Name: dna extraction, quantification, and cutting
Uploaded: 2019-01-31T09:26:45.000Z
Duration: 4 min 46 s
Channel: JoVE

K12 Standards

north-carolina-k-12-science-standard-course-of-study

North Carolina K-12 Science Standard Course of Study

9-12

Biology

heredity-inheritance-and-variation-of-traits

Heredity- Inheritance and Variation of Traits

LS.Bio.8.1

dna-isolation-and-restriction-enzyme-analysis

DNA Isolation and Restriction Enzyme Analysis

מיצוי DNA הוא הסרה וטיהור של DNA מהתאים. ראשית, התאים עוברים ליזה - שבירה פתוחה - בדרך כלל באמצעות שילוב של שיבוש פיזי וטיפול בכימיקלים, כגון חומר ניקוי הממיס את התא ואת קרומי הגרעין. SDS או סודיום דודציל סולפט הוא חומר ניקוי נפוץ הפועל על ידי מסיסים החלבונים והשומנים המרכיבים את הממברנות הללו. לאחר מכן התוכן יכול לצוף בחופשיות לתוך הפתרון שמסביב. 

לאחר מכן, יש להפריד את הדנ"א מהמולקולות האחרות הקיימות. פרוטאינאז K המוסף לתגובה יפרק קשרים פפטידים ויעכל חלבונים מזהמים. לאחר מכן מוסיפים מלח לדגימה, אשר מייצב את קבוצות הפוספט הטעונות שלילית בעמוד השדרה של הדנ"א, ולאחר תוספת של אלכוהול קר כקרח, מזרז את הדנ"א מחוץ לתמיסה. המשקע הלבן נאסף על ידי סיבובו בצנטריפוגה שם הוא מתיישב לתחתית הצינור. לאחר שטיפה והשעיה מחדש בתמיסת חיץ, הדנ"א המופק יכול סוף סוף לשמש במחקר או ביישומי ביוטכנולוגיה. 

יישומים ביוטכנולוגיים מסוימים, כמו טביעת אצבע של דנ"א, שיכולים לזהות דפוסים חדשים בדנ"א ספציפיים לאדם או ליחידים, כרוכים בשימוש באנזימי הגבלה. אנזימי הגבלה הם מולקולות המקיימות אינטראקציה עם דנ"א ומזהות רצפים ספציפיים. ברגע שהאתר הספציפי שלהם מזוהה, הם חותכים את הדנ"א. זה יגרום לגדיל להיחתך לחתיכה ליניארית אחת או יותר. אם הדנ"א שהופק היה פלסמיד, פיסת דנ"א עגולה המצויה לרוב בחיידקים, כל חתך יגרום לכך שהדנ"א ייצור מקטע ליניארי או מקטעים. אנזימי הגבלה שונים מזהים רצפי דנ"א שונים, ולכן שימוש בשילוב שלהם יכול לגרום ליצירת מקטעים נפרדים. 

בטביעת אצבע של דנ"א אנו יכולים לבחון את המקטעים האלה באמצעות טכניקה שנקראת דנ"א או אלקטרופורזה בג'ל. כדי להכין ג'לים, אבקת agarose מעורבב עם חיץ מחומם עד מומס. לאחר מכן מוסיפים כתם נוקלאוטיד לתערובת החמה ואז מוזגים את התמיסה הזו לתבנית היציקה. מסרק מוכנס כדי ליצור את הבארות. לאחר שהתמצק, הג'ל מועבר לקופסת ג'ל מלאה בחיץ והמסרק מוסר. תערובת ייחוס של מקטעי דנ"א צבועים באורכים ידועים, סולם הדנ"א, מתווספת לבאר אחת ודגימות הדנ"א הצבועות המעניינות נטענות בבארות הנותרות. הקופסה מחוברת למקור חשמל והפעלת החשמל גורמת לנדידה של קבוצות הפוספטים הטעונים שלילית בנוקלאוטידים של הדנ"א דרך הג'ל לכיוון האנודה, הקצה החיובי. חתיכות קטנות יותר נעות מהר יותר מהשברים הגדולים יותר, הנודדים בקושי. 

