Name: Amplification combinée de la recombinase polymérase Essai CRISPR/Cas12a pour la détection de Fusarium oxysporum f. sp. cubense Tropical Race 4 (Vidéo) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-11-14T13:35:00.000+00:00
Duration: 6 min 47 s
Description: Découvrez une méthode rapide de détection de Fusarium oxysporum f. sp. cubense Tropical Race 4 par amplification combinée de la recombinase polymérase et CRISPR/Cas12a. Cette technique offre une alternative économique et précise pour la pathologie végétale.

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<ol><li>Viljoen, A., Ma, L. J., Molina, A. B. Fusarium Wilt (Panama Disease) and Monoculture in Banana Production: Resurgence of a Century-Old Disease. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aViljoen%2C+A+%22Emerging+Plant+Diseases+and+Global+Food+Security%22">Emerging Plant Diseases and Global Food Security</a>. , The American Phytopathological Society. St. Paul, MN. (2020).</li>
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<li>Zhang, Y. M., Zhang, Y., Xie, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evaluation+of+CRISPR%2FCas12a-based+DNA+detection+for+fast+pathogen+diagnosis+and+GMO+test+in+rice%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Breed%22%5BJournal%5D)">Evaluation of CRISPR/Cas12a-based DNA detection for fast pathogen diagnosis and GMO test in rice.</a> Mol Breed. 40 (1), 11(2020).</li>
<li>Wang, Q., Qin, M., Coleman, J. J., Shang, W., Hu, X. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+and+sensitive+detection+of+Verticillium+dahliae+from+complex+samples+using+CRISPR%2FCas12a+technology+combined+with+RPA%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Dis%22%5BJournal%5D)">Rapid and sensitive detection of Verticillium dahliae from complex samples using CRISPR/Cas12a technology combined with RPA.</a> Plant Dis. 107 (6), 1664-1669 (2023).</li>
<li>Sun, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+and+sensitive+detection+of+two+fungal+pathogens+in+soybeans+using+the+recombinase+polymerase+amplification%2FCRISPR-Cas12a+method+for+potential+on-site+disease+diagnosis%5BTitle%5D)+AND+%22Pest+Manag+Sci%22%5BJournal%5D)">Rapid and sensitive detection of two fungal pathogens in soybeans using the recombinase polymerase amplification/CRISPR-Cas12a method for potential on-site disease diagnosis.</a> Pest Manag Sci. 80 (3), 1168-1181 (2024).</li>
<li>Chen, Z., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+frontline%2C+rapid%2C+nucleic+acid-based+Fusarium+circinatum+detection+system+using+CRISPR%2FCas12a+combined+with+recombinase+polymerase+amplification%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Dis%22%5BJournal%5D)">A frontline, rapid, nucleic acid-based Fusarium circinatum detection system using CRISPR/Cas12a combined with recombinase polymerase amplification.</a> Plant Dis. 107 (6), 1902-1910 (2023).</li>
<li>Mu, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CRISPR-Cas12a-based+diagnostics+of+wheat+fungal+diseases%5BTitle%5D)+AND+%22J+Agric+Food+Chem%22%5BJournal%5D)">CRISPR-Cas12a-based diagnostics of wheat fungal diseases.</a> J Agric Food Chem. 70 (23), 7240-7247 (2022).</li>
<li>Li, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Visual+detection+of+Fusarium+temperatum+by+using+CRISPR-Cas12a+empowered+LAMP+assay+coupled+with+AuNPs-based+colorimetric+reaction%5BTitle%5D)+AND+%22LWT%22%5BJournal%5D)">Visual detection of Fusarium temperatum by using CRISPR-Cas12a empowered LAMP assay coupled with AuNPs-based colorimetric reaction.</a> LWT. 185, 115190(2023).</li>
