Name: how scientists identify bacteria and fungi
Uploaded: 2019-01-29T11:04:46.000Z
Duration: 5 min 6 s
Channel: JoVE

K12 Standards

Louisiana Student Standards for Science

High School

Life Sciences

ecosystems-interactions-energy-and-dynamics

Ecosystems: Interactions, Energy And Dynamics

HS-LS2-7

Microbial and Fungal Diversity

מיקרואורגניזמים מוגדרים כצורות חיים קטנות מכדי לראות בעין בלתי. אבל בעוד שאנחנו בדרך כלל לא רואים אותם, מיקרובים נמצאים בכל מקום, עושים דברים טובים כמו לעזור לעיכול שלנו או להכין יוגורטים ויין, לדברים לא כל כך טובים כמו גרימת זיהום או מחלות. 
אם כבר מדברים על זיהומים, בשנת 1928, אלכסנדר פלמינג חזר למעבדה שלו מחופשה, והבחין זיהום פטרייה מוזר על אחת מצלחות תרבית החיידקים שלו. באופן מעניין, מושבות החיידקים סביב הזיהום נהרסו. תצפית זו הובילה למחקר רב יותר, שבסופו של דבר הגיע לשיאו בפיתוח פניצילין ואנטיביוטיקה אחרת שיכולה לטפל בזיהומים חיידקיים. עם זאת, אף על פי שהם עשויים לחיות זה לצד זה בעולם המיקרוסקופי, אנו יודעים מחקירת הצורות והפילוגניות שלהם שחיידקים ופטריות הם אורגניזמים שונים ומגוונים בתכלית. בואו נעבור בקצרה על כמה מהמאפיינים המגדירים של שתי הקבוצות העיקריות הללו. 
חיידקים הם פרוקריוטים חד-תאיים, כלומר הם אורגניזמים חד-תאיים ללא גרעין. לכל החיידקים יש דופן תא, אך הרכבו ועובייתו משתנים. לחיידקים גראם חיוביים יש דופן תא עם שכבה פפטידוגליקנית עבה, אשר שומרת בקלות על מולקולות סגולות גבישיות בצביעת גרם. עם זאת, לחיידקים גראם שליליים יש דופן תא דקה המוקפת בקרום ליפופוליסכריד חיצוני, והם שומרים רק על הכתם הנגדי, הספרנין בצבע אדום. צביעת גרם מאפשרת התבוננות גם בצורות חיידקים. חיידקים עגולים נקראים קוקוס. חיידקים בצורת מוט נקראים בצילוס. וחיידקים בצורת ספירלה נקראים ספירילה. יתר על כן, ניתן לאפיין מושבות חיידקים גם בעין בלתי, באמצעות תכונות כגון צבע, צורה וגודל המושבה. 
עכשיו, בואו נסתכל על הפטריות. בניגוד לחיידקים, פטריות הן איקריוטים, ולכן לתאים שלהן יש אברונים הקשורים לקרום וגרעין. הם מסווגים בדרך כלל לקבוצות בהתבסס על אסטרטגיות הרבייה שלהם. לדוגמה, לאסקומקוטה, או פטריות שק, הכוללות מורלים, פניציליום וכמהין, יש גופי פרי הנקראים אסקוקרפים. מורלים מלאים במבנים אלה. אם נסתכל על אלה מקרוב, הם מכילים מבנים קטנים רבים הנקראים asci, אשר בתורו מכילים ascospores רבים שנוצרו במהלך רבייה מינית. עם זאת, Ascomycota לעתים קרובות להתרבות באופן א-מיני על ידי ניצנים. הקבוצה הפטרייתית העיקרית השנייה שנבחן היא הבזידיומיקוטה, או פטריות המועדון. רוב הפטריות האכילות והרעילות ביער הן למעשה מבני רבייה של הבזידיומיקוטה. בקבוצה זו, מה שאנו מכנים כובע פטריות ידוע טכנית בשם basidiocarp. בפטריות מוזהבות, הזימים מתחת לבזידיוקרפ מרופדים במבנים זעירים המכונים בסידיה, ואלה מייצרים בזידיוספורים, נבגי רבייה מיקרוסקופיים, במהלך רבייה מינית. נבגים אלה מופצים בדרך כלל על ידי הרוח, בדומה לזרעי צמחים רבים. כאן בחנו כמה קבוצות עיקריות של חיידקים ופטריות, ואת המאפיינים המגדירים אותן בצורה פשוטה מאוד. עם זאת, בשל המספר העצום של מיני מיקרובים, למעלה מטריליון על פי הערכות רבות, מדענים לעתים קרובות לזהות ולקבץ אותם באמצעות שיטות נוספות, כולל בדיקה של הדנ"א שלהם. 
במעבדה זו תזהו מיני חיידקים שונים באמצעות צביעת גרם, ותבחנו את מאפייני המושבה. תוכלו גם לבחון מיני פטריות כדי לזהות את מבני הרבייה שלהם.

