Nous décrivons une technique de mesure de l’intégrité de la barrière intestinale, dans laquelle le taux de translocation d’un sucre marqué par fluorescence de taille connue reflète la perméabilité des coloïdes intestinaux humains dérivés de tissus.
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Article de méthode
Nous décrivons une technique de mesure de l’intégrité de la barrière intestinale, dans laquelle le taux de translocation d’un sucre marqué par fluorescence de taille connue reflète la perméabilité des coloïdes intestinaux humains dérivés de tissus.
La barrière intestinale est un site critique de régulation entre les antigènes luminaux et le système immunitaire de l’hôte, et sa dérégulation est impliquée dans de multiples maladies gastro-intestinales. Les organoïdes intestinaux peuvent être un outil utile pour comprendre et modéliser les différences dans l’intégrité de la barrière intestinale. Ici, nous décrivons un protocole qui utilise des colonoïdes humains pour quantifier les différences fonctionnelles de la barrière intestinale en mesurant le flux de traceurs fluorescents à travers les monocouches d’organoïdes. Après avoir fait croître les monocouches jusqu’à la confluence, nous ajoutons un traceur fluorescent, tel que le FITC-dextran, à la chambre apicale et détectons sa translocation dans la chambre basolatérale au fil du temps. L’augmentation de la translocation du traceur fluorescent reflète une barrière épithéliale plus perméable ou plus faible. Ce protocole est une plateforme adaptable qui permet d’évaluer les différences fonctionnelles de la barrière intestinale dans plusieurs conditions en parallèle. En utilisant des variantes de ce protocole, on peut évaluer la perméabilité transépithéliale à des molécules de taille, de forme et de structure chimique variées, ainsi que les différences de perméabilité dans le contexte de traitements isolés ou de changements microenvironnementaux sur les côtés apical ou basolatéral des cellules épithéliales. Cela permet une compréhension plus approfondie du mécanisme et du traitement de la rupture de la barrière dans les états pathologiques.
La muqueuse intestinale est une structure complexe qui joue un rôle important dans la régulation du contact entre les métabolites, les antigènes et les microbes dans la lumière intestinale et le système immunitaire et la circulation entérique. Les cellules épithéliales intestinales sont un élément clé de ce système et, dans des conditions saines, forment une barrière hautement sélective. Le transport à travers l’épithélium peut se faire par de multiples mécanismes : transport actif ou passif transcellulaire, pores paracellulaires ou voies de fuite régulées par des jonctions serrées et des jonctions adhérentes. La question de savoir si l’une de ces voies peut être utilisée par une molécule pour se déplacer à travers l’épithélium est déterminée par l’hydrophobie, la taille et la structure chimique. Une fois à travers l’épithélium, ces molécules peuvent interagir plus facilement avec les cellules immunitaires de la muqueuse et pénétrer dans la circulation sanguine ou lymphatique de l’intestin 1,2 La perturbation de la barrière intestinale est une caractéristique de plusieurs maladies gastro-intestinales inflammatoires, telles que les maladies inflammatoires de l’intestin et la maladie cœliaque 1,3,4,5,6,7. On pense que cette barrière intestinale affaiblie joue un rôle dans la physiopathologie de ces processus pathologiques par le biais d’une translocation dérégulée d’antigènes pathogènes, qui peuvent alors créer une réponse inflammatoire locale ou systémique.
