-1::1
Simple Hit Counter
Skip to content

Products

Solutions

×
×
Sign In

FR

EN - EnglishCN - 简体中文DE - DeutschES - EspañolKR - 한국어IT - ItalianoFR - FrançaisPT - Português do BrasilPL - PolskiHE - עִבְרִיתRU - РусскийJA - 日本語TR - TürkçeAR - العربية
Sign In Start Free Trial

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

Behavior
Biochemistry
Bioengineering
Biology
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
View All
JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

Biological Techniques
Biology
Cancer Research
Immunology
Neuroscience
Microbiology
JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduate courses

Analytical Chemistry
Anatomy and Physiology
Biology
Calculus
Cell Biology
Chemistry
Civil Engineering
Electrical Engineering
View All
JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

Advanced Biology
Basic Biology
Chemistry
View All
JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

Biology
Chemistry

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

Accounting
Finance
Macroeconomics
Marketing
Microeconomics

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Authors

Teaching Faculty

Librarians

K12 Schools

Biopharma

Products

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduates

JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Solutions

Authors
Teaching Faculty
Librarians
K12 Schools
Biopharma

Language

French

EN

English

CN

简体中文

DE

Deutsch

ES

Español

KR

한국어

IT

Italiano

FR

Français

PT

Português do Brasil

PL

Polski

HE

עִבְרִית

RU

Русский

JA

日本語

TR

Türkçe

AR

العربية

    Menu

    JoVE Journal

    Behavior

    Biochemistry

    Bioengineering

    Biology

    Cancer Research

    Chemistry

    Developmental Biology

    Engineering

    Environment

    Genetics

    Immunology and Infection

    Medicine

    Neuroscience

    Menu

    JoVE Encyclopedia of Experiments

    Biological Techniques

    Biology

    Cancer Research

    Immunology

    Neuroscience

    Microbiology

    Menu

    JoVE Core

    Analytical Chemistry

    Anatomy and Physiology

    Biology

    Calculus

    Cell Biology

    Chemistry

    Civil Engineering

    Electrical Engineering

    Introduction to Psychology

    Mechanical Engineering

    Medical-Surgical Nursing

    View All

    Menu

    JoVE Science Education

    Advanced Biology

    Basic Biology

    Chemistry

    Clinical Skills

    Engineering

    Environmental Sciences

    Physics

    Psychology

    View All

    Menu

    JoVE Lab Manual

    Biology

    Chemistry

    Menu

    JoVE Business

    Accounting

    Finance

    Macroeconomics

    Marketing

    Microeconomics

Start Free Trial
Loading...
Home
JoVE Journal
Neuroscience
Analyse automatisée optimisée de la modulation de l’homéostasie des mitochondries neuronales viva...
Analyse automatisée optimisée de la modulation de l’homéostasie des mitochondries neuronales viva...
JoVE Journal
Neuroscience
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Neuroscience
Optimized Automated Analysis of Live Neuronal Mitochondria Homeostasis Modulation by Isoform-Specific Retinoic Acid Receptors

Analyse automatisée optimisée de la modulation de l’homéostasie des mitochondries neuronales vivantes par des récepteurs d’acide rétinoïque spécifiques aux isoformes

Full Text
1,044 Views
08:33 min
July 28, 2023

DOI: 10.3791/65452-v

José J. M. Vitória1, Vinícius de Paula1, Odete A. B. da Cruz e Silva1, Diogo Trigo1

1Neuroscience and Signalling Laboratory, Institute of Biomedicine (iBiMED), Department of Medical Sciences,University of Aveiro

AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This study focuses on advancing the analysis of mitochondria, essential organelles for cellular function, by developing automated tools for efficient image processing. Using MATLAB, the researchers addressed the challenges posed by the complex mitochondrial network, enabling rapid analysis of timelapse images. The implications of mitochondrial anomalies for disease mechanisms and therapeutic strategies are also explored.

Key Study Components

Area of Science

  • Neuroscience
  • Mitochondrial Biology
  • Automated Imaging Analysis

Background

  • Mitochondria are crucial for various cellular functions.
  • Anomalies in mitochondria are linked to disease processes.
  • Improved microscopy and computational tools are essential for analyzing mitochondrial function.
  • High-resolution imaging and bioinformatic strategies are critical for detailed analysis.

