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Article de méthode

Exploration du mécanisme de la formule San Jie Tong Mai contre l’athérosclérose via la pharmacologie en réseau et la protéomique

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DOI :

10.3791/70080

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17 avril 2026

 ,  ,  ,  ,  , 
1Department of Cardiology, the Third Affiliated Clinical Hospital of Changchun University of Chinese Medicine, 2Department of Respiratory, The Affiliated Hospital of Changchun University of Chinese Medicine, 3The Affiliated Hospital of Changchun University of Chinese Medicine

Dans cet article

Résumé

Cette étude démontre que la formule San Jie Tong Mai atténue l’athérosclérose chez les souris ApoE-/- en régulant le métabolisme des glucocorticoïdes médié par Hsd11b1, améliorant ainsi la dyslipidémie et l’inflammation vasculaire. Des analyses intégrées de pharmacologie en réseau, de protéomique et d’amarrage moléculaire révèlent un mécanisme synergique multi-composantes et multi-cibles sous-jacent à ses effets anti-athéroscléreux.

Résumé

Cette étude visait à élucider le mécanisme de la formule San Jie Tong Mai (SJTMF) contre l’athérosclérose (SA), une cause majeure de morbidité cardiovasculaire. En utilisant des modèles murins ApoE-/- , nous avons démontré que SJTMF inhibe significativement la progression de la plaque AS. Grâce à une stratégie intégrée de pharmacologie en réseau et de protéomique, cinq composants bioactifs principaux ont été identifiés : le bêta-sitostérol, la naringeniine, la lutéoline, l’isorhamnétine et l’acide 3bêta-hydroxy-24-méthylène-8-lanostène-21-oïque. Parallèlement, la protéomique a révélé 129 protéines liées à l’AS qui étaient exprimées différenciellement. L’amarrage moléculaire a confirmé des interactions de liaison à haute affinité entre ces composants et la cible clé Hsd11b1, dont les énergies de liaison sont toutes inférieures à -5 kcal/mol. Les études mécanistiques ont également révélé que SJTMF pourrait réguler le métabolisme des glucocorticoïdes médié par Hsd11b1. Cette régulation contribue à une amélioration significative à la fois de la dyslipidémie et de l’inflammation vasculaire, supprimant ainsi le développement de la SA. Collectivement, ce travail démontre, pour la première fois, le mécanisme innovant par lequel une formule de médecine traditionnelle chinoise exerce des effets anti-SA grâce à une régulation synergique multi-composante de la cible Hsd11b1 , offrant de nouvelles perspectives pour l’intervention thérapeutique.

Introduction

L’athérosclérose (SA), une maladie inflammatoire chronique affectant la vascularisation systémique, constitue la principale base pathologique des événements cardiovasculaireset cérébrovasculaires 1. Sa pathogenèse implique des interactions complexes entre facteurs génétiques, environnementaux, psychosociaux et pathologiques multifactoriels, présentant des caractéristiques multi-étapes et polygéniques. Bien que les stratégies thérapeutiques actuelles — en particulier les agents hypoglycémiques tels que les statines et les inhibiteurs de la Proprotéine Convertase Subtilisine/Kexin Type 9 (PCSK9) — réduisent efficacement les niveaux de cholestérol des lipoprotéines de basse densité (LDL-C), elles ne traitent pas entièrement le risque inflammatoire résiduel qui entraîne des événements cardiovasculairesrécurrents 2. De plus, les effets indésirables associés à la thérapie (par exemple, diabète nouvellement présent, myotoxicité, insuffisance hépatorénale) limitent l’utilisation à long terme et l’intensification de la thérapie abaissant leslipides 3,4. Ces limitations soulignent la nécessité d’approches complémentaires ciblant directement l’inflammation vasculaire, y compris les traitements anti-inflammatoires, afin de réduire davantage le risque cardiovasculaire au-delà de la simple réduction des lipides.

