קדימה הגנטיקה היא שיטה רבת עוצמה לחשוף את הרמה המולקולרית של כמה Toxoplasma Egresses מהתא המארח שלה. הפרוטוקולים ניתנים כימית mutagenize טפילים, להעשיר את מוטנטים עם פגמים יציאה יזומה, ולאמת את הפנוטיפ של מוטציות משובטים.
הרשמה ל-JoVE נדרשת לצפייה בתוכן זה. התחברו או התחילו בגרסת ניסיון בחינם.
מאמר שיטה
קדימה הגנטיקה היא שיטה רבת עוצמה לחשוף את הרמה המולקולרית של כמה Toxoplasma Egresses מהתא המארח שלה. הפרוטוקולים ניתנים כימית mutagenize טפילים, להעשיר את מוטנטים עם פגמים יציאה יזומה, ולאמת את הפנוטיפ של מוטציות משובטים.
נפוצה, מחייבים תאיים, protozoan הטפיל Toxoplasma gondii גורם למחלות אופורטוניסטית ב חיסונית שנפרצו חולים וגורם למומים מולדים עם זיהום מולד. מחזור שכפול ממס מתאפיינת בשלושה שלבים: 1. הפלישה פעיל של תא פונדקאי גרעיני: 2. שכפול בתוך התא המארח, 3. יציאה פעילה מן התא המארח. מנגנון של יציאה היא יותר ויותר להיות מוערך כתהליך, ייחודי פיקוח הדוק, אשר עדיין ממעטים להבין ברמה המולקולרית. מסלולי איתות יציאה בבסיס אופיינו באמצעות סוכני פרמקולוגיים הפועלים על היבטים שונים של מסלולים 1-5. לפיכך, גורמים עצמאיים שונים של יציאה זוהו שכל להתכנס על שחרורו של Ca 2 + תאיים, סימן שהוא גם קריטי עבור הפלישה התא המארח 6-8. תובנה זו הודיע הגן המועמד הגישה שהוביל identiאחת מהבעיות הנגזרות מהחלוקה של הצמח כמו סידן קינאז החלבון תלויה (CDPK) מעורב יציאה 9. בנוסף, פריצות הדרך האחרונות מספר יציאה הבנה נעשו באמצעות (כימי) גישות גנטיות 10-12. לשלב שפע של מידע תרופתי עם נגישות גנטי גדל והולך של Toxoplasma לנו לאחרונה הוקמה מסך המאפשר העשרה מוטציות טפיל עם פגם יציאה התא המארח 13. למרות mutagenesis כימי באמצעות N-ethyl-N-nitrosourea (ENU) או אתיל methanesulfonate (EMS) שימש במשך עשרות שנים בחקר הביולוגיה Toxoplasma 11,14,15, רק לאחרונה יש מיפוי גנטי של מוטציות שבבסיס פנוטיפים הופכים לשגרה 16 -18. יתר על כן, על ידי יצירת מוטציות רגישות טמפרטורה, תהליכים חיוניים ניתן גזור ואת הגנים הבסיסיים מזוהה באופן ישיר. מוטציות אלה מתנהגים כמו wild-type תחת טמפרטורה מתירנית (35 ° C), אבל לא מצליחים עמ 'roliferate בטמפרטורת כובל (40 ° C) כתוצאה של מוטציה הנדון. כאן אנו להמחיש שיטה חדשה ההקרנה פנוטיפי לבודד מוטנטים עם פנוטיפ הטמפרטורה רגיש יציאה 13. האתגר עבור מסכי היציאה היא להפריד egressed מן הלא egressed טפילים, אשר מורכבת על ידי מהיר מחדש הפלישה הדביקות הכללי של טפילים לתאי המארח. מסך יציאה הוקמה בעבר היה מבוסס על סדרה של צעדים מסורבלת biotinylation להפריד בין תאיים טפילים תאיים 11. שיטה זו גם לא ליצור מוטנטים מותנים וכתוצאה מכך פנוטיפים חלשים. השיטה המתוארת כאן מתגבר מצורף חזקה של egressing טפילים על ידי הכללת מתחרה glycan, סולפט dextran (DS), המונע טפילים יידבקו אל התא המארח 19. יתר על כן, טפילים תאיים נהרגים במיוחד את ידי pyrrolidine dithiocarbamate (PDTC), מה שמשאיר טפילים תאייםללא פגע 20. לכן, עם מסך פנוטיפי חדש במיוחד לבודד מוטנטים טפיל עם פגמים יציאה יזומה, כוחה של הגנטיקה כעת ניתן לפרוס באופן מלא לפענח את המנגנונים המולקולריים העומדים בבסיס התא המארח יציאה.
