-1::1
Simple Hit Counter
Skip to content

Products

Solutions

×
×
Sign In

FR

EN - EnglishCN - 简体中文DE - DeutschES - EspañolKR - 한국어IT - ItalianoFR - FrançaisPT - Português do BrasilPL - PolskiHE - עִבְרִיתRU - РусскийJA - 日本語TR - TürkçeAR - العربية
Sign In Start Free Trial

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

Behavior
Biochemistry
Bioengineering
Biology
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
View All
JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

Biological Techniques
Biology
Cancer Research
Immunology
Neuroscience
Microbiology
JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduate courses

Analytical Chemistry
Anatomy and Physiology
Biology
Calculus
Cell Biology
Chemistry
Civil Engineering
Electrical Engineering
View All
JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

Advanced Biology
Basic Biology
Chemistry
View All
JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

Biology
Chemistry

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

Accounting
Finance
Macroeconomics
Marketing
Microeconomics

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Authors

Teaching Faculty

Librarians

K12 Schools

Biopharma

Products

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduates

JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Solutions

Authors
Teaching Faculty
Librarians
K12 Schools
Biopharma

Language

French

EN

English

CN

简体中文

DE

Deutsch

ES

Español

KR

한국어

IT

Italiano

FR

Français

PT

Português do Brasil

PL

Polski

HE

עִבְרִית

RU

Русский

JA

日本語

TR

Türkçe

AR

العربية

    Menu

    JoVE Journal

    Behavior

    Biochemistry

    Bioengineering

    Biology

    Cancer Research

    Chemistry

    Developmental Biology

    Engineering

    Environment

    Genetics

    Immunology and Infection

    Medicine

    Neuroscience

    Menu

    JoVE Encyclopedia of Experiments

    Biological Techniques

    Biology

    Cancer Research

    Immunology

    Neuroscience

    Microbiology

    Menu

    JoVE Core

    Analytical Chemistry

    Anatomy and Physiology

    Biology

    Calculus

    Cell Biology

    Chemistry

    Civil Engineering

    Electrical Engineering

    Introduction to Psychology

    Mechanical Engineering

    Medical-Surgical Nursing

    View All

    Menu

    JoVE Science Education

    Advanced Biology

    Basic Biology

    Chemistry

    Clinical Skills

    Engineering

    Environmental Sciences

    Physics

    Psychology

    View All

    Menu

    JoVE Lab Manual

    Biology

    Chemistry

    Menu

    JoVE Business

    Accounting

    Finance

    Macroeconomics

    Marketing

    Microeconomics

Start Free Trial
Loading...
Home
JoVE Journal
Biology
Un Exonuclease analyse basée sur la fluorescence pour caractériser DmWRNexo, orthologue humain pr...
Un Exonuclease analyse basée sur la fluorescence pour caractériser DmWRNexo, orthologue humain pr...
JoVE Journal
Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biology
A Fluorescence-based Exonuclease Assay to Characterize DmWRNexo, Orthologue of Human Progeroid WRN Exonuclease, and Its Application to Other Nucleases

Un Exonuclease analyse basée sur la fluorescence pour caractériser DmWRNexo, orthologue humain progéroïde WRN Exonuclease, et son application à d'autres nucléases

Full Text
5,719 Views
06:10 min
December 23, 2013

DOI: 10.3791/50722-v

Penelope A. Mason1, Ivan Boubriak1, Lynne S. Cox1

1Department of Biochemistry,University of Oxford

AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This study presents a fluorescence-based assay to measure exonuclease activity, crucial for understanding genome stability. The method allows for the analysis of substrate preferences and enzyme activity in a reproducible manner.

Key Study Components

Area of Science

  • Biochemistry
  • Genetics
  • Molecular Biology

Background

  • Exonucleases are vital for maintaining genome integrity.
  • WRN exonuclease dysfunction is linked to premature aging.
  • In vitro studies help clarify in vivo roles of nucleases.
  • Fluorescence assays provide a safer alternative to radioactivity-based methods.

Purpose of Study

  • To develop a rapid and reproducible assay for measuring exonuclease activity.
  • To identify substrate preferences and reaction conditions for the WRN exonuclease.
  • To enhance understanding of the enzyme's role in genome stability.

Methods Used

  • Incubation of purified WRN exonuclease with fluorescent DNA substrates.
  • Separation of degradation products using acrylamide urea gel electrophoresis.
  • Fluorescence imaging for quantifying exonuclease activity.
  • Analysis of processive and overall enzyme activity.

Main Results

  • The assay demonstrated high reproducibility and stability of DNA substrates.
  • Quantitative results indicated preferred substrate conditions for WRN exonuclease.
  • The method proved to be cost-effective and safer than traditional techniques.
  • Insights gained contribute to understanding the enzyme's biological functions.

Conclusions

  • The fluorescence-based assay is a valuable tool for studying exonuclease activity.
  • Findings enhance knowledge of WRN exonuclease's role in genome stability.
  • This method can be applied to other nucleases for broader research implications.

Frequently Asked Questions

What is the significance of exonucleases?
Exonucleases are essential for maintaining genome integrity and preventing mutations.
How does the fluorescence-based assay work?
The assay measures the degradation of fluorescent DNA substrates by the exonuclease, allowing quantification of activity.
What are the advantages of this assay over traditional methods?
It offers better reproducibility, lower costs, and increased safety compared to radioactivity-based techniques.
What can be learned from the substrate preferences of WRN exonuclease?
Understanding substrate preferences can provide insights into the enzyme's biological functions and mechanisms.
Can this method be applied to other nucleases?
Yes, the fluorescence-based assay can be adapted for studying various nucleases.