En médecine traditionnelle chinoise (MTC), la SA relève des catégories d'« empêchement thoracique » (Xiong Bi) et « accumulation de vaisseaux » (Mai Ji), l’intrication de « mucos-stase » (Tanyu Hujie) étant reconnue comme sa pathogenèse centrale. Guidés par le principe de « hydrothérapie transformant la stase » (Yuneng Huashui), notre groupe de recherche a développé la « Formule San Jie Tong Mai (SJTMF) » composée de 14 herbes, dont la Salvia miltiorrhiza (Danshen) et la Whitmania pigra Whitman (Shuizhi), afin de résoudre synergiquement la turbidité du mucos, dissiper la stase et promouvoir la diurèse. Des études cliniques préliminaires ont démontré l’efficacité du SJTMF dans l’amélioration significative des profils lipidiques et la stabilisation/inversation des plaques athérosclérotiques chez des patients âgés présentant un AScarotidien 5. Des études expérimentales ont également révélé sa capacité à inhiber la progression du AS en modulant la polarisation des macrophages et les voies d’autophagie 6,7. Néanmoins, les caractéristiques multi-composantes, multi-cibles et multi-voies des formules MTC posent des défis pour élucider systématiquement leurs mécanismes régulateurs intégrés à l’aide d’approches réductionnistes conventionnelles.

Pour explorer les mécanismes moléculaires médiateurs des effets anti-athéroscléreux du SJTMF et relever les défis, cette étude a utilisé une stratégie multidisciplinaire intégrée. La pharmacologie de réseau, conceptualisée parHopkins 8,9, a été utilisée pour construire un réseau multidimensionnel « composant herboriste-cible-voie maladie ». Cette approche a facilité la prédiction des principaux composés actifs du SJTMF et des cibles thérapeutiques potentielles pour l’intervention sur l’AS, conformément aux caractéristiques holistiques de régulation de la MTC. Pour compléter cela, la technologie protéomique, tirant parti d’analyses protéiques qualitatives et quantitatives à haut débit ethaute précision, a surveillé dynamiquement les changements dans le profil d’expression protéique associé à l’AS après l’intervention SJTMF sur des modèles animaux. Cela a permis d’identifier des molécules effectrices clés et des événements de signalisation, fournissant ainsi des preuves expérimentales pour l’exploration mécanistique. Par la suite, des simulations d’amarrage moléculaire de haute précision ont été réalisées pour évaluer les modes de liaison et les énergies de liaison entre les cibles principales prédites par la pharmacologie du réseau et les composants bioactifs clés, fournissant une base théorique pour les interactions potentiellescomposant-cible 11. Comparée aux approches alternatives, telles que la seule base sur les prédictions de la pharmacologie des réseaux (sujettes à des taux élevés de faux positifs et sans validation expérimentale)12 ou la combinaison uniquement de protéomique avec l’amarrage moléculaire (qui peut ne pas capturer les interactions au niveau du système prédites par l’analyse réseau), cette stratégie intégrée aborde de manière synergique ces limitationsinhérentes 13.

En intégrant des techniques multidimensionnelles, cette étude vise à élucider systématiquement la base pharmacodynamique clé, le réseau cible central et les mécanismes synergiques multi-voies de la SJTMF. Ainsi, fournir un soutien théorique axé sur les mécanismes pour faire progresser la modernisation de la MTC et le développement de médicaments innovants.

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Protocole

Toutes les procédures animales ont été réalisées avec l’approbation du Comité des Animaux Expérimentaux de l’Université de Médecine Chinoise de Changchun (Approbation Éthique n° 2023521). Des souris mâles C57BL/6J et ApoE⁻/⁻ (5 semaines, 18-22 g) sans pathogène spécifique (SPF) ont été inclus dans l’étude (licences d’utilisation d’animaux de laboratoire n° SCXK (JI) 2023-002 et SCXK (SU) 2021-0013). Les informations concernant les réactifs et l’instrumentation sont fournies dans le Tableau des matériaux.