Il existe plusieurs protocoles établis pour mesurer la barrière intestinale. Les études in vitro utilisent traditionnellement des lignées cellulaires cancéreuses, telles que les cellules T84 ou Caco-2, pour mesurer la résistance électrique transépithéliale (TEER) et quantifier les composants des jonctions serrées et des jonctions adhérentes8. Ex vivo, des mesures du courant transépithélial peuvent être prises à l’aide de chambres d’Ussing sur biopsie ou d’échantillons d’intestin réséqués9. Les études in vivo consistent généralement à administrer des traceurs inertes par voie orale, puis à mesurer l’absorption de ces traceurs dans le sang ou l’urine10,11. Bien que ces techniques se soient avérées utiles dans l’étude de la barrière intestinale, elles présentent plusieurs limites : les lignées cellulaires immortelles transformées présentent intrinsèquement des changements métaboliques et cytosquelettiques qui affectent la barrière intestinale de manière mal définie ; l’accès aux patients, aux échantillons de patients ou aux organismes modèles peut être limité ; Les études in vivo sont difficiles à contrôler pour les facteurs de confusion ou à tirer des conclusions au niveau moléculaire. Ainsi, bien que des preuves de cette rupture de la barrière aient été rapportées dans de multiples modèles de maladies, la compréhension du mécanisme de ces défauts de la barrière intestinale reste limitée, et notre capacité à cibler et à traiter cet aspect des maladies gastro-intestinales est restée insaisissable.
Les organoïdes intestinaux humains offrent une capacité unique et passionnante d’élucider la cause et le traitement des défauts de la barrière intestinale. Les organoïdes intestinaux humains dérivés de tissus sont des cultures de cellules cellulaires primaires dérivées de cellules souches adultes situées à la base des cryptes intestinales12. Ces cellules peuvent être isolées à partir d’une biopsie ou d’échantillons chirurgicaux et mises en culture pour maintenir les changements génétiques et épigénétiques observés chez les patients dont elles sont dérivées 13,14,15. Ils servent de modèle plus pertinent sur le plan physiologique que les lignées cellulaires immortelles traditionnelles, car ils n’ont pas les changements métaboliques des lignées cellulaires cancéreuses et peuvent être différenciés en différents types de cellules présents dans l’épithélium intestinal mature 16,17,18. De plus, parce qu’ils peuvent être développés in vitro, ils sont plus accessibles et utiles pour des études contrôlées de l’effet cellulaire de divers traitements et conditions de croissance en parallèle. Bien qu’il existe également des limites inhérentes aux modèles d’organoïdes intestinaux, notamment l’absence d’autres types de cellules non épithéliales et le contexte du système du corps entier, il a été démontré que les organoïdes intestinaux humains fournissent un modèle fiable pour de multiples aspects des maladies gastro-intestinales13.
Parmi ceux-ci, il a été démontré que les organoïdes intestinaux modélisent étroitement les défauts de la barrière intestinale, démontrant les changements attendus dans l’organisation des jonctions serrées et la TEER dans le cadre d’agressions de barrière 19,20,21. Ici, nous adaptons une technique d’évaluation de l’intégrité de la barrière dans les coloïdes humains, dans laquelle le flux de molécules marquées par fluorescence à travers des monocouches d’organoïdes est détecté22. Dans ce protocole, les organoïdes sont cultivés et mûris en monocouches bidimensionnelles polarisées sur des membranes semi-perméables. Le dosage implique l’ajout d’un traceur fluorescent à la surface apicale de la monocouche épithéliale, et sa présence sur le côté opposé est quantifiée dans le temps. L’augmentation du flux du traceur est le reflet d’un épithélium plus perméable ou plus perméable. Ce test fournit une lecture de barrière fonctionnelle, qui peut s’ajouter aux évaluations de la structure des jonctions serrées et adhérentes. De plus, bien que les mesures TEER soient souvent utilisées pour fournir une évaluation de base de l’intégrité de la barrière, le test de flux décrit ici peut être adapté pour détecter la perméabilité de molécules de différentes classes, charges et tailles, caractérisant ainsi la barrière de manière beaucoup plus détaillée. Plusieurs traceurs fluorescents disponibles dans le commerce peuvent être utilisés à cette fin. De plus, grâce à l’utilisation de spectres fluorescents non chevauchants, la perméabilité à plusieurs traceurs peut être évaluée simultanément. De plus, la configuration monocouche de ce test permet d’évaluer la réponse barrière aux conditions de croissance appliquées spécifiquement à la surface apicale ou basolatérale des cellules uniquement. Grâce à cela, une évaluation contrôlée de l’effet des traitements, des changements microenvironnementaux et des conditions de co-culture est possible.