Les exonucléases jouent un rôle essentiel pour assurer la stabilité du génome. La perte de la fonction de l’exonucléase WRN entraîne un vieillissement prématuré. L’étude des substrats et d’autres exigences de la nucléase in vitro peut aider à élucider son rôle in vivo. Ici, nous démontrons un test rapide et reproductible basé sur la fluorescence pour mesurer son activité nucléase.

Cette expérience utilise un test robuste et reproductible basé sur la fluorescence pour déterminer l’activité des exonucléases. Incuber l’enzyme purifiée avec le substrat d’ADN fluorescent pour permettre à l’enzyme de dégrader séquentiellement l’ADN. Ensuite, résolvez l’ADN sur un gel d’urée acrylamide pour séparer les produits de dégradation par taille.

Ensuite, utilisez l’imagerie de fluorescence pour identifier et quantifier l’étendue de l’activité des exonucléases. Les résultats analysés peuvent déterminer les conditions de réaction du substrat préférées, le processus et l’activité globale de l’enzyme. Le principal avantage de cette technique par rapport aux techniques existantes basées sur la radioactivité est que les substrats d’ADN sont stables pendant une longue période, ce qui permet une excellente reproductibilité, une réduction des coûts et une augmentation de la sécurité.

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

Sign In Start Free Trial

Explore More Videos

Mots-clés : Essai basé sur la fluorescence DmWRNexo exonucléase WRN Dommages à l’ADN Stabilité du génome Activité des nucléases Réplication de l’ADN Recombinaison Substrat d’oligonucléotides Essai radioactif Processivité Préférence de substrat

Related Videos

Les études génétiques des protéines humaines réparation de l'ADN utilisant de la levure comme système modèle

14:09

Les études génétiques des protéines humaines réparation de l'ADN utilisant de la levure comme système modèle

Related Videos

18.6K Views

Quantitative, en temps réel Analyse de l'activité de réparation par excision de base dans les lysats cellulaires Utilisant des lésions spécifiques Beacons moléculaires

15:01

Quantitative, en temps réel Analyse de l'activité de réparation par excision de base dans les lysats cellulaires Utilisant des lésions spécifiques Beacons moléculaires

Related Videos

14.1K Views

Microscopie de la force atomique Enquêtes sur la reconnaissance des lésions de l'ADN dans la réparation de l'excision des nucléotides

10:59

Microscopie de la force atomique Enquêtes sur la reconnaissance des lésions de l'ADN dans la réparation de l'excision des nucléotides

Related Videos

10.2K Views

Correction d’épreuves et de test de réparation d’ADN en utilisant l’analyse de spectrométrie de masse MALDI-TOF et de nucléotide simple Extension

11:08

Correction d’épreuves et de test de réparation d’ADN en utilisant l’analyse de spectrométrie de masse MALDI-TOF et de nucléotide simple Extension

Related Videos

10.3K Views

Observation en temps réel de la réaction d’échange de brin ADN médiée par Rad51

06:24

Observation en temps réel de la réaction d’échange de brin ADN médiée par Rad51

Related Videos

8.7K Views

Dépistage cinétique de l'activité nucléane à l'aide de sondes d'acide nucléique

06:52

Dépistage cinétique de l'activité nucléane à l'aide de sondes d'acide nucléique

Related Videos

8.8K Views

Visualisation et quantification des dommages à l’ADN spécifiques au site à base d’endonucléase

10:59

Visualisation et quantification des dommages à l’ADN spécifiques au site à base d’endonucléase

Related Videos

4.2K Views

Nanomachines à base de DNAzyme 10-23 pour la reconnaissance des acides nucléiques

07:16

Nanomachines à base de DNAzyme 10-23 pour la reconnaissance des acides nucléiques

Related Videos

1.6K Views

Utilisation d’oligonucléotides synthétiques modifiés pour doser des enzymes métabolisant des acides nucléiques

05:33

Utilisation d’oligonucléotides synthétiques modifiés pour doser des enzymes métabolisant des acides nucléiques

Related Videos

1.5K Views

Évaluation de l’activité de réparation des cassures double brin de l’ADN à l’aide de dosages rapporteurs à haut débit et quantitatifs basés sur la luminescence

05:01

Évaluation de l’activité de réparation des cassures double brin de l’ADN à l’aide de dosages rapporteurs à haut débit et quantitatifs basés sur la luminescence

Related Videos

2.3K Views

JoVE logo
Contact Us Recommend to Library
Research
  • JoVE Journal
  • JoVE Encyclopedia of Experiments
  • JoVE Visualize
Business
  • JoVE Business
Education
  • JoVE Core
  • JoVE Science Education
  • JoVE Lab Manual
  • JoVE Quizzes
Solutions
  • Authors
  • Teaching Faculty
  • Librarians
  • K12 Schools
  • Biopharma
About JoVE
  • Overview
  • Leadership
Others
  • JoVE Newsletters
  • JoVE Help Center
  • Blogs
  • JoVE Newsroom
  • Site Maps
Contact Us Recommend to Library
JoVE logo

Copyright © 2026 MyJoVE Corporation. All rights reserved

Privacy Terms of Use Policies
WeChat QR code