כאשר הריצה מסתיימת, הג'ל נחשף לאור אולטרה סגול כדי להמחיש את כתם הנוקלאוטיד בדגימות ה- DNA. ניתן לאשר את נוכחותם על סמך מיקומם היחסי לרצועות הסולם. מאחר שלדנ"א עם רצפים שונים יש אתרים חתוכים במקומות שונים, זה יכול לייצר תבניות פס חדשות, או טביעות אצבע, שניתן להשתמש בהן כדי להבחין בין אנשים או פרופילי דנ"א שונים. 

במעבדה זו תבצע מיצוי DNA באמצעות חיץ עם ובלי SDS כדי להעריך את החשיבות של דטרגנטים בבידוד DNA ולאחר מכן לעכל DNA פלסמיד עם אנזימי הגבלה שונים כדי לבחון את פרופילי ה- DNA המתקבלים.

ניתוח אנזימי בידוד והגבלה של dna

גילוי הדנ"א כמולקולה תורשתית בכל האורגניזמים הוביל לפריצות דרך מדעיות ורפואיות עצומות ושיפר משמעותית את הבנתנו את עצמנו ואת האורגניזמים האחרים. בידוד דנ"א ויצירת פרופיל היו הצעדים הראשונים הבסיסיים עבור רבים מהפיתוחים במאה האחרונה; מזיהוי תפקוד גנים ועד מהפכות בחקלאות ובזיהוי פלילי.

<h4>בידוד DNA מתאים</h4>

בידוד DNA הוא הליך פשוט למדי הדורש כמה צעדים אך חיוניים: קצירת תאים, ליזה, פירוק חלבונים, ולבסוף משקעים DNA. באופן כללי, ניתן לקצור דנ"א מכמויות קטנות של רקמות, כגון עלה בודד של צמח, זקיקי שיער של בעלי חיים, או תאי אפיתל שניתן להחליק בקלות בתוך הפה עם תמיסת מלח פשוטה. מאחר שהדנ"א ממודר בתוך הגרעין או המיטוכונדריה בתוך תאים איקריוטים, מדענים מפרקים תחילה את התא ואת קרום הגרעין כדי לחשוף את הדנ"א, וזה נעשה עם שלב הליזיס. עם זאת, ברגע שהדנ"א נחשף, הוא יכול להתפרק על ידי יוני מתכות כבדות ורמות קיצוניות של pH. לכן, תמיסת חיץ המכילה דטרגנט משמשת לא רק להמסת קרום התא, אלא גם להגנה על ה- DNA מפני אלמנטים מתפרקים בתמיסה. יתר על כן, דנ"א הוא מולקולה ארוכה במיוחד שמתעבה בתוך הגרעין על ידי אריזה הדוקה סביב חלבונים מיוחדים הנקראים היסטונים. לכן, אנזים בשם פרוטאינאז K, אשר מפרק קשרים פפטידים של חלבונים, מתווסף כדי להפריד את הדנ"א מהיסטונים וחלבונים אחרים. לאחר מכן, מדענים מפרידים דנ"א משאר תמצית התא באמצעות התכונות הכימיות שלה. בשל המבנה הטעון שלילית של חומצות גרעין, יוני Na+ בתמיסת נתרן כלורי נקשרים ומשתלבים בגדילי DNA שזורים. ברגע שהדנ"א מגובש, ניתן לצפות בו בעין בלתי. דנ"א אינו מסיס באלכוהול ומזרז בקלות בטמפרטורות נמוכות, ולכן מדענים מוסיפים אלכוהול קר כדי לזרז דנ"א. לבסוף, ניתן להמיס את הדנ"א המואץ ולאחסן אותו במים שעברו דה-יוניזציה או במאגר עדין, ללא אנזימים שיכולים לפרק חומצות גרעין, עד שייעשה בו שימוש.

