1. ציפוי משטחים עם ליגנד מטריקס
- אולטראסאונד יחולו על תאים בגודל 3.5 ס"מ וולס, כמו גם מנות בודדות או צלחת 6 היטב. מבחני ביוכימיים, מעיל ליגנד ישירות על גבי פלסטיק. עבור immunofluorescence, זכוכית לרתיחה coverslips שלוש פעמים במים MilliQ ומקום 4 coverslips אל קרקעית הבאר זה.
- משטחי זכוכית חייב להיות derivatized כדי להבטיח ציפוי ליגנד יעיל. ממיסים sulpho-M-maleimidobenzoyl-N-hydrosuccinimide אסתר ב PBS על 1 מ"מ. הוסף 2 מ"ל זה טוב דגירה במשך 30 דקות בטמפרטורת החדר.
- לשטוף את המשטחים derivatized 3 פעמים עם PBS.
- מעיל או זכוכית או פלסטיק derivatized מטופל עם ליגנד integrin. החל 2 מ"ל של 10 מיקרוגרם / מ"ל integrin ligand9, מומס PBS המכילה Ca 2 + ו - Mg 2 + זה טוב דגירה לילה ב 4 ° C.
- הכן monoparticulate BSA על ידי חימום BSA 1%, מומסים PBS, עד 85 מעלות צלזיוס במשך 13 דקות. להתירלהתקרר ואז לעבור דרך מסנן 0.45-מיקרומטר.
- לשטוף ליגנד מצופים משטחים 3 פעמים עם PBS ולחסום עם BSA monoparticulate במשך 30 דקות.
2. הכנת תאים
- כדי לשלוט על סביבת מטריקס במהלך הניסוי, סינתזת החלבון צריך להיות חסום על ידי תוספת של cycloheximide מיקרוגרם / מ"ל 25-80% fibroblasts confluent למשך 2 שעות.
- יש לשטוף cycloheximide שטופלו בתאים עם PBS ולנתק מהבקבוק התרבות באמצעות 0.5 מ"ג / מ"ל טריפסין / EDTA.
- קציר תאים משפחתיים שנכתבו על ידי צנטריפוגה ב 500X גרם במשך 5 דקות.
- תאים Resuspend ב DMEM/25 HEPES מ"מ, 25 מיקרוגרם / מ"ל cycloheximide.
- ספירת צפיפות התאים של השעיה באמצעות haemocytometer ו לדלל עד 105 מ"ל-1.
- דגירה תאים על 37 מעלות צלזיוס במשך 20 דקות כדי להתאושש integrin פני השטח.
- שוטפים את ליגנד מצופה, BSA, חסומים בארות 3 פעמים עם PBS.
- 2 זרעים מ"ל של תרחיף תאים לתוך היטב כל אחד מהם.
- Alloתאים W כדי להתפשט עבור 2 שעות על 37 מעלות צלזיוס, 5% CO 2.
3. אולטראסאונד גירוי
- לחמם פולט אולטרסאונד מערך ג'ל צימוד ל 37 ° C.
- החל בועה אפונה בגודל של צימוד ג'ל כדי פולט כל אחד.
- לבדוק כי כל אחד פולט הוא פונקציונלי באמצעות אינדיקטור אולטרסאונד גלאי דיודה.
- מניחים את הבארות על מערך פולט. להחזיר מערך 37 מעלות צלזיוס, 5% CO 2 ולאפשר הטמפרטורה כדי לאזן במשך 10 דקות.
- הפעל את האות אולטרסאונד.
- האות אולטרסאונד יהיה לבטל אחרי 20 דקות, מחקה את המשטר הטיפולי. אם פעמים גירוי קצר נדרשים, צלחות יש להסיר מערך בתזמון הנכון נקודות. בכל המקרים להשתמש unstimulated צלחות כביקורת שלילית.
4. הדבקה ניתוח מיקוד ידי immunofluorescence
- לניתוח של יצירת מוקדי הידבקות, החל את האות 20 דקות אולטרסאונדולאחר מכן אפשר לפתח עבור מבנים של 40 דקות נוספות על ידי שמירה על תאים על 37 מעלות צלזיוס, 5% CO 2.
- Aspirate התקשורת לתקן את התאים על ידי הפעלת 2 paraformaldehyde מ"ל 4% ב PBS. דגירה במשך 14 דקות בטמפרטורת החדר.
- Aspirate paraformaldehyde ולשטוף שלוש פעמים עם PBS, החלת PBS בעדינות את קצה גם כדי למנוע דור של כוחות גזירה.
- להעביר את כל coverslip מן 3.5 ס"מ גם לצלחת 24 גם עבור מכתים immunofluorescent שלאחר מכן.
- להרוות paraformaldehyde שיורי על ידי יישום 0.5 מ"ל 0.1 מ 'גליצין ב PBS לכל אחד 24 בארות. דגירה במשך 20 דקות בטמפרטורת החדר.
- Aspirate גליצין ולשטוף שלוש פעמים עם PBS.
- Permeabilise תאים על ידי יישום 0.5 מ"ל 0.5% טריטון X-100 (w / v) ב PBS. דגירה במשך 4 דקות בטמפרטורת החדר.
- Aspirate טריטון X-100 ולשטוף שלוש פעמים עם PBS.
- חסום על ידי יישום 0.5 מ"ל 3% (w / v) BSA ב PBS. דגירה בין לילה ב 4 & Dלמשל, ג
- כתם vinculin המכילים הידבקות עם מוקד הנוגדן-1 hVIN מדולל 1:400 בבלוק BSA. דגירה למשך שעה בטמפרטורת החדר.
- יש לשטוף שלוש פעמים עם PBS.
- החל fluorophore (DyLight 488), מצומדות נוגדנים משני (מדולל 1:200) ו אקטין עם כתם TRITC-מצומדות phalloidin (דילול 1:200) בבלוק BSA. דגירה במשך 30 דקות בטמפרטורת החדר.
- יש לשטוף שלוש פעמים עם PBS, ופעם עם מים.
- הר בשקופית כוס בעמדה הפוכה באמצעות להאריך mountant זהב.
5. כימות הפעלת Rac1 ידי assay הנפתח