1. Pharmacologie des réseaux

  1. Prédiction des composantes actives et des cibles de SJTMF
    1. Criblez les composants actifs de la peau de Salvia miltiorrhiza, Panax notoginseng, Artemisia scoparia, Poria cocos, Alisma plantago-aquatica L, Amomum villosum, Santalum albumL, Citrus aurantium et Citrus reticulata en utilisant la biodisponibilité orale (OB) ≥ 30 % et la ressemblance de médicament (DL) ≥ 0,18 comme critères.
    2. Criblez les composants actifs de Whitmania pigra Whitman, Bombyx batryticatus, Periostracum cicadae, Caulis Bambusae in Taeniam et Ophicalcitum en appliquant la règle des cinq de Lipinski, avec les paramètres suivants : miLogP ≤ 5, nOHNH ≤ 5, et nOH ≤ 10.
    3. Combinez les composés criblés avec leurs codes SMILES pour prédire les cibles composées.
      REMARQUE : Pour les détails sur les deux bases de données mentionnées ci-dessus, voir le tableau des matériaux.
  2. Prédiction des cibles liées aux AS et construction d’un réseau « composant-cible de médicament ».
    1. Utilisez la base de données GeneCards pour récupérer des cibles de maladies liées au AS en utilisant une terminologie standardisée des maladies.
    2. Utilisez le logiciel Venny 2.1 pour identifier les cibles croisées entre SJTMF et AS comme cibles thérapeutiques potentielles de SJTMF pour AS.
    3. Utilisez Cytoscape 3.9.1 pour construire un diagramme réseau « composant-cible du médicament ».
      REMARQUE : Pour les détails sur les bases de données mentionnées ci-dessus, voir le tableau des matériaux.

2. Acclimatation

  1. Hébergez toutes les souris dans des installations SPF (24 °C ; 50-60 % d’humidité ; cycle clair/obscur de 12 heures). Fournissez à volonté la nourriture standard et l’eau. Prévoyez 7 jours pour l’acclimatation avant les expériences.

3. Préparation de SJTMF

  1. Préparez la formulation de 14 plantes contenant : Salvia miltiorrhiza (Dan Shen) 30 g, Artemisia scoparia (Yin Chen) 10 g, Panax notoginseng (San Qi) 10 g, Poria cocos (Fu Ling) 10 g, Amomum villosum (Sha Ren) 10 g, Alisma plantago-aquatica L (Ze Xie) 30 g, Santalum albumL (Tan Xiang) 10 g, Écorce d’agrumes reticulata (Chen Pi) 10 g, Citrus aurantium (Zhi Qiao) 10 g, Whitmania pigra Whitman (Shui Zhi) 10 g, Periostracum cigale (Chan Tui) 10 g, Bombyx batryticatus (Jiang Can) 10 g, Caulis Bambusae en Taeniam (Zhu Ru) 10 g, et Ophicalcitum (Hua Rui Shi) 30 g.
  2. Décoquegin les matériaux à base de plantes (1 800 g au total) 3× avec 8 volumes d’eau distillée (1,5 h par extraction).
  3. Filtrez à travers de la gaze et du nylon 100 mailles.
  4. Concentrez le filtrat à 60 °C (densité : 1,23-1,27). Concentré sec sous pression réduite à 70 °C.
  5. Pulvériser l’extrait séché à travers un tamis à 80 mailles (rendement : 20,6 %).
    REMARQUE : Suite à un rapportprécédemment publié 7, les souris ont reçu 3,56 g∙kg⁻¹∙day⁻¹ d’extrait SJTMF (normalisé par surface corporelle).

4. Établissement du modèle

  1. Induire l’ASA chez les souris ApoE-/- en suivant un régime riche en graisses pendant 12 semaines (HCD ; 20 % de lipides, 1,25 % de cholestérol). Mesurez votre poids corporel tous les 7 jours pour le suivi métabolique.
  2. Assignez les souris C57BL/6J au groupe témoin (témoin, régime normal + solution saline). Répartissez aléatoirement les souris modélisées avec succès en quatre groupes : groupe modèle, groupe atorvastatine (0,0026 mg/g atorvastatine), groupe SJTMF-L (faible dose de SJTMF, 3,56 g∙kg-1∙jour-1), groupe SJTMF-H (SJTMF à haute dose, 7,12 g∙kg-1∙day-1)7. Administrez toutes les interventions par un manège standardisé de 0,4 mL le matin pendant 4 semaines.
    REMARQUE : Les solutions d’origine de SJTMF ont été préparées selon notreprotocole établi 7. Les interventions expérimentales ont commencé à la 9e semaine, le dosage matinal maintenant le rythme temporel clinique. Les souris ont été définies comme modélisées avec succès lorsque des plaques athéroscléreuses évidentes ont été observées dans l’aorte par une coloration grossière en huile rougeO 7.