<h4>כימות DNA</h4>

תגובות המשתמשות בדנ"א דורשות לעתים קרובות טוהר גבוה וכמויות מדויקות של דנ"א. לכן, לאחר בידוד הדנ"א, מדענים משתמשים בספקטרופוטומטר כדי לכמת את כמות הדנ"א בדגימה שלהם, כמו גם את טוהר הדנ"א בדגימה. ספקטרופוטומטר מודד את עוצמת קרן האור המועברת דרך דגימה כפונקציה של אורך הגל שלה. חומצות גרעין בולעות אור ב-260 ננומטר, בעוד חלבונים בולעים אור ב-280 ננומטר. על ידי מדידת עוצמת קרן אור ב-260 ננומטר, מדענים יכולים לקבוע את ריכוז הדנ"א. יתר על כן, על ידי הערכת עוצמת האור הן ב-260 ננומטר והן ב-280 ננומטר, ניתן לקבוע את טוהר תכולת הדנ"א. בדגימה של DNA טהור, יחס 260/280 ננומטר צריך להתקרב לערך של 2.

<h4>אנזימי הגבלה</h4>

עבור מספר ניתוחים, כגון שיבוט, ריצוף ומיפוי מקטעי DNA וגנומים, יש לחתוך את הדנ"א המבודד ברצפים ספציפיים באמצעות אנזימי הגבלה. אנזימים אלה מיוצרים על ידי חיידקים כמנגנונים של חסינות מולדת מפני חדירת DNA נגיפי ומתפקדים כמספריים מולקולריים. לכן, לאחר שאנזימי הגבלה מזהים דנ"א נגיפי, הם מתחילים לפרק אותו על ידי חיתוכו למקטעים ברצפי נוקלאוטידים מסוימים שהם מזהים. רצפי נוקלאוטידים אלה הם לרוב באורך שישה עד שנים עשר נוקלאוטידים והם בדרך כלל פלינדרומיים, מה שאומר שיש להם את אותו רצף נוקלאוטידים בכיוונים 3'-5' ו-5'-3'. לדוגמה, אנזים ההגבלה EcoRI חותך DNA ברצף 3'... GAATTC...-5', שקורא אותו דבר בכיוון 5'-3'. כמו EcoRI, ישנם מאות אנזימים המתאימים לרצפים פלינדרומיים שונים רבים. ברגע שהדנ"א נחתך על ידי אנזימים אלה, מדענים יכולים לטעון את הדנ"א על ג'ל בתא אלקטרופורזה ולהעביר זרם חשמלי דרך הג'ל. דנ"א נושא מטענים שליליים, מה שגורם למקטעי דנ"א לנדוד לכיוון האנודה. עם זאת, נקבוביות הג'ל מאטות מקטעי דנ"א גדולים יותר ביחס לרצפי דנ"א קטנים יותר, ולכן החתיכות נפרדות בהתאם לגודלן. לאחר השלמת האלקטרופורזה, ניתן לדמיין מקטעי DNA בעזרת צבעים הנקשרים באופן ספציפי למולקולות DNA.

חיתוך דנ"א באמצעות אנזימי הגבלה והפרדת מקטעי דנ"א באמצעות אלקטרופורזה מאפשרים לחוקרים לזהות גדלים של מקטעים לא ידועים ביחס לסולם סטנדרטי. לאחר מכן ניתן לבודד עוד יותר את רסיסי העניין הללו ולקשור אותם לווקטור פלסמיד לצורך שיבוט גנטי. הנדסה גנטית וניתוחי מעבדה שופרו מאוד עם שיטות אלה. בעזרת פרופיל דנ"א, מדענים מסוגלים לרצף גנומים כדי להבין עוד יותר את פעולתם של אורגניזמים והם גם מסוגלים לזהות ולאפיין גנים מסוימים1.

