1. הכנת חומר אצות
- תאים בתרבית Ostreococcus הם מי ים מלאכותיים (ASW). מלחי ים (בדרך כלל כ -40 גרם לליטר) הם מומסים במים deionised למליחות של 30 ppt, כפי שנמדד באמצעות מד מליחות. אמצעי העשרה 11,12, יסודות קורט מתכות וויטמינים נוספים, כמתואר בטבלה 1-3. התקשורת היא אז פילטר עיקור באמצעות כמה 0.22 מיקרומטר הסינון.
- לצורך תחזוקה, תאים של מתח Ostreococcus OTTH95 הם תת תרבות בסביבה נקייה מחיידקים, בדילול של 1/100 ב ASW טרי כל 7 ימים ו גדל תחת אור קבוע גידול צמחים בחממה מצויד אור הירח הכחול הסינון. עוצמת האור צריך להיות קרוב ל 20 μmol m -2 s -1 והטמפרטורה נשמרת על 20 ° C. התאים אינם דורשים תסיסה מתמדת, אבל הם מזועזעים אחת ל -2 עד 3 ימים כדי למנוע צבירה.
- לשינוי זה, 50 מ"ל של תאים נדרשים על התא דהnsity של 20-30 x 10 6 מ"ל -1, שאמור להיות מושג לאחר 5-7 ימים culturing המשנה. צפיפות התאים axeny משוער ניתן לקבוע באמצעות אחת cytometry זרימה או haemocytometer לפחות הגדלה של X40.
2. Electroporation
- הכן את ה-DNA לשינוי. לשינוי זה, 5 מיקרוגרם של ה-DNA, טהור פלסמיד linearised נדרש בריכוז של 1 מיקרוגרם / μl במים deionised סטרילית. כדי להשיג את ה-DNA, החוקרים ממליצים להשתמש midi Qiagen ערכת הכנה, אם כי שיטות אחרות יכול לעבוד באותה מידה. לעכל את המוצר עם האנזים החותך ב עמוד השדרה של וקטור פעם, אבל לא transgene או הגן הבחירה. יתר על כן לטהר ולרכז את ה-DNA ליניארי שהתקבל על ידי משקעים אתנול, ו resuspend המוצר בהיקף המתאים מים באיכות גבוהה deionised סטרילית.
- הכינו צינורות microcentrifuge המכילים DNA 5 מיקרוגרם לשינוי זה. Controאני עם ה-DNA לא נחוץ כל שורה בתא להשתנות. זכור את הצינורות על קרח, יחד עם קובט electroporation 2 מ"מ לשינוי זה.
- להכין 2.2 מ"ל של חיץ resuspension לכל שינוי. ממיסים סורביטול לפתרון M 1 ב DDH 2 O, מוסיף 0.1% חומצה pluronic F68 ו-מסנן לעקר.
- הוספת חומצה pluronic F68, לריכוז סופי של 0.1% אל התאים, ועל גלולה אותם במשך 10 דקות בכל 8000x גרם ב 10 ° C בצינור 50 מ"ל עם תחתית בצורת חרוט. מיד resuspend התאים מ"ל 1 של חיץ resuspension ידי pipetting למעלה ולמטה, ולהעביר את הצינור microfuge. ספין למטה במשך 10 דקות ב 8000 XG ב 10 ° C, עובד מהר, חזור על שלב זה לשטוף פעם נוספת.
- עם קצה גזירה, resuspend כל גלולה האחרון μl 40 מאגר resuspension. הוסף 40 μl של תאים resuspended אל צינור ה-DNA של כל linearised על קרח, לערבב בעדינות ולהעביר את קובט electroporation.
- שים את קובט על electropנאום המכונה. לשנות את ההגדרות כדי kV 6 ס"מ -1, 600 Ω, ו 25 μF. Electroporate התאים.
- דגירה התאים electoporated ב cuvettes את בטמפרטורת החדר למשך 10 דקות, ולהשתמש זמן להכין את תרבות צלוחיות רקמות. לתייג אותם להוסיף 30 מ"ל של ASW טרי זה. קח 1 מ"ל מתוך בקבוק אחד ובעדינות להוסיף אותו קובט המקביל. דגירה של 2 דקות בעדינות להסיר את ASW, עכשיו המכיל כדורית של תאים בעדינות ולאט לאט פיפטה ישירות ASW בבקבוק התרבות.
- התאים בדרך כלל להישאר כדורית. יש להיזהר לא ללחוץ או להפריע את התאים מצטברים ברגע זה. אפשר התאים להתאושש בחממה למשך 1-2 שעות, resuspend מכן על ידי רועדת על צלוחיות. בשלב זה, התאים צריכים resuspend בחופשיות גושים לא צריך להיות גלוי. השאירו את התרבויות לשחזר לילה בחממה.