סקירה כללית
הפרוטוקולים ניתנים 1 להגדיר את המינון של mutagen שמוביל להרג 70% הטפילים (פרוטוקול 1). ההליך הבא ניתן להעשיר את מוטנטים היציאה המושרה מתוך מאגר הטפיל mutagenized (פרוטוקול 2, איור 2). זה מלווה בפרוטוקול לבדוק את השכיחות של מוטציות היציאה בבריכה מועשר, או כדי לאמת את הפנוטיפ יציאה ב מוטציות בודדות (פרוטוקול 3). לבסוף, פרוטוקול ניתן ליצור שיבוטים טפיל בודדים מאוכלוסיות מועשר על ידי הגבלת דילול (פרוטוקול 4).
1. טיטרציה של mutagen
היזהר מיוחד, כגון כפפות כפולות, כאשר עובדים עם חומרים ונוזלים מוטגניות ביותר. איסוף פסולת נוזלית בנפרד לסילוק נאות.
2. העשרה של מוטציות היציאה (איור 2)
3. אימות של פנוטיפים מוטנטים על ידי מבחני היציאה
לאחר ביצוע המסך העשרה התבגרות האוכלוסייה העשירה למעבר 1 בתאים HFF, פנוטיפים את צריכה להיות מאושרת על ידי assay יציאה 11,13. Assay זה אמור לשמש גם כדי לאמת את שיבוטים בודדים לאחר פרוטוקול 4.
4. לשבט מוטציות היציאה על ידי הגבלת דילול
לאחר אימות של הפנוטיפ של האוכלוסייה מועשר יציאה מוטציה באמצעות פרוטוקול 3, האוכלוסייה polyclonal צריך לשכפל להשיג שיבוטים טפיל יחיד.
5. נציג תוצאות
ENU מוטאגנים ו EMS אינם יציבים כאשר הם מאוחסנים על פני תקופות זמן ארוכות. לכן, בדיקת כוח מוטגניות שלהמניות הוא קריטי כדי להשיג תוצאות לשחזור. תוצאות טיטרציה טיפוסי הקטל עקומות עבור שניהם ENU ו EMS מוצגות באיור 1. עם זאת, מומלץ לבצע מבחני פלאק לניסוי כל mutagenesis לוודא את המינון המתאים היה בשימוש. כדי לשמור על הגיוון באוכלוסייה טפיל mutagenized, חשוב להמשיך עם מסך מוטציה יציאה מהר ככל האפשר. בדרך כלל, 1 מעבר של טפילים לתוך הבקבוק החדש מתבצע על מנת לאפשר את הטפילים ששרדו להתאושש לפני הולך קדימה עם המסך. יש לזכור כי פעולה זו תגרום חלוקת מוטנטים את. לכן לא ניתן לשלול כי מוטציות משובטים רבים מבודדים לאחר סיום ההליך כולו מכילים בדיוק גנוטיפ זהה. כדי למנוע בידוד פעמים באותו מספר מוטנטים זה מומלץ לבודד רק מוטציה אחת לכל יציאה mutagenesis, אלא אם כן פנוטיפים שלהם (למשל היציאה דיפרנציאלי רגישויות inducer) הםשונים מאוד זה מזה. מצד שני, לא כל התוצאות המסך בידוד מוטנטים עם פנוטיפ הרצוי. בפרט 2 + Ca-ionophore A23187 פנוטיפ עמיד נדיר ודורש ניסויים mutagenesis מספר ומסכי לבודד מוטציה יציאה אחת. לכן מומלץ לבצע 5-10 mutagenesis וניסויים מסך במקביל.