מגוון מיקרוביאלי ופטרייתי

חיידקים ופטריות הם שתי קבוצות מגוונות מאוד של אורגניזמים שיכולות להיות להן השפעות מועילות או מזיקות משמעותיות על בריאות האדם. מסיבה זו, חשוב להבין ולהבחין בין מינים בודדים של קבוצות אלה. כזכור, טקסונומים ביולוגיים מקבצים אורגניזמים בהתבסס על הקשר הפילוגנטי שלהם. שלושת תחומי החיים, חיידקים, ארכאה ואוקריוטה מפרידים את החיים לשלוש קבוצות נפרדות. בעוד שכל החיידקים נמצאים בתחום החיידקים, פטריות נמצאות בתחום Eukaryota (פטריות הממלכה). בנוסף לארכאה, תחום החיידקים כולל באופן בלעדי פרוקריוטים חד-תאיים, כלומר התאים שלהם חסרים גם קרום גרעיני וגם אברונים הקשורים לקרום. לעומת זאת, לפטריות של תחום אאוקריוטה יש אברונים הקשורים לקרום והן כוללות אורגניזמים חד-תאיים ורב-תאיים.
<h4>חיידקים</h4>
חיידקים נמצאים כמעט בכל מקום על פני כדור הארץ והם מותאמים מאוד לסביבות שבהן הם גדלים. כתוצאה מכך, תחום זה כולל כמות מדהימה של גיוון. ההשפעה של אורגניזמים אלה על בריאות האדם מגוונת באותה מידה. לדוגמה, מינים כמו סטרפטוקוקוס תרמופילוס יכולים לשמש לייצור מזונות מותססים כמו יוגורט, בעוד נבגים של החיידק Bacillus anthracis אחראים לאנתרקס המחלה שעלולה להיות קטלנית.
כדי לסייע בזיהוי של אורגניזם כזה, מיקרוביולוגים פיתחו מספר עצום של בדיקות כדי לאפיין הן תאים בודדים והן מושבות שלמות של חיידקים1. אחת השיטות הנפוצות ביותר לזיהוי חיידקים היא על ידי צביעת גרם. בדיקה זו משתמשת בצבעים צבעוניים כדי לקבוע את הרכב דופן התא של החיידק. חיידקים גראם-חיוביים, הנושאים דופן תא עבה המורכבת מחלבון הנקרא פפטידוגליקן, שומרים על צבע הנקרא סגול גבישי ולכן נראים סגולים. לעומת זאת, לחיידקים גראם-שליליים יש דופן תא דקה יותר ללא פפטידוגליקן והם אינם שומרים על הסגול הגבישי. במקום זאת, תאים אלה נראים ורודים בגלל כתם נגדי שנקרא ספרנין. השימוש בצביעת גרם משמש לעתים קרובות כשלב מקדים בזיהוי מין חיידקי. סיווג נוסף דורש זיהוי של מאפיינים נוספים. זה יכול לכלול את הצורה של חיידקים בודדים, אשר עשויים להיות cocci (עגול), spirillum (ספירלה), או bacilli (בצורת מוט). בנוסף, ניתן להשתמש בצבע, בצורה, בברק, במרקם ואפילו בריח של מושבות חיידקים כדי להבחין בין מינים.
<h4>פטריות</h4>
פטריות של תחום אאוקריוטה הן גם מגוונות מאוד מבחינה אקולוגית ויכולות לנוע בגודלן משמרים מיקרוסקופיים ועד לאורגניזם הגדול ביותר על פני כדור הארץ, פטריית הדבש (Armillaria ostoyae). כל הפטריות הן הטרוטרופיות, כלומר עליהן לרכוש את מזונן מהסביבה. אורגניזמים אלה מפגינים גם גיוון בפעילויות הספציפיות שלהם, בנישות ובהשפעות פוטנציאליות על בריאות האדם. לדוגמה, פטריות מסוימות נצרכות או משמשות לייצור מזון על ידי בני אדם בעוד שאחרות יכולות לגרום לזיהומים חמורים או אפילו קטלניים2.