5. Collecte d’échantillons, récolte et préservation de l’aorte

REMARQUE : Après 4 semaines d’administration intragastrique, jeûnez toutes les souris pendant 12 heures (eau ad libitum). Mesurez le poids corporel final, puis sacrifiez-le par luxation cervicale sous anesthésie.

  1. Incisez l’abdomen de la souris jusqu’au processus xiphoïde.
  2. Isoler l’aorte de la racine aortique jusqu’à la bifurcation de l’artère iliaque commune.
  3. Retirez l’excès de tissu adipeux et transectez l’aorte à environ 1 cm de distance de l’arc aortique.
  4. Fixez l’aorte dans du paraformoldéhyde ou congelez-la instantanément dans de l’azote liquide.
    REMARQUE : Collectez le sérum et conservez les tissus aortiques à -80 °C pour une analyse ultérieure.
  5. Tache HE
    1. Placez les sections dans le xylène en séquence pendant 20 minutes chacune, deux fois au total ; Puis transférer dans de l’éthanol absolu pendant 10 minutes chacun, deux fois au total. Hydratez les sections en passant par une série descendante d’éthanol graduée (95 %, 90 %, 80 %, 70 %), 5 minutes par concentration.
    2. Colorez en séquence avec 0,4 % d’hématoxyline pendant 3 à 8 minutes, puis avec une solution à éosine à 0,5 % pendant 1 à 3 minutes.
      REMARQUE : Rincez bien avec de l’eau distillée entre les étapes.
    3. Déshydrater les coupes via une série croissante d’éthanol (95 % jusqu’à l’éthanol absolu), 5 min par concentration. Libérez les sections en xylène pendant 5 minutes chacune, deux fois au total. Laissez sécher complètement à l’air, puis montez avec une résine neutre.
    4. Observez au microscope et capturez des images.

6. Préparation totale des protéines à partir d’échantillons de tissu aortique

REMARQUE : Des protéines ont été isolées à partir des tissus aortiques de chacun des trois groupes expérimentaux (groupe témoin, groupe modèle, groupe SJTMF-H).

  1. Homogénéisez les tissus aortiques dans un tampon de lyse (1,5 % SDS/100 mM Tris-HCl, pH 8,5), puis incubez à 95 °C pendant 15 minutes pour obtenir la dénaturation des protéines.
  2. Refroidissez les échantillons, puis centrifugez-les à 12 000 × g et 4 °C pendant 5 minutes et collectez le surnageant. Précipitez les protéines du surnageant en utilisant la méthode de précipitation par acétone.
  3. Redissoudez le précipité protéique (8 M urée/100 mM Tris-HCl, pH 8,5), puis préparez le kit de test BCA selon les instructions du fabricant et déterminez la concentration totale en protéines voir le tableau des matériaux).
    REMARQUE : Avec la même quantité de protéines entre différents échantillons, la solution redissoute a été utilisée pour remplir tous les échantillons au même volume.
  4. Effectuer une réduction des protéines et une alkylation avec TCEP et CAA à 37 °C pendant 1 heure.
  5. Ajoutez la trypsine (1:50) à l’échantillon de protéines et incubez à 37 °C pendant 24 heures (voir Tableau des matériaux).
  6. Utilisez TFA pour ajuster le pH à 6,0 afin d’arrêter la digestion. Centrifugez l’échantillon à 12 000 × g pendant 15 minutes, puis purifiez les peptides du surnageant à l’aide d’une colonne de dessalage SDB-RPS fabriquée par vous (voir Tableau des matériaux).
    REMARQUE : Le peptide éluate a été séché sous vide et stocké à -20 °C pour une utilisation ultérieure.

