פיתחנו וקטור lentiviral שיש לה, בנוסף LTR תאת מגיב, את אלמנט Rev-תגובה (RRE) כי ניתן לווסת את ביטוי הגן הכתב בצורה HIV-1 ו-תאת Rev-מותנה. וקטור מאפשר את זיהוי ספציפי של שכפול HIV בתאים חיים באמצעות ביטוי ה-GFP.
מאמר שיטה
* These authors contributed equally
פיתחנו וקטור lentiviral שיש לה, בנוסף LTR תאת מגיב, את אלמנט Rev-תגובה (RRE) כי ניתן לווסת את ביטוי הגן הכתב בצורה HIV-1 ו-תאת Rev-מותנה. וקטור מאפשר את זיהוי ספציפי של שכפול HIV בתאים חיים באמצעות ביטוי ה-GFP.
רוב HIV-תגובה וקטורים ביטוי מבוססים על האמרגן HIV, לחזור מסוף ארוך (LTR). בעוד מגיבים חלבון ה-HIV מוקדם, תאת, LTR הוא גם מגיב למצבים ההפעלה הסלולרית לפעילות הכרומטין המקומי שבו האינטגרציה התרחשה. זה יכול לגרום ל-HIV פעילות עצמאית גבוהה, הגביל את השימושיות של הכתב LTR מבוססי תאים סימן נשאיות 1,2,3. הנה, אנחנו נבנה וקטור ביטוי lentiviral שיש לה, בנוסף LTR תאת-תגובה, מספר רב של רצפי דנ"א HIV הכוללים את אלמנט Rev-HIV בתגובה אתרי שחבור 4,5,6. וקטור שולב וירוס כתב lentiviral, המתיר גילוי ספציפי מאוד של שכפול ה-HIV בקרב אוכלוסיות תא חי. הפעילות של וקטור נמדדה על ידי ביטוי של חלבון פלואורסצנטי ירוק (GFP). היישום של וקטור זה כפי שדווח כאן מציעה גישה חלופית הרומן השיטות הקיימות, כגון PCR באתרו או מכתים HIV אנטיגן, לזהות נשאי HIV לתאים. וקטור יכול גם לבטא גנים טיפוליים לניסויים קליניים בסיסיים או למקד נשאי HIV לתאים.
1. Transfection של פלסמידים עבור הפקה של Rev-מותנה חלקיקים lentiviral
הגדרת: Rev-GFP תלוי וקטור lentiviral, pNL-GFP-RRE-SA, תוארה בעבר 4,5,6. כדי להרכיב לתוך חלקיק נגיפי, הפלסמיד היה contransfected לתוך HEK293 בתאי T לבנות עם HIV-1 אריזה, pCMVΔ8.2 (בתנאי בחביבות על ידי ד"ר Dider Trono), וכן פלסמיד שנשא את גליקופרוטאין VSV-G (pHCMV-G) . Transfection בוצע בשיטת סידן פוספט.
הכנת מאגרים: 10 X בהרוורד (Hepes בופר) הוכנה על ידי המסת 5 גרם של Hepes, 8 גרם של NaCl, 0.37 גרם של KCl, 1 גרם דקסטרוז, 0.103 גרם Na 2 HPO 4 (anhydrous) ב 100 מ"ל של H 2 O. The10 Aliquot X בהרוורד חיץ לתוך 1 מ"ל aliquots ולאחסן ב -20 ° C. בזמן transfection, להמיר את 10 X 2 X בהרוורד כדי בהרוורד עם H 2 O (1: 5 דילול), ולהתאים את ה-pH על בין 7.05-7.12. (ל -10 מ"ל 2 X בהרוורד, זה בדרך כלל דורש כ 50 μL של 1M NaOH). סנן לעקר את החיץ 2X בהרוורד על ידי עובר דרך 0.22 מיקרומטר Millipore הסינון. חיץ CaCl 2 נעשתה על ידי המסת CaCl 2 ב 10 Hepes מ"מ עד 2M ריכוז הסופי. התאם ל-pH 5.8, מסנן לעקר את החיץ ולאחסן ב 4 ° C.
נוהל:
2. תתרכז חלקיקים נגיפיים ולקבוע titer ויראלי
3. סימון HIV-1 תאים חיובי עם החלקיקים lentiviral, vNL-GFP-RRE-SA
הגדרת: תא T מסוג CD4 אנושי קו, CEM-SS, היה נגוע הראשון עם HIV-1. ב 48 השעות שלאחר הזיהום, התאים היו superinfected עם חלקיקי lentiviral, vNL-GFP-RRE-SA. בעקבות superinfection עוד יומיים, GFP חיובי תאים נותחו על ידי cytometry הזרימה. כמו שליטה, HIV-1 נגוע CEM-SS התאים נדבקו זהה עם vNL-GFP-RRE-SA. רק ב-HIV-1-נגועים CEM-SS תאים הולידה את ה-GFP בתאים חיוביים אך לא HIV-1 נגוע CEM-SS תאים.
נוהל:
4. נציג תוצאות
אם הניסויים מבוצעים בהצלחה, אוכלוסייה גדולה של GFP יזוהו בתאים HIV-1-נגועים CEM-SS על ידי cytometer את הזרימה, בעוד שליטה, התאים GFP חיובי לא יזוהו ב HIV-1 נגוע CEM-SS תאים.