בתוך פטריות הממלכה קיימות שתי חלוקות טקסונומיות נפרדות המבוססות על אסטרטגיית הרבייה של המין. ראשית, אסקומיקוטה, הידועה בשם פטריות השק, יש מבנה רבייה שנקרא ascus. יחד, asci רבים יוצרים ascocarp, או "גוף הפרי" של הפטריות. פטריות אלה יכולות להתרבות מינית או א-מינית על ידי ניצנים. אסקומיקוטה מורכבת מכמה זנים חשובים מבחינה כלכלית כמו שמרים המשמשים לבישול בירה ואפיית לחם, וכמה מינים פופולריים במטבח, כגון מורלים וכמהין. הקבוצה השנייה, Basidiomycota, כוללת אורגניזמים הידועים בכינוי "פטריות מועדון" בשל נוכחותו של מבנה רבייה גדול בצורת מועדון שנקרא basidium. בניגוד לאסקומקוטה, רוב הבסידומוקוטה מתרבים אך ורק על ידי רבייה מינית. מצב זה מתרחש כאשר שני תפטירים הפלואידים מצטרפים ליצירת בזידיוקרפ. על פטריית כפתור, זהו מבנה הכובע. בחלק התחתון של הבזידיוקרפ, מבני רבייה הנקראים זימים המרופדים במבנים הנקראים בזידיה מייצרים גרעינים הפלואידים שבסופו של דבר יוצרים בזידיוספורים. לאחר מכן מתפזרים הבזידיוספורים על ידי הרוח. חלוקה טקסונומית זו כוללת פטריות כפתור נפוצות רבות, כמו גם פטריות בצק בר.
<h4>חשיבות המיקרוביולוגיה</h4>
בסך הכל, ברור כי פונקציות מגוונות ומאפיינים של מיקרואורגניזמים להפוך את הזיהוי שלהם חשוב ביותר לבריאות האדם ולרווחתו. בעוד מספר עצום של מינים של פטריות וחיידקים זוהו עד כה, ההערכה היא כי מיליונים נוספים טרם זוהו וסווגו. בנוסף, הדיסציפלינות האנושיות החוקרות פטריות וחיידקים מגוונות כמו האורגניזמים עצמם וללא ספק ימשיכו לגדול. הרלוונטיות של מיקרואורגניזמים לתחומי הרפואה נפוצה כיום יותר מאי פעם, כאשר מינים עמידים לאנטיביוטיקה של חיידקים זיהומיים מאיימים על בריאות האדם. הבנת המבנה והמאפיינים הביולוגיים של מינים זיהומיים ולא זיהומיים מספקת תובנות מפתח הנחוצות ליצירת טיפולים אנטיביוטיים חדשים ואסטרטגיות מניעה3-4.
מיקרוביולוגיה היא גם קריטית לתעשיית המזון. מוצרים רבים, כולל יוגורט, גבינה, קומבוצ'ה, לחם ואלכוהול מיוצרים באמצעות קטגוריות או מינים ספציפיים של מיקרואורגניזמים. במקביל, מדעני מזון מתמקדים בהנדסת תרכובות כימיות וחומרים משמרים שיפחיתו את הצמיחה של מיקרובים לא רצויים על מזון. בכל התהליכים האלה נדרשת הבנה של האופן שבו מיקרובים שורדים, מתרבים ומשפיעים על סביבתם.
<h4>הפניות </h4>
<ol class="references">
	<li>הירושי אסאקורה, הולגר ברויגמן, סו-איצ'י מקינו ויושיקו סוגיטה-קונישי, "גישות מולקולריות לסיווג פתוגנים מיקרוביאליים בעלי חשיבות לבריאות הציבור", BioMed Research International, vol. 2014, Article ID 725801, 2 עמודים, 2014. https://doi.org/10.1155/2014/725801.</li>
	<li>Treseder, K. K. ו J. T. לנון (2015). "תכונות פטרייתיות שמניעות דינמיקה של מערכות אקולוגיות ביבשה." Microbiol מול Biol Rev 79 (2): 243-262.</li>
	<li>Arvanitis, מ 'ו E. Mylonakis (2015). "אינטראקציות פטרייתיות-חיידקיות והרלוונטיות שלהן לבריאות". מיקרוביול התא 17 (10): 1442-1446.</li>
	<li>Aarestrup, F. M., et al. (2008). "עמידות חיידקים בשרשרת המזון: אפידמיולוגיה ואסטרטגיות בקרה". מומחה Rev Anti Infect Ther 6 (5): 733-750.</li>
</ol>

