Phenomics de phages: approches physiologiques à caractériser de nouvelles protéines virales

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11 juin 2015

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Savannah E. Sanchez¹ , Daniel A. Cuevas² , Jason E. Rostron¹ , Tiffany Y. Liang³ , Cullen G. Pivaroff¹ , Matthew R. Haynes¹ , Jim Nulton⁴ , Ben Felts⁴ , Barbara A. Bailey⁴ , Peter Salamon⁴ , Robert A. Edwards¹^,⁵^,⁶ , Alex B. Burgin⁷ , Anca M. Segall¹ , Forest Rohwer¹

¹Department of Biology, San Diego State University, ²Computational Science Research Center, San Diego State University, ³Bioinformatics and Medical Informatics Research Center, San Diego State University, ⁴Department of Mathematics and Statistics, San Diego State University, ⁵Department of Computer Science, San Diego State University, ⁶Mathematics and Computer Science Division, Argonne National Laboratory, ⁷SPARC Committee, Broad Institute

Ici, nous présentons des approches phénomiques pour la caractérisation fonctionnelle des gènes de phages putatifs. Les techniques comprennent un test développé capable de surveiller le métabolisme anabolique de l’hôte, les plaques d’essai multiphénotypiques (MAPs), en plus de la méthode établie de métabolomique, capable de mesurer les effets sur le métabolisme catabolique.