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L’étude des maladies du système nerveux central (SNC) est notoirement difficile en raison de la signalisation intercellulaire complexe et multimodale médiée par le liquide interstitiel (ISF)1,2,3,4. Cette complexité est particulièrement marquée dans les tumeurs cérébrales, telles que le glioblastome (GBM), où des signaux intercellulaires sont transmis entre les cellules néoplasiques etstromales 5,6,7,8,9. Dans de nombreux cas, l’échange aberrant de biomolécules diverses, y compris les métabolites et les messagers protéés, contribue à l’étiologie sous-jacente des pathologies du SNC. Ce défi d’investigation est aggravé, notamment dans la GBM, par le fait que la composition moléculaire de l’ISF est dynamique temporellement et évolue tout au long de la progression de la maladie ainsi qu’en réponse aux traitementsinterventionnels 10,11.
Les méthodes traditionnelles d’investigation préclinique de la GBM incluent des études in vitro et des modèles animaux à un seul objectif. La nature de ces approches limite leur applicabilité clinique plus large en raison de leur incapacité à saisir à la fois les caractéristiques du microenvironnement tumoral et les changements temporels longitudinaux. Les avancées réalisées au début des années 1980 ont surmonté ces limites contextuelles avec le développement de la microdialyse intracérébrale (cMD)12,13,14,15. Depuis sa création il y a 45 ans, la cMD s’est imposée comme la méthode standard pour l’échantillonnage longitudinal du liquide interstitiel (ISF) dans le cerveauvivant 16. Cela est réalisé par la diffusion libre et la convection de solutés ISF à haute concentration à travers une membrane semi-perméable dans un liquide céphalorachidien (aCSF)17, généralement artificiel, à faible concentration de solutés, perfusé en continu et à faible concentration de solutés17. Ces membranes semi-perméables sont composées de divers polymères biocompatibles avec des coupures de taille de pores de poids moléculaire courantes allant de 20 kDa à 3MDa 18. Cette procédure peu invasive permet la collecte longitudinale in situ d’une grande variété d’analytes, allant de petites molécules, telles que des métabolites ou des neurotransmetteurs, jusqu’à de grandes protéines, telles que les anticorps. Cependant, la porosité structurelle des membranes de cMD, couplée à la nature adsorptive de ses polymères compositionnels, peut avoir un impact significatif sur la récupération relative des analytes présentant des caractéristiques biochimiques ou dimensionnelles particulières, telles que les lipides ou les anticorps, respectivement19,20.
Les avancées pour surmonter cette limitation des membranes cMD ont commencé au début des années 2010 avec le développement de la microperfusion cérébrale à flux ouvert (cOFM)21. Fonctionnant selon des principes généraux similaires à ceux de la cMD, la cOFM élimine les limitations biochimiques imposées par les membranes semi-perméables en les remplaçant contre une sonde en réseau plastique avec des ouvertures macroscopiques à faible adsorption d’environ 100 μm de taille20. De nombreux rapports ont démontré l’utilité accrue de la cOFM par rapport à la cMD grâce à la collecte de composants détectables de l’ISF, notamment les hormones peptidiques, les nanocorps/anticorps, les petites thérapies lipophiles et les liposomesPEGylés 19,22,23,24,25. Des rapports antérieurs examinant la réaction physiologique des tissus à l’implantation de la sonde guide cOFM montrent que l’intégrité de la barrière hémato-encéphalique est rétablie 15 jours après l’implantation, et qu’aucune cicatrice gliale ne se forme jusqu’à 30 jours aprèsl’implantation 26. Grâce au remplacement des membranes de microdialyse par des ouvertures macroscopiques, les chercheurs ont également démontré la capacité innovante des sondes guides cOFM à faciliter l’injection de cellules de gliome xénogreffées dans le cerveau de rats immunodéficients, de sorte que l’implantation et la croissance tumorales atraumatiques se produisent directement autour de la zone d’échantillonnage27 de cOFM.
Les considérations concernant l’utilisation de la cOFM dans l’étude des pathologies du SNC doivent néanmoins reconnaître ses limites méthodologiques. En raison de sa dépendance à la diffusion passive et à la convection des analytes ISF en un perfusat en flux, ces limitations concernent la concentration d’analytes et le volumed’échantillon 18. Les composants de l’ISF échantillonnés seront dilués dans le perfusate cOFM collecté par rapport aux niveaux endogènes, ce qui conduit de nombreuses recherches à comparer les rapports relatifs d’analytes entre les conditionsexpérimentales 28. Les débits typiques varient de 0,1 μL/min à 1,0 μL/min, ce qui équivaut à seulement 6 μL/h à 60 μL/h. En tenant compte des temps de dégagement des espaces morts des tubes, la durée totale d’échantillonnage doit également être prise en compte. Cela est particulièrement important lors de la réalisation de collectes de cOFM chez des animaux anesthésiés, où les préoccupations liées au bien-être animal doivent être prises en compte avec soin. Une description plus détaillée de ces considérations et d’autres est disponible dans un rapport de méthodes précédent de l’équipe de développement decOFM 29.
Dans ce manuscrit, nous fournissons un protocole mis à jour pour l’utilisation de l’échantillonnage longitudinal de cOFM dans l’étude des maladies neurologiques, avec un accent particulier sur la GBM. Le protocole comprend des étapes pour l’implantation de canules guidant cOFM, l’injection de cellules tumorales et l’engraftement via le guide cOFM, ainsi que deux configurations d’échantillonnage cOFM chez des animaux éveillés en mouvement libre. Nous présentons des données représentatives démontrant les effets du traitement sur les composants métabolomiques et protéomiques de l’ISF mesurés par cOFM, l’impact de la configuration de l’échantillonnage sur les concentrations d’analytes, et l’efficacité de l’implantation de cellules tumorales guidées par cOFM.