בידוד DNA ופרופיל הם גם מעשיים עבור אירועים המשפיעים ישירות על חיי היומיום. לדוגמה, מדעני זיהוי פלילי מנתחים באופן שגרתי דגימות DNA כדי לספק ראיות לתיקים פליליים ואזרחיים2. באופן דומה, עובדי בריאות מוציאים ומנתחים דנ"א כדי לבדוק אבהות ומחלות גנטיות. לאחרונה, ערכות ניתוח מוצא DNA הפכו פופולריות על ידי מתן אפשרות למשתמשים לקבוע את השושלת הגנטית שלהם, למצוא קרובי משפחה, ואפילו לגלות את הנטייה הגנטית שלהם למצבים בריאותיים שונים3. לבסוף, עם התקדמות הביוטכנולוגיה וההנדסה הגנטית, רפואה מותאמת אישית צוברת תאוצה בקרב חוקרים קליניים לפתח טיפולים באמצעות הנתונים הגנטיים של הפרט, וסוללת את הדרך לטיפול יעיל בחולים ללא תופעות לוואי מזיקות4.

<h4>הפניות</h4>

<ol class="references">
	<li>Chambers, GK, et al. טביעת אצבע DNA בזואולוגיה: עבר, הווה, עתיד. חקירת ז'נה. 2014, כרך 5, 3 doi: 10.1186/2041-2223-5-3.</li>
	<li>רואר, ל. טביעת אצבע DNA בזיהוי פלילי: עבר, הווה, עתיד. חקור ז'נה. . . 2013, כרך 4, 22 doi: 10.1186/2041-2223-4-22.</li>
	<li>קירקפטריק, BE ורשקין, MD. בדיקת מוצא ופרקטיקה של ייעוץ גנטי. J Gen ייעוץ. 2016, כרך 26, 1 (6-20).</li>
	<li>המבורג, מסצ'וסטס וקולינס, FS. הדרך לרפואה מותאמת אישית. N Engl J Med . 2010; כרך 363, 301-304.,</li>
</ol>

ניתוח אנזימי בידוד והגבלה של DNA

גילוי הדנ"א כמולקולה תורשתית בכל האורגניזמים הוביל לפריצות דרך מדעיות ורפואיות עצומות ושיפר באופן משמעותי את ...

Education

JoVE Lab Manual

ביולוגיה

Genetics

גנטיקה

dna extraction, quantification, and cutting

DNA extraction, quantification, and cutting are key steps in many biology labs. Scientists use these methods to study genes, prepare DNA for testing, and compare fragments for analysis.

DNA isolation starts with a small sample, such as a leaf, hair follicles, or epithelial cells from the mouth collected with a saline solution. The first steps are cell harvesting, lysis, protein degradation, and DNA precipitation. Lysis breaks open the cell and nuclear membranes so the DNA can be released from the nucleus or mitochondria in eukaryotic cells. A detergent-containing buffer helps dissolve membranes and also protects DNA from degrading conditions such as heavy metal ions and extreme pH.

After the DNA is exposed, Proteinase K is added. This enzyme breaks peptide bonds in proteins and helps separate DNA from histones and other proteins. The DNA is then mixed with sodium chloride, and Na+ ions help the tangled DNA strands clump together because nucleic acids carry negative charges. Cold alcohol is added next, since DNA does not dissolve in alcohol and will precipitate at low temperatures. The DNA can then be dissolved in deionized water or a mild buffer for storage, as long as the solution is free of enzymes that could break it down.

Once DNA is isolated, scientists often measure how much DNA they have and how pure it is. A spectrophotometer does this by sending light through the sample at specific wavelengths. DNA absorbs light at 260 nm, while proteins absorb light at 280 nm. The 260 nm reading shows DNA concentration, and the 260/280 ratio helps estimate purity. In a sample of pure DNA, that ratio should approach 2.

For cloning, sequencing, and mapping DNA fragments or genomes, scientists often need to cut DNA at specific sites. They use restriction enzymes, which are bacterial proteins that act like molecular scissors against invading viral DNA. These enzymes recognize short nucleotide sequences, often six to twelve bases long, and the sequences are usually palindromic, meaning they read the same in both directions. EcoRI is one example and cuts at the sequence GAATTC.

