Name: Essai de biodégradation aérobie de matériaux à l’aide d’un inoculum naturel d’eau de mer marine et d’un respiromètre en boucle fermée (Vidéo) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-10-24T13:40:00.000+00:00
Duration: 8 min 43 s
Description: Découvrez un protocole de biodégradation aérobie de matériaux en milieu marin utilisant un inoculum d'eau de mer naturelle et un respiromètre en boucle fermée. Cette méthode standardisée permet de quantifier les taux de dégradation pour l'industrie et la recherche.

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<ol><li>Avio, C. G., Gorbi, S., Regoli, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Plastics+and+microplastics+in+the+oceans%3A+From+emerging+pollutants+to+emerged+threat%5BTitle%5D)+AND+%22Marine+Environ+Res%22%5BJournal%5D)">Plastics and microplastics in the oceans: From emerging pollutants to emerged threat.</a> Marine Environ Res. 128, 2-11 (2017).</li>
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</ol>

<table><tbody><tr><td>0,2 & micro ; M, filtre acétate de cellulose de 47 mm</td><td>Géofiltre géotechnique</td><td>83100056</td><td>Filtrer l’eau de mer</td></tr><tr><td>Pipette volumétrique de 100 mL</td><td>Thermo Fisher Scientific, Fisherbrand</td><td>13-650-2U</td><td>Classe A ; L’acide lixivié et rincé à l’eau déionisée</td></tr><tr><td>Béchers en verre de 100 à 600 mL</td><td>Thermo Fisher Scientific, Fisherbrand</td><td>50-194-5690</td><td>Classe A ; L’acide lixivié et rincé à l’eau déionisée</td></tr><tr><td>Des billes de fraisage de 20 mm</td><td>Retsch</td><td>53680062</td><td>Acier inoxydable. Utilisé avec un bocal de mouture pour le mouture cryogénique du polymère</td></tr><tr><td>Bocaux de broyage de 50 mL</td><td>Retsch</td><td>14620216</td><td>Acier inoxydable. Utilisé avec des boules de mouture de 400 et de 20 mm Mixer Mill pour le moulin cryogénique du polymère</td></tr><tr><td>Pipet volumétrique de 75 mL</td><td>Thermo Fisher Scientific, Fisherbrand</td><td>13-650-2T</td><td>Classe A ; L’acide lixivié et rincé à l’eau déionisée</td></tr><tr><td>Pompe à air et système de bulles</td><td>Tetra</td><td>77846</td><td>Aérer l’eau de mer lors de l’équilibre avant l’incubation</td></tr><tr><td>Feuille d’aluminium</td><td>Fisherbrand</td><td>01-213-100</td><td>Couverture pour l’autoclavage et un stockage propre</td></tr><tr><td>Chlorure d’ammonium (NH4Cl)</td><td>Thermo Fisher Scientific, Fisher Chemical</td><td>A661-500</td><td>Pic de nutriments dans l’eau de mer</td></tr><tr><td>Bilan analytique</td><td>Mettler</td><td>AT201</td><td>Peser les substrats expérimentaux et de contrôle</td></tr><tr><td>Autoclave</td><td>Tuttnauer</td><td>MFI-TTN-3870EA</td><td>Stériliser les récipients et les ensembles de couvercles</td></tr><tr><td>Micro-Oxymax de base 120VAC à canal unique</td><td>Columbus Instruments</td><td>0135-8000</td><td>Utilisé pour stocker des contrôles positifs et des polymères</td></tr><tr><td>Gaz d’étalonnage</td><td>Airgas</td><td>X03NI92P3000001</td><td>Mélanges primaires de gaz standard ; 2,7 % de dioxyde de carbone, 4,5 % de méthane, équilibre azote</td></tr><tr><td>Moniteur d’ordinateur</td><td>Dell</td><td>210-BMKK</td><td>Moniteur hub USB-C Dell Pro 24 Plus. Utilisé avec ordinateur pour exécuter le logiciel Micro-Oxymax</td></tr><tr><td>Gants cryogéniques</td><td>Thermo Fisher Scientific, Tempshield, Gants Cryo</td><td>11-394-306</td><td>Utilisé pour manipuler l’azote liquide</td></tr><tr><td>Thermomètre à cadran</td><td>Thermo Fisher Scientific, H-B Instrument Durac</td><td>13-201-433</td><td>Thermomètre calibré pour la température de l’eau de mer au moment de la collecte</td></tr><tr><td>Pipettes jetables</td><td>Thermo Fisher Scientific, Fisherbrand</td><td>13-711-7M</td><td>Rincez les parois du récipient pour libérer le matériau</td></tr><tr><td>Boîtier ENC52 à contrôle de température et de lumière</td><td>Columbus Instruments</td><td>4740-4054</td><td>Maintenir les conditions de température et de lumière</td></tr><tr><td>Pinces à flasques</td><td>Thermo Fisher Scientific, Fisherbrand</td><td>S07387</td><td>Utilisé pour manipuler des bocaux de mouture dans de l’azote liquide</td></tr><tr><td>Fioles, 250 mL</td><td>DWK Sciences de la Vie</td><td>14395-250</td><td>Récipients du réacteur d’échantillons</td></tr><tr><td>Fioles en coquille de verre avec bouchons de type bouchon</td><td>Thermo Fisher Scientific, Fisherbrand</td><td>03-339-26D</td><td>Stockage des échantillons</td></tr><tr><td>Profondeur portatif H22PX</td><td>West Marine, Norcross Marine</td><td>6849368</td><td>Déterminer la profondeur du site de collecte de l’eau de mer</td></tr><tr><td>GPS portable 73</td><td>Garmin</td><td>10-01504-00</td><td>Utilisé pour déterminer l’emplacement du site de collecte de l’eau de mer</td></tr><tr><td>Poêle HDPE</td><td>Thermo Scientific, Nalgene</td><td>13-359-26</td><td>Utilisé pour faire l’acidification de la verrerie&nbsp ; dans une solution à 10 % HCl</td></tr><tr><td>Acide chlorhydrique (solution d’eau acide)</td><td>Thermo Fisher Scientific, Fisher Chemical</td><td>A144-212</td><td>ACS certifié Plus, 36,5 à 38,0 %. Contrôle des capteurs CO2 et