חיידקים ופטריות הם שתי קבוצות מגוונות מאוד של אורגניזמים שיכולות להיות להן השפעות מועילות או מזיקות משמעותיות על בריאות האדם. בשביל זה ...

Education

JoVE Lab Manual

Biology

ביולוגיה

Evolution

אבולוציה

how scientists identify bacteria and fungi

Bacteria and fungi are highly diverse organisms, and scientists identify them by looking at their structure, growth, and role in health. Some species help people, while others can cause disease, so learning how to tell them apart matters in biology and medicine.

Biological taxonomists group organisms by evolutionary relatedness. Life is divided into three domains: Bacteria, Archaea, and Eukaryota. Bacteria belong to the domain Bacteria, which includes single-celled prokaryotes. Prokaryotic cells lack a nuclear membrane and membrane-bound organelles. Fungi belong to the domain Eukaryota, in Kingdom Fungi. They have membrane-bound organelles and can be either unicellular or multicellular.

Bacteria live almost everywhere on Earth, and their diversity is very large. This group includes helpful species such as Streptococcus thermophilus, which is used to make fermented foods like yogurt. It also includes harmful species such as Bacillus anthracis, whose spores cause anthrax. Microbiologists use several tests to identify bacteria. One common test is Gram staining, which uses colored dyes to show cell wall structure.

Gram-positive bacteria have a thick cell wall made of peptidoglycan, so they retain crystal violet and appear purple. Gram-negative bacteria have a thinner cell wall without peptidoglycan, so they do not keep crystal violet. Instead, they take up safranin and appear pink. Gram staining is often a first step in bacterial identification. Scientists then look at other traits, including cell shape. Cocci are round, spirillum are spiral, and bacilli are rod-shaped. Colony color, shape, sheen, texture, and even smell can also help distinguish species.

Fungi are also diverse and can range from microscopic yeast to the honey fungus, Armillaria ostoyae, which is the largest organism on Earth. Fungi are heterotrophic, which means they must get food from their environment. Some fungi are used in food production or are eaten by people, while others can cause severe or even deadly infections.

Within Kingdom Fungi, two major divisions are based on reproduction. Ascomycota are the sac fungi. They have a reproductive structure called an ascus, and many asci form an ascocarp, or fruiting body. These fungi can reproduce sexually or asexually by budding. This group includes yeast used in brewing beer and baking bread, as well as edible fungi like morels and truffles.