After cutting, the DNA fragments are loaded into a gel and separated by electrophoresis. DNA is negatively charged, so it moves toward the anode when an electric current is applied. Smaller fragments travel faster through the gel pores than larger ones, so the pieces separate by size. Dyes that bind to DNA make the fragments visible, and researchers compare them with a standard ladder to estimate fragment size. The fragments can then be isolated and ligated into a plasmid vector for genetic cloning.

These methods support many modern applications. Scientists use DNA profiling to sequence genomes and to identify and study genes. DNA analysis also helps in forensics for criminal and civil cases, in paternity testing, and in checks for genetic diseases. Ancestry kits use DNA to help people trace lineage, find relatives, and learn about possible health traits. These tools also support personalized medicine, where researchers use a person’s genetic data to design treatments with fewer harmful side effects.

DNA Extraction, Quantification, and Cutting

dna-extraction-quantification-and-cutting

genetics of organisms

Mendelian Traits and Exceptions

Mendelian genetics explains how traits move from parents to offspring. Gregor Mendel studied pea plants in 1865 and showed that many visible traits are controlled by two alleles, or gene versions, with one inherited from each parent. He also found that some alleles are dominant and others are recessive. Mendel’s work was not widely accepted until 1900, and it took about 30 more years for Mendelian inheritance to fit into evolutionary theory. One reason for the delay was that real breeding...

dna isolation and restriction enzyme analysis

DNA extraction, quantification, and cutting are key steps in many biology labs. Scientists use these methods to study genes, prepare DNA for testing, and compare fragments for analysis. DNA isolation starts with a small sample, such as a leaf, hair follicles, or epithelial cells from the mouth collected with a saline solution. The first steps are cell harvesting, lysis, protein degradation, and DNA precipitation. Lysis breaks open the cell and nuclear membranes so the DNA can be released from...

bacterial transformation

Plasmid DNA Transfer in Bacteria

Plasmid DNA transfer in bacteria helped launch modern genetic engineering. The idea traces back to Frederick Griffith’s work on pneumonia-causing Streptococcus pneumoniae in the early 20th century. He studied a rough, non-virulent R strain and a smooth, virulent S strain with a protective polysaccharide capsule. When he injected mice with heat-killed bacteria of either strain, the mice survived. But when heat-killed S-strain bacteria were mixed with live R-strain bacteria, the mice died, and...

genetics

Learn how DNA is isolated, measured with a spectrophotometer, cut with restriction enzymes, and separated by gel electrophoresis for analysis.

DNA Extraction, Quantification, and Cutting | JoVE K12

התכוננו ללמד את ניתוח אנזימי בידוד והגבלה של DNA עם מדריך מדריכים זה באורך 2 דקות. כולל שלבי הכנה מרכזיים עבור מעבדת Biology ב-JoVE Lab Manual.

הכנת מדריך עבור ניתוח אנזימי בידוד והגבלה של DNA ב-Biology - 14K+ צפיות | JoVE Lab Manual

עקבו אחר הנהלים של ניתוח אנזימי בידוד והגבלה של DNA שלב אחר שלב בסרטון פרוטוקול סטודנטים זה באורך 13 דקות. חלק מאוסף Biology ב-JoVE Lab Manual.

פרוטוקול סטודנטים עבור ניתוח אנזימי בידוד והגבלה של DNA ב-Biology - 33K+ צפיות | JoVE Lab Manual

What is Meiosis?

Meiosis is the process by which diploid cells divide to produce haploid daughter cells. In humans, each diploid cell contains 46 chromosomes, half from ...

Meiosis I

Meiosis II

Meiosis vs. Mitosis

Crossing Over

Crossing over is the exchange of genetic information between homologous chromosomes during prophase I of meiosis I. Genetic recombination gives rise to ...

Nondisjunction

Nondisjunction is the failure of homologous chromosomes or sister chromatids to separate correctly and move to the opposite poles of the cells. This ...