<li>Liang, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Development+of+an+RPA-based+CRISPR%2FCas12a+assay+in+combination+with+a+lateral+flow+strip+for+rapid+detection+of+toxigenic+Fusarium+verticillioides+in+maize%5BTitle%5D)+AND+%22Food+Control%22%5BJournal%5D)">Development of an RPA-based CRISPR/Cas12a assay in combination with a lateral flow strip for rapid detection of toxigenic Fusarium verticillioides in maize.</a> Food Control. 157, 110172(2024).</li>
<li>Matthews, M. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+combined+recombinase+polymerase+amplification+CRISPR%2FCas12a+assay+for+detection+of+Fusarium+oxysporum+f.+sp.+cubense+tropical+race+4%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Rep%22%5BJournal%5D)">A combined recombinase polymerase amplification CRISPR/Cas12a assay for detection of Fusarium oxysporum f. sp. cubense tropical race 4.</a> Sci Rep. 15 (1), 2436(2025).</li>
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<li>Blomme, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Bacterial+diseases+of+bananas+and+enset%3A+Current+state+of+knowledge+and+integrated+approaches+toward+sustainable+management%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Plant+Sci%22%5BJournal%5D)">Bacterial diseases of bananas and enset: Current state of knowledge and integrated approaches toward sustainable management.</a> Front Plant Sci. 8, 1290(2017).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>Protéine EnGen Lba Cas12a (Cfp1)</td><td>New England Biolabs</td><td>M0653T</td><td></td></tr><tr><td>Diluant EnGen Lba Cas12a</td><td>New England Biolabs</td><td>B0653A</td><td></td></tr><tr><td>Eppendorf PCR Tubes</td><td>Merck</td><td>EP0030124332</td><td></td></tr><tr><td>Tubes micro à verrouillage Eppendorf</td><td>Merck</td><td>EP0030121708</td><td></td></tr><tr><td>Sacs d’extraction universels</td><td>BIOREBA</td><td>430100</td><td></td></tr><tr><td>Échelle ADN GeneRuler 100 pb</td><td>Thermo Fischer Scientific</td><td>SM0241 / SM0242</td><td></td></tr><tr><td>Genie Centrifuge Mini-6KO</td><td>OptiGene</td><td>OP-FUGE</td><td></td></tr><tr><td>Génie III</td><td>OptiGene</td><td>https://www.optigene.co.uk/instruments/genie-iii/&nbsp ;</td><td></td></tr><tr><td>Porte-bande Genie</td><td>OptiGene</td><td>GBLOCK-01 / GBLOCK-02 / GBLOCK-03</td><td></td></tr><tr><td>Genie Strips</td><td>OptiGene</td><td>OP-0008-50 / OP-0008-500</td><td></td></tr><tr><td>Kit de synthèse d’ARN à haut rendement HiScribe T7</td><td>New England Biolabs</td><td>E2040S</td><td></td></tr><tr><td>Spectrophotomètre UV/Vis NanoDrop ND-1000</td><td>Thermo Fischer Scientific</td><td>https://caeonline.com/buy/spectrometers/nanodrop-nd-1000/293669253</td><td></td></tr><tr><td>NEBuffer 3</td><td>New England Biolabs</td><td>B7003S</td><td></td></tr><tr><td>NEBuffer r2.1</td><td>New England Biolabs</td><td>B6002S</td><td></td></tr><tr><td>Poudre de polyvinylpyrrolidone (PVP)</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>9003-39-8</td><td></td></tr><tr><td>Kit RNA Clean et Concentrateur-5</td><td>Zymo Research</td><td>R1013</td><td></td></tr><tr><td>Colorant de charge d’ARN</td><td>Thermo Fischer Scientific</td><td>R0641</td><td></td></tr><tr><td>Téléilluminateur SmartBlue Blue Light</td><td>Accuris Instruments</td><td>E4000-E</td><td></td></tr><tr><td>Granulés d’hydroxyde de sodium (NaOH)</td><td>Merck, EMPARTA</td><td>K277</td><td></td></tr><tr><td>Tris (hydroxylméthyl) aminométhane</td><td>Merck</td><td>77-86-1</td><td></td></tr><tr><td>Kit Liquide Base TwistAmp</td><td>TwistDx</td><td>TALQBAS01</td><td></td></tr></tbody></table>