On sait que les défauts de la barrière intestinale jouent un rôle pathogène important dans le développement de plusieurs maladies gastro-intestinales, mais le terme « intestin perméable » est de plus en plus utilisé dans les médias populaires sans précision. Cela souligne la nécessité de modèles améliorés pour évaluer et caractériser la barrière intestinale. Le système décrit utilise des monocouches d’organoïdes intestinaux physiologiques dérivés de tissus humains pour évaluer l’intégrité de la barrière fonctionnelle dans des conditions contrôlées.
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Tous les échantillons ont été acquis et utilisés conformément à un protocole approuvé par l’Institutional Review Board (IRB) de l’Université du Colorado, numéro de protocole 14-2012.
REMARQUE : Toutes les procédures des étapes 1 à 3 doivent être effectuées dans une enceinte de biosécurité stérile avec une technique stérile. Un schéma du protocole est présenté à la figure 1.
1. Établissement de colonoïdes humains à partir de cultures congelées
REMARQUE : Assurez-vous que tous les matériaux sont prêts dans l’enceinte de biosécurité avant de décongeler les cellules afin de minimiser l’exposition des organoïdes décongelés au milieu de congélation. Le protocole commence avec des colonoïdes humains cryoconservés dérivés de tissus. Des protocoles de dérivation et de cryoconservation de colonoïdes humains ont été décrits précédemment24.
2. Passage et expansion des colonoïdes humains
3. Génération de monocouches de coloïdes humains
4. Mesure de la résistance électrique transépithéliale (TEER) et de la maturation monocouche
5. Dosage du flux FITC-dextran
REMARQUE : Ce protocole utilise FITC-dextran 4 kDa (rayon de Stokes 14 Å). Cependant, en fonction des besoins expérimentaux, des traceurs fluorescents de différentes tailles, charges et fluorophores peuvent être utilisés22. Plusieurs traceurs peuvent également être utilisés en même temps, auquel cas il faut confirmer que les spectres d’excitation et de fluorescence d’émission ne se chevauchent pas. Il est suggéré d’effectuer les étapes 5.1 à 5.3 dans une armoire chauffante (incubateur non humidifié, sans CO2 ) réglée à 37 °C. Si ce n’est pas le cas, les réactifs doivent être chauffés à 37 °C avant d’être utilisés, et les cellules, les tampons et les échantillons collectés doivent être conservés à 37 °C pendant les temps d’incubation.
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À l’aide de ce protocole, la perméabilité des colonoïdes humains sains en présence et en l’absence de signalisation inflammatoire a été analysée. Il a été démontré précédemment que l’ajout d’un mélange de cytokines inflammatoires, appelé cytomix, qui comprend de l’IFNγ, du TNFα et de l’IL-1β (chacun à 10 ng/ml), induit un dysfonctionnement de la barrière intestinale tel que mesuré par TEER dans des modèles de cellules épithéliales intestinales20,27. Nous avons ch...
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Il s’agit d’un protocole permettant d’évaluer la barrière intestinale dans le modèle physiologiquement représentatif des monocouches coloïdes humaines. Le test de flux de traceur fluorescent décrit ici fournit des informations sur l’intégrité fonctionnelle de la barrière au-delà de ce qui est glané avec d’autres types de tests de barrière, tels que TEER, les mesures en chambre d’Ussing ou l’évaluation de l’expression des protéines de jonction serrée. De plus, l’utilisation de modèles d’o...
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Il n’y a pas de divulgations ou de conflits d’intérêts.
Le Dr Sean Colgan est financé par les subventions des NIH DK1047893, DK50189, DK095491, DK103639 et VA Merit BX002182.