Basidiomycota are commonly called club fungi because they have a club-shaped basidium. Most Basidiomycota reproduce sexually. Two haploid mycelia join to form a basidiocarp, which is the cap of a button mushroom. On the underside, gills lined with basidia produce haploid nuclei that later form basidiospores. Wind spreads these spores. This group includes many button mushrooms and wild puff mushrooms.

Studying microbes is important for human health and for food production. Millions of species may still need to be identified and classified, and microbiology continues to grow as a field. This work is especially important now because multi-antibiotic-resistant bacteria can threaten human health. Knowing microbial structure and biology helps scientists develop new antibiotics and prevention strategies. Microbiology also supports the food industry, where microbes are used to make yogurt, cheese, kombucha, bread, and alcohol, while other compounds and preservatives are designed to limit unwanted microbial growth.

How Scientists Identify Bacteria and Fungi

how-scientists-identify-bacteria-and-fungi

natural selection

Fitness and Selection in Populations

Fitness and natural selection shape how traits spread through a population over time. Variation in inherited phenotypes gives evolution its raw material. When a trait is heritable and affects survival or reproduction, natural selection can change how common that trait becomes in later generations. Fitness means reproductive success compared with others in the same population. A heritable trait that improves fitness is called an adaptation. Individuals with higher lifetime reproductive success...

artificial selection

Selective Breeding in Dogs and Crops

Artificial selection, also called selective breeding, is the human choice of which plants or animals reproduce. It uses natural variation in a population to produce traits people want. Over many generations, this can create domesticated organisms that look very different from their wild ancestors. Natural selection is a different process, but it helps explain how change happens in nature. In adaptive evolution, differences in traits can lead to differences in survival and reproductive success.

hardy-weinberg and genetic drift

Hardy-Weinberg Tests for Population Change

Hardy-Weinberg tests help scientists check whether a population is changing over time. Because evolution happens slowly and over large areas, researchers often use mathematical models to study it. These models use measurable data and computer simulations to predict how allele frequencies may shift across many generations. The Hardy-Weinberg equilibrium equation is one common model. It was developed independently in 1908 by G. H. Hardy and Wilhelm Weinberg. The equation gives the expected...

evolutionary relationships

DNA Evidence in Evolutionary Trees

DNA evidence helps scientists map evolutionary relationships between living things. Early classification began with Aristotle in the 4th century BC and was later improved during the Renaissance and by Carolus Linnaeus in the mid-1700s. These systems grouped species by physical similarity, such as the presence or absence of a backbone in vertebrates and invertebrates. Traits like a backbone are called synapomorphies, which are shared traits that likely came from a common ancestor. Physical...

plant diversity

Plant Adaptations for Land Life

Plant adaptations for land life explain how plants moved from water to land and diversified over time. Kingdom Plantae first appeared about 410 million years ago, when green algae began transitioning from aquatic environments to dry land. That shift was difficult, but land offered more light, more carbon dioxide, and far less competition than crowded oceans. Life on land forced plants to solve new problems. Aquatic plants can absorb water and nutrients directly from the surrounding liquid, use...

animal diversity

Animal Classification and Adaptation

Kingdom Animalia includes a wide range of organisms that share a few basic traits. Most animals are multicellular eukaryotes that move, consume organic matter, and reproduce sexually. Even with those shared features, animals are extremely diverse because each species adapts to a different niche. A niche is the place, role, and set of interactions a species has with living and nonliving parts of its environment. Specialization helps species survive, reproduce, and reduce competition with others...

microbial and fungal diversity

Bacteria and fungi are highly diverse organisms, and scientists identify them by looking at their structure, growth, and role in health. Some species help people, while others can cause disease, so learning how to tell them apart matters in biology and medicine. Biological taxonomists group organisms by evolutionary relatedness. Life is divided into three domains: Bacteria, Archaea, and Eukaryota. Bacteria belong to the domain Bacteria, which includes single-celled prokaryotes. Prokaryotic...

evolution

Learn how bacteria and fungi are classified, stained, and identified, plus why microbes matter in health, medicine, and food production.

