כל ההליכים הכרוכים באיסוף דגימות בוצעו בהתאם להנחיות IRB של המכון.
1. בדיקת פגוציטוזה
- לדגור 2 x 106 לויקוציטים ו 4 x 106 קונידיה מסומנת FITC (ריבוי זיהום = 2) ב 1.5 מ"ל של RPMI + 10% FCS בצלחת תרבית תאים 12 באר. כפקדים, כלול תאים בלבד (ללא conidia) ותאים + conidia ללא תווית.
- יש להניח באינקובטור CO2 לח בטמפרטורה של 37°C ולדגור למשך פרק הזמן הרצוי (למשל, 0.5 שעות, שעתיים או 4 שעות).
- לאחר הדגירה, לקצור תאים עם מגרד תאים ולשים צינור 15 מ"ל.
- סבבו במשך 5 דקות בטמפרטורה של 300 x גרם בטמפרטורת החדר.
- לאסוף supernatant עבור ניתוח ציטוקינים או לזרוק אם לא רצוי. השהה מחדש כל דגימה ב 100 μL של PBS + 2 mM EDTA.
2. צביעת נוגדנים
- עבור כל דגימה, הכינו 100 מיקרוליטר של תערובת נוגדנים, כולל נוגדן APC נגד FITC, לפי טבלה 1.
- שים דגימה של 100 μL לתוך באר אחת של צלחת V תחתונה 96 באר. הוסף 150 μL של PBS + 2 mM EDTA לכביסה.
- לפיצוי צבע, מקמו 1 x 106 תאים לכל צבע בבארות נוספות של הלוח התחתון V של 96 בארות. כלול באר של תאים שנותרה לא מוכתמת. הוסף 150 μL של PBS + 2 mM EDTA לכביסה.
- מכסים את הצלחת בנייר כסף דביק.
- סבבו במשך 5 דקות בטמפרטורה של 300 x גרם בטמפרטורת החדר. הסירו את נייר הכסף.
- השליכו את הסופרנאטנט על ידי היפוך מהיר וחזק של הצלחת רק פעם אחת מעל הכיור או עם מגבת נייר חד פעמית.
הערה: אין לחזור על הפעולה או לדפוק את הצלחת על נייר עד לייבוש, שכן הדבר יגרום לאובדן מסיבי של תאים מהצלחת.
- להשהות תאים בתערובת נוגדנים 100 μL, ולערבב היטב על ידי pipetting.
- לפיצוי צבע, להשעות מחדש את התאים המתאימים ב 100 μL של PBS + 2 mM EDTA ולהוסיף נוגדן יחיד לכל באר באותה כמות המשמשת בתערובת נוגדנים.
- מכסים בנייר כסף ודגורים במשך 20 דקות בטמפרטורת החדר בחושך.
- הסירו את נייר הכסף. הוסף 150 μL של PBS + 2 mM EDTA לכל באר לשטיפה. מכסים ברדיד אלומיניום.
- סבבו במשך 5 דקות בטמפרטורה של 300 x גרם בטמפרטורת החדר. הסירו את נייר הכסף. השליכו את הסופרנאטנט על ידי היפוך מהיר וחזק של הצלחת מעל הכיור או מגבת נייר חד פעמית.
- השהה מחדש ב 200 μL של PBS + 2 mM EDTA ולהעביר תאים מכל באר לצינור תחתון עגול נפרד. ודא שאין אשכולות תאים בהשעיה. הסר אשכולות אחרת.
הערה: כל צביר גדול מספיק כדי שהעין תוכל לראות הוא גדול מספיק כדי לסתום את הציטומטר.
3. ציטומטריית זרימה
- הפעל את ציטומטר הזרימה ותן לו להתחמם. הפעל את תוכנת הרכישה.
- צור ניסוי חדש והגדר ותייג את הדגימות.
- הגדר פרמטרים (FSC 250, SSC 250) וגלאים עבור פלואורופורים FITC, APC, BUV395, V500 ו- PerCP-Cy5.5.
- הגדרת פיצוי
- הגדרת פיצוי פתוחה.
- ציין צבעים בודדים.
- באמצעות תאי הבקרה שנותרו ללא כתמים או עם כתמים בודדים, הגדר את מתחי גלאי PMT כך שיכללו את כל האירועים בסולם.
- תעד לפחות 10,000 אירועים של כל פקד.
- השתמש בהגדרת הפיצוי כדי לחשב את זליגת הפלואורופורים ולהחיל אותה על הגדרות הציטומטר של הניסוי.
- רישום נתונים לדוגמה
- הצג FSC ו- SSC בתוכנת הרכישה והגדר שער סביב לויקוציטים.
- בהתבסס על שער לויקוציטים, הציגו את תרשים הנקודות SSC/CD45 ואת השער עבור תאי CD45+ כדי להיפרד מקונידיה.
- הצג תאי CD45+ בתרשים נקודה CD14/CD66b ומונוציטים שער (CD14+) ונויטרופילים (CD66b+) בנפרד.
- הצגת נויטרופילים בתרשים נקודה אנטי-FITC/FITC.
- באמצעות הדגימה עם conidia ללא תווית, הגדר רבעים עבור אותות anti-FITC ו- FITC, המאפשר מקסימום של 1% מהתאים ברבעים המתאימים.
- חזור על שלבים 3.5.4 ו- 3.5.5 עבור שער המונוציטים.
- רשום את כל הדגימות עם לפחות 20,000 אירועים בשער לויקוציטים.
טבלה 1: תערובת נוגדנים לציטומטריית זרימה. כמויות של כל מגיב ניתנות כמיקרוליטרים לדגימה (1 x 106 תאים) לניתוח.
| מגיב | μl לדגימה |
| CD45 BUV395 | 1 |
| CD14 V500 | 0.5 |
| CD66b PerCP-Cy5.5 | 1.5 |
| נגמ"ש נגד FITC | 0.5 |
| PBS + 2 mM EDTA | 97 |
| סך | 100 |