amplification combinée de la recombinase polymérase essai crispr/cas12a pour la détection de fusarium oxysporum f. sp. cubense tropical race 4

Combined Recombinase Polymerase Amplification CRISPR/Cas12a Assay for Detecting Fusarium oxysporum f. sp. cubense Tropical Race 4

Amplification combinée de la recombinase polymérase Essai CRISPR/Cas12a pour la détection de Fusarium oxysporum f. sp. cubense Tropical Race 4

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Utilisation de l'assemblage de l'ADN, de multiples vecteurs de CRISPR peuvent être construits en parallèle dans une réaction de clonage unique, ce qui rend la construction d'un grand nombre de vecteurs CRISPR une tâche simple. Tomate racines chevelues sont un excellent modèle pour valider des vecteurs CRISPR et de générer des matériaux mutantes.

Haut-débit CRISPR Vector Construction et caractérisation de l&#39;ADN Modifications par génération de tomate Poilu Roots

Nous décrivons une stratégie de remplacement de gène robuste pour manipuler génétiquement le champignon Ustilago maydis. Ce protocole explique comment générer des mutants de deletion pour enquêter sur les phénotypes d'infection. Elle peut être étendue à modifier les gènes de manière quelconque, par exemple en ajoutant une séquence codant pour une étiquette de protéine fluorescente.

Manipulation génétique de l&#39;agent pathogène des plantes<em&gt; Ustilago maydis</em&gt; Pour étudier la biologie de Fungal and Plant Microbe Interactions

Nous présentons ici une méthode pour l’ingénieur le génome de c. elegans en utilisant CRISPR-Cas9 ribonucléoprotéines et modèles de réparation dépendant d’homologie.

Un rapide et Facile de Pipeline pour générer des Mutants de Point génomique dans c. elegans en utilisant CRISPR/Cas9 ribonucléoprotéines

L’objectif de ce protocole est de permettre l’édition CRISPR/Cas9 transparente du génome de C. elegans en utilisant des complexes de ribonucléoprotéines assemblés et le marqueur co-CRISPR dpy-10 pour le dépistage. Ce protocole peut être utilisé pour effectuer une variété de modifications génétiques chez C. elegans, y compris des insertions, des délétions, des remplacements de gènes et des substitutions de codon.

CRISPR/Cas9 Édition du gène C. elegans rbm-3.2 à l’aide du marqueur de criblage co-CRISPR dpy-10 et des complexes de ribonucléoprotéines assemblés.

Dans ce travail, une méthode de détection rapide, sensible et portable pour Candidatus Liberibacter asiaticus basée sur l’amplification de la polymérase recombinase combinée à CRISPR-Cas12a a été développée.

Détection de Candidatus liberibacter asiaticus déployable sur le terrain à l’aide de l’amplification de la polymérase recombinase combinée à CRISPR-Cas12a

Les systèmes CRISPR-Cas et les protéines anti-CRISPR ont été intégrés dans le schéma des portes booléennes chez Saccharomyces cerevisiae. Les nouveaux petits circuits logiques ont montré de bonnes performances et approfondi la compréhension des facteurs de transcription basés sur dCas9 / dCas12a et des propriétés des protéines anti-CRISPR.

Circuits numériques géniques basés sur des systèmes CRISPR-CAS et des protéines anti-CRISPR

Nous présentons un protocole qui combine l’amplification de la polymérase recombinase avec un système CRISPR/Cas12a pour la détection de traces de virus à ADN et construisons une microscopie portable pour smartphone avec une classification assistée par l’intelligence artificielle pour la détection des virus à ADN au point de service.

Système de détection de virus à ADN basé sur RPA-CRISPR/Cas12a-SPM et Deep Learning

Ici, nous présentons la préparation étape par étape de l’amplification isotherme prémélangée et lyophilisée basée sur la recombinase et des réactions basées sur CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats), qui peuvent être utilisées pour la détection de biomarqueurs d’acides nucléiques d’agents pathogènes de maladies infectieuses ou d’autres marqueurs génétiques d’intérêt.

Diagnostics basés sur CRISPR au point d’intervention avec réactifs prémélangés et lyophilisés

Pour faciliter la détection rapide et précise d’Acinetobacter baumannii, nous présentons un protocole qui utilise l’amplification par polymérase recombinase (RPA) en conjonction avec l’endonucléase LbaCas12a pour identifier les infections à A. baumannii .

Détection rapide et spécifique des infections à Acinetobacter baumannii à l’aide d’un système d’amplification par polymérase recombinase/système à base de Cas12a

Ici, nous décrivons une procédure simple et rapide pour détecter l’ADN d’agents pathogènes d’abeilles, tels que Lotmaria passim et Nosema ceranae, à l’aide d’une lyse cellulaire prête à l’amplification, d’une amplification par polymérase recombinase et de tests CRISPR/Cas12a.

Détection sur site de l’ADN des parasites trypanosomatidés et de Nosema ceranae par lyse alcaline couplée au système RPA/CRISPR/Cas12a

Découvrez une méthode rapide de détection de Fusarium oxysporum f. sp. cubense Tropical Race 4 par amplification combinée de la recombinase polymérase et CRISPR/Cas12a. Cette technique offre une alternative économique et précise pour la pathologie végétale.

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Amplification combinée de la recombinase polymérase Essai CRISPR/Cas12a pour la détection de Fusarium oxysporum f. sp. cubense Tropical Race 4

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