Name: Identification d’espèces de mycobactéries par la méthode d’une puce à ADN (Vidéo) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-06-24T14:30:00.000+00:00
Duration: 6 min 27 s
Description: Découvrez une méthode de puce à ADN pour identifier rapidement les espèces de Mycobacterium avec une haute sensibilité et spécificité. Cette technique améliore le diagnostic clinique et permet une détection précoce des infections mycobactériennes.

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<ol><li>Primm, T. P., Lucero, C. A., Falkinham, J. O. III <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Health+impacts+of+environmental+mycobacteria%5BTitle%5D)+AND+%22Trends+Genet%22%5BJournal%5D)">Health impacts of environmental mycobacteria.</a> Trends Genet. 38 (8), 821-830 (2004).</li>
<li>Sawyer, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mycobacterium+bovis+and+its+impact+on+human+and+animal+tuberculosis%5BTitle%5D)+AND+%22Trends+Genet%22%5BJournal%5D)">Mycobacterium bovis and its impact on human and animal tuberculosis.</a> Trends Genet. 39 (8), 587-592 (2023).</li>
<li>Zhao, Q., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+impact+of+DNA+microarray+chip+technology+on+the+diagnosis+and+management+of+non-tuberculous+mycobacterial+infections+in+immunocompromised+patients%5BTitle%5D)+AND+%22Antimicrob+Agents+Chemother%22%5BJournal%5D)">The impact of DNA microarray chip technology on the diagnosis and management of non-tuberculous mycobacterial infections in immunocompromised patients.</a> Antimicrob Agents Chemother. 65 (12), e01500-e01500 (2021).</li>
<li>Liu, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+microarray-based+detection+of+drug-resistant+Mycobacterium+strains%3A+a+single-center+experience%5BTitle%5D)+AND+%22Clin+Microbiol+Infect%22%5BJournal%5D)">DNA microarray-based detection of drug-resistant Mycobacterium strains: a single-center experience.</a> Clin Microbiol Infect. 26 (10), 1400-1407 (2020).</li>
<li>Li, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comparative+evaluation+of+DNA+microarray+and+next-generation+sequencing+for+Mycobacterium+identification%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Infect+Dis%22%5BJournal%5D)">Comparative evaluation of DNA microarray and next-generation sequencing for Mycobacterium identification.</a> Int J Infect Dis. 118, 250-258 (2022).</li>
<li>Chen, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Optimizing+probe+design+for+DNA+microarray-based+Mycobacterium+identification%3A+a+computational+biology+approach%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Optimizing probe design for DNA microarray-based Mycobacterium identification: a computational biology approach.</a> BMC Microbiol. 19 (2), 120-129 (2019).</li>
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<li>Imran, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+microarray+technology+for+the+detection+and+identification+of+Mycobacterium+species%3A+a+review%5BTitle%5D)+AND+%22J+Microbiol+Biotechnol+Res%22%5BJournal%5D)">DNA microarray technology for the detection and identification of Mycobacterium species: a review.</a> J Microbiol Biotechnol Res. 6 (2), 275-285 (2020).</li>
<li>Garcia-Sanchez, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Advances+in+DNA+microarray+technology+for+Mycobacterium+detection+and+characterization%5BTitle%5D)+AND+%22J+Mol+Diagn%22%5BJournal%5D)">Advances in DNA microarray technology for Mycobacterium detection and characterization.</a> J Mol Diagn. 24 (5), 650-662 (2022).</li>
<li>Wang, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Machine+learning+analysis+of+SERS+fingerprinting+for+the+rapid+determination+of+Mycobacterium+tuberculosis+infection+and+drug+resistance%5BTitle%5D)+AND+%22Comput+Struct+Biotechnol+J%22%5BJournal%5D)">Machine learning analysis of SERS fingerprinting for the rapid determination of Mycobacterium tuberculosis infection and drug resistance.</a> Comput Struct Biotechnol J. 26 (20), 5364-5377 (2022).</li>
<li>Wang, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Integration+of+DNA+microarray+data+with+clinical+outcomes+in+tuberculosis+patients%3A+implications+for+personalized+medicine%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Diagn%22%5BJournal%5D)">Integration of DNA microarray data with clinical outcomes in tuberculosis patients: implications for personalized medicine.</a> Mol Diagn. 16 (3), 150-160 (2024).</li>
