כרומטוגרפיית עמודות היא טכניקה המשתמשת בטור ארוז כדי להפריד תרכובות בהתבסס על האינטראקציות שלהן עם פאזה נייחת, שהיא בדרך כלל בצורה של חרוזים מיקרוסקופיים. החללים בין החרוזים מלאים בממס. פתיחת העמוד מאפשרת לממס לזרום דרך השלב הנייח. כאשר מורחים תערובת על החלק העליון של העמוד הארוז ואחריו עוד מהממס, התערובת עוברת לשלב הנייד וזורמת דרך הפאזה הנייחת.
כל רכיב של התערובת אינטראקציה עם השלב הנייח בצורה שונה. לחלק מהרכיבים יש אינטראקציות חלשות עם הפאזה הנייחת ולכן נעים במהירות דרך העמודה, בעוד שלאחרים יש אינטראקציות חזקות עם הפאזה הנייחת ולכן נעים לאט יותר. זה מפריד את התרכובות השונות ללהקות, אשר נאספים בשברים קטנים. זה מאפשר טיהור של כל תרכובת.
אז, איזה סוג של תכונות ניתן להשתמש כדי להפריד תערובות? אחת התכונות הנפוצות ביותר היא קוטביות. לשם כך, ג'ל סיליקה, שהוא צורה של דו תחמוצת הסיליקון, משמש לעתים קרובות כמו השלב נייח. ג'ל סיליקה מקיים אינטראקציה עם תרכובות על ידי אינטראקציות דיפול-דיפול וקשרי מימן דרך קבוצות -OH הנוצרות על פני השטח שלו. לפיכך, תרכובות קוטביות יתקשרו חזק עם הפאזה הנייחת, בעוד שתרכובות שאינן קוטביות יתקשרו בצורה חלשה.
תכונות אחרות שניתן לנצל להפרדה כוללות גודל, מטען והידרופוביות. דרך נפוצה לטעון את הפאזה הנייחת לתוך הטור היא כתרחיף של הפאזה הנייחת והממס. לאחר מכן, השלב ה