Capture promoteur Salut-c : Haute résolution, Genome-wide profilage des Interactions de promoteur

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10:16 min

28 juin 2018

10.3791/57320-v

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Éléments de régulation de l’ADN, comme améliorateurs, contrôlent l’expression des gènes en contactant physiquement les promoteurs de gènes cibles, souvent par le biais des interactions chromosomiques à longue portée, s’étendant sur grandes distances de génomiques. Promoteur de Capture Hi-C (DAPE-C) identifie des interactions significatives entre les promoteurs et les régions distales, permettant l’attribution des séquences régulatrices potentiels de leurs gènes cibles.

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Bibliothèque Hi-C

Chapters in this video

0:04

Titre

0:52

Fixation au formaldéhyde

2:14

Digestion par HindIII et biotinylation des surplombs des fragments de restriction

4:09

Capture hybride en solution

6:53

Isolation des produits de ligation contenant des fragments de promoteurs

8:55

Résultats : Profil PCHi-C d'IL8 dans des cellules hématopoïétiques humaines

9:34

Conclusion

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