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Un guide pratique de l’évolution quasi continue assistée par phage et robotique
Un guide pratique de l’évolution quasi continue assistée par phage et robotique
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Bioengineering
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JoVE Journal Bioengineering
A Practical Guide to Phage- and Robotics-Assisted Near-Continuous Evolution

Un guide pratique de l’évolution quasi continue assistée par phage et robotique

Full Text
2,308 Views
05:08 min
January 12, 2024

DOI: 10.3791/65974-v

Samir Aoudjane1, Stefan Golas2, Osaid Ather1, Michael J. Hammerling3, Erika DeBenedictis1

1The Francis Crick Institute, 2Massachusetts Institute of Technology, 3Future House

AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

L’évolution quasi continue assistée par phage et robotique (PRANCE) est une technique d’évolution rapide et robuste des protéines. La robotique permet la parallélisation des expériences, la surveillance en temps réel et le contrôle de la rétroaction.

Nous essayons de rendre le mystérieux processus de l’évolution suffisamment prévisible pour être utilisé pour l’ingénierie. PRANCE nous donne la possibilité d’intégrer l’évolution dans l’échelle de temps du laboratoire avec la parallélisation pour mieux la comprendre. L’automatisation des laboratoires intègre des concepts d’ingénierie logicielle plus générale, y compris l’IA, dans le développement du code de contrôle.

Les gens intègrent également des bras manipulateurs et des systèmes de convoyeurs multidirectionnels dans les plates-formes de manipulation des liquides. Dans l’ensemble, l’automatisation comprend une instrumentation et des flux de travail plus avancés. Le contrôle par rétroaction améliore le succès de l’évolution continue en empêchant les modes de défaillance courants comme l’extinction.

Ceci est essentiel lors des évolutions multiplexes où les molécules ont des activités de départ variables et où la rigueur de l’évolution dynamique est essentielle pour obtenir les résultats souhaités. Les nouvelles questions scientifiques incluent l’exploration de l’impact de différentes conditions sur l’évolution et l’examen des effets sur la propagation des phages et l’efficacité des circuits d’évolution. Grâce à ces outils d’ingénierie des protéines améliorés, nous cherchons à concevoir des protéines plus sophistiquées, sensibles à leur environnement et dynamiques dans leur fonction.

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