1. Immunostaining של תאי CD8 T תושב ותאי גידול
- לדלל את הנוגדנים (ריכוז סופי 10 מיקרוגרם / מ"ל) ואת הצבע הגרעיני (ריכוז סופי 1 מיקרוגרם / מ"ל) במדיה RPMI-1640 ללא פנול אדום.
הערה: השתמש בנוגדנים מצומדים פלואורסצנטית נגד CD8 (מורין IgG, שיבוט SK1) ואנטי-EpCAM (מולקולת הידבקות תאי אפיתל) (מורין IgG HEA-125) כדי לסמן לימפוציטים מסוג CD8 T ותאי אפיתל גידוליים, בהתאמה. השתמש בנוגדן אנטי-CD90/Thy1 מצומד פלואורסצנטית (murine IgG, clone 5E10) כדי לתייג פיברובלסטים ותאי אנדותל פעילים. השתמש 4',6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) כדי לתייג את גרעין התאים עם קרום פלזמה פגום על מנת להעריך את כדאיות הרקמה.
- מוציאים את לוחות התרבית מהאינקובטור ומשתמשים בפיפטה כדי לשאוב נוזל כלשהו בתוך מכונות הכביסה מנירוסטה. אין להסיר את המדיה 1.1 מ"ל RPMI-1640 הממוקמת מתחת לתוספות תרבית התא.
- מבלי לגעת בפרוסה ולהשתמש בקצה פיפטה, מוסיפים 40 מיקרוליטר של התמיסה המכילה את הנוגדנים על כל פרוסת גידול.
- יש לדגור על הצלחת בטמפרטורה של 37°C למשך 15 דקות כדי לאפשר צביעת נוגדנים.
- בעזרת מלקחיים עדינים, מוציאים את מכונות הכביסה, מוציאים את הפרוסות וטובלים אותן 10 שניות במדיה RPMI-1640 ללא פנול אדום. החזירו את הפרוסות לתוספות תרבית התאים והוסיפו טיפה של מדיום RPMI-1640 ללא פנול אדום על כל פרוסה בנפרד. שמרו על הצלחת בטמפרטורה של 37°C למשך 10 דקות. המשך להדמיה.
2. הדמיה וניתוח נדידת תאי CD8 T בתוך פרוסות גידולי ריאה אנושיים
הערה: המיקרוסקופ הקונפוקלי המשמש בפרוטוקול זה הוא דיסק מסתובב זקוף המצויד במטרה טבילה במים פי 25 (25x/0.95 N.A).
- הכנת מערך מיקרוסקופ
- הגדר את הטמפרטורה של תא החום של המיקרוסקופ על 37 ° C כמה שעות לפני תחילת ההדמיה.
- הגדר מערכת כדי לנקב כל הזמן פרוסות גידול עם מחומצן (5% CO2, 95% O2) פנול ללא סל"ד אדום מדיום (איור 1). השתמשו במשאבה פריסטלטית כדי להזרים את אמצעי הזילוח לתוך תא ההדמיה ושאפו את התמיסה לצלוחית איסוף פסולת.
- הפעל את המשאבה הפריסטלטית כדי לאפשר לתמיסה המחומצנת לעבור דרך צינורות הזילוח.
- בעזרת מלקחיים עדינים, מוציאים את הפרוסה מצלחת 6 הבארות ומעבירים אותה לצלחת פלסטיק בקוטר 35 מ"מ מלאה בתווך סל"ד אדום נטול פנול. לשתק את הפרוסה עם עוגן פרוסה בקוטר 19.7 מ"מ עם חוטים מרווחים של 2 מ"מ. הניחו את צלחת הפטרי על שלב ההדמיה של המיקרוסקופ. חבר את קצות הכניסה והשקע של מערכת הזלוף. הפעל את מערכת הזילוח והגדר את קצב זרימת המדיה ל- 0.8 מ"ל/דקה.
- מנמיכים את יעד הטבילה במים לפרוסה. התמקדו בחלק העליון של הפרוסה באור שדה בהיר. באמצעות אור פלואורסצנטי מתאים, בחר אזור עניין המכיל תאי CD8 T, איים סרטניים (חיובי עבור EpCAM), ואזור סטרומה (חיובי עבור CD90). בדוק את הכדאיות של תאים בתוך הפרוסה על ידי הערכת צביעת DAPI במשטח החתוך ועמוק יותר לתוך הרקמה.
הערה: פרוסה בריאה מכילה רק מיעוט של תאים חיוביים ל-DAPI במרחק של כמה מיקרונים מהמשטח החתוך.
- הגדר הפעלת הדמיה עם הפעולות הבאות.
- בהתאם לעוצמת האות הפלואורסצנטי של 3 הפלואורופורים, הגדר את זמן החשיפה בין 50 ל -800 מילישניות ואת עוצמת הלייזר בין 20 ל -40%.
- בחר את עובי ערימת z לתמונה בתוך פרוסת הגידול.
הערה: כאן נלכדו 10-12 מטוסים אופטיים בעומק כולל של 60-70 מיקרומטר בממד z.
- בחר את מיקום ההתחלה בערך 10 מיקרומטר מתחת לתאי CD8 T המסומנים הראשונים.
- הגדירו את מרווח הזמן בין כל תמונת z stack בין 10 ל-30 שניות ואת זמן ההקלטה הכולל בין 10 ל-30 דקות.