כוח העשרה של המסך נבדק על ידי ערבוב מוטציה יציאה ידוע עם wild-type טפילים על יחסים שונים. תערובות אלה היו נתונים המסך לבין שכיחות הפנוטיפ של מוטציה באוכלוסייה מועשר הוערך. באמצעות wild-type טפילים המבטאים RFP cytoplasmic וקו מוטציה לבטא YFP cytoplasmic מקרים יכולים במהירות שתקבע cytometry הזרימה (איור 3) 13. התוצאות מראות כי פנוטיפים מוטנטים יכול להיות מועשר באופן שגרתי לטוהר 80% החל על ידי טפיל 1 יציאה מוטציה לכל p wild-type 10000arasites 13. עם זאת, כאשר מוטציה יציאה: wild-type תחילת יחס הטפיל הוא 1:100,000 הטפילים, אוכלוסיית מבודד רק 1-2% (1:100) מוטנטים היציאה. לכן הכוח העשרה של המסך הוא של פי 1000. מאז המסך מתחיל עם חיסון של 120,000 טפילים, אשר בדרך כלל 70% הן בנות קיימא, אנו בדרך כלל לבצע שני סבבים של העשרה. הטפילים בודדים הם גדלו בין סיבובים העשרה. הליך זה מביא אוכלוסייה מוטציה 100% גם כאשר החל 1:1,000,000 היציאה מוטציה: wild-type טפילים.
Assay יציאה לאמת ולאפיין את פנוטיפים מחייבת ריבוי של זיהום התא המארח המאפשר בידול של vacuoles בודדים. זה קריטי במיוחד כאשר מנתחים מצבים עם אחוזים גבוהים של יציאה כמו טפילים בודדים פזורים סביב. כפי שניתן לראות בתרשים 4, אם אוכלוסיות egressed לא מופרדים היטב קל לזלזל אחוזשל יציאה ידי ספירת שני vacuoles egressed כמו vacuole 1. מאז יציאה ופלישה הם תהליכים הקשורים, וכמה הטמפרטורה רגישים פנוטיפים להציג פנוטיפ קלה בטמפ 'נמוכה יותר, לא תהיה כל מוטציות יעילות הפלישה דומים. מוטציות כאלה כן יש מחוסן בכמה מינונים גבוהים יותר לקפל להשיג צפיפות גבוהה vacuole מספיק הערכה מדויקת של הפנוטיפ יציאה שלהם. יתר על כן, כמה inducers היציאה לא יעילה לעורר יציאה של vacuoles המכילים ארבעה טפילים או פחות. לפיכך, חשוב כי vacuoles להכיל שמונה טפילים או יותר, כאשר החל assay יציאה. במעבדה שלנו אנו מוטציות מסך בודד עם יציאה מסוימת משפר נגד משפרי היציאה אחרים. על ידי פרופיל שלהם חוצה תגובתיות מוטנטים יכולים להיות מקובצים בכיתות שונות. לבסוף, לא כל מוטציות היציאה תהיה הטמפרטורה רגיש. בשנת מוטציות מסוימות מבודדים עם inducers היציאה מפעילה צעדים לפני שחרורו של intracellular Ca 2 + מועדים שאינם טמפרטורה פנוטיפים רגישים. זאת בשל מסלולים מקבילים שיכולים להוביל היציאה והכניסה לפני האות מתכנסת על שחרורו של Ca 2 + תאיים.

באיור 1. Mutagen טיטרציה כימית במינון. מבחני א הרובד הופיעה צלחת 6-גם באמצעות ריכוזים שונים EMS ו מספרים שונים של טפילים בכל טוב כפי שצויין. כתמים לבנים הם הפלאק טפיל שנוצרו בשכבה HFF. ב ', ג עקומות ההישרדות של טפילים בעת החשיפה במינונים שונים של EMS (ב') ENU (C). הישרדות הוערך על ידי מבחני פלאק. המינון גרימת הרג 70% נבחר לניסויים mutagenesis. ממוצע של שלושה ניסויים בלתי תלויים + / - סטיית התקן מוצגים.

באיור 2. ייצוג סכמטי של המסך העשרה יציאה מוטציה. טמפרטורה מצוין על ציר ה-Y, ואילו התקדמות הזמן מיוצג על ידי ציר ה-x. טפילים ירוקים משקפים טפילים מוטציה היציאה, טפילים אדומים המשקפים wild-type טפילים. העיתוי של שינוי התנאים על ידי גירוי inducer יציאה מצוינים בחלק העליון מסומנים על ידי חצים על הקו הכחול המשקף את פרופיל הטמפרטורה. שאומצה מ Eidell et al. 13.

איור 3. העשרה אופיינית של פנוטיפים מוטנטים היציאה. תוצאות העשרת מוטציה יציאה מעורב לתוך wild-type טפילים על יחסים שונים (ציר x). אחוז פנוטיפים מוטנטים היציאה באוכלוסייה גדל אחרי המסך הוא זמם על ציר ה-Y ו הוערך על ידי cytometry זרימה (טפילים מוטציה היציאה הביע YFP cytoplasmic, wild-type טפילים הביע סייtoplasmic RFP). תוצאות של שלושה ניסויים בלתי תלויים מיוצגים על ידי נקודות נתונים אדום, כחול וירוק. שאומצה מ Eidell et al. 13.