3. הכללה של תאים בצלחות במצע חצי מוצק
למחרת, החיטוי פתרון של 2.1% נקודת התכה נמוכה agarose ב DDH 2 O בבקבוק המכיל מוט ערבוב. שמור מותכת על 65-90 מעלות צלזיוס בכוס גדולה יותר המכילה מים על stirrer חימום מגנטי. לשינוי זה להכין 8 צלחות פטרי (בקוטר 55 מ"מ) ו -8 צינורות x 15 מ"ל כל אחת מכילה 9 מ"ל של ASW, בתוספת מבחר הנדרש. אם אתה משתמש Nourseothricin או G418, השתמש 2 מ"ג / מ"ל. - אוספים את התאים השתנו מן החממה. עבודה flowhood סטרילית, הוסף 1 מ"ל של רותחים LMP agarose כדי מ"ל 9 באחד הצינורות. סגור את הצינור, ומערבבים על ידי היפוך. לאחר מכן הוסף 0.5 מ"ל של תאים שהפכו זה עתה, לערבב במהירות ולשפוך לתוך הצלחת. חזור על תהליך זה עם 7 צינורות הנותרים, ואז להמשיך בקבוק השינוי הבא.
- השאירו הצלחות לפתוח בשכונה זרימת במשך שעה, על agarose להגדיר. ואז לסגור את הצלחות ולהעבירם רבועים מנות גדולות פטרי, אשר תקיים 4 צלחות כל אחת. לאטום את השנינות צלחות מרובעH parafilm. לציין כי הצלחות לא יקבע לחלוטין, וכתוצאה מכך, ג'ל הוא שברירי מאוד. יש להיזהר לא לשבור את הג'ל במהלך הטיפול בו הצלחות. מניחים את כל צלחות מרובעות בחממה.
4. מבחר המושבות טרנספורמציה
- מושבות אמור להופיע לאחר 10 עד 21 ימים על הצלחות שינוי, אך לא על צלחות שהפכו מדומים. לקחת מושבות להשתמש פיפטה 200 μl עם חתוכים טיפים. שעליך לעשות הוא לבחור מושבות בחינם ולמצוץ את המושבה הירוקה. יש להיזהר שלא לכלול תאים מן המושבות השכנות.
- להעביר את התאים 2 מ"ל של מדיום נוזל המכיל את הבחירה, בצלחת בארות 24. בעת שימוש Nourseothricin, השתמש 1.75 מ"ג / מ"ל. מערבבים ידי pipetting מעלה ומטה. בחר 24-50 מושבות לכל שינוי. לאטום את הצלחות עם parafilm והעברה חממה.
- אחרי שבוע, להעביר 100 μl של כל טוב 2 מ"ל טרי ASW עם מבחר בצלחת בארות 24 ולגדול על additionaL-7 ימים. שורות תאים ששרדו יכול לשמש למחקרים נוספים. שילוב יציבה למספר הגנום הכניסה יש לנתח באמצעות PCR ו כתם הדרום. הדנ"א הגנומי ניתן להשיג מטרות אלה באמצעות כל שיטה לאורך בקנה מידה סטנדרטית להפקת DNA הצמח.
5. נציג תוצאות
פיצול תאים 1/100 הגיעו צפיפות של 25 מיליון תאים למיליליטר לאחר גידול של 7 ימים. Electroporation של תאים עם ההגדרות המתאימות הביא כמה זמן קבועים בין 10 ל 14 אלפיות השנייה. כאשר תאים מועברים בינוני צלוחיות תרבות, כדורית של תאים צריך טופס. כאשר מזועזע קלות אחרי שעה, התאים צריכים בקלות resuspend. הכללה של 1 מ"ל תאים הופכים אגר LMP 0.2% אמורה לגרום ג'ל חצי מוצק עקבי אבל רק. מושבות אמור להופיע לאחר 10 עד 21 ימים. כאשר למהפך 5 מיקרוגרם של ה-DNA linearised באמצעות פרוטוקול לעיל, 50-100 מושבות לכל שינויהצלחת היו אמורים בדרך כלל, לעומת אף על לוחות בקרה שליליות. ~ 80% מושבות הרים נבחרו באופן חיובי על ידי עמידות לאנטיביוטיקה במדיום נוזלי נעשה שימוש במחקרים הבאים.