How Scientists Identify Bacteria and Fungi | JoVE K12

Tennessee Academic Standards

Biological Change: Unity and Diversity

BIO1.LS4.3

Virginia  Standards of Learning

HIgh School

BIO.8

BIO.8.d

new-jersey-student-learning-standards-for-science

New Jersey Student Learning Standards for Science

Life Science

Ecosystems: Interactions, Energy, and Dynamics

HS-LS2-2

Arizona Science Standards

HS.L2

HS.L2U3.18

Alabama Course of Study Science

9-12

Ecosystems: Interactions Energy and Dynamics

9-12.B.2.9

Next Generation Science Standards

heredity-inheritance-and-variation-of-traits

Heredity: Inheritance and Variation of Traits

HS-LS4-6

Georgia Standards of Excellence

Environmental Science

SEV2.

SEV2.a

Botany

SBO1.

coevolution-plant-morphological-anatomical-structures-with-animals-ie

Coevolution of plant morphological and anatomical structures with animals (i.e., pollination), Rhizobium (i.e., nitrogen fixation), and Mycorrhiza (i.e., fungi in rhizosphere).

התכוננו ללמד את מגוון מיקרוביאלי ופטרייתי עם מדריך מדריכים זה באורך 4 דקות. כולל שלבי הכנה מרכזיים עבור מעבדת Biology ב-JoVE Lab Manual.

הכנת מדריך עבור מגוון מיקרוביאלי ופטרייתי ב-Biology - 3.6K+ צפיות | JoVE Lab Manual

עקבו אחר הנהלים של מגוון מיקרוביאלי ופטרייתי שלב אחר שלב בסרטון פרוטוקול סטודנטים זה באורך 8 דקות. חלק מאוסף Biology ב-JoVE Lab Manual.

פרוטוקול סטודנטים עבור מגוון מיקרוביאלי ופטרייתי ב-Biology - 18K+ צפיות | JoVE Lab Manual

What is an Ecosystem?

Overview

An ecosystem is the interaction between all abiotic and biotic factors in an environment and can be classified as terrestrial or aquatic. ...

Trophic Levels

All organisms in an ecosystem occupy a trophic level in the food chain. The lowest level consists of primary producers, which synthesize their food from ...

Primary Production

The total amount of energy acquired by primary producers in an ecosystem is called gross primary production (GPP). However, of this energy, producers use ...

Production Efficiency

Net production efficiency (NPE) is the efficiency at which organisms assimilate energy into biomass for the next trophic level. Due to low metabolic rates ...

Trophic Efficiency

Trophic level transfer efficiency (TLTE) is a measure of the total energy transfer from one trophic level to the next. Due to extensive energy loss as ...

Life Histories

Constrained by limited energy and resources, organisms must compromise between offspring quantity and parental investment. This trade-off is represented ...

Energy Budgets and Reproductive Strategies

Organisms must balance energy intake with the energy required for growth, maintenance, and reproduction. These trade-offs result in a variety of ...

Population Growth

Population size is dynamic, increasing with birth rates and immigration, and decreasing with death rates and emigration. In ideal conditions with ...

Ecological Niches

All organisms have a position within an ecosystem. The complete set of living and nonliving factors&#x2014;including food resources, climate, and ...

Ecological Succession

Ecological succession is influenced by the processes of facilitation, inhibition, and toleration. Facilitation occurs when early successional species ...

Keystone Species

Measures of species biodiversity, such as richness (i.e., the number of species present) and evenness (i.e., their relative abundance), describe an ...

Symbiosis

Symbiotic relationships are long-term, close interactions between individuals of different species that affect the distribution and abundance of those ...

Competition

When organisms require the same limited resources within an environment, they may have to compete for them. Competition is a net-negative interaction. ...

Predator-Prey Interactions

Predators consume prey for energy. Predators that acquire prey and prey that avoid predation both increase their chances of survival and reproduction ...

Ecological Disturbance

An ecological disturbance is a temporary disruption in the environment resulting from abiotic, biotic, or anthropogenic factors, causing a pronounced ...

What is Biodiversity?

Biodiversity describes the variety of living things at multiple organizational levels: genetic, species and ecosystem diversity. Species diversity ...

