Isolement intestinal de larves de poisson-zèbre pour le séquençage de l’ARN unicellulaire

Notre recherche vise à étudier les changements transcriptomiques survenant au cours du développement gastro-intestinal et le dysfonctionnement chez les larves de poisson-zèbre. Ici, nous fournissons un nouveau protocole qui permet d’isoler différents types de cellules dans l’intestin du poisson-zèbre, ce qui a des applications potentielles dans la compréhension de la santé et des maladies gastro-intestinales. Au cours des dernières années, on s’est intéressé de plus en plus à l’interaction entre le système nerveux entérique et d’autres types de cellules intestinales au cours du développement et de la maladie.

La compréhension de ces dynamiques complexes à l’aide de techniques avancées telles que le séquençage de l’ARN unicellulaire a le potentiel de révéler des informations essentielles sur les neuromyopathies entériques, conduisant à des diagnostics et des traitements plus précis. À l’aide de ce protocole, nous avons réussi à identifier divers types de cellules intestinales, y compris les cellules épithéliales, stromales, sanguines, musculaires, immunitaires et même les neurones entériques et gliales, qui n’avaient pas été capturés auparavant à cette quantité en utilisant des approches similaires. Ainsi, nous fournissons une technique fiable pour étudier la composition gastro-intestinale au cours du développement et du dysfonctionnement.