7. Chromatographie liquide - spectrométrie de masse en tandem (LC - MS/MS)

  1. Injecter 200 ng de digestion peptidique avec un volume d’injection de 1 μL sur une colonne de piège C18 (75 μm × 2 cm, 3 μm, 100 Å). Les peptides ont ensuite été séparés sur une colonne analytique C18 en phase inversée (75 μm × 15 cm, 1,7 μm, 100 Å) à un débit de 0,3 μL/min.
  2. Utilisez de l’eau contenant 0,1 % d’acide formique (FA) comme phase mobile A et de l’acétonitrile (ACN) contenant 0,1 % d’acide formique comme phase mobile B (voir Tableau des matériaux). Appliquez un gradient linéaire de 12 % à 30 % B sur 0 à 12 minutes, suivi d’une augmentation de 30 % à 80 % B sur 12 à 15 minutes, et maintenez à 80 % B de 15 à 18 minutes pour le lavage de colonne. Réglez le débit à 0,300 μL/min de 0 à 15 min, puis augmentez-le à 0,400 μL/min de 16 à 18 min. Réglez la tension capillaire à 1500 V.
  3. Acquérir des spectres MS et MS/MS sur la plage de 100 à 1700 m/z.
  4. Analysez la mobilité ionique sur la plage de 0,6 à 1,6 Vs/cm². Réglez le temps d’accumulation et le temps de rampe à 50 ms.

8. Analyse de la fonction des protéines

REMARQUE : Les protéines différenciellement exprimées (DEP) issues de la protéomique ont été croisées avec des cibles clés issues de la pharmacologie des réseaux, et les protéines cibles qui se chevauchent ont été sélectionnées pour l’annotation fonctionnelle de l’ontologie génique (GO) et l’analyse d’enrichissement des voies par la Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG). Les catégories fonctionnelles et voies avec P < 0,05 ont été considérées comme significatives.

  1. Analysez les données brutes de la DIA en mode sans bibliothèque.
  2. Recherchez les fichiers spectres dans la base de données de séquences protéiques de Souris.
  3. Définissez les paramètres principaux de recherche.
    1. Activer les options de génération d’ions précurseurs pour la génération de bibliothèques spectrales prédites in silico.
    2. Spécifiez l’enzyme avec un maximum de 2 clivages manqués autorisés (voir Tableau des matériaux).
    3. Fixer la carbamidométhylation de la cystéine (C) comme modification fixe.
    4. Considérez l’oxydation de la méthionine (M) et l’acétylation N-terminale de la protéine comme modifications variables.
    5. Réglez la précision de masse du précurseur et la précision de masse MS1 à 15 ppm.
    6. Permettre la correspondance entre les exécutions et l’inférence heuristique des protéines.
    7. Fixez le seuil du taux de fausse découverte (FDR) précurseur à 1 % pour une identification fiable.
  4. Exécutez l’analyse DIA-NN (1.8.2 beta 11).
    REMARQUE : Effectuez la quantification au niveau des protéines avec DIA-NN, et effectuez des analyses bioinformatiques et des visualisations avec R. Significativement, les DEP ont été déterminés par la valeur P du test t de Student et des seuils de changement de pli.

9. Amarrage moléculaire

  1. Téléchargez la structure cristalline tridimensionnelle de la protéine cible depuis la base de données RCSB PDB et enregistrez-la au format PDB ; pendant ce temps, téléchargez la structure moléculaire du composant actif central de SJTMF depuis la base de données PubChem et enregistrez-la au format SDF.
  2. Utilisez PyMOL 2.6.0 pour effectuer l’élimination de l’eau et l’hydrogénation sur la structure protéique cible, éliminer les ligands endogènes non pertinents et sauvegarder la structure protéique traitée au format PDB ; obtenir les paramètres de poche d’amarrage via le plugin Getbox de PyMOL, avec les paramètres de la grille définis comme suit : center_x = -7,2, center_y = 53,4, center_z = 30,6, size_x = 73,7, size_y = 85,9, size_z = 67,2, et le nombre de conformations d’amarrage num_modes = 10.
  3. Importez séparément le fichier protéine cible traitée et le fichier du fichier composé central de SJTMF dans AutoDock Tools 1.5.6 pour convertir les deux fichiers au format PDBQT, puis effectuez un docking moléculaire avec AutoDock Vina 1.1.2 en fonction des paramètres de la grille définis ci-dessus.
  4. Visualisez les résultats du docking moléculaire avec PyMOL.

10. Statistiques

  1. Effectuer une analyse statistique.
  2. Exprimez les résultats en moyenne ± écart-type (DS).
  3. Spécifier l’utilisation du test de différence significative honnête (HSD) de Tukey pour une analyse post hoc après une ANOVA unidirectionnelle lorsque les données rencontrent la normalité et l’homogénéité des variances ; appliquer le test de Games-Howell pour les données hétérodastiques. Considérons un p < 0,05 statistiquement significatif.
  4. Visualisez les données à l’aide de GraphPad Prism8.0.2.