| ריכוז סופי | המניות פתרון | נפח של 1 ליטר |
| NANO 3 | 8.83 x 10 -4 M | 75 גר '/ ל' ד"ה 2 O | 1 מ"ל |
| NH 4 Cl | 3.63 x 10 -5 M | 2.68 גר '/ ל' ד"ה 2 O | 1 מ"ל |
| β-glycerophosphate | 1 x 10 -5 M | 2.16 גר '/ ל' ד"ה 2 O | 1 מ"ל |
| H 2 3 SEO | 1 x 10 -8 M | 1.29 מ"ג / ל 'ד"ה 2 O | 1 מ"ל |
| טריס בסיס (pH 7.2) | 1 x 10 -3 M | 121.1 גר '/ ל' ד"ה 2 O | 1 מ"ל |
| K עקבות פתרון מתכת | | טבלה 2 | 1 מ"ל |
| f / 2 פתרון ויטמין | | לוח 3 | 0.5 מ"ל |
טבלה 1. המרכיבים בינוני לצמיחה של א ' tauri 11, 12. איפור בנפח כולל של 1 ליטר של מי ים מלאכותיים כדי מליחות של 30 ppt, ולהוסיף את המרכיבים הנ"ל מפתרונות מניות כמצוין. סנן-לעקר בינוני ושימוש בתוך שבוע. מניות של כל תרכובות מלבד פתרון ויטמין ניתן ונקווה להוסיף 6 מ"ל של פתרון זה עבור כל ליטר של המדיום.
| ריכוז סופי | המניות פתרון | סכום של 1 ליטר |
| Na 2 EDTA • 2H 2 O | 1 x 10 -4 M | | 41.6 גרם |
| FeCl 3 • 6 שעות 2 O | 1 x 10 -5 M | | 3.15 גר ' |
| Na 2 מו 4 • 2H 2 O | 1 x 10 -8 M | 6.3 גר '/ ל' ד"ה 2 O | 1 מ"ל |
| ZnSO 4 • 7H 2 O | 1 x 10 -9 M | 22.0 גר '/ ל' ד"ה 2 O | 1 מ"ל |
| CoCl 2 • 6 שעות 2 O | 1 x 10 -9 M | 10.0 גר '/ ל' ד"ה 2 O | 1 מ"ל |
| MnCl 2 • 4H 2 O | 1 x 10 -8 M | 180.0 גר '/ ל' ד"ה 2 O | 1 מ"ל |
| CuSO 4 • 5H 2 O | 1 x 10 -8 M | 9.8 גר '/ ל' ד"ה 2 O | 1 מ"ל |
טבלה 2. עקוב אחר פתרון מתכת 11,12. לעשות עד לסך של 1 ליטר, ב ד"ה 2 O, וחום לפרק. הפתרון aliquot ומקפיאים לאחסון. הריכוזים האחרונים הצביעו מתייחסים בינוני של דבר, לא הפתרון מתכת עקבות.
| ריכוז סופי | המניות פתרון | סכום של 1 ליטר |
| ויטמין B 12 | 1 x 10 מ -10 | 1 גר '/ ל' ד"ה 2 O | 1 מ"ל |
| ביוטין | 1 x 10 -9 M | 0.1 גר '/ ל' ד"ה 2 O | 10 מ"ל |
| תיאמין • HCl | 1 x 10 -7 M | | 200 מ"ג |
לוח 3. f / 2ויטמין הפתרון 11. לעשות עד לסך של 1 ליטר ב DH 2 O, פילטר לעקר, aliquot ומקפיאים. הריכוזים האחרונים הצביעו מתייחסים בינוני של דבר, לא הפתרון ויטמין.

באיור 1. סקירה גרפית של תהליך השינוי. ייצוג סכמטי של הליך גנטית כדי להפוך Ostreococcus tauri ידי electroporation.

איור 2. תאים גדילה והתרבות. הם תת תרבות בסביבה נקייה מחיידקים, בדילול של 1/100 ב ASW טרי כל 7 ימים, גדל תחת אור קבוע גידול צמחים בחממה מצויד אור ירח כחול הסינון. עוצמת האור צריך להיות קרוב ל 20 μmol m -2 s -1 והטמפרטורה נשמרת על 20 מעלות צלזיוס תאים אינם דורשים תסיסה מתמדת, אבל הם שלhaken אחת ל -2 עד 3 ימים כדי למנוע צבירה.

איור 3. במושבה היווצרות על 0.2% LMP agarose. העברת 4 צלחות פטרי צלחת גדולה בכיכר, ואת החותם עם parafilm (למעלה משמאל). כאשר הקימו מושבות, פשוט לבחור בחינם (באופן אידיאלי בצורת conically) מושבות (מימין למעלה) ולמצוץ אותם בצלחת עם טפטפת P200. לא אמורה להיות מושבות בשלט שלילית (מימין למטה).