$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
כל ההליכים הכוללים דגימות של בעלי חיים נבדקו ואושרו על ידי האתיקה המתאימה לבעלי חיים ועדת ביקורת.
1. מיקרוסקופיה פלואורסצנטית של גיליון אור (LSFM) (2-3 שעות)
- הגדרה לדוגמה
- הגדר אופטיקה של תאורה 5X/0.1 ו-5X/0.16 זיהוי אופטיקה. הרכיבו את מחזיק הדגימה ואת נימי הדגימה (קוטר פנימי של 1.5 מ"מ, ירוק) והניחו אותם במיקרוסקופ.
NOTE: עיין במדריך ההפעלה של המיקרוסקופ להליכי התקנה מפורטים. - הרכיב את העובר באופן הבא:
- הכן את קצה הפיפטה P200 על ידי חיתוך החלק העליון כך שיתאים לקוטר הנימים והסר את החלק המחודד (~ 3 מ"מ) עבור חיבור הדגימה.
- ממיסים את הקצה הקהה של קצה הפיפטה בעזרת להבה קטנה.
- כבו את הלהבה והצמידו במהירות את העובר אנכית לקצה המומס.
- התקן את החלק העליון של קצה הפיפטה עם נימי הדגימה.
- אפשר למאגר התא להתאזן עם העובר למשך דקה אחת כדי לפנות פסולת או בועות.
- באמצעות תוכנת ההדמיה, בחר Locate capillary תחת אתר טאב והתאם את צירי x, y ו-z כדי למקם את הנימים לדוגמה.
- בחר אתר sample וזום ל-0.6X כדי להתמקד בעובר. סובב את העובר כדי לוודא שהציר הארוך של הגפה המצולמת מיושר עם נתיב האור של שני מקורות האור (איור 1B).
- רכישת תמונה
- תחת <span style='משפחת גופנים:Arial,sans-serif;גודל גופן:12pt;סגנון גופן:רגיל;משתנה גופן:רגיל;קישוט טקסט:ללא;יישור אנכי:קו בסיס;רווח לבן:גלישה מוקדמת;'>רכישה tab, הגדר את פרמטרי נתיב האור כגון יעדי זיהוי, מסנן חסימת לייזר, מפצל קרן, מצלמות ולייזרים.
NOTE: תעלת החלבון הפלואורסצנטי הירוק (GFP) משמשת בניסוי זה (אורך גל עירור: 488 ננומטר; מסנן פליטה: פס פס (BP) 505 עד 545 ננומטר; מפצל קרן: SPS LP 560). - סמן את תיבת הסימון של סריקת הציר להפחתת צל.
- הגדר את הגדרות הרכישה: עומק סיביות, 16 סיביות; זום, 0.36-0.7X; תאורה חד צדדית (שמאל/ימין) או תאורה דו-צדדית.
- לחץ על Continuous והגדר את עוצמת הלייזר, זמן החשיפה, עוצמת הלייזר ומיקום גיליון האור כדי להשיג תמונות חדות יותר.
NOTE: עוצמת הלייזר נשמרת נמוכה ככל האפשר כדי למזער נזקי אור. - לחץ על STOP to end image acquisition.
- רכישה רב-ממדית
- הגדר את z-stack על-ידי הזזת מיקום Z עבור התמונה הראשונה והאחרונה. לחץ על Optimal כדי להגדיר את מספר הפרוסה.
- לחץ על Start Experiment כדי להשיג את z-stack שנבחר.
- בסיום, שמור את התמונה בפורמט .czi.
- עיבוד תמונה (אופציונלי)
- המשך עם מיזוג צדדי כפול תחת עיבוד גיליון אור ערוץ אם מוחלת תאורה דו-צדדית. עיבוד Multiview נחוץ אם נרכשות תצוגות מרובות כדי לשלב תמונות מזוויות מרובות.
- צור תמונה דו-ממדית באמצעות נתונים מהפיקסלים בעלי העוצמה הגבוהה ביותר לאורך ציר ההקרנה תחת Maximum Intensity Projection.
- תחת Copy ערוץ, לחץ תת-ערכה לבחירת קבוצות משנה של תמונות מהערכה המקורית.
2. כימות של ארבוריזציה של אקסון (30 דקות לכל עצב בודד)
- פתח את קובץ התמונה בתוכנת ניתוח ההדמיה (כברירת מחדל, התמונה המכילה את נתוני XYZ נפתחת במצב Surpass וכתצוגה תלת-ממדית).
- התאם את הצבע, הבהירות והניגודיות של התמונה באמצעות Display Adjustmentwindow (Edit | הצג התאמת תצוגה) כדי לזהות חוטים על סמך ניגודיות עוצמה מקומית.
- לחץ על Add New filments ובחר בסמל נתיב אוטומטי (ללא לולאה)<span style='משפחת גופנים:Arial,sans-serif;גודל גופן:12pt;סגנון גופן:רגיל;משתנה גופן:רגיל;משקל גופן:400;קישוט טקסט:ללא;יישור אנכי:קו בסיס;רווח לבן:גלישה מוקדמת;'> אלגוריתם בתפריט הנפתח.
- בחר את אזור העניין (במקרה זה, אקסון הפילוח של העניין). לחץ על next בסיום.
- הגדר את נקודות ההתחלה והזרע על ידי הקצאת מידות הקוטר הגדולות והדקות ביותר, שניתן למדוד באמצעות Slice .
- הקצה נקודת התחלה בקצה אזור העניין. כדי להשיג הוספה או הסרה ידנית של נקודות התחלה, שנה תחילה את מצב המצביע (Navigate | בחר) ולאחר מכן Shift + לחיצה ימנית בנקודות העניין.
- בחר ערכי סף ידניים לנקודות זרע כדי להבטיח שכל העצבים הגלויים מסומנים. שינוי מצב המצביע (Navigate | select) ולאחר מכן Shift + לחיצה שמאלית בנקודות העניין להוספה או הסרה ידנית של נקודות seed.
NOTE: חשוב להסיר ידנית רעשי רקע ואותות מעצבים שכנים. - סמן את התיבה הסר נקודות זרע סביב נקודות התחלה.
- בדוק הסר מקטעים מנותקים לאפשר אי הכללה של נקודות רחוקות מדי, שעלולות לייצג רעשי רקע. ציין את Maximum Gap Length בשלב הבא להגדרת הגבול העליון עבור הדרה.
- התאם את הסף לחיסור רקע, המשתמש במסנן גאוס כדי להעריך את עוצמת הרקע של כל ווקסל.
- הגדר את הסף האוטומטי לקוטר דנדריט באמצעות שטח חתך משוער algorithm.
- דלג על השלבים לחישוב עמוד השדרה.
- סיים את התהליך ובחר את הסגנון והצבע הרצויים.
- בטל את הסימון בתיבת עוצמת הקול במאפיינים כדי להציג רק את האקסונים המשוחזרים.
- תחת סטטיסטיקה tab, בחר מפורט. השתמש בנימה מס'. Dendrite Terminal Points כדי לכמת את מסופי העצב המוטורי כאינדיקטור לארבוריזציה של אקסון מוטורי.
NOTE: סטטיסטי ניתן להוסיף הערות אם רוצים. - ייצא את התמונה של האקסון המשוחזר כקובץ .tif.