Threats to Biodiversity

There have been five major extinction events throughout geological history, resulting in the elimination of biodiversity, followed by a rebound of species ...

Biodiversity and Human Values

Human civilization relies on biodiversity in many ways. Sudden changes in species biodiversity result in environmental changes that can modify weather ...

What is Photosynthesis?

All living organisms on Earth are directly or indirectly dependent on photosynthesis. It is the only biological process that can capture energy from ...

What is Conservation Biology?

Conservation biology is a scientific field that focuses on the preservation of biodiversity in order to protect ecosystems while meeting the needs of the ...

The Anatomy of Chloroplasts

Green algae and plants, including green stems and unripe fruit, harbor specialized organelles called chloroplasts to carry out photosynthesis. They ...

Sustainable Development

As the human population continues to grow and use resources, we must be mindful of our planet&rsquo;s natural limits. Sustainable development provides a ...

Photosystems

Photosystems are multiprotein complexes that form the functional units of photosynthesis in plants, algae, and cyanobacteria. They are found embedded in ...

Conservation of Small Populations

Small population sizes put a species at extreme risk of extinction due to a lack of variation, and a consequent decrease in adaptability. This weakens ...

The Photochemical Reaction Center

Reaction centers are pigment-protein complexes that initiate energy conversion from photons to chemical entities. Therefore, photochemical reaction center ...

What is Weather?

Overview

Weather refers to the current state of atmospheric conditions at a specific time and place. Weather is temporary and is influenced by the ...

The Antenna Complex

Plants and other photosynthetic organisms comprise pigments capable of absorption of direct sunlight. These pigments are present in the reaction center - ...

What is Climate?

Climate refers to the prevailing weather conditions in a specific area over an extended period. As the saying goes, &#8220;Climate is what you expect. ...

the-z-scheme-of-electron-transport-in-photosynthesis

The Z-Scheme of Electron Transport in Photosynthesis

The light reactions of photosynthesis assume a linear flow of electrons from water to NADP+. During this process, light energy drives the splitting of ...

Global Climate Change

Throughout its ~4.5 billion year history, the Earth has experienced periods of warming and cooling. However, the current drastic increase in global ...

The Calvin Benson Cycle

Ribulose 1,5- bisphosphate carboxylase/oxygenase (RuBisCo) is a critical enzyme that catalyzes carbon dioxide assimilation during photosynthesis. However, ...

Conservation of Declining Populations

Conservation of declining population focuses on ways of detecting, diagnosing, and halting a population decline. The approach uses methods to prevent ...

Introduction to Cellular Respiration

Organisms harvest energy from food, but this energy cannot be directly used by cells. Cells convert the energy stored in nutrients into a more usable ...

Habitat Fragmentation

Habitat fragmentation describes the division of a more extensive, continuous habitat into smaller, discontinuous areas. Human activities such as land ...

What is Glycolysis?

Overview
Cells make energy by breaking down macromolecules. Cellular respiration is the biochemical process that converts &#34;food energy&#34; (from the ...

Energy-requiring Steps of Glycolysis

Glucose is the source of nearly all energy used by organisms. The first step of converting glucose into usable energy is called glycolysis. Glycolysis ...

Energy-releasing Steps of Glycolysis

Glycolysis is divided into two phases based on whether energy is utilized or released. While the first phase consumes ATP, the second phase produces ...

ATP Synthase: Mechanism

In animals, the mitochondrial F1F0 ATP synthase is the key protein that synthesizes ATP molecules through a complex catalytic mechanism. While the nuclear ...

Outcomes of Glycolysis

Nearly all the energy used by cells comes from the bonds that make up complex organic compounds. These organic compounds are broken down into simpler ...

The ADP/ATP Carrier Protein

ADP/ATP carrier or AAC protein is the most abundant carrier protein in the inner mitochondrial membrane. It transports large quantities of ADP and ATP, ...

Pyruvate Oxidation

After glycolysis, the charged pyruvate molecules enter the mitochondria via active transport and undergo three enzymatic reactions. These reactions ensure ...

