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Commençons par Legionella pneumophila, un agent pathogène respiratoire exprimant un composant du système de sécrétion marqué par fluorescence nécessaire à l’infection de l’hôte.
Pour quantifier la polarité de ces composants, acquérez des images de fluorescence et ajustez le contraste pour distinguer les cellules individuelles.
Placez des régions rectangulaires du pôle cellulaire vers le cytoplasme pour mesurer les gradients de fluorescence.
Masquez ces régions pour extraire l’intensité moyenne et la variance, puis calculez les scores de polarité sous forme de rapports de variance/intensité moyenne.
Des scores de polarité élevés indiquent un recrutement ciblé des composants aux pôles bactériens.
Pour les mesures dynamiques, capturez deux images en accéléré et ajustez le contraste pour visualiser clairement les cellules.
Placez des régions carrées au centre de la cellule pour mesurer la fluorescence cytosolique.
Masquez des cellules entières pour corriger le photoblanchiment et définissez des régions d’arrière-plan entre les cellules pour la soustraction du bruit.
Exportez toutes les intensités et calculez l’évolution de la fluorescence au fil du temps.
L’augmentation de l’intensité indique le regroupement, tandis que la diminution de l’intensité reflète la redistribution dynamique des composants de la sécrétion au sein de la bactérie.
Pour quantifier la polarité, ajustez le contraste de l’image de manière à ce que les bactéries soient clairement visibles.
Ensuite, zoomez sur la région d’intérêt et utilisez l’outil Région pour placer un rectangle de 0,25 par 1,3 micromètre commençant au pôle et se prolongeant dans le cytoplasme, en vous assurant que le rectangle reste à l’intérieur des limites bactériennes.
Marquez au moins 200 bactéries et créez des masques à l’aide du bouton Région à masquer dans le menu Analyser. Cliquez sur les statistiques du masque et choisissez l’objet sous la portée du masque. Marquez ensuite l’intensité moyenne et la variance sous les caractéristiques et l’intensité.
Exportez les données sous forme de fichier texte et utilisez l’application de tableur pour calculer les scores de polarité de chaque bactérie en tant que rapport entre la variance et l’intensité moyenne.
Pour quantifier la dynamique des protéines de fusion, ouvrez la fenêtre de capture d’image et marquez le time lapse.
Entrez deux dans la case du nombre de points de temps. Acquérir deux images successives de Legionella Pneumophila exprimant la protéine fluorescente d’intérêt.
Ajustez le contraste de l’image jusqu’à ce que les cellules soient clairement visibles. Utilisez ensuite l’outil de région pour placer un carré de 0,25 par 0,25 micromètre au milieu d’au moins 400 cellules.
Ensuite, utilisez le bouton Région à masquer dans le menu Analyser pour créer un masque des carrés d’intérêt. Créez un masque vide et utilisez l’outil Pixel pour marquer la zone entière d’au moins 25 cellules aléatoires. Créez un autre masque et utilisez le grand outil pinceau pour marquer les zones entre les cellules.
Enfin, sélectionnez les statistiques du masque et assurez-vous que l’objet est sélectionné sous la portée du masque pour le premier masque. Sous Caractéristiques et intensité, choisissez Intensité moyenne. Exportez les données et répétez le processus pour le masque 2. Pour le masque 3, sélectionnez l’intégralité du masque et exportez l’intensité moyenne.