Profilage spatial complet de transcriptomes agnostiques par stéréo-seq

Cet article présente un protocole permettant d’effectuer un profilage transcriptomique spatial complet de l’ARN de l’hôte, du virus, du fongique et du microbiome à partir de coupes de tissus fixés au formol et inclus dans de la paraffine à l’aide de Stereo-seq, qui permet de cartographier à haute résolution divers transcriptomes tout en préservant l’architecture tissulaire.