Purpose of Study

  • To develop a MATLAB tool for analyzing live confocal images of mitochondria.
  • To enhance the efficiency of mitochondrial analysis through automation.
  • To address challenges in measuring mitochondrial parameters accurately.

Methods Used

  • Live confocal imaging systems for capturing mitochondrial dynamics.
  • Automated analysis tools developed using MATLAB.
  • Machine learning algorithms for image segmentation and quantification.
  • CRISPR-Cas9 for studying mitochondrial morphology.
  • Emphasis on developing non-invasive methods for in vivo studies.

Main Results

  • The study successfully developed a tool that automates mitochondrial analysis.
  • This tool improves the reliability and efficiency of quantifying mitochondrial parameters.
  • Addresses the complexity and variability of mitochondrial populations.
  • Highlights the relevance of mitochondrial function in disease and therapeutic applications.

Conclusions

  • The developed tool facilitates robust mitochondrial analysis, enhancing research in cell biology and disease mechanisms.
  • Contributes to the understanding of mitochondria in personalized medicine.
  • The study underscores the potential for novel therapeutic strategies targeting mitochondrial function.

Frequently Asked Questions

What advantages does the MATLAB tool provide for mitochondrial analysis?
The MATLAB tool automates the analysis process, significantly enhancing efficiency and reducing manual effort in handling large data volumes from mitochondrial imaging.
How can the imaging model be adapted for different experiments?
The imaging model can be adapted by incorporating various types of cell cultures or live imaging systems to study different biological questions concerning mitochondria.
What types of data are obtained through this analysis?
The analysis yields detailed quantification of mitochondrial parameters such as morphology, dynamics, and functional status, contributing to a better understanding of mitochondrial roles.
Are there any limitations to the automated analysis tool?
While the automated tool enhances efficiency, it may require validation against manual measurements to ensure accuracy, especially given mitochondrial heterogeneity.
In what ways can the findings impact therapeutic development?
The findings can lead to insights into mitochondrial-targeted therapies, potentially aiding in the design of personalized medicine approaches focused on mitochondrial dysfunction.
What is the significance of CRISPR-Cas9 in this study?
CRISPR-Cas9 is used to manipulate mitochondrial morphology, providing insights into how alterations at the mitochondrial level affect overall cellular function and health.

Le réseau mitochondrial est extrêmement complexe, ce qui le rend très difficile à analyser. Un nouvel outil MATLAB analyse les mitochondries confocales en direct dans des images timelapse, mais il en résulte un volume de sortie important nécessitant une attention manuelle individuelle. Pour résoudre ce problème, une optimisation de routine a été développée, permettant une analyse rapide des fichiers.

Mes recherches se sont concentrées sur le domaine des neurosciences, et en particulier, nous voulons comprendre les bases moléculaires de la maladie. Cela nous a amenés à examiner les cellules, leur structure et les organites qui remplissent les différentes fonctions cellulaires. De plus en plus, les mitochondries, elles ont reçu de plus en plus d’attention.

Les anomalies au niveau mitochondrial deviennent absolument fondamentales pour comprendre les processus pathologiques, et elles peuvent même fournir des cibles intéressantes pour de nouveaux médicaments ou stratégies thérapeutiques. Ici, à l’Université d’Aveiro, nous avons pu développer des outils intéressants pour étudier les mitochondries. Non seulement la microscopie et les approches plus traditionnelles, mais nous avons également pu optimiser les outils d’analyse automatisés couplés à des stratégies bioinformatiques pour pouvoir quantifier et fournir une analyse plus détaillée lors de la fonction mitochondriale.