The Citric Acid Cycle: Overview

In aerobic organisms, the citric acid cycle is the second stage of cellular respiration wherein molecules derived from the breakdown of carbohydrates, ...

The Citric Acid Cycle: Output

The citric acid cycle is termed an amphibolic pathway as it operates both anabolically and catabolically. The cyclic reactions balance the flux of the ...

electron-transport-chain-complex-i-and-ii

Electron Transport Chain: Complex I and II

The mitochondrial electron transport chain (ETC) is the main energy generation system in the eukaryotic cells. However, mitochondria also produce ...

electron-transport-chain-complex-iii-and-iv

Electron Transport Chain: Complex III and IV

During the electron transport chain, electrons from NADH and FADH2 are first transferred to complexes I and II, respectively. These two complexes then ...

The Electron Transport Chain

The electron transport chain or oxidative phosphorylation is an exothermic process in which free energy released during electron transfer reactions is ...

the-supercomplexes-in-the-crista-membrane

The Supercomplexes in the Crista Membrane

The mitochondrial cristae membrane is the primary site for the oxidative phosphorylation (OXPHOS) process of energy conversion mediated through ...

ATP Synthase: Structure

ATP synthase or ATPase is among the most conserved proteins found in bacteria, mammals, and plants. This enzyme can catalyze a forward reaction in ...

Use mathematical and/or computational representations to support explanations of factors that affect carrying capacity, biodiversity and populations of ecosystems at different scales. Emphasis is on quantitative analysis and comparison of the relationships among interdependent factors including boundaries, resources, climate and competition. Examples of mathematical comparisons could include graphs, charts, histograms, or population changes gathered from simulations or historical data sets.

HS-LS2-1

What are Biogeochemical Cycles?

The most common elements in organic molecules, carbon, hydrogen, oxygen, nitrogen, sulfur, and phosphorus, are only available in the ecosystem in limited ...

The Water Cycle

The Earth&rsquo;s hydrosphere includes all of the areas where the storage and movement of water occurs. Since water is the basis of all living processes, ...

The Carbon Cycle

Carbon is the basis of all organic matter on Earth, and is recycled through the ecosystem in two primary processes: one in which carbon is exchanged among ...

The Nitrogen Cycle

Nitrogen atoms, present in all proteins and DNA, are recycled between abiotic and biotic components of the ecosystem. However, the primary form of ...

The Phosphorus Cycle

Unlike carbon, water, and nitrogen, phosphorus is not present in the atmosphere as a gas. Instead, most phosphorus in the ecosystem exists as compounds, ...

The Sulfur Cycle

Sulfur, an important element in the chemical makeup of proteins, is recycled through the atmosphere and aquatic and terrestrial environments. Found in the ...

Use mathematical representations to support claims for the cycling of matter and flow of energy among organisms in an ecosystem. Emphasis is on using a mathematical model of stored energy in biomass to describe the transfer of energy from one trophic level to another and that matter and energy are conserved as matter cycles and energy flows through ecosystems. Emphasis is on atoms and molecules such as carbon, oxygen, hydrogen and nitrogen being conserved as they move through an ecosystem.

HS-LS2-4

What are Populations and Communities?

Populations are groups of individuals of the same species that inhabit a shared environment. Communities include multiple co-existing, interacting ...

Distribution and Dispersion

Ecology is the study of how organisms interact with their environment and with one another. An important aspect of ecology is understanding where species ...

Evaluate the claims, evidence and reasoning that the complex interactions in ecosystems maintain relatively consistent numbers and types of organisms in stable conditions, but changing conditions may result in a new ecosystem. Examples of changes in ecosystem conditions could include modest biological or physical changes, such as moderate hunting or a seasonal flood and extreme changes, such as volcanic eruption or sea level rise. Emphasis should be on describing drivers of ecosystem stability and change, not on the organismal mechanisms of responses and interactions.

HS-LS2-6

How Scientists Identify Bacteria and Fungi

Description

Transcript

Tags

More videos by Standards