כל ההליכים הכרוכים באיסוף דגימות בוצעו בהתאם להנחיות ה-IRB של המכון.
1. אפיון הזדקנות עצבית באורגנואידים בקליפת המוח
- עיבוד אורגנואידים בקליפת המוח עבור קריוסקציה:
הערה: השלבים בוצעו במכסה מנוע של בטיחות ביולוגית Class 2.
- הכן 2 צינורות מ"ל, כל אחד מלא ב -1.5 מ"ל של 4% פרפורמלדהיד (PFA).
- חותכים את קצה הפיפטה P1000 (כדי להפוך אותו לקדח רחב) ומעבירים בעדינות כל אורגנואיד לאחד מצינורות 2 מ"ל שהוכנו לעיל (אורגנואיד אחד לכל צינור).
הערה: כדי למנוע ערבוב עודף של אמצעי התמיינות (DM) עם ה-PFA, אפשר לאורגנואיד לשקוע לכיוון הפתח של קצה הפיפטה P1000 והנח את הקצה ממש מעל החלק העליון של ה-PFA בצינור לפני הוצאת האורגנואיד החוצה. זה יאפשר לחוקר להעביר רק את האורגנואיד ומדיה מינימלית מאוד.
- אפשר לתהליך הקיבוע להתרחש ב-4 מעלות צלזיוס למשך שעה אחת.
- בעזרת קצה פיפטה P1000 לא חתוך, שאפו בזהירות עודפי PFA והוסיפו 1.5 מ"ל של PBS קר 1x (מי מלח חוצץ פוספט).
- העבירו את הצינורות לשייקר מסלולי המוגדר על 70 סל"ד למשך 10 דקות בטמפרטורת החדר (RT).
- חזור על תהליך הכביסה עם PBS 1x קר שלוש פעמים כדי להבטיח שכל ה-PFA הוסר ביסודיות.
הערה: אין להשליך PFA למיכלי פסולת רגילים; במקום זאת, הכינו מיכל ספציפי לפינוי פסולת כימית לשם כך, מכיוון ש-PFA מהווה סכנה.
- טבלו את האורגנואידים ב-1x PBS המכיל 30% סוכרוז ודגרו בטמפרטורה של 4 מעלות צלזיוס עד שכל האורגנואידים שקעו לתחתית הצינור.
הערה: הזמן הדרוש לאורגנואידים לשקוע תלוי בגודלם ובגילם. אורגנואידים בני שלושה חודשים עשויים להימשך עד 5 שעות.
- בעזרת קצה פיפטה P1000 חתוך ורחב קדח, העבירו בעדינות שלושה עד חמישה אורגנואידים לתבנית הרכבה המכילה תמיסת הרכבה העשויה מ-30% סוכרוז ו-100% טמפרטורת חיתוך אופטימלית (OCT) בינונית ביחס של 3:2.
- השתמש בקצה פיפטה של 10 מיקרוליטר בעזרת סטריאומיקרוסקופ כדי לכוון ולמקם אורגנואידים בתבנית דמוית רשת.
- הנח את התבנית על קרח יבש כדי למצק את תמיסת הסוכרוז OCT לפני שתמשיך בחתך הקפאה (16-20 מיקרומטר) באמצעות קריוסטט.
הערה: עבור בטא-גלקטוזידאז הקשור להזדקנות, יש לעבד את כל הרקמות לחלוקה לאחר שהן שקעו. עבור אימונופלואורסצנטיות, ניתן לעבד רקמות לחיתוך למחרת. אם לא מוכתמים מיד, יש לאחסן את כל השקופיות המכילות קטעים בטמפרטורה של -20 מעלות צלזיוס לפני אימונופלואורסצנציה או בטא-גלקטוזידאז לאחר מכן.
- תהליך לניתוח הזדקנות באורגנואידים במוח קליפת המוח:
הערה: ניתן לבצע את השלבים הבאים על ספסל מעבדה רגיל.
- העבירו את השקופיות למיכל צביעת שקופיות מיקרוסקופ עם מכסה ושטפו את רקמת האורגנואיד החתוכה שלוש פעמים עם 1x PBS למשך 10 דקות ב-RT כדי להסיר כל תמיסת הרכבה עודפת.
- לאחר מכן, דגרו את הרקמה השטופה בתמיסת צביעה בטא-גלקטוזידאז טרייה למשך הלילה בטמפרטורה של 37 מעלות צלזיוס.
הערה: תמיסת הצביעה של בטא-גלקטוזידאז עשויה ממאגר פוספט (עבור 10 מ"ל של מאגר פוספט: 8.15 מ"ל של 1 מ"ל NaH2PO4, 1.85 מ"ל של 1M Na2HPO4) pH מותאם = 6, 100 מ"מ של אשלגן הקסציאנופראט (III), 100 מ"מ של אשלגן הקסציאנופראט (II) טריהידרט, 5 מ' של NaCl, 1 מ' של MgCl2, 20 מ"ג/מ"ל של X-Gal. הימנע משימוש באינקובטור תרבית תאים סטנדרטי המכיל CO2 מכיוון שה-CO2 ישנה את ה-pH של תמיסת הצביעה בטא-גלקטוזידאז.
- כדי להסיר את תמיסת הבטא-גלקטוזידאז, שטפו את הרקמות המוכתמות עם 1x PBS שלוש פעמים למשך 10 דקות כל אחת ב-RT.
- הרכיבו את הרקמות השטופות עם תושבת זכוכית נגד דהייה ואפשרו לתמיסת ההרכבה להתמצק למשך 30 דקות ב-RT לפני הצפייה במיקרוסקופ.