כל ההליכים הכרוכים באיסוף דגימות בוצעו בהתאם להנחיות IRB של המכון.
1. הכנת פאן לויקוציטים
- לשאוב 1 מ"ל של דם היקפי מתורם בריא (או חולה) מזרק heparinized. יש לוודא קבלת אישור מוועדת האתיקה האחראית לתרומת הדם.
- יש לערבב 1 מ"ל של דם היקפי אנושי עם 30 מ"ל של מאגר ליזיס ACK (150 mM NH4Cl, 1 mM KHCO3 ו- 0.1 mM EDTA, pH 7.0) בצינור של 50 מ"ל ולדגור במשך 8 דקות בטמפרטורת החדר.
- מלאו את הצינורות ב-PBS ובצנטריפוגה ב-300 x גרם למשך 6 דקות. שאפו את הסופרנאטנט והשעו מחדש את הגלולה ב-30 מ"ל של חיץ ליזיס ACK.
- חזור על שלבים 1.2 ו-1.3 עד שהסופרנאטנט נקי. לבסוף, לשטוף את התאים PBS, צנטריפוגה ב 300 x גרם במשך 6 דקות בטמפרטורת החדר, ולהשעות מחדש את גלולת התא ב 2 מ"ל של מדיום תרבית (RPMI1640 + 10% FCS). לדגור על התאים ב 37 ° C במשך 60 דקות.
2. טעינת תאי ראג'י עם SEB
- הכינו שני צינורות פלקון 15 מ"ל עם 1.5 x 106 תאי ראג'י לכל צינור. סובבו את התאים (300 x גרם במשך 6 דקות בטמפרטורת החדר) והשליכו את הסופרנאטנט.
- מרחפים מחדש את התאים בתווך שיורי (כ-50-100 מיקרוליטר), מוסיפים SEB של 1.9 מיקרוליטר (1.9 מיקרוגרם) ודגרים בטמפרטורת החדר למשך 15 דקות. מוסיפים 5 מ"ל של מדיום תרבית, מסובבים את התאים (300 x גרם במשך 6 דקות בטמפרטורת החדר), ומרחפים מחדש את הגלולה בתווך תרבית (RPMI1640 + 10% FCS) בצפיפות של 1 x 106 תאים / מ"ל.
3. השראת סינפסות חיסוניות ופרוטוקול צביעה
- פיפטה 500 μL של הכנת תאי Raji טעונים SEB לתוך צינור FACS ו 500 μL של הכנת תאי Raji פרוקים לתוך צינור FACS אחר. הוסף 650 μL של pan-leukocytes לכל צינור ולסובב את התאים (300 x גרם במשך 10 דקות בטמפרטורת החדר). השליכו את הסופרנאטנט והשעו מחדש את הגלולה ב-150 מיקרוליטר של מדיום תרבית (RPMI1640 + 10% FCS). יש לדגור בטמפרטורה של 37°C (בדרך כלל למשך 45 דקות).
- מערבלים בעדינות את התאים (10 שניות ב-1,000 סל"ד) ומוסיפים 1.5 מ"ל של פרפורמלדהיד (1.5%) במהלך המערבולת כדי לתקן את התאים. עצור את הקיבוע על ידי הוספת 1 מ"ל של PBS + 1% BSA. גלולה את התאים (300 x גרם במשך 10 דקות בטמפרטורת החדר ואת ההשעיה גלולת התא ב 1 מ"ל של PBS + 1% BSA לאחר הדגירה בטמפרטורת החדר במשך 10 דקות.
- גלולה (300 x גרם במשך 10 דקות בטמפרטורת החדר) ולהשהות מחדש את התאים ב 100 μL של PBS + 1% BSA + 0.1% saponin במשך 15 דקות בטמפרטורת החדר כדי לחדור את התאים (צלחת 96 באר, בצורת U).
- לשטוף את התאים PBS + 1% BSA + 0.1% saponin עם צנטריפוגה (300 x גרם במשך 10 דקות בטמפרטורת החדר) ולהשעות מחדש את גלולת התא ב 50 μL של PBS + 1% BSA + 0.1% saponin המכיל נוגדנים או תרכובות עם תווית פלואורופור (CD3-PE-TxRed (1:30), Phalloidin-AF647 (1:150), ו- DAPI (1:3,000)).
- לדגור על התאים בטמפרטורת החדר בחושך במשך 30 דקות. לשטוף את התאים 3 פעמים על ידי הוספת 1 מ"ל של PBS + 1% BSA + 0.1% saponin. צנטריפוגה ב 300 x גרם במשך 10 דקות בטמפרטורת החדר. השהה מחדש את התאים ב- 60 μL של PBS לצורך ציטומטריית זרימת הדמיה.
4. רכישת תמונה באמצעות ציטומטר זרימה
הערה: הליך רכישת התמונות וניתוח הנתונים הבאים מבוססים על ציטומטריית זרימת הדמיה באמצעות תוכנות כגון imagestream (IS100), INSPIRE ו- IDEAS. עם זאת, ניתן להשתמש גם בציטומטרים אחרים של זרימה ובתוכנות ניתוח.
- פתח את תוכנת הניתוח במחשב המחוברת לציטומטר זרימת ההדמיה ולחץ על Initialize Fluidics בתפריט המכשיר. החל את החרוזים על היציאה הימנית כאשר תתבקש לעשות זאת.
- טען את תבנית ברירת המחדל מתפריט קובץ ולחץ על הפעלה/הגדרה. בחר חרוזים מהתפריט הנפתח תצוגה.
- התאם את תאורת השדה הבהיר על-ידי לחיצה על הגדר עוצמה אם הערך שצוין נמוך מ- 200.
- הפעל את שגרת הכיול והבדיקות בכרטיסיה סיוע על-ידי לחיצה על התחל הכל.
- לחץ על Flush/Lock/Load והחל את הדגימות ביציאה השמאלית כאשר תתבקש לעשות זאת. לאחר טעינת התאים בציטומטר הזרימה, פתח את מסווג התאים והתאם את הערכים באופן הבא: גבול עליון של עוצמת שיא ב- 1,022 עבור כל ערוץ, גבול תחתון של עוצמת שיא ב- 50 עבור ערוץ 2 (DAPI) וערוץ 5 (CD3-Pe-TxR), אזור גבול תחתון ב- 50 עבור ערוץ 1 (פיזור צדדי) וגבול עליון ב- 1,500.
- שנה את עוצמת לייזר העירור ל- 405 ננומטר (15 mW), 488 ננומטר (200 mW) ו- 647 ננומטר (90 mW) בכרטיסיה התקנה.
- העבר את התפריט הנפתח תצוגה בין תאים וחרוזים כדי להעריך את מסווג התאים ואת התאמות עוצמת הלייזר.
הערה: ודא שכל התאים וזוגות התאים נמצאים בתצוגת התא ושגושי תאים, פסולת ותמונות עם פיקסלים רוויים נמצאים בתצוגת הפסולת על-ידי שינוי מסווגי התאים ו/או כוחות לייזר העירור.
- הגדר את שם המדגם ואת מספר התמונות שיש לרכוש (15,000-25,000 עבור דגימות ו- 500 עבור בקרות פיצוי) בכרטיסיה הגדרה. לחץ על הפעלה/הגדרה כדי להתחיל ברכישה.