Une plate-forme intégrée pour la cartographie de la Genome-wide, des États de la chromatine, à l’aide de la puce séquençage haut-débit dans les tissus de la tumeur

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5 avril 2018

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5 avril 2018

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Nous décrivons ici un protocole de puce-séquençage haut débit optimisé et pipeline analyses calcul pour la détermination de modèles État pangénomique chromatine de lignées de cellules et tissus tumoraux congelés.

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Modifications des histones

Chapters in this video

0:04

Titre

0:31

Traitement des tissus/lignées cellulaires et réticulation

1:57

Lyse tissulaire, sonication et préparation des anticorps

2:52

Immunoprécipitation de la chromatine

3:40

Lavage et réticulation inverse des complexes ADN-protéine immunoprécipités

4:43

Purification et quantification de l'ADN précipité

6:00

Génération de bibliothèques à l'aide du kit NEBNext Ultra II DNA Library Preparation Kit

7:53

Résultats : Immunoprécipitation de tissus et de cellules tumoraux par ChIP-seq à haut débit

9:23

Conclusion

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