<li>Wang, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+identification+of+Mycobacterium+tuberculosis+complex+and+common+non-tuberculous+Mycobacteria+by+DNA+microarray+chip%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Rapid identification of Mycobacterium tuberculosis complex and common non-tuberculous Mycobacteria by DNA microarray chip.</a> BMC Microbiol. 21 (1), 242(2021).</li>
<li>Smith, J. D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+microarray+insights+into+Mycobacterium+epidemiology+and+control+strategies%5BTitle%5D)+AND+%22J+Clin+Microbiol%22%5BJournal%5D)">DNA microarray insights into Mycobacterium epidemiology and control strategies.</a> J Clin Microbiol. 60, e02033-e02121 (2022).</li>
<li>Garcia, L. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Tracking+Mycobacterial+spread+via+DNA+microarray%3A+a+community-based+study%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">Tracking Mycobacterial spread via DNA microarray: a community-based study.</a> PLoS One. 18 (3), e0282123(2023).</li>
<li>Li, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Economic+evaluation+of+DNA+microarray+chip+technology+in+Mycobacterium+diagnosis%5BTitle%5D)+AND+%22Diagnostics%22%5BJournal%5D)">Economic evaluation of DNA microarray chip technology in Mycobacterium diagnosis.</a> Diagnostics. 11 (12), 2235(2021).</li>
<li>Wang, Z., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cost-benefit+analysis+of+implementing+DNA+microarray+chip+for+Mycobacterium+detection+in+clinical+settings%5BTitle%5D)+AND+%22J+Med+Econ%22%5BJournal%5D)">Cost-benefit analysis of implementing DNA microarray chip for Mycobacterium detection in clinical settings.</a> J Med Econ. 25 (1), 113-122 (2022).</li>
<li>Liu, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((False+positives+and+false+negatives+in+DNA+microarray+chip+detection+of+Mycobacteria%3A+a+comprehensive+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Microb+Pathog%22%5BJournal%5D)">False positives and false negatives in DNA microarray chip detection of Mycobacteria: a comprehensive analysis.</a> Microb Pathog. 149, 104671(2020).</li>
<li>Chen, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Validation+and+improvement+of+DNA+microarray+chip+for+Mycobacterium+identification%3A+coping+with+genetic+variants%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Cell+Infect+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Validation and improvement of DNA microarray chip for Mycobacterium identification: coping with genetic variants.</a> Front Cell Infect Microbiol. 11, 627923(2021).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>Chlorure de sodium injectable à 0,9 % (NaCl)</td><td>FuZhou HAIWANGFUYAO</td><td>H35020289</td><td></td></tr><tr><td>Appareils d’amplification d’Applied Biosystems</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>Thermocycleur Veriti à 96 puits</td><td></td></tr><tr><td>CapitalBio LuxScan10K/B</td><td>CapitalBio</td><td>LuxScan10K/B</td><td></td></tr><tr><td>CapitalBio SlideWasher 24&nbsp ;</td><td>CapitalBio</td><td>SlideWasher 24&nbsp ;</td><td></td></tr><tr><td>&nbsp ; Centrifugeuse&nbsp ;</td><td>Eppendorf</td><td>5424R</td><td>MaX.speed 15000 min-1</td></tr><tr><td>Tampon d’hybridation</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Puce et couvercle de la puce à gènes HybSet</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Kit d’identification des espèces de Mycobacterium</td><td>CapitalBio</td><td>301030</td><td></td></tr><tr><td>Contrôles négatifs, contrôles positifs</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Extracteur d’acide nucléique</td><td>TIANLONG</td><td>GeneRotex 96</td><td></td></tr><tr><td>Réactif d’amplification PCR</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Tampon phosphate pH 6,8</td><td>ShangHai yuanye Bio-Technology</td><td>Référence R20029-10</td><td></td></tr><tr><td>Pipettes et pointes</td><td>Thermo Scientific</td><td>0,1 à 10 &mu ; L, 2 - 20 &mu ; L, et 20 - 200 &mu ; L, 100-1000 &mu ; L</td><td></td></tr><tr><td>qEx-DNA/RNA Kit d’extraction ou de purification d’acides nucléiques</td><td>TIANLONG</td><td>qEx-ADN/ARN</td><td></td></tr><tr><td>SDS</td><td>CapitalBio</td><td>441060</td><td></td></tr><tr><td>Hydroxyde de sodium (NaOH)</td><td>XILONGS&nbsp ; Scientifique</td><td>Référence : XK13-011-00027</td><td></td></tr><tr><td>SSC</td><td>CapitalBio</td><td>441050</td><td></td></tr><tr><td>bain-marie thermostatique</td><td>SURUI</td><td>HH-W600</td><td></td></tr></tbody></table>

