1. תרביות תאים חיידקיים והכנת סופרנאטנט ללא תאי לקטובצילוס (LCFS)
הערה: שלבים 1.2 – 1.9 מתבצעים בחדר אנאירובי.
- הכינו צלחת אגר ומרק של דה מאן-רוגוזה-שארפ (MRS) המכילים L-ציסטאין ועיקרו על ידי אוטוקלאבינג.
- לדגור מראש את צלחת אגר MRS בתא אנאירובי H2 נשמר ב 37 ° C עם חמצן 20 ppm.
- הפשירו מלאי חיידקי לקטובצילוס וחסנו את צלחת האגר בתרבית החיידקים (איור 1A (i)).
- לדגור על חיידקים במשך 2-3 ימים בתא אנאירובי H2 ב 37 ° C ו 20 ppm חמצן עד מושבות חיידקים בודדים מתקבלים.
- לשטוף ולייבש את צינור תרבית אנרובי מסוג Hungate. Autoclave צינור התרבות ב 121 ° C במשך 15 דקות.
- לאחר מכן לדגור על הצינור בתא אנאירובי H2 ב 37 ° C ו 20 ppm חמצן כדי להסיר חמצן.
- מניחים 2 - 3 מ"ל של מרק MRS לתוך הצינור. אטמו את הצינור עם פקק גומי בוטיל והבריגו את המכסה.
- קבל מושבה אחת עם לולאה ומקם אותה לתוך צינור תרבית 1.5 מ"ל עם 500 μL של 1x PBS. (איור 1A (ii)).
- השהו את המושבה באמצעות מזרק 1 מ"ל (איור 1A (iii)). עשה זאת על ידי, החדרת המחט של מזרק 1 מ"ל במרכז מכסה הצינור, שאיפה המושבה מרחפת ולאחר מכן להשעות אותו בחזרה לתוך מדיה מרק MRS. (איור 1A (iv)).
- לדגור את מדיה מרק MRS באינקובטור שייקר במשך 2 ימים (37 ° C, 5% CO2, 200 סל"ד).
- מדוד את הצפיפות האופטית (OD) באמצעות ספקטרופוטומטר כדי לנטר את עקומות צמיחת החיידקים עד שהספיגה ב-OD620 מגיעה ל-2.0.
- יש להפריד בין כדוריות החיידקים לבין המצע המותנה על ידי צנטריפוגה במהירות של 1,000 x גרם למשך 15 דקות. יש לשטוף את כדורי החיידקים שנאספו עם 1x PBS ולהשהות מחדש ב-4 מ"ל של RPMI 1640 בתוספת 10% נסיוב בקר עוברי. אין לכלול אנטיביוטיקה במדיום.
- לשמור על כדורי החיידקים בסל"ד ולדגור באינקובטור שייקר במשך 4 שעות ב-37°C עם 5% CO2 במהירות של 100 סל"ד.
- להכנת הסופרנאטנט הפרוביוטי, יש להסיר את כדורית החיידקים באמצעות צנטריפוגה בטמפרטורה של 1000 x גרם, למשך 15 דקות בטמפרטורה של 4°C. סננו את הסופרנאטנט המשוחזר באמצעות מסנן של 0.22 מיקרומטר ואחסנו בטמפרטורה של -80°C עד לשימוש.
2. דור של spheroids
- הכנת שורות תאים של סרטן המעי הגס
- לגדל קווי תאים DLD-1, HT-29 ו-WiDr כחד-שכבות עד למפגש של 70-80% ולדגור על הצלחת ב-37°C באינקובטור 5%CO2 (מדיום גידול: RPMI המכיל 10% נסיוב בקר עוברי (FBS) ו-1% פניצילין-סטרפטומיצין).
- עבור תאים שגדלו בצלחת פטרי 100 מ"מ, שטפו את הצלחת פעמיים עם 4 מ"ל של 1x PBS. הוסף 1 מ"ל של 0.25% טריפסין-EDTA ודגור על צלחת פטרי במשך 2 דקות ב 37 ° C באינקובטור 5% CO2 כדי לנתק את התאים.
- לאחר הדגירה, לבדוק את דיסוציאציה התא תחת מיקרוסקופ ולנטרל טריפסין-EDTA עם 5 מ"ל של מדיום גידול.
- מעבירים את התאים המנותקים לצינור חרוטי 15 מ"ל וצנטריפוגה למשך 3 דקות ב 300 x גרם.
- יש להשליך את הסופרנאטנט ולהשהות מחדש בעדינות עם 3 מ"ל של מצע צמיחה.
- ספור את התאים עם כחול טריפאן כדי לקבוע תאים קיימא באמצעות המוציטומטר. (איור 1B (i))
- היווצרות כדורית
- בצינור חרוטי של 15 מ"ל, דללו את התאים מ-2.1.5 כדי לקבל 1-2 x 105 תאים/מ"ל (איור 1B (ii))
- הוסף ריכוז סופי של 0.6% מתילצלולוז לתרחיף התא והעבר את התאים המדוללים למאגר סטרילי.
הערה: עבור כל קו תאים, כמות המתילצלולוז הדרושה צריכה להיות טיטרציה ולהיקבע בהתאם.
- השתמש פיפטה רב ערוצית כדי לחלק 200 μL של תאים לכל באר של חיבור נמוך במיוחד 96 באר עגול התחתון microplate. (איור 1B (iii))
- לדגור את הצלחת ב 37 ° C בחממה 5% CO2 במשך 24 - 36 שעות.
- לאחר 24 - 36 שעות, התבונן בצלחת תחת מיקרוסקופ אור כדי להבטיח היווצרות כדורית.
3. טיפול תלת ממדי בתאי סרטן המעי הגס עם LCFS
- צור ספרואידים כמתואר בשלבים 2 ו-3.
- לפני ביצוע טיפול LCFS, הפשיר את LCFS קפוא בטמפרטורת החדר (RT) במשך 10 - 20 דקות.
- חסן את פתרון מניית LCFS למדיום צמיחה. דילול סדרתי ל 25%, 12.5% ו -6% במדיום הגידול (כלומר, 25% LCFS = 150 מיקרוליטר של מדיום גידול + 50 מיקרוליטר של LCFS).
- מוציאים את צלחת תרבית התאים המכילה ספרואידים מהאינקובטור ומוציאים כמה שיותר ממדיום הגידול מכל באר באמצעות פיפטה של 200 מיקרוליטר.
- הוסף את מצע הגידול עם LCFS על התאים ודגר ב 37 ° C באינקובטור 5% CO2 במשך 24 - 48 h.
הערה: הנפח שישמש יהיה תלוי בגודל הצלחת כדלקמן: 2 מ"ל עבור לוחות תרבית תאים 6 בארות; 200 μL עבור לוחות תרבית תאים 96 באר.