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DOI: 10.3791/50242-v
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This article presents a protocol for non-targeted metabolite profiling of serum using ultra performance liquid chromatography coupled with mass spectrometry (UPLC-MS). It details the workflow from sample preparation to data analysis and metabolite identification.
Le profilage des métabolites non ciblés par chromatographie liquide ultra performante couplée à la spectrométrie de masse (UPLC-MS) est une technique puissante pour étudier le métabolisme. Cet article décrit un flux de travail typique utilisé pour le profilage non ciblé des métabolites du sérum, y compris l’organisation et la préparation des échantillons, l’acquisition de données, l’analyse des données, le contrôle de la qualité et l’identification des métabolites.
L’objectif global de cette procédure est d’effectuer un profilage robuste et non ciblé des métabolites sériques dans une expérience à grande échelle. Tout d’abord, extrayez les métabolites sous forme de plaque. Établissez un échantillon et une méthode de contrôle qualité robustes pour assurer la stabilité analytique dans le temps.
Ensuite, acquérez des données spectrales de masse sur des échantillons de CQ et de sérum randomisés en réplication, procédez au prétraitement des données, à l’analyse statistique et à l’identification des métabolites. Les résultats du profilage des métabolites non ciblés par U-P-L-C-M-S peuvent être utilisés pour identifier des biomarqueurs à petites molécules dans le sérum. Le protocole est présenté ici pour l’analyse du sérum.
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