אם הניסויים מבוצעים בהצלחה, וקטור Rev-מותנה lentiviral, vNL-GFP-RRE-SA, יאפשר זיהוי ספציפי מאוד של איידס משכפלים לחיות אוכלוסיות תאים, באמצעות מדידה של חלבון פלואורסצנטי ירוק הביטוי (GFP). בדוגמה זו, שנקטפו CEM-SS תאים הוכתמו נוגדן PE-שכותרתו עכברוש חד שבטי כנגד CD24 העכבר, HSA, ונותחו לאחר מכן על cytometer זרימה הן HSA וביטוי GFP.

באיור 1. כפי שמוצג כאן, אוכלוסייה גדולה של GFP זוהה HIV-1-נגועים בתאי superinfected עם vNL-GFP-RRE-SA (איור 1 ג'). לעומת זאת, התאים GFP חיובי לא התגלו או CEM-SS תאים HIV-1 נגוע ללא superinfection lentiviral (איור 1 א) או HIV-1 לתאים נגוע עם superinfection lentiviral (איור 1b).
כמו עם תאת תלויי וקטורים התפתחה בשלב מוקדם יותר ביטוי, מערכת Rev המתואר כאן הוא ניצול של תהליך התפתח HIV. הכללת Rev-התלות הופכת את וקטור מבוססי LTR הביטוי תלויה מאוד בנוכחות של שכפול ה-HIV. היישום של וקטור זה כפי שדווח כאן, וירוס ה-HIV תלויי הכתב, מציעה גישה חדשה הרומן לזהות נשאי HIV לתאים. וקטור מאפשר בדיקה של תאים חיים, יכול לבטא את כל הגן לניסויים בסיסי או קליני, כמו lentivirus פסאודו הקלדת יש גישה סוגי תאים ורקמות ביותר.
העבודה נתמכה בחלקה על ידי שירות הבריאות הציבורי מענק 1R01AI081568 מ NIAID ל י.ו. ועל ידי תרומות נדיבות של תורמים הרוכבים של רייד 2009 איידס NYCDC מאורגן על ידי מ 'רוזן Day2 בע"מ
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| מטריצת בטיחות ביולוגית | |||
| 37°C 5%CO2 אינקובטור | |||
| ציטומטר זרימה | FACSCalibur | ||
| צנטריפוגה | Beckman Coulter Inc. | אלגה®6KR | |
| 4°מקרר C | |||
| -20°מקרר C | |||
| -80°מקרר בטמפרטורה של C | |||
| סופר תאים | Nexcelom Bioscience | סלומטר (Cellometer)® AutoT4 | |
| קו תאי HEK293T | המכונים הלאומיים לבריאות (National Institutes of Health) | ||
| קו תאי CEM-SS | המכונים הלאומיים לבריאות | ||
| קו תאי Jurkat J1.1 | המכונים הלאומיים לבריאות | ||
| DMEM | Invitrogen | 11965-118 | |
| RPMI 1640 | Invitrogen | 21870 | |
| FBS מועשר בחלבונים (Heat-Inactivated Fetal Bovine Serum) | Invitrogen | 10438-018 | |
| HIV-1NL4-3 | הוכנו על ידי טרנספקציה של תאי HeLa ב-DNA פרו-ויראלי משובט | ||
| pNL-GFP-RRE | מחיקה מלאה של כל מסגרות הקריאה הפתוחות (ORFs) של HIV מתוך pNL4-3 | ||
| pNL-GFP-RRE-SA | הכנסת HIV-1 A5 ו-D4 אל pNL-GFP-RRE | ||
| pCMVΔ8.2 | סופק על ידי ד"ר Dider Trono | ||
| pHCMV-G | |||
| 10x HBS (מלחים במאזן Hepes) | Invitrogen | 11344-041 | |
| 2M CaCl22 בופר | Invitrogen | S-013-154-10 | |
| 1% פאראפורמאלדהיד | Sigma-Aldrich | 158127 | |
| חומר הלבנה | |||
| מבחנות פאלקון (Falcon) בנפח 50 מ"ל | BD Biosciences | 358206 | |
| מבחנות עם תחתית עגולה בנפח 5 מ"ל | BD Biosciences | 352063 | |
| 0.45μמסנן Millipore M | EMD Millipore | SLHA033SS | |
| 0.20μמסנן Millipore M | EMD Millipore | SLFG85000 | |
| צלח פטרי 100 מ"מ | Sigma-Aldrich | CLS430588 | |
| עמודת הפרדה על בסיס גודל (סף חיתוך של 100,000MW) | Sartorius AG | VS2041 | |
| מבחנה להקפאה בנפח 2 מ"ל | Axygen Scientific | SCT-200 | |
| פלטה בעלת 96 בארות | BD Biosciences | 353227 | |
| מבחנת מיקרוצנטריפוגה 1.7 מ"ל | Axygen Scientific | MCT- 175-C |
בקש הרשאה לשימוש חוזר בטקסט או באיורים של מאמר JoVE זה
בקש הרשאה