identification d’espèces de mycobactéries par la méthode d’une puce à adn

Identification of Mycobacterium Species by DNA Microarray Chip Method

Des résultats positifs Pour les sondes du genre Mycobacterium (contrôle interne, CI) et de Mycobacterium tuberculosis, leurs valeurs de résultat positives sont déterminées par la méthode ROC (Receiver Operating Characteristic). Pour les sondes utilisées pour détecter les 16 autres MNT, leurs valeurs de résultat positives sont déterminées par la méthode du percentile.
Contrôle qualité expérimental Le résultat de détection du produit témo...

Identification d’espèces de mycobactéries par la méthode d’une puce à ADN

This study presents a DNA microarray chip method designed for the accurate identification of Mycobacterium species. By leveraging asymmetric PCR ...

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Médecine

Cette vidéo présente une méthode pour détecter les souches cyanobactériennes dans un échantillon environnemental à l’aide d’une puce à microréseaux d’anticorps. Les échantillons porteurs de diverses bactéries interagissent avec les anticorps imprimés, et l’immunomarquage avec des anticorps anti-cyanobactéries marqués au fluorophore révèle la présence de souches cyanobactériennes spécifiques par fluorescence à des endroits distincts.

Technique de détection de souches cyanobactériennes à l’aide d’une puce à microréseau d’anticorps

Un microréseau d'amplification asymétrique combine l'amplification par PCR et l'hybridation microarray dans une seule chambre, qui simplifie considérablement microarray flux de travail pour l'utilisateur final. Simplifier microarray flux de travail est une première étape nécessaire pour la création de diagnostics des biopuces qui peuvent être utilisées en routine dans des environnements à faibles ressources.

Faisant preuve d&#39;une multi-résistante<em&gt; Mycobacterium tuberculosis</em&gt; Amplification de puces à ADN

Microdissection a été largement utilisé pour l'examen de l'ADN, de l'ARN et de la protéine dans le tissu. microscopie de capture laser (LCM) est la méthode la plus couramment utilisée, mais une nouvelle technique de fraisage, mesodissection, est disponible depuis peu. Nous démontrons extraction d'ARN à partir mesodissected formol paraffine fixe des lames de tissus intégrés de granulomes de Mycobacterium tuberculosis.

Une nouvelle approche microdissection de la récupération<em&gt; Mycobacterium tuberculosis</em&gt; Transcriptions spécifiques de formol paraffine fixe embarqué poumon granulomes

Cet article vidéo décrit une méthode de puces à ADN sur la base in vitro afin de déterminer les gènes cibles et des sites de liaison pour deux régulateurs de réponse du système de composants.

ADN purifié par affinité Chip (DAP-puce) Méthode pour déterminer les cibles génétiques pour bactérienne Deux systèmes de réglementation composants

La spectrométrie de masse à temps de vol laser assistée par matrice (MALDI-TOF MS) et les techniques moléculaires (séquençage du gène de l’ARNr 16S) permettent d’identifier des pathogènes bactériens rares dans les diagnostics de routine. L’objectif de ce protocole réside dans la combinaison des deux techniques qui permet d’obtenir des données plus précises et plus fiables.

Identification des bactéries pathogènes rares par 16S ARNr Gene Séquençage et MALDI-TOF MS

La présence de toxines cyanobactériennes dans les réservoirs d’eau douce destinée à la consommation humaine est une préoccupation majeure pour les autorités chargées de la gestion de l’eau. Afin d’évaluer le risque de contamination de l’eau, cet article décrit un protocole de détection sur le terrain des souches de cyanobactéries dans des échantillons liquides et solides à l’aide d’une puce à microréseaux d’anticorps.

Protocole expérimental pour la détection cyanobactéries Dans les échantillons liquides et solides avec un anticorps Microarray Chip

EUCAST a développé un protocole de test direct de sensibilité aux antimicrobiens (AST) pour les hémocultures automatisées. Cependant, sa dépendance à l’identification microbienne basée sur la spectrométrie de masse peut être évitée en utilisant un protocole de préparation directe de l’inoculum dans un système automatisé d’identification microbienne. Cette approche permet de fournir des rapports AST dans les 24 heures suivant le prélèvement de l’échantillon.

Identification microbienne directe à l’aide d’un système automatisé d’identification microbienne pour faciliter la méthode RAST d’EUCAST sans spectrométrie de masse

La technique iChip utilise un dispositif d’isolement in situ simple et peu coûteux qui augmente les taux de découverte de nouveaux micro-organismes dans le sol. De nouveaux micro-organismes peuvent être utilisés pour des études plus approfondies relatives au microbiome du sol ou à la découverte de produits naturels, entre autres applications.

Isolement des micro-organismes du sol à l’aide de la technologie iChip

Ce protocole décrit la méthode CTAB pour extraire de l’ADN de haute qualité des mycobactéries, surmontant les défis posés par leurs parois cellulaires solides et riches en acide mycolique. Le processus implique la digestion enzymatique, la lyse cellulaire avec CTAB, et la purification de l’ADN par extraction organique et précipitation d’éthanol. Cette méthode produit de l’ADN adapté à des études moléculaires et fiable pour la recherche sur les mycobactériens.

Extraction d’acides désoxyribonucléiques par génome entier à partir d’espèces de Mycobacterium via la technique du bromure de cétyltriméthylammonium

Ici, nous proposons des méthodes simples pour tester et évaluer la présence d'espèces réactives de l'oxygène dans les cellules.

Production et détection d&#39;espèces réactives de l&#39;oxygène (ROS) dans les cancers

Découvrez une méthode de puce à ADN pour identifier rapidement les espèces de Mycobacterium avec une haute sensibilité et spécificité. Cette technique améliore le diagnostic clinique et permet une détection précoce des infections mycobactériennes.

Identification d’espèces de mycobactéries par la méthode d’une puce à ADN

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