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DOI: 10.3791/56896-v
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Nous présentons ici un protocole afin d’obtenir des données de trois couleurs smFRET et son analyse avec un ensemble 3D modèle de Markov caché. Avec cette approche, les scientifiques peuvent extraire informations cinétiques systèmes complexe des protéines, y compris coopérativité ou interactions corrélées.
L’objectif général de cette procédure est d’étudier la dynamique de systèmes protéiques complexes de manière quantitative en mettant l’accent sur les interactions corrélées telles que la coopérativité. Cette méthode peut aider à répondre à des questions clés dans le domaine de la biologie quantitative où les complexes protéiques et leurs interactions dynamiques sont d’une importance centrale. Le principal avantage de cette technique est qu’elle permet d’appliquer des FRET monomoléculaires multicolores dynamiques à des systèmes biologiquement pertinents.
Avant d’assembler la chambre d’écoulement, découpez un canal d’écoulement dans un film adhésif transparent de 40 microns d’épaisseur, pulvérisez un adhésif à fixation rapide sur le côté non adhésif du film et laissez sécher l’adhésif. Pour commencer l’assemblage de la chambre d’écoulement, procurez-vous une lame de quartz fondu fonctionnalisée PEG de trois millimètres d’épaisseur avec des trous d’entrée et de sortie. Appliquez le côté enduit d’adhésif en aérosol du film de plafond sur le côté fonctionnalisé de la diapositive, en alignant le canal avec les crochets d’entrée et de sortie.
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