- לצורך ניתוח של הפעלת Rac1, החל את האות 20 דקות אולטרסאונד לתאים על 37 מעלות צלזיוס, 5% CO 2. כאשר הערכת זמני תגובה ארוכים יותר מ -20 דקות, החל את האות אולטרסאונד במשך 20 דקות ולשמור על תאים ב 37 מעלות צלזיוס, 5% CO 2 עבור הזמן שנותר כדי לאפשר תגובה לפתח.
- Aspirate התקשורת המקום היטבים על הקרח. יש לשטוף את הבארות עם 2 מ"ל PBS קר ו aspirate. ודא PBS כל שיורי מוסר על ידי השארת בארות מוטה לרגע 1 ואחריו השאיפה יסודית.
- Lyse תאים על הקרח עם חיץ 35 תמוגה μl (גליצרול 10%, 20 Hepes mM pH 7.4, 140 מ"מ NaCl, 1% NP40, Deoxycholate נתרן 0.5%, 4 מ"מ EGTA, 4 mM EDTA, 1 × מעכב פרוטאז מלאה) לכל טוב. בדוגמה זו, 6 בארות משמשים בכל נקודת זמן כדי לייצר 210 μl של lysate התא. בארות יותר או פחות יכול לשמש אך נפח lysate סך צריך להסתכם ~ 200 μl.
- תאים שריטות היטב מגרד התא כדי להבטיח תמוגה התא המלא ולהשאיר בארות מוטה לרגע 1 כדי לאפשר lysate לבריכה.
- העברת lysate כדי צינור קר כקרח microfuge 1.5 מ"ל (lysates מתאגדים ממשטר טיפול זהה) ואת הספין ב 21000 × גרם ל -2 דקות 4 ° C עד פסולת הסלולר גלולה.
- העברת 180 μl של lysate לקור קרח 1.5-מ"ל microfuge צינורות המכילים 130 μl של חיץ תמוגה ו 25 μl PAK-שפעathione agarose חרוזים 10. שמור lysate גולמי הנותרים ב -20 מעלות צלזיוס להפרדת ג'ל לאחר מכן.
- לכידת Rac1 פעיל החרוזים PAK-גלוטתיון agarose ידי סיבוב צינורות במשך 40 דקות 4 ° C.
- קציר agarose חרוז conjugates ידי צנטריפוגה ב 2000 × גרם לדקה 1 ב 4 ° C.
- לשטוף חרוז conjugates שלוש פעמים עם מאגר 500 תמוגה μl, קציר חרוזים על ידי צנטריפוגה ב 2000x G ו השלכת supernatant לאחר כל שטיפה. בזהירות להסיר כל חיץ הנותרים לשטוף תמוגה עם פיפטה 200 μl.
- Elute כל דגימה על ידי הוספת 35 μl חיץ SDS-PAGE ההעמסה דגירה על 85 מעלות צלזיוס על גוש חום רועד במשך 5 דקות. הסר חרוזים על ידי צנטריפוגה ב 21000 × גרם לדקה 1.
- לפתור eluate חרוז על ידי SDS-PAGE, להעביר nitrocellulose ו בדיקה עבור Rac1.
6. נציג תוצאות
בפרוטוקול זה אנו מתארים גיוס של vinculin-כתםאד מוקד הידבקויות ו Rac1 פעילות לפי אולטרסאונד. לצורך ניסוי הדבקה מוקד, העמדה הבסיסית היא כי fibroblasts הפזורים על ליגנד של 5 β α 1-integrin לא יוצרים vinculin המכילים הידבקויות (איור 3 א) אלא אם הקולטן fibronectin 2, syndecan-4, עוסקת על ידי תוספת של ליגנד מסיס (איור 3 ב) 3,4. עם זאת, גירוי עם אולטרסאונד גורם להיווצרות מוקדי הידבקות באותה מידה כמו מעורבות של syndecan-4 (איור 3 ג), המציין כי גירוי אולטרסאונד יכול להחליף רכיבים מסוימים של מסלול fibronectin תלוי איתות 5. המשוכה מפתח עם פרוטוקול זה הוא ביטול הקמת מוקד הדבקה בהעדר ממריץ. עיכוב בלתי שלמה של סינתזת החלבון על ידי cycloheximide יאפשר בתצהיר מטריקס כי היא מספקת את התאים אוטומטית לעורר. צפיפות יתר של תאים יכול גם להוביל formatio ברמה נמוכה הידבקות מיקודn ו תגובה גרועה אולטרסאונד כמו crosstalk בין תאים תאים ותא סיכות קשר יסבך הניסוי אשר נועד לבודד גירוי אחד. התפתחות של assay הבסיסית שאנו מציגים אותו ניסוי, חזר עם fibroblasts חסרי syndecan-4 (איור 4). Fibroblasts אלה עדיין להגיב אולטרסאונד (איור 4C), אך אינם מגיבים ליגנד syndecan-4 (איור 4B). הניסוי באמצעות Sdc4 - / - fibroblasts אולטרסאונד מדגים כי אכן יכול לעקוף את הצורך fibronectin קולטנים מסוימים, מדגים כיצד פרוטוקול פשוט ניתן לפתח כדי לקבל מידע נוסף על מסלול איתות.
לצורך ניסוי ביוכימי אנחנו מדגימים אולטרסאונד שיכול לגרום הפעלת Rac1, באמצעות assay הנפתח כי הוא עיבוד של השיטה המתוארת על ידי דל פוסו et al. 10. משקעים של פעיל Rac1 0, 10, 30 ו -60 דקות לאחר initiation של גירוי אולטרסאונד מגלה כי Rac1 פסגות פעילות 10-30 דקות, לפני החזרה לקו הבסיס (איור 5). סופג lysates הגולמי של vinculin מבטיח הטעינה שווה בין נקודות זמן. התוצאה דומה הפעלת Rac1 על ידי מעורבות של syndecan 3-4, אבל הוא מעט ממושך יותר מאשר הפעלה באמצעות fibronectin. לכן 8-10 חזרות נדרשים בדרך כלל כדי להשיג נתונים משמעותיים. הפעלת Rac1 אחראי המחויבות של תאים להיווצרות מוקדי הידבקות, ועל הידבקויות מוקד המתהווה מתחיל להיווצר על 10-30 דקות, בד בבד עם הפעלת Rac1. יזם ברגע, הידבקויות אלו ימשיכו להבשיל לתוך הפלאק הדבקה גדולים המוצגים דמויות 3 ו -4.