Spermatogenesis

Spermatogenesis is the process by which haploid sperm cells are produced in the male testes. It starts with stem cells located close to the outer rim of ...

Oogenesis

In human women, oogenesis produces one mature egg cell or ovum for every precursor cell that enters meiosis. This process differs in two unique ways from ...

Fertilization

During fertilization, an egg and sperm cell fuse to create a new diploid structure. In humans, the process occurs once the egg has been released from the ...

Cleavage and Blastulation

After a large-single-celled zygote is produced via fertilization, the process of cleavage occurs while zygotes travel through the uterine tube. Cleavage ...

Gastrulation

Gastrulation establishes the three primary tissues of an embryo: the ectoderm, mesoderm, and endoderm. This developmental process relies on a series of ...

Neurulation

Neurulation is the embryological process which forms the precursors of the central nervous system and occurs after gastrulation has established the three ...

Cell Migration

Cell migration, the process by which cells move from one location to another, is essential for the proper development and viability of organisms ...

Determination

During embryogenesis, cells become progressively committed to different fates through a two-step process: specification followed by determination. ...

Use models to explain how DNA is passed from parents to offspring through the processes of meiosis and fertilization in sexual reproduction.

LS.Bio.6.1

Mutations

Mutations are changes in the sequence of DNA. These changes can occur spontaneously or they can be induced by exposure to environmental factors. Mutations ...

genome-size-and-the-evolution-of-new-genes

Genome Size and the Evolution of New Genes

types-of-genetic-transfer-between-organisms

Types of Genetic Transfer Between Organisms

Base-pairing and DNA Repair

The DNA Replication Fork

Lagging Strand Synthesis

The Replisome

Proofreading

Synthesis of new DNA molecules is carried out by the enzyme DNA polymerase, which adds nucleotides on the daughter strand complementary to the template ...

Replication in Prokaryotes

DNA replication has three main steps: initiation, elongation, and termination. Replication in prokaryotes begins when initiator proteins bind to the ...

Replication in Eukaryotes

In eukaryotic cells, DNA replication is highly conserved and tightly regulated. Multiple linear chromosomes must be duplicated with high fidelity before ...

Overview of DNA Repair

Base Excision Repair

Nucleotide Excision Repair

DNA Distortion and Damage
Cells are regularly exposed to mutagens&#8212;factors in the environment that can damage DNA and generate mutations. UV ...

Mismatch Repair

Organisms are capable of detecting and fixing nucleotide mismatches that occur during DNA replication. This sophisticated process requires identifying the ...

Fixing Double-strand Breaks

Homologous Recombination

Gene Conversion

Restarting Stalled Replication Forks

Construct an explanation to summarize how inheritable genetic variations may result from: new genetic combinations in meiosis, mutations during replication, or mutations caused by environmental factors.

LS.Bio.6.2

An Overview of Genetic Analysis

An organism&#8217;s physical traits, or phenotype, are a product of its genotype, which is the combination of alleles (gene variants) inherited from its ...

Genetic Crosses

To dissect genetic processes or create organisms with novel suites of traits, scientists can perform genetic crosses, or the purposeful mating of two ...

Punnett Squares

Monohybrid Crosses

Dihybrid Crosses

Trihybrid Crosses

Trihybrid Crosses
Some of Mendel&#8217;s crosses examined three pairs of contrasting characteristics. Such a cross is called a trihybrid cross. A ...

Law of Independent Assortment

Chi-square Analysis

The chi-square test is a statistical hypothesis test. It is used to check whether there is a significant difference between an expected value and an ...

Pedigree Analysis

Multiple Allele Traits

Incomplete Dominance

Gregor Mendel&#39;s work (1822 - 1884) was primarily focused on pea plants. Through his initial experiments, he determined that every gene in a diploid ...

Lethal Alleles

Agouti: A Lethal Allele
Lucien Cu&#233;not discovered lethal alleles in 1905 while studying the inheritance of coat color in mice. The agouti gene is ...

