Method Article

בידוד מושבת חיידקים ממוקד באמצעות פירוק הידרוג'ל בדוגמת אור

September 26th, 2025

In This Article

Abstract

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

מקור: Fattahi, N., et al. ממשקי הידרוג'ל מתכלים לסינון, בחירה ובידוד חיידקים. J. Vis. Exp. (2021).

סרטון זה מדגים את מיצוי מושבות החיידקים מהידרוג'ל מתכלה באמצעות אור UV. נבחרת מושבה ספציפית, וחשיפה לאור מעוצב נועדה ליזום פירוק הידרוג'ל מקומי. לאחר התאמת עוצמת האור ומשך האור, אור ה-UV מופעל ומשחרר את המושבה. לאחר מכן המושבה נשאבת דרך צינורות ומועברת לצינור לניתוח במורד הזרם.

Protocol

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

1. זני חיידקים ופרוטוקולי תרבית

  1. פס מושבות של חיידקים על צלחות אגר בתוספת אמצעי גידול מתאימים. בדוח זה, B. subtilis (זן 1A1135, Bacillus Genetic Stock Center) מתורבת על ATGN (0.079 M KH2PO4 (אשלגן דימימן פוספט), 0.015 M (NH4)2SO4 (אמוניום גופרתי), 0.6 מ"מ MgSO4·7H2O (מגנזיום גופרתי הפטהידרט), 0.06 מ"מ CaCl2·2H2O (סידן כלורי דיהידרט), 0.0071 מ"מ MnSO4·H2O (מנגן (II) סולפט מונוהידרט), 0.125 M FeSO4·7H2O (ברזל סולפט הפטהידרט), 28 מ"מ גלוקוז, pH: 7 ± 0.2, 15 גרם/ליטר אגר) צלחות אגר בתוספת 100 מיקרוגרם/מ"ל ספקטינומיצין....

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Results

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
figure-results-1

איור 1: היווצרות הידרוג'ל על כיסויי זכוכית תיולטית. (A) מרווחים בעובי של 12.7 מיקרומטר ממוקמים בשני צדדים מנוגדים של כיסוי בסיס שמכיל קבוצות תיול תגובתיות. (ב) תמיסת קודמן ההידרוג'ל מוזרמת על מגלשת זכוכית פלואורית שאינה מגיבה. (C) מגלשת הזכו.......

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Materials

List of materials used in this article
NameCompanyCatalog NumberComments
(3-מרקפטופרופיל) טריאתוקסילאןסיגמא-אולדריץ'ברקוד 175617-25G> 95%
אבקת דטרגנט אלקונוקסאלקונוקס1104 
אמוניום גופרתיפישר כימיקליםA702-500מאושר על-ידי ACS גרגירי
אוטוקלאב SK300Cימאטו סיינטיפיק18016 
בצילוס סבטיליס 1A1135המרכז למלאי גנטי של בצילוס1א1135 
מיקרוסקופ זקוף Brightfieldתאגיד אולימפוסBX51 
סידן כלורי, נטול מיםפישר כימיקליםC614-500לכדורי ייבוש, 4-20 רשת
צנטריפוגה 5702אפנדורף5702 
חומצת לימון מונוהידראטסיגמא-אולדריץ'C1909-500Gמגיב ACS, > 99.0%
D-גלוקוז (דקסטרוז)VWR אמרסקו מדעי החיים0188-1 ק"ג 
בסיס אלסטומר סיליקון DOWSIL 184תאגיד דאו סיליקון טמפרטורת אחסון: -30-60 מעלות צלזיוס
DOWSIL 184 חומר ריפוי אלסטומר סיליקוןתאגיד דאו סיליקון טמפרטורת אחסון: < 32 מעלות צלזיוס
ספקטרופוטומטר מיקרו-צלחת EPOCH2מכשירי ביוטקתקופה 2 
Escherichia coli ATCC 25922תרמו פישר סיינטיפיק₪19020 
אתנול, נטול מיםפישר כימיקלים459844 
זכוכית כיסוי מיקרוסקופ פישרברנדפישר סיינטיפיק12540א 
שקופיות מיקרוסקופ פרימיום של Fisherfinest רגילותפישר סיינטיפיק12-544-4 
תמיסת מי חמצןסיגמא-אולדריץ'216763-500 מ"למכיל מעכב, 30% משקל ב-H2O
אינקו-שייקר מיניאמת מידהE5-0014-01 
איזופרופנולסיגמא-אולדריץ'190764 
מגנזיום גופרתי, 7-לחותמקרון פיין כימיקלים6066-04אוונטור פרפורמנס מטיריאלס בע"מ
מתנולסיגמא-אולדריץ'ברקוד 179337-4Lמגיב ACS, > 99.8%
ספקטרופוטומטר NanoDrop Oneתרמו סיינטיפיקND-ONEC-W 
חנקן, דחוסמת'סוןUN1066 
מנקה פלזמה חמצןהאריק פלזמהPDC-001-HP 
פנטאריתריטול טטרה (מרקפטואתיל) פוליאוקסיאתילן (4 זרועות-PEG)תאגיד NOF אמריקהPTE-100SHסאנברייט-PTE-100SH
תמיסת מלח חוצצת פוספט (PBS), פי 10VWR אמרסקו מדעי החייםK813-500 מ"ליש לאחסן בטמפרטורה של 15-30 מעלות צלזיוס
פולידימתיל סילוקסן (PDMS) סליגארד 184דאו קורנינג4019862 
מצולע400MightexDSI-D-000 
שקופיות מיקרוסקופ פרימיוםפישר סיינטיפיק12-544-425 x 75 x 1 מ"מ
נתרן כלוריסיגמא מדעי החייםS5886-500Gביו-ריאגנט, מתאים לתרבית תאים
נתרן הידרוקסידסיגמא-אולדריץ'S8045-500GBioXtra, > 98%, כדורים (נטולי מים)
נתרן פוספט דיהידראט מונו-בסיסיסיגמא-אולדריץ'71505-250 גרםBioUltra, לביולוגיה מולקולרית, > 99.0% (T)
מד עובי נירוסטהמוצרי מותג מדויקים77739 
חומצה גופרתיתסיגמא-אולדריץ'320501-2.5 ליטר 
טולואן, נטול מים, 99.8%סיגמא-אולדריץ'ברקוד 244511-1Lנטול מים, > 99.8%
טריכלורו (1H,1H,2H,2H,2H perfluorooctyl) סילאן (TPS), 97%סיגמא-אולדריץ'ברקוד 448931-10G 
מרק סויה טריפטיסיגמא-אולדריץ'22092-500 גרםלמיקרוביולוגיה
סוניקטור אולטראסוניפישר סיינטיפיקFS-110H 

Reprints and Permissions

Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article

Request Permission

Tags

Photodegradable HydrogelBacterial Colony IsolationLight Patterned DegradationUV Light ExposureFluorescence MicroscopyColony AspirationHydrogel DegradationTargeted Colony ExtractionLight Pattern DesignSyringe Aspiration

Related Articles