Analyse rapide et exploration de microscopie par fluorescence Images

L’objectif global de cette procédure est d’utiliser une plate-forme d’analyse d’images pour analyser et explorer rapidement les images de microscopie fluorescente. Pour ce faire, il faut d’abord ensemencer des cellules dans une plaque, en ajoutant des perturbations à chaque puits et en incubant la plaque. Les images sont ensuite acquises à l’aide d’un microscope à fluorescence automatisé, et les images sont chargées semi-automatiquement sur la plate-forme d’analyse d’images pheno ripper à l’aide de l’outil pheno loader.

Après avoir défini les paramètres d’analyse, pheno ripper identifie automatiquement les types de blocs récurrents dans les images et génère des profils phénotypiques pour chaque image qui peuvent être explorés à l’aide du navigateur pheno. En fin de compte, le dernier gramme du cluster montre les relations entre différentes conditions et caractéristiques de l’image, ce qui permet de comparer des phénotypes complexes mais subtils générés par l’écran d’imagerie à haut débit. Le principal avantage de cette technique par rapport aux méthodes existantes qui nécessitent l’identification automatisée des cellules individuelles est qu’elle est beaucoup plus rapide et plus facile à utiliser.