מיקרוסקופיה אלקטרונית לאחר הזיהוי הראשוני על השקופיות, העריך את נוכחותו של הוירוס הענק באמצעות תצפית במיקרוסקופ אלקטרוני של תרביתי העל. הנח 5 µl מהדגימה החיובית על רשת שעברה פריקה זוהרת (glow-discharge). המתן כ-20 דקות בטמפרטורת החדר. ייבש את הרשת בזהירות והנח עליה טיפה קטנה של ammonium molybdate בריכוז 1% למשך 10 שניות. השאר את הרשת להתייבש למשך 5 דקות. בצע מיקרוסקופיה אלקטרונית ב-200 keV. הנח את הרשת על התומך; הכנס את התומך לתוך המיקרוסקופ. בדוק את סקירת הוואקום על ידי לחיצה על האייקון המתאים. סגור את השסתומים והתחל בתצפית בגודל נקודה (spot size) 5 ובהגדלה של 25,000x. מדוד את הוירוס הענק באמצעות ImageJ או ישירות במיקרוסקופ בעזרת כלי המדידה של המיקרוסקופ הממוקם במסך הרכישה. הערה: סווג את הדגימה לקבוצת ה-Faustovirus עם גודל קפסיד של כ-200 nm. בו ח'ליל, ג'. י'. , ואחריםאסטרטגיה מהירה לבידוד של Faustoviruses חדשים מדגימות סביבתיות באמצעות Vermamoeba vermiformis. .J. Vis. Exp (2016).
סרטון זה מדגים דימוי של חלקיקי Faustovirus מתרבית אמבה מזוהמת באמצעות מיקרוסקופיה אלקטרונית חודרת (TEM). הסרטון סוקר את הכנת הרשת, צביעה שלילית עם ammonium molybdate לשיפור הניגודיות, וויזואליזציה של הנגיף תחת המיקרוסקופ. הפרוטוקול מסתיים במדידת גודלו של ה-Faustovirus באמצעות כלי התוכנה המשולבים במיקרוסקופ.