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Résultats

Le SJTMF supprime la formation de plaques athérosclérosiques chez les souris ApoE-/-
Pour étudier l’effet inhibiteur de la SJTMF sur la SA, un modèle ApoE-/- de souris a été utilisé pour surveiller les variations de poids corporel et observer les altérations histopathologiques de l’aorte. Comparé au groupe modèle, l’intervention SJTMF a atténué la prise de poids corporel chez les souris nourries à ApoE-/-

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Discussion

Bien que des études antérieures aient démontré que le SJTMF exerce des effets anti-inflammatoires et induit la polarisation des macrophages dans les modèles murins ApoE⁻/⁻ 6,7, les mécanismes moléculaires spécifiques sous-jacents à son activité anti-athéroscléreuse restent incertains. Le principe du « même traitement pour différentes maladies » en médecine tr...

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Déclarations de divulgation

Les auteurs n’ont aucun conflit d’intérêts à déclarer.

Remerciements

Cette étude a été soutenue par la Fondation des sciences naturelles de la province du Jilin (n° YDZJ202401644ZYTS).

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Matériaux

Liste des matériaux utilisés dans cet article
NomEntrepriseNuméro de catalogueCommentaires
2-Chloroacétamide (ACA)Sigma-AldrichC0627-100G
Solution de fixation au paraformaldéhyde à 4 %Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd.80096618
0,5&ndash ; 10 & micro ; L Micropipetteeppendorf4924000029
10 & ndash ; 100 & micro ; L Micropipetteeppendorf4924000053
20 & ndash ; 200 & micro ; L Micropipetteeppendorf4924000061
100 & ndash ; 1 000 & micro ; L Micropipetteeppendorf4924000088
1000 & micro ; Embouts de pipette LNEST Life Science Co., Ltd.303216
10 & micro ; Embouts de pipette LNEST Life Science Co., Ltd.301016
20 & micro ; Embouts de pipette LNEST Life Science Co., Ltd.302106
Tube centrifuge de 15 mLNEST Life Science Co., Ltd.601052
Tube centrifugeuse de 1,5 mLNEST Life Science Co., Ltd.615601
Une base de données guidée par une expérience à haut débit et une base de données de référence de la médecine traditionnelle chinoise (HERB)/http://herb.ac.cn/v2
Acétonitrile (LC-MS)Thermo Fisher ScientificA955-4
Acétone acétonyleSinopharm Chemical Reagent Co., Ltd.10000418
Eau à l’ammoniacSinopharm Chemical Reagent Co., Ltd.10011028
AutoclaveShanghai Sanshen Medical Devices Co., Ltd.YM75
Acclaim PepMap (75µ ; m*2cm, C18, 3µ ; m, 100Å ;)Thermo164535
AURORA ULTIMATE (75µ ; M*25cm, 1,6µ ; m, 100Å ;)AURORAAUR3-25075C18-CSI
Kit de test protéique BCASangon Biotech (Shanghai) Co., Ltd.C503021-0500
Centrifugeuse réfrigérée haute vitesse de laboratoireHunan Kecheng Instrument Equipment Co., Ltd.H1 - 16KR
Bromophénol BlueSinopharm Chemical Reagent Co., Ltd.71008060
Chauffe-blocHangzhou Miu InstrumentsDKT-100
ChloroformeSinopharm Chemical Reagent Co., Ltd.10006818
Système d’imagerie chimiluminescenceHangzhou Shenhua Technology Co., Ltd.SH - 523
Développé propreSuzhou Jinghua Equipment Co., Ltd.SW-CJ-2D
Verre de couvertureJiangsu Shitai Experimental Equipment Co., Ltd.10212450C
Cytoscape v3.9.1//
DIA-NN (V1.8.1)L’Institut Francis Crickgithub.com/vdemichev/DiaNN
Affichage numérique Bain d’eau à température constanteChangzhou Jinnan Instrument Manufacturing Co., Ltd.HH - W600