verrerie à lessivation d’acide</td></tr><tr><td>Hotte à écoulement laminaire</td><td>Sciences de l’air</td><td>FLOW-48-A</td><td>Minimiser les contaminants aériens lors de la préparation de l’échantillon</td></tr><tr><td>Grand Niskin ; Bouteille Beta Plus uniquement - 8,2L horizontal, PVC</td><td>La science d’abord</td><td>3-1980-H65</td><td>Pour la collecte d’eau de mer depuis la jetée ou le bateau</td></tr><tr><td>Bac à azote liquide</td><td>Thermo Fisher Scientific, Bel Art Magic Touch 2</td><td>11-999-063</td><td>Conserver de l’azote liquide &nbsp ;</td></tr><tr><td>Récipient de transfert d’azote liquide, 10 L</td><td>Thermo Scientific</td><td>TY509X2</td><td>Stocker et distribuer de l’azote liquide pour la cryousine</td></tr><tr><td>Azote liquide, qualité industrielle, 22 PSI</td><td>Airgas</td><td>NI 180LT22</td><td>Utilisé pour fragiliser et moudre les polymères</td></tr><tr><td>Crible mécanique</td><td>Humbolt, Grainger</td><td>5DPL6</td><td>Analyse de tamisage pour la distribution de la taille des particules</td></tr><tr><td>Micro-Oxymax&nbsp ;</td><td>Columbus Instrumentts</td><td>7395-113-D64</td><td>Joint torique scellé en silicone, port métallique avec 3 raccords, et bouchon à vis GL45 & nbsp ;</td></tr><tr><td>Interface d’expansion Micro-Oxymax 10 canaux</td><td>Columbus Instruments</td><td>0135-8101</td><td>Composant du système de respirométrie</td></tr><tr><td>Micro-Oxymax Respiromètre (capteur CO2 3 %)</td><td>Columbus Instruments</td><td>0135-8403</td><td>Infrarouge non dispersif</td></tr><tr><td>Broyeur mélangeur 400</td><td>Retsch</td><td>207450001</td><td>Moulin à mélangeur 400. Utilisé pour le mouture cryogénique de polymères</td></tr><tr><td>Contrôleur de pipette motorisée</td><td>Eppendorf</td><td>4430000018</td><td>Transfert de l’eau de mer vers les récipients du réacteur d’échantillonnage</td></tr><tr><td>Bouteille de laboratoire HDPE à bouche étroite ambrée, 1 L</td><td>Thermo Scientific, Nalgene</td><td>02-923-5</td><td>Échantillon discret d’eau de mer en eau entière</td></tr><tr><td>Nylon mesh 20 microns</td><td>ELKO Filtering Co.</td><td>41718</td><td>Utilisé pour tamiser l’eau de mer brute afin d’éliminer les particules hétérogènes plus grandes</td></tr><tr><td>Vibrateur orbital en plein air</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>SK4000</td><td>Maintenir le mouvement orbital des récipients du réacteur pendant l’incubation</td></tr><tr><td>OptiPlex 5090 Petit Ordinateur de Forme</td><td>Dell</td><td>C0SL03</td><td>Ordinateur Desktom utilisé pour exécuter le logiciel Micro-Oxymax & nbsp ;</td></tr><tr><td>Compteur pH/Cond</td><td>Mettler Toledo, SevenExcellence S470-Basic</td><td>30046252</td><td>Compteur de pH/conductivité de laboratoire pour mesurer l’inoculum initial et final de l’eau de mer</td></tr><tr><td>Bouteille de polyéthylène, 60 mL</td><td>Qorpak</td><td>PLC-03564</td><td>Échantillon discret d’eau de mer filtrée</td></tr><tr><td>Phosphate de potassium monobase (KH2(PO4))</td><td>Thermo Fisher Scientific, Fisher BioReagents</td><td>BP362-500</td><td>Pic de nutriments dans l’eau de mer</td></tr><tr><td>Équilibre de précision</td><td>Sartorius</td><td>Practum2102-1S</td><td>Pèser le tare et le poids total des récipients</td></tr><tr><td>Carboy rond, 20 L</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>02961A</td><td>Lixiviation acide pour le stockage de l’eau de mer</td></tr><tr><td>Lunettes de sécurité</td><td>Thermo Fisher Scientific, Fisherbrand</td><td>19-181-513</td><td></td></tr><tr><td>Scoopula</td><td>Thermo Fisher Scientific, Fisherbrand, Scoopula</td><td>01-257-567</td><td>Scoopula de laboratoire en acier inoxydable</td></tr><tr><td>Tamis</td><td>Advantech, Grainger</td><td>40PR18-40PR55</td><td>Tamis en acier inoxydable. Le nombre de tamis et les tailles dépendront du matériau testé.</td></tr><tr><td>Cellulose Sigmacell, Type 101</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>435236-250G</td><td>Poudre, substrat de contrôle positif</td></tr><tr><td>Sodium Bicarbonate</td><td>Thermo Fisher Scientific, Fisher Chemical</td><td>S233-500</td><td>Contrôle du capteur CO2</sous></td></tr><tr><td>Sulfite de sodium, anhydre, 98 %</td><td>Thermo Fisher Scientifique, Thermo Sciences Chimiques</td><td>AAA1793336</td><td>Contrôle du capteur CO2</sous></td></tr><tr><td>Sonde thermomètre/thermistance</td><td>Fisherbrand</td><td>15-079-700</td><td>Vérifier la température de l’incubateur</td></tr><tr><td>Baromètre à cadran de précision traçable</td><td>Fisherbrand</td><td>14-648-51</td><td>Enregistrer la pression atmosphérique au début de l’expérience</td></tr><tr><td>Victor Régulateur à deux étages à hydrogène de moyenne capacité, méthane, CGA - 350</td><td>AirGas</td><td>VIC0781-3559</td><td>Régulateur de gaz d’étalonnage & nbsp ;</td></tr><tr><td>Fioles volumétriques, 2 L</td><td>Thermo Fisher Scientific, Fisherbrand</td><td>FB4002000</td><td>Classe A ; l’acide lixivié et rincé à l’eau déionisée. Utilisé pour préparer de l’eau de mer riche en nutriments.</td></tr><tr><td>Bassins de pesée</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>02-202-101</td><td>Polyéthylène</td></tr></tbody></table>