באיור 1. טופס גל אולטרסאונד. אולטראסאונד מהווה אות לסירוגין 1.5 MHz כי בשל משרעת נמוכה (30 mW / cm 2, ממוצע מרחבית, הממוצע הזמני) אין כל השפעה חימום.

איור 2. ייצוג סכמטי של עבודה להכנת וגירוי של תאים עם אולטרסאונד.

איור 3. אינדוקציה אולטראסאונד של היווצרות מוקדי הידבקות ב fibroblasts. Fibroblasts פוזרו על שבר integrin מחייב של fibronectin (א ') לפני גירוי עם שבר syndecan-4-מחייב של fibronectin (ב) או אולטרסאונד (C). בעקבות גירוי 60 דקות, התאים היו קבועות, מוכתם עבור vinculin ו אקטין, וצילמו ידי epifluorescence. בר = 10 מיקרומטר.

איור 4. אינדוקציה אולטראסאונד של היווצרות מוקדי הידבקות ב fibroblasts חסרי syndecan-4. Sdc4 - / - fibroblasts פוזרו על שבר integrin מחייב של fibronectin (א ') לפני גירוי עם שבר syndecan-4-מחייב של fibronectin (ב) או אולטרסאונד (C). בעקבות גירוי 60 דקות, התאים היו קבועות, מוכתם עבור vinculin ו אקטין, וצילמו ידי epifluorescence. למרות Sdc4 - / - fibroblasts היו fibronectin, חסר רגישות, אולטרסאונד המושרה עדיין היווצרות הידבקות מרחק, מה שמצביע אולטרסאונד עוקף מעורבות הקולטן מטריקס. בר = 10 מיקרומטר.

איור 5. הפעלת Rac1 באולטרסאונד. התאים היו מגורה דקות 0, 10, 30 ו 60 עם 6 בארות המשמשים לכל נקודת זמן. כמות ה-Rac1 GTP בדגימות מן כמובן Rac1 הנפתח זמן assay היה דמיינו ידי הדגירה עם נוגדנים נגד Rac1 על כתם המערבי (תמונה למעלה). כימות עוצמת הלהקה (ממוצע של 8-10 משכפל) מגלה גדל Rac1ctivity כתוצאה האות אולטרסאונד ב 10 ו 30 דקות, לפני חזרתם של רמת הבסיס ב 60 דקות (גרף). ברים שגיאה מייצגים SEM