Polygenic Traits

background-and-environment-affect-phenotype

Background and Environment Affect Phenotype

Although the genetic makeup of an organism plays a major role in determining the phenotype, there are also several environmental factors, such as ...

Use mathematics and computational thinking to predict the variation and distribution of expressed traits based on: Mendelian inheritance, co-dominance, incomplete dominance, multiple alleles, and sex-linked inheritance.

LS.Bio.7.1

Overview

A pedigree is a diagram displaying a family&#x2019;s history of a trait. Analyzing pedigrees can reveal (1) whether a trait is dominant or ...

Probability Laws

Overview

The probability of inheriting a trait can be calculated using the sum and product rules. The sum rule is used to calculate the probability of ...

The Concept of Multiple Allelism

Multiple allelism describes genes that exist in three or more allelic forms. Although diploid organisms, like humans, ...

Analyze and interpret data to explain how polygenic traits result in a wide range of phenotypes.

LS.Bio.7.2

Pleiotropy

Pleiotropy is the phenomenon in which a single gene impacts multiple, seemingly unrelated phenotypic traits. For example, defects in the SOX10 gene cause ...

Nature and Nurture

Many human characteristics, like height, are shaped by both nature&mdash;in other words, by our genes&mdash;and by nurture, or our environment. For ...

Construct an explanation to summarize how traits result from interactions of genetic factors (multiple genes and/or alleles) and environmental factors.

LS.Bio.7.3

PCR: The Polymerase Chain Reaction

The polymerase chain reaction, or PCR, is a technique used to amplify DNA through thermocycling &#8211; cyles of temperature changes at fixed time ...

DNA Gel Electrophoresis

DNA gel electrophoresis is a technique used for the detection and separation of DNA molecules. An electric field is applied to a gel matrix comprised of ...

DNA Isolation

DNA isolation protocols can be fast and straightforward or complex and time-consuming depending on the type and quality of DNA required for further ...

Restriction Enzymes

Restriction enzymes are bacterial enzymes used to cut DNA in a sequence-specific manner. To cleave DNA, they bind to specific palindromic sequences called ...

DNA Agarose Gel Electrophoresis

Agarose gel electrophoresis is a laboratory technique commonly used to separate DNA fragments by size. However, it can also be used to isolate and purify ...

The revelation of DNA as the hereditary molecule in all organisms has led to enormous scientific and medical breakthroughs and significantly enhanced our ...

Preparation of Solutions and Materials
ExpandNOTE: For this lab to run smoothly, it is recommended to not exceed 12 samples per laboratory class.
First ...

DNA Isolation
ExpandNOTE: In this experiment you will perform DNA isolation under two experimental conditions: one using a buffer containing the detergent ...

Analyze and interpret data to compare DNA samples.

Transgenic Organisms

Reproductive Cloning

CRISPR

Synthetic Biology

Synthetic biology is an interdisciplinary science that involves using principles from disciplines such as engineering, molecular biology, cell biology, ...

Ribosome Profiling

Ribosome profiling or ribo-sequencing is a deep sequencing technique that produces a snapshot of active translation in a cell. It selectively sequences ...

Transgenic Plants

Recombinant DNA technology called transgenesis is often used to add a foreign gene or remove a detrimental gene from an organism. Such genetically ...

Gene Therapy

biofuels-producing-ethanol-from-cellulosic-material

Biofuels: Producing Ethanol from Cellulosic Material

Source: Laboratories of Margaret Workman and Kimberly Frye - Depaul University
In this experiment, cellulosic material (such as corn stalks, leaves, ...

Testing For Genetically Modified Foods

Source: Laboratories of Margaret Workman and Kimberly Frye - Depaul University
Genetic modification of foods has been a controversial issue due to debated ...

Obtain and communicate information that summarizes the impact of biotechnology applications on the individual, society, and the environment, including agriculture and medicine.

LS.Bio.8.2

Understand genetic mechanisms for variation.

DNA Extraction, Quantification, and Cutting

Description

Transcript

Tags

More videos by Standards