essai de biodégradation aérobie de matériaux à l’aide d’un inoculum naturel d’eau de mer marine et d’un respiromètre en boucle fermée

Aerobic Biodegradation Testing of Materials Using a Natural Marine Seawater Inoculum and Closed Loop Respirometer

Essai de biodégradation aérobie de matériaux à l’aide d’un inoculum naturel d’eau de mer marine et d’un respiromètre en boucle fermée

Proper assessment of biodegradable materials depends on the wide adoption of standard test methods. Although such methods exist, testing capacity remains ...

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L'échelle du laboratoire digesteurs anaérobies permettre aux scientifiques de la recherche de nouvelles façons d'optimiser les applications existantes de la biotechnologie anaérobie et d'évaluer le potentiel du méthane production de divers déchets organiques. Cet article présente un modèle généralisé pour la construction, l'inoculation, l'exploitation et la surveillance d'un laboratoire échelle agité en continu digesteur anaérobie.

Continu agité digesteur anaérobie pour convertir les déchets organiques en biogaz: configuration du système et le fonctionnement de base

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Dépistage des bactéries marines pour l’isolement des souches dégradant les polluants

Source : Villela, H. D. M. , et al. Prospection de souches microbiennes pour la bioremédiation et le développement de probiotiques pour la recherche et la préservation des métaorganismes. J. Vis. Exp. (2019)Cette vidéo démontre l’isolement sélectif des bactéries marines dégradant le pétrole en enrichissant des échantillons d’eau de mer sur des milieux pétroliers, permettant la récupération de souches pures susceptibles d’être utilisées dans la bioremédiation du pétrole brut et le nettoyage...

