בידוד של נוגדנים וחלבונים רקומביננטיים המבטאים שברי אימונוגלובולין G (IgG) Fc מתרבות התאים supernatants ופתרונות תאים מדוללים lysed ניתן להשיג באמצעות חלבון כרומטוגרפיה זיקה. במעבדות ובתעשייה בסיסיות של מדע והנדסה, עמודים עמוסים בחלבון נקבובי A מצופה agarose, זכוכית, או חרוזים פולימריים משמשים בדרך כלל עבור כרומטוגרפיה זיקה, למרות עלויות כספיות גבוהות וזמני עיבוד ארוכים1-3. זה מוערך היטב כי כרומטוגרפיה זיקה מייצגת את ההוצאה הגדולה ביותר ועיבוד צוואר בקבוק הן במעבדה והן בהגדרות תעשייתיות2,4. כתוצאה מכך, שיפורים רבים פותחו כדי להקטין את עלות זמן העיבוד מבלי להקריב את התאוששות המוצר הכוללת מרכבת התהליך1,2,5-7. מבטיח במיוחד לבידוד של נוגדנים וחלבונים אחרים מבטא Fc הוא כרומטוגרפיה זיקה באמצעות חלבון ספיחה קרום2,5,7-10. בעוד לכידת Fc ב chromatography עמודה הוא דיפוזיה מוגבלת(כלומר Fc-expressing חלבון חייב להתפזר לתוך ובאמצעות נקבוביות פנימיות כדי להגיע לרוב החלבון A) עם ירידה בלחץ גבוה על פני העמודה, הסעת המונים ספיחה ממברנה מונעת על ידי הסעה בתפזורת, וכתוצאה מכך הימנעות מגבלות דיפוזיה8,9,11,12. בנוסף, ירידה בלחץ על פני ספיחה ממברנה נמוכה, ובכך מאפשר קצב זרימת זלוף מהיר יותר לעומת עמודים ארוזים חרוזים8,9,11,12. לכן, עבור בידוד בקנה מידה מעבדה, כרומטוגרפיה קרום צפוי להפחית את זמן הבידוד על ידי מספר שעות ולהגדיל את לכידת המוצר לעומת כרומטוגרפיה עמודה. יתר על כן, מודלים מתמטיים עבור ספיחה IgG ספיחה ממברנה הוצעו8,9,11,12, ובכך מאפשר למשתמשי קצה לחזות ביצועים במעבדה.
צוואר בקבוק נוסף במעבדות מדע והנדסה בסיסיות הוא אפיון החלבון המבטא Fc. עם זאת, בחירת שיטות מתאימות להשלמת מבחני אפיון, כגון כתמים מערביים, יכולה להפחית מאוד את הזמן המושקע בבדיקות מוצרים. לדוגמה, העברה חלקית במערכת חיץ רציפה יכולה להשיג העברה אלקטרופורטית של חלבונים מג'ל SDS-PAGE לקרום פוליוויניל דיפלוורידין (PVDF) תוך דקות ספורות, לעומת העברה של שעה-שעתיים במיכל (רטוב) במערכת חיץ רציפה13.
פרוטוקול מהיר, זול ויעיל לבידוד ואפיון של חלבון היתוך כימרי המבטא שבר FC של IgG אנושי מתואר בזאת. רוב הציוד זמין בקלות במעבדות הנדסה ביו-רפואית בסיסיות סטנדרטיות, ביולוגיה