Shaker de décolorationWuhan Lingsi Biotechnology Co., Ltd.TSY-B
Machine de déshydratationWuhan Junjie Electronics Co., Ltd.JT-12J
ÉosineWuhan Lingsi Biotechnology Co., Ltd.E8090
Incorporation de la paraffineSinopharm Chemical Reagent Co., Ltd.69019361
Absolu d’éthanolSinopharm Chemical Reagent Co., Ltd.10009218
Machine d’IntégrationWuhan Junjie Electronics Co., Ltd.JB-P5
GraphPad Prism/8.0.2
Acide acétique glaciaireSinopharm Chemical Reagent Co., Ltd.10000218
GeneCards/https://www.genecards.org/
GlycérolSinopharm Chemical Reagent Co., Ltd.10010618
GlycineBiofroxx1275GR500
Ontologie génique (GO)/geneontology.org
HématoxylineWuhan Lingsi Biotechnology Co., Ltd.G1140
Horizontal ShakerHaimen Qilinbeier Instrument Manufacturing Co., Ltd., JiangsuTS - 1
Enclos barrières hydrophobesServicebioWG1066-1
HCIUsine de réactifs chimiques de XinyangGB622-89
Chromatographie liquide haute performanceAgilent1200
IsopropanoSinopharm Chemical Reagent Co., Ltd.80109218
Image-Pro PlusCybernétique médiatiqueVersion 6.0
Système d’imagerieNikonDS-Fi3
Ciseaux micro-disséqueurs IRIS-FineRWD Life Science Co., Ltd.S12004-09
Encyclopédie Kyoto des gènes et génomes (KEGG)/www.genome.jp/kegg/
Lame de microscopeNantong Mevid Life Science Co., Ltd.PC2-301
Four à micro-ondesAppareils électriques de fours à micro-ondes Galanz Co., Ltd.P70D20TL-P4
Mini-centrifugeuseLaboratoire du DragonD1008E
Résine neutreWuhan Lingsi Biotechnology Co., Ltd.G8590
NaClSinopharm Chemical Reagent Co., Ltd.10019318
NCBI/www.ncbi.nlm.nih.gov
Pulvérisateur à cellules ultrasoniques sans contactSCIENTZ08-III
n-ButanolSinopharm Chemical Reagent Co., Ltd.100052190
FourShanghai Huitai Instrument Manufacturing Co., Ltd.DHG-9140A
PubChem/https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/
Poudre tampon phosphate PBSWuhan Lingsi Biotechnology Co., Ltd.P1010
Microtome pathologiqueLeica Instruments Co., Ltd. (Shanghai)RM2016
Centrifugeuse portableWuhan Lingsi Biotechnology Co., Ltd.D1008
R 4.5.1//
Tampon de lyse RIPA (1,5 ML)MeilunbioMA0151
Dodécyle sulfate de sodium (SDS)Sigma-AldrichL3771-500G
SpeedVacGemmyCV200
Logiciel SPSSStatistiques IBM SPSSVersion 22
Pinces de soutureRWD Life Science Co., Ltd.FC11001R-11
Microscope stéréoscopique à dissectionRWD Life Science Co., Ltd.77001S
Colonnes de rotation RMCWBIOCW0597S
spectromètre de masse timsTOF ProBruker DaltonicstimsTOF Pro
Plateforme de données et d’analyse des systèmes de pharmacologie de médecine traditionnelle chinoise (TCMSP)/https://tcmspw.com/tcmsp.php
Mélangeur thermiqueHangzhou Miu InstrumentsMTC-100
Acide trifluoroacétique (TFA)Sigma-Aldrich299537-500G
Tris(2-carboxyéthyl)phosphine chlorhydrate (TCEP)Sigma-AldrichC4706-10G
TrypsineSigma-AldrichT575-31N-10
Homogénéiseur tissulaireHangzhou Miu InstrumentsMT-30K
Tris(hydroxyméthyl)aminométhane (base Tris)Sigma-AldrichT1503-1KG
Système UltiMate 3000 RSLCnanoThermo ScientificUltiMate 3000 RSLCnano
UniProt (03-01-2023)L’Institut Francis Crickgithub.com/vdemichev/DiaNN
UréeSigma-Aldrich51456-500G
Venny2.1/https://www.bioinformatics.com.cn/static/others/jvenn/example.html
Mélangeur à vortexKylin-BellVORTEX-5
Ciseaux à ressort VannaRWD Life Science Co., Ltd.S11001-08
Eau (LC-MS)Thermo Fisher ScientificW6-4
XylèneSinopharm Chemical Reagent Co., Ltd.10023418

Références

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