Analyse de l'interaction avec la chromatine Tag appariés Fin de séquençage (Chia-PET) pour la cartographie des interactions Chromatine et transcription Comprendre le règlement

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30 avril 2012

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30 avril 2012

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Analyse de l'interaction de la chromatine par Tag appariés Fin de séquençage (Chia-PET) est une méthode pour De novo Détection des interactions chromatine, pour une meilleure compréhension du contrôle de la transcription.

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Protocole ChIA-PET

Chapters in this video

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Titre

1:00

Vue d'ensemble de l'analyse des interactions chromatiniennes par séquençage de tags appariés (ChIA-PET)

2:15

ChIP - Immunoprécipitation de la chromatine

4:24

Lyse cellulaire

5:07

Lyse nucléaire

7:11

Fragmentation de la chromatine

8:26

Lavage, pré-clairance et couplage de l'anticorps aux billes

10:08

Immunoprécipitation de la chromatine

11:20

Lavage et élution

11:48

ChIA-PET - Analyse des interactions chromatiniennes par séquençage de tags appariés

12:29

Émoussage des fragments d'ADN de la ChIP

13:33

Ligation de demi-linkers biotinylés à l'ADN de la ChIP

16:02

Élution et ligation de proximité des fragments d'ADN de la ChIP

18:08

Immobilisation de l'ADN ChIA-PET sur billes de streptavidine

20:47

Conclusion

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