פרוטוקול זה מנצל לנתץ assay כדי לקבוע את רמות של GTPase RhoC פעיל בתוך התאים.
מאמר שיטה
פרוטוקול זה מנצל לנתץ assay כדי לקבוע את רמות של GTPase RhoC פעיל בתוך התאים.
RhoC GTPase יש הומולוגיה 91% ל RhoA GTPase. בגלל השכיחות שלה בתאים, ריאגנטים רבים וטכניקות RhoA GTPase פותחו. עם זאת, RhoC GTPase מתבטא תאים סרטניים עם גרורות ברמות נמוכות יחסית. לכן, כמה RhoC ספציפי ריאגנטים פותחו. יש לנו להתאים assay ההפעלה Rho GTPase כדי לזהות RhoC. טכניקה זו משתמשת GST-Rho תחום מחייב היתוך חלבון לשלוף פעיל GTPase RhoC. בנוסף, אנחנו יכולים לקצור חלבון הכולל בתחילת assay כדי לקבוע רמות בסך הכל (GTP והתוצר כבול) GTPase RhoC. זה מאפשר להגדרה של GTPase RhoC פעיל לעומת סך בתא. כמה גירסאות מסחריות של הליך זה פותחו עם זאת, ערכות המסחרי מותאמים RhoA GTPase ובדרך כלל אינם פועלים היטב עבור RhoC GTPase. חלקים של assay שונו, כמו גם פיתוח של נוגדנים RhoC ספציפי.
1. הכן GST-Fusion חלבון
2. GST-Fusion לנתץ assay
3. נציג תוצאות
תוצאות טובות צריך לייצר להקה אחת על כ 22 kDa. תוצאות Bad לייצר להקות מרובות או רקע גבוה. זה מעיד על פירוק חלבונים, כביסה שלם של דגימות או שימוש הישנה GST-RBD.

באיור 1. שלוש שורות תאים נפרדים להביע רמות שונות של RhoC GTPase מוצגים להפגין רמות נמוכות של RhoC פעיל בסך הכל, רמות גבוהות של RhoC פעיל מוחלט או לא RhoC. כתם הופשט אז reprobed עם נוגדן ל אקטין שמירה על הבית הגן לשמש שליטה טעינת לחלבון RhoC מוחלט.

איור 2. להקות מרובות או רקע תוצאות גבוהות מן פירוק חלבונים, כביסה שלם של דגימות או השימוש הישן GST-RBD.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
השלב הקריטי ביותר של ההליך הוא דור של טרי GST-RBD. אי לשים לב בשלב זה היא הסיבה העיקרית לכישלון. כל המדרגות, מדור של GST-RBD (1.2) כדי הדגירה לילה עם lysate התא (2.5), צריך להיעשות ביום אחד. צעד נוסף הוא חיוני כדי לוודא שיש מספיק תאים כדי להפיק את lysates התא. זו היא בעלת חשיבות מיוחדת כאשר מסתכלים RhoC GTPase, שנוטה להיות נוכח רמות נמוכות בתא.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
מחלקת הביטחון W81XWH-05-1-0005, W81XWH-06-1-0495, W81XWH-08-1-0029 ו W81XWH-08-1-0356
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| חרוזי גלוטיון-ספרוז 4B | Healthcare | 17-0756-01 | |
| קריטריון 4-20% ג'ל Tris-HCl | Bio-Rad | 345-0032 |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
בקש הרשאה לשימוש חוזר בטקסט או באיורים של מאמר JoVE זה
בקש הרשאה