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

Sign In Start Free Trial

Explore More Videos

Neurosciences numéro 197 Modulation de l’homéostasie Récepteurs de l’acide rétinoïque spécifiques aux isoformes Outils MATLAB Fichiers timelapse Traitement d’images Volume de sortie Attention manuelle Configurations expérimentales Optimisation de routine Code MATLAB Formulaires en direct Analyse de fichiers Lecture de documents Traitement de données Vitesse Données spécifiques à une trame Comportement des mitochondries Agonistes des récepteurs de l’acide rétinoïque

Related Videos

Détermination des espèces d'oxygène Potentiel membrane mitochondriale et réactive dans les neurones corticaux de rat en direct

09:56

Détermination des espèces d'oxygène Potentiel membrane mitochondriale et réactive dans les neurones corticaux de rat en direct

Related Videos

66.6K Views

Mesure des niveaux d’acide rétinoïque dans les neurosphères à l’aide d’une lignée cellulaire rapporteure d’acide rétinoïque

03:56

Mesure des niveaux d’acide rétinoïque dans les neurosphères à l’aide d’une lignée cellulaire rapporteure d’acide rétinoïque

Related Videos

532 Views

Mesure quantitative des niveaux relatifs à l'acide rétinoïque E8.5 Embryons et Neurosphère Cultures Utilisation du F9 RARE-Lacz base de cellules Reporter Assay

09:49

Mesure quantitative des niveaux relatifs à l'acide rétinoïque E8.5 Embryons et Neurosphère Cultures Utilisation du F9 RARE-Lacz base de cellules Reporter Assay

Related Videos

8.3K Views

L'analyse des rétinoïque induite par l'acide Neuro-Différenciation de cellules souches embryonnaires de souris en deux et trois dimensions corps embryoïdes

09:04

L'analyse des rétinoïque induite par l'acide Neuro-Différenciation de cellules souches embryonnaires de souris en deux et trois dimensions corps embryoïdes

Related Videos

9.5K Views

Détermination de la respiration mitochondriale et de la glycolyse dans des échantillons de tissu rétinien ex vivo

08:45

Détermination de la respiration mitochondriale et de la glycolyse dans des échantillons de tissu rétinien ex vivo

Related Videos

4.9K Views

Imagerie en direct du système mitochondrial dans les astrocytes en culture

06:20

Imagerie en direct du système mitochondrial dans les astrocytes en culture

Related Videos

4.7K Views

Imagerie en direct de l’état redox du glutathion mitochondrial dans les neurones primaires à l’aide d’un indicateur ratiométrique

07:47

Imagerie en direct de l’état redox du glutathion mitochondrial dans les neurones primaires à l’aide d’un indicateur ratiométrique

Related Videos

3.4K Views

Analyse en temps réel de la bioénergétique dans les cellules épithéliales pigmentaires rétiniennes humaines primaires à l’aide de la respirométrie à haute résolution

09:16

Analyse en temps réel de la bioénergétique dans les cellules épithéliales pigmentaires rétiniennes humaines primaires à l’aide de la respirométrie à haute résolution

Related Videos

3.1K Views

Analyse quantitative de la stabilisation de la membrane endoplasmique du réticulum (MAM) associée aux mitochondries dans un modèle neuronal de la maladie d’Alzheimer (MA)

06:41

Analyse quantitative de la stabilisation de la membrane endoplasmique du réticulum (MAM) associée aux mitochondries dans un modèle neuronal de la maladie d’Alzheimer (MA)

Related Videos

1.3K Views

Analyse quantitative des métabolites alimentaires de la vitamine A dans les tissus oculaires et non oculaires murins à l’aide de la chromatographie liquide à haute performance

05:03

Analyse quantitative des métabolites alimentaires de la vitamine A dans les tissus oculaires et non oculaires murins à l’aide de la chromatographie liquide à haute performance

Related Videos

1.8K Views

JoVE logo
Contact Us Recommend to Library
Research
  • JoVE Journal
  • JoVE Encyclopedia of Experiments
  • JoVE Visualize
Business
  • JoVE Business
Education
  • JoVE Core
  • JoVE Science Education
  • JoVE Lab Manual
  • JoVE Quizzes
Solutions
  • Authors
  • Teaching Faculty
  • Librarians
  • K12 Schools
  • Biopharma
About JoVE
  • Overview
  • Leadership
Others
  • JoVE Newsletters
  • JoVE Help Center
  • Blogs
  • JoVE Newsroom
  • Site Maps
Contact Us Recommend to Library
JoVE logo

Copyright © 2026 MyJoVE Corporation. All rights reserved

Privacy Terms of Use Policies
WeChat QR code