Utilisation du clivage sous cibles et du test de marquage (CUT & Tag) dans la recherche sur le myoblaste chez la souris

Les recherches de notre groupe portent sur la façon dont la structure et la transcription du génome des cellules souches musculaires squelettiques adultes sont régulées et maintenues, en particulier lors de changements de sulfates, comme l’engagement, la différenciation et le tinasis des cellules souches. Les cellules souches musculaires squelettiques adultes, qui ne représentent que 1 % des cellules mononucléées dans le tissu musculaire, présentent un défi pour les études des caractéristiques de la chromatine à l’aide de High-C, ChIPs et ATAC seq, en raison de leur rareté dans les suspensions unicellulaires obtenues par digestion musculaire. L’immunoprécipitation de la chromatine, ChIP, a été un outil clé pour le profilage des caractéristiques du génome.

Une technique de coupe et d’étiquetage plus simple et plus efficace, mise au point par le Dr Steven Henikoff, surpasse souvent la ChIP, en particulier dans l’étude de l’épigénétique dans des populations de cellules rares. Sa facilité d’utilisation élargit l’accessibilité pour les chercheurs, y compris les experts non épigénétiques.