באיור 4. תוצאות אופייניות של assay יציאה. כמה חצים. לציון ארבע vacuoles שלמים שונים המכילים טפילים 4-8. ב. החצים מסמנים ארבע קבוצות של טפילים מפוזרים המשקפות ארבע vacuoles egressed עצמאיים. היציאה היה המושרה על ידי A23187 (ב) או DMSO כביקורת שלילית (). טפילים להביע YFP cytoplasmic 22.

איור 5. דילול סדרתי עבור קווי טפיל משובט. ארבע אוכלוסיות polyclonal (אדום, כחול, צהוב, ירוק) הם בדילול סדרתי confluent ב 384 גם אחד צלחת עם תאים HFF. בשורה C ואני מקבל 10 טפילים לכל טובהם פי 2 בדילול מלא (40 + μl 40 μl) עד שורות H ו-N, בהתאמה. גוון של אפור מציין את מספר קטן והולך של טפילים בכל טוב. בדרך כלל, שיבוטים בודדים נמצאים בשורות DF ו JL.
| תרכובת | מניות | עבודה ריכוז | μl הדרוש T25 (10 מ"ל) | זמן הדגירה (דקות) |
| DTT | 1 M ב DMSO | 5 מ"מ | 50 | 15 |
| אתנול | 190 הוכחת | 5% | 500 | 30 |
| A23187 | 2 מ"מ DMSO | 1 מיקרומטר | 5 | 5 |
| nigericin * | 2 מ"מ DMSO | 10 מיקרומטר | 50 | 30 |
* Nigericin לא ניתן להשתמש להעשרתמסך ment כמו הטפילים אינם שורדים גירוי nigericin, רק משתמשים nigericin באימות של מוטציות היציאה.
1. לוח יציאה inducers המשמשים נהלים. למהול ב 10 מ"ל HBBSc המכיל 25 מ"ג / מ"ל DS של המסך, או לא DS עבור אימות מוטציה (assay יציאה). כל תרכובות של Sigma-Aldrich.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
פרוטוקול תיאר מספק שיטה יעילה לבודד מוטנטים Toxoplasma עם מום יציאה. אנחנו מבודדים בהצלחה מוטציות לאורך השלבים השונים של מסלול יציאה, שחלקם יש פנוטיפ הפלישה כפול 13. השפעה על הפלישה ניתן לקבוע באמצעות מה שמכונה אדום ירוק assay, אשר מבדיל בין פלש ללא פלש טפילים ידי מכתים ההפרש נוגדנים 23,24. עבור שני מבחני הפלישה יציאה זה יכול להיות נוח להביע את הסמן חלבון autofluorescent בציטופלסמה של טפילים 13,22. עם זאת, אם להיות טפילים mutagenized...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
אין לנו מה למסור.
עבודה זו מומנה על ידי איגוד הלב האמריקני המדען פיתוח גרנט 0635480N ואת המכונים הלאומיים לבריאות מענק מחקר AI081220. BIC נתמך על ידי קרן עין האבירים הטמפלרים מענק מחקר.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| שם מגיב | חברה | מספר קטלוגי | תגובות |
| ENU | Sigma-Aldrich | N3385 | 1 M לניירות ערך DMSO, החנות ב -20 ° C |
| EMS | Sigma-Aldrich | M0880 | 1 M לניירות ערך DMSO, החנות ב -20 ° C |
| Dextran סולפט | Sigma-Aldrich | D4911 | |
| PDTC | Sigma-Aldrich | P8765 | 100 מ"מ לניירות ערך PBS |
| הבדל מהירה | EMD כימיקלים | 65044-93 | |
| מסנן בעל | קולמן בן הזוג | 540100 | |
| 3 מיקרומטר פוליקרבונט המסנן | Whatmanשלייכר & Schuell | 110612 | |
| Hemocytometer | האוסר מדעי | 1475 | |
| CO 2 חממות | יצרנים שונים | CO Humidified, 5% 2, ב 35, 37 ו - 40 ° C | |
| מיקרוסקופ פלואורסצנטי | יצרנים שונים | הפוך באופן אידיאלי, תחום רחב במטרה שמן 63x או 100x |
HBSSc (לפי בלאק ואח' 11.):
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.