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| Nom | Entreprise | Numéro de catalogue | Commentaires |
|---|---|---|---|
| Tubes à centrifuger coniques de 15 mL | Celltreat | 229411 | |
| Flacon cryogénique à filetage interne de 2 ml. | Corning | 430488 | |
| Tubes à centrifuger coniques de 50 mL | Celltreat | 229421 | |
| Plaque à 6 puits, traitée pour culture tissulaire | Celltreat | 229106 | |
| 70 &mu ; Crépine à cellules M | Faucon | 352350 | |
| Plaque inférieure noire / transparente à 96 puits | Thermo Scientific | 165305 | |
| A83-01 ; | R& D | 2939 | |
| Lecteur de plaques BioTek Synergy | Agilent | Synergie H1 | |
| Compteur de cellules à fond clair Auto T4 | Nexcelcom | CMT-AT4P | |
| Chambres de comptage de cellules de cellomètre | Nexcelcom | NC1531583 | |
| CHIR99021 | Sigma-Aldrich | SML1046-5MG | |
| Solution d’enrobage de collagène | Applications cellulaires | 125-50 | |
| DMEM/F-12 | Gibco | 11330057 | |
| DMSO | Sigma-Aldrich | D2650-100ML | |
| Éthanol 100 % | Fisher Scientific | N° A4094 | |
| Voltohmmètre EVOM2 avec électrode Stx2 | Instruments de précision mondiaux | NC9792051 | |
| Sérum fœtal bovin (FBS) | Cytiva | SH30396.03HI | |
| Pointes de pipette filtrante | Fisher Scientific | 02-707-000, 02-707-002, 02-707-006, 02-707-008 | |
| Isothiocyanate de fluorescéine (FITC)-dextran, 4kDa | Sigma-Aldrich | 46944 | |
| Gastrin I (Humain) | R& D | 3006 | |
| GlutaMAX ; | Fisher Scientific | 35050061 | 200 mM de lipeptide de L-alanyl-L-glutamine |
| Hanks solution saline tamponnée 10x | Thermo Scientific | 14065056 | |
| HEPES 1M | Thermo Scientific | 15630080 | |
| Interféron gamma recombinant humain | BioLégende | 575308 | |
| Interleukine 1 bêta recombinante humaine | Thermo scientifique | 200-01B-500UG | |
| Milieu de croissance des organoïdes intestinaux IntestiCult (humain) | STEMCELL Technologies | 06010 ; | Milieux organoïdes intestinaux commerciaux |
| Microscope inversé en direct | Olympe | IX85 | |
| Matrigel | Corning | 354234 | Matrice extracellulaire (ECM) |
| Incubateur microbiologique | Fisher Scientific | 151030515 | |
| Plaque multipuits pour la culture en suspension, 24 puits | Greiner Bio-one | 662102 | |
| Nicotinamide | R& D | 4106 | |
| Parafilm | Millipore Sigma | HS234526B | Film d’étanchéité |
| Pipettes Pasteur (verre borosilicaté) | Fisher Scientific | 13-678-20B | |
| PBS ; | Gibco | 10010-023 | |
| Pénicilline Streptomycine (10 000 U/mL) | Gibco | 15140122 | |
| Facteur de croissance épidermique recombinant | R& D | 2028-EG | |
| Centrifugeuse réfrigérée | Beckman Coulter | BE-AX15R | |
| SB202190 ; | R& D | 1264 | |
| Thiazovivine | R& D | 3845 | |
| Insert de culture cellulaire ThinCert pour plaque 24 puits, 0,4 &mu ; m | Greiner Bio-one | 662641 | |
| Trypsine-EDTA (0,25 %) | Fisher Scientific | 25200114 | |
| Facteur de nécrose tumorale alpha recombinant humain | R& D | Référence 10291-TA-100 | |
| Dichlorhydrate d’Y-27632 ; | Tocris | TB1254-GMP |
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