Name: Électrophorèse sur gel dénaturant Dégradé (DGGE) (Vidéo) | JoVE Journal
Uploaded: 2007-02-25T00:00:00.000+00:00
Duration: 10 min 52 s
Description: Découvrez l'électrophorèse sur gel dénaturant pour profiler les communautés bactériennes dans les biofilms microbiens. Cette méthode analyse les séquences 16S rRNA et leurs variations spatio-temporelles.

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Électrophorèse sur gel dénaturant dégradé (dgge)

Denaturing Gradient Gel Electrophoresis (DGGE)

Électrophorèse sur gel dénaturant Dégradé (DGGE)

D'accord. Bonjour, je m'appelle Celeste Peterson et je suis chercheuse à l'Université Harvard, où j'étudie les communautés microbiennes en biofilm. J'analyse les communautés bactériennes en examinant leur séquence de l'ARN 16S et la manière dont cette séquence évolue dans le temps et l'espace. Pour ce faire, j'utilise l'Électrophorèse en gradient de denaturant (DDGE).Ceci n'est pas une électrophorèse acrylique normale de mon échantillon ; elle doit être maintenue à 60 degrés pendant son exécution, et le tampon doit être pompé en continu. Nous allons donc réchauffer le tampon pendant environ une heure, jusqu'à ce qu'il atteigne 60 degrés, puis nous pourrons exécuter l'analyse. Maintenant, je vais laver cette plaque avec une solution diluée de uc, en éliminant les impuretés, et allumer la lumière.Tout ce qui ressemble à cela peut provoquer des régularités. Il est important d'essuyer toute l'eau. Ainsi, lorsque j'assemble le gel, je placerai cette puce à l'extérieur du gel.Ainsi, le gel se trouvera entre ces deux morceaux de verre et la puce sera à l'extérieur, sans affecter le gel situé entre les deux. Je vais maintenant assembler le gel dans ces pinces, puis les rapprocher en les se

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Électrophorèse sur gel dénaturant de polyacrylamide urée est utilisée pour séparer l'ADN simple brin ou l'ARN jusqu'à une limite de 500 nucléotides. L'urée en combinaison avec des échantillons dénature la chaleur et non structurées brins simples migrer dans la matrice de gel en fonction de leur poids moléculaire.

Électrophorèse sur gel dénaturant Urée polyacrylamide (PAGE urée)

Un protocole de base pour la séparation des fragments d'ADN sur gel d'agarose en utilisant est décrite.

Électrophorèse sur gel d&#39;agarose pour la séparation de fragments d&#39;ADN

Cette vidéo montre la séparation par électrophorèse des fibres amyloïdes basée sur l’électrophorèse du gel d’agarose semi-dénaturant bidimensionnelle. La technique sépare les agrégats amyloïdes polymorphes en fonction de leur taille hétérogène.

Électrophorèse bidimensionnelle semi-dénaturante sur gel d’agarose : une technique pour séparer les fibres amyloïdes polymorphes en fonction de l’hétérogénéité de taille

Dans cette vidéo, nous faisons la démonstration d’une méthode d’électrophorèse sur gel bidimensionnelle qui sépare des protéines individuelles d’un mélange complexe de protéines obtenues à partir de tissus tumoraux d’adénome hypophysaire non fonctionnel humain (NFPA). Les protéines sont séparées en fonction de leur charge électrique dans la première dimension et séparées en fonction des poids moléculaires dans la deuxième dimension.

Électrophorèse bidimensionnelle sur gel de polyacrylamide : technique de séparation pour l’analyse des protéines dans un mélange complexe de protéines basé sur la charge et la masse moléculaire

La détection rapide et la quantification fiable des événements d’édition de l’ARN à l’échelle génomique restent difficiles et reposent actuellement sur des méthodes de séquençage direct de l’ARN. Le protocole décrit ici utilise l’électrophorèse sur gel à gradient de microtempérature (μTGGE) comme méthode simple, rapide et portable de détection de l’édition de l’ARN.

Une approche non séquentielle pour la détection rapide de l’édition de l’ARN

Cette vidéo montre le protocole d'un essai angiogenèse in vitro que les stades récapitule plusieurs de l'angiogenèse. Time-lapse images de la germination, la formation de lumière, la ramification et anastomose - caractéristiques essentielles de l'angiogenèse - sont présentés.

Optimisé fibrine billes de gel d&#39;analyse pour l&#39;étude de l&#39;angiogenèse

Nous décrivons un protocole pour la microfabrication de l'appareil de gradient générant microfluidique qui peuvent générer des gradients spatiaux et temporels bien définis microenvironnement. Dans cette approche, l'appareil de gradient générant microfluidiques peuvent être utilisées pour étudier la migration cellulaire dirigée, l'embryogenèse, la cicatrisation, et les métastases du cancer.

Un dispositif microfluidique Dégradé génératrices de biologie cellulaire

DDS-AGE est une technique utile pour la détection et la caractérisation de l'amyloïde comme les polymères dans les cellules. Ici nous démontrons une adaptation qui rend cette technique prêtent à grande échelle des applications.

Le dépistage de l&#39;agrégation amyloïde par les semi-électrophorèse sur gel dénaturant Détergent-Agarose

Nous décrivons une méthode pour l'extraction d'ADN de haut poids moléculaire, génomique de la biomasse planctonique concentrés sur des filtres de 0,22 um Sterivex, suivie d'une centrifugation en gradient de chlorure de césium de densité pour la purification.

Extraction de l&#39;ADN à partir de 0,22 Filtres Sterivex uM et le césium Centrifugation gradient de chlorure de densité

Dans cette vidéo, nous décrivons la caractérisation de complexes multiprotéiques (PPM) en bleu électrophorèse en gel de polyacrylamide natif (BN-PAGE). Dans une première dimension, dialysées lysats cellulaires sont séparés par BN-PAGE pour identifier les PPM individuelle. Dans une deuxième dimension SDS-PAGE, PPM d'intérêt sont subdivisées afin d'analyser leurs électeurs par immunoblot.

Bleu d&#39;électrophorèse sur gel de polyacrylamide natif (BN-PAGE) pour l&#39;analyse des complexes multiprotéiques de lysats cellulaires

Découvrez l'électrophorèse sur gel dénaturant pour profiler les communautés bactériennes dans les biofilms microbiens. Cette méthode analyse les séquences 16S rRNA et leurs variations spatio-temporelles.

Électrophorèse sur gel dénaturant Dégradé (DGGE)

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