Enrichissement sélectif et isolement des bactéries marines dégradant le pétrole à partir d’échantillons d’eau de mer

La réduction microbienne du sulfate est un processus d’une grande importance en biotechnologie environnementale. Le succès des réacteurs sulfurogènes dépend entre autres de la composition microbienne des boues. Ici, nous présentons un protocole pour développer des boues sulfurogènes à partir de sédiments de cheminées hydrothermales dans un réacteur UASB à des fins de déchloration réductrice.

Développement de sulfurogènes boues de sédiments marins et la réduction de trichloroéthylène dans une couverture Réacteur à refoulement de boue anaérobie

La pollution affecte tous les biomes. Les milieux marins ont été particulièrement touchés, en particulier les récifs coralliens, l'un des écosystèmes les plus sensibles de la Planète. La bioremédiation est la capacité des organismes à dégrader les contaminants. Ici, nous décrivons des méthodologies pour isoler et tester des microbes présentant la capacité de bioremédiation et les caractéristiques probiotiques potentielles pour des coraux.

Prospection de souches microbiennes pour le développement de bioremédiation et de probiotiques pour la recherche et la préservation des méta-organismes

Ce protocole présente une méthode d’évaluation du taux d’alimentation du crustacé xylophage Limnoria en mesurant la production de granulés fécaux. Cette méthode est conçue pour être utilisée dans des laboratoires non spécialisés et peut être incorporée dans des protocoles d’essai standard afin d’évaluer la durabilité accrue du bois dans des conditions marines.

Test rapide de résistance du bois à la biodégradation par les crustacés marins xylophages

Nous présentons ici un protocole de criblage de la biodiversité des sols afin de rechercher les souches fongiques impliquées dans la dégradation des matériaux récalcitrants. Tout d’abord, les souches fongiques capables de se développer sur les acides humiques ou la lignocellulose sont isolées. Leur activité est ensuite testée à la fois dans des essais enzymatiques et sur des polluants tels que les hydrocarbures et les plastiques.

Isolement et dépistage de la biodiversité du sol à la recherche de champignons impliqués dans la dégradation des matériaux récalcitrants

Ce protocole décrit la mise en place et le fonctionnement d’un système de micro-respirométrie qui peut être utilisé pour étudier les caractéristiques physiologiques de l’holobionte corallien.

Caractérisation physiologique de l’holobionte corallien à l’aide d’un nouvel outil de micro-respirométrie

La pollution de l’air a un impact sur la qualité de vie de tous les organismes. Nous décrivons ici l’utilisation de la biotechnologie des microalgues pour le traitement du biogaz (élimination simultanée du dioxyde de carbone et du sulfure d’hydrogène) et la production de biométhane par le biais de bassins d’algues semi-industriels ouverts à haut débit et l’analyse ultérieure de l’efficacité du traitement, du pH, de l’oxygène dissous et de la croissance des microalgues.

Purification du biogaz par l’utilisation d’un système microalgue-bactérien dans des étangs semi-industriels à haute teneur en algues

L’objectif de cet article est de détailler les meilleures pratiques pour la fabrication de milieux pour les micro-organismes anaérobies exigeants acquis dans un environnement. Ces méthodes aident à gérer les cultures anaérobies et peuvent être appliquées pour soutenir la croissance de micro-organismes insaisissables non cultivés, la « matière noire microbienne ».

Ensemble de formats de milieux simulés in situ pour la culture de micro-organismes anaérobies acquis dans l’environnement

Ce protocole décrit une bonne pratique pour déterminer la production de méthane et les paramètres cinétiques microbiens à l’aide de la respirométrie pour le microbiote anaérobie, la co-digestion des déchets alimentaires et des boues activées par les déchets.

Mesure du potentiel biométhanique des déchets alimentaires co-digérés en anaérobie avec des boues activées par les déchets à l’aide de la respirométrie

Découvrez un protocole de biodégradation aérobie de matériaux en milieu marin utilisant un inoculum d'eau de mer naturelle et un respiromètre en boucle fermée. Cette méthode standardisée permet de quantifier les taux de dégradation pour l'industrie et la recherche.

Essai de biodégradation aérobie de matériaux à l’aide d’un inoculum naturel d’eau de mer marine et d’un respiromètre en boucle fermée (Vidéo) | JoVE Journal

Essai de biodégradation aérobie de matériaux à l’aide d’un inoculum naturel d’eau de mer marine et d’un respiromètre en boucle fermée

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