450/40 nm, avant (2) et après (3) l’ajout de furimazine. Enfin, le signal BRET pour l’activité des protéines G induites par le basus et le ligand est mesuré à l’aide de monochromateurs 450/40 nm et 535/30 nm, respectivement, sur 3 min (3 cycles de 60 s avec un intervalle de mesure de 0,30 s) (4) et 16 min (16 cycles de 60 s avec un intervalle de mesure de 0,30 s) (5). Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
Un schéma généralisé de la configuration et de l’exécution de l’expérience est détaillé à la figure 2. L’activation des protéines de la famille Gs ou Gi/o suite à l’activation ligand de deux RCPG a été évaluée à l’aide des biocapteurs G-CASE. Tout d’abord, une famille prototypique de RCPG A a été étudiée, le β2-AR transfecté transitoirement dans les cellules HEK 293T. Lorsqu’un agoniste (c’est-à-dire l’isoprotérénol) a été appliqué à des cellules HEK wt exprimant le β2-AR avec le capteur de protéine Gs(court)-CASE, une diminution dépendante de la concentration du signal BRET a été observée, indiquant l’activation de la protéine Gs (Figure 3B). Les valeurs de ΔBRET diminuaient avec la concentration du ligand jusqu’à ce que la saturation soit atteinte, avec un plateau observé environ 5 minutes après la stimulation du ligand. En revanche, les cellules HEK wt transfectées avec le plasmide pcDNA3.1 vide et le capteur de protéine Gs(court)-CASE ont présenté une réponse inverse mais faible et non significative à la stimulation à l’isoprotérénol (Figure 3B). Dans ce protocole, les valeurs obtenues après 15 min de stimulation par ligand sont tracées. Pour garantir la cohérence des résultats et l’indépendance vis-à-vis de la sélection temporelle, d’autres points temporels doivent être testés, afin de s’assurer que l’équilibre a été atteint. De plus, pour comparer les résultats de différentes expériences, la sélection temporelle doit être ajustée en fonction de la cinétique d’activation de chaque expérience.
Pour générer les courbes dose-réponse sigmoïdales illustrées à la figure 3C, les valeurs de ΔBRET mesurées 15 min après la stimulation (lorsque le plateau est stabilisé) ont été tracées en fonction des différentes concentrations de ligands. L’EC50 observée (9,4 nM ± 2,1 nM) se situe dans la gamme des valeurs du Kd connu du récepteur pour l’isoprotérénol (13 nM ± 6 nM)13,14 (figures 3C,D). Ces résultats démontrent l’efficacité des capteurs G-CASE dans l’évaluation de l’activation de la protéine G avec une réponse observée spécifiquement associée à la présence du β2-AR.

Figure 3 : Évaluation du capteurde protéine G s dans les cellules HEK wt. Lectures cinétiques de ΔBRET lors de l’ajout de l’agoniste isoprotérénol à des cellules HEK wt transfectées avecle capteur de protéine G s et β2-AR (A) ou pcDNA3.1 (B). (C) Courbes dose-réponse obtenues en ajustant les valeurs ΔBRET ( %) après 15 minutes de stimulation de ligand à des concentrations de ligands variables. (D) Comparaison des valeurs maximales de ΔBRET entre les cellules transfectées témoins pcDNA3.1 et β2-AR stimulées avec de l’isoprotérénol. La différence statistique par rapport à l’état de l’ADNpc3.1 a été testée à l’aide d’un test de Mann-Whitney non paramétrique (**p < 0,01). Les données montrent la moyenne ± MEB de trois expériences indépendantes réalisées en double. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
Deuxièmement, les biocapteurs ont été testés dans des cellules HEK CB1, une lignée cellulaire HEK 293T exprimant de manière stable le CB1R. Ces cellules ont été transfectées transitoirement avec le capteur de protéine Gi3-CASE. La stimulation avec l’agoniste CB1R WIN-55,212-2 a induit un signal ΔBRET dépendant de la concentration, indiquant l’activation de la voie Gi3 (Figure 4A). En revanche, les cellules HEK wt transfectées avec le capteur de protéine Gi3-CASE et stimulées dans les mêmes conditions n’ont montré aucune réponse, confirmant la spécificité de l’activation de CB1R (Figure 4B). Un plateau a été atteint environ 5 minutes après l’activation du ligand. La courbe dose-réponse correspondante a mis en évidence la réponse ΔBRET dépendante de la concentration induite par la stimulation de WIN-55,212-2 dans les cellules HEK-CB1, alors qu’aucune réponse de ce type n’a été observée dans les cellules HEK wt (Figure 4C). L’EC50 observée (112 nM ± 25 nM) se situe dans la gamme des valeurs de l’EC50 connue du récepteur pour WIN-55,212-2 (354 nM ± 62 nM)15 (figures 4C, D). Enfin, une comparaison des valeurs de ΔBRET obtenues 15 min lors de la stimulation agoniste avec 10 μM de WIN-55,212-2 dans les cellules HEK CB1 et HEK wt illustre l’activation dépendante de CB1R de la voie de signalisation Gi3 (Figure 4D).

Figure 4 : Évaluation du capteur de protéine Gi3 dans les cellules HEK CB1. Lectures cinétiques de ΔBRET lors de l’ajout de l’agoniste WIN-55,212-2 aux cellules HEK CB1 (A) ou HEK wt (B). Courbes dose-réponse obtenues en ajustant les valeurs ΔBRET ( %) après 15 min de stimulation du ligand en fonction de la concentration du ligand (C). Comparaison des valeurs maximales de ΔBRET entre les cellules témoins HEK wt et HEK CB1 stimulées avec WIN-55.212-2 (D). La différence statistique par rapport à l’état HEK wt a été testée à l’aide d’un test de Mann-Whitney non paramétrique (****p < 0,0001). Les données montrent la moyenne ± MEB de cinq expériences indépendantes réalisées en double. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
Les auteurs n’ont rien à divulguer.
Ce protocole décrit l’utilisation de biocapteurs basés sur BRET pour la mesure en temps réel de l’activation de la protéine G dans les cellules vivantes HEK293 lors de la stimulation du ligand du récepteur couplé à la protéine G. Ici, le récepteur β2-adrénergique et le récepteur cannabinoïde de type 1 servent d’exemples pour démontrer l’efficacité des capteurs pour plusieurs sous-types de protéines G et pour divers RCPG.
Les cellules HEK-CB1 ont été un cadeau de M. Guzman (Université Complutense, Madrid, Espagne), et le plasmide du récepteur β2-adrénergique a été un cadeau de D. Perrais (IINS, Institut interdisciplinaire de neurosciences, Bordeaux, France). Gi3-CASE et Gs(court)-CASE étaient un cadeau de Gunnar Schulte (plasmide Addgene # 168122 ; Addgene plasmide # 168124). Certaines des illustrations ont été créées à l’aide de BioRender.com. Ces travaux sont soutenus par le Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche et financés par l’Agence nationale de la recherche (ANR) PolyFADO (ANR-21-CE44-0019), AlzCaBan (ANR-24-CE44-4647) et SCHIZOLIP (ANR-22-CE44-0034).
| Plaque de culture avancée à 96 puits, blanche avec fond plat transparent, avec couvercle, Greiner bio-one | Dutscher | 655983 | |
| Film blanc BrightMax ClearLine | Dutscher | 760245 | |
| ClarioSTAR LVF | BMG Labtech | ||
| Diméthylsulfoxyde (DMSO) | Sigma | D4540 | |
| DPBS modifié, sans chlorure de calcium ni chlorure de magnésium, liquide, filtré stérile, adapté à la cellule | Sigma  ; | D8537 | |
| Dulbecco » s modifié Eagle' s medium (DMEM) GlutaMAX | Sigma | D0822 | Il fait chaud à 37 °C Bain marie en C avant utilisation |
| Sérum fœtal bovin (FBS) | Sigma  ; | F9665 | |
| Galphai3-Nluc-Gbeta1-Ggamma2-Vénus | Addgene | 168122 | https://www.addgene.org/Gunnar_Schulte/ Don de Gunnar Schulte |
| Galphas (isoforme courte)-Nluc-Gbeta3-Ggamma1-Vénus | Addgene | 168124 | https://www.addgene.org/Gunnar_Schulte/ Don de Gunnar Schulte |
| HEK-293T exprimant de manière stable CB1R (HEK CB1) | Cadeau généreux de M. Guzman (Université Complutense, Madrid, Espagne) | ||
| HEK-293T de type sauvage (HEK wt) | |||
| Isoprotérénol | Sigma | I6504 | Solubilisé dans H20 et stocké à &ndash ; 20 & degrés C |
| Lipofectamine 2000 | Invitrogen  ; | 11668019 | |
| Opti-MEM I complément sérique réduit medium GlutaMAX | Fischer | 11564506 | |
| pcDNA3 Flag tag bêta-2-récepteur adrénergique FLAG C-ter | Généreux don de D. Perrais (IINS, Bordeaux) | ||
| pcDNA3.1-(vide)-TAG | Addgene | 138209 | |
| Pénicilline/streptomycine | Sigma  ; | P4333 | |
| Solution de poly-L-lysine (PLL) | Sigma | RNBL7086 | |
| Trypsine-EDTA & nbsp ; | Sigma  ; | T3924 | |
| VICTOIRE : 55 212-2 | Cayman Chemicals | 10009023 | Solubilisé dans le DMSO et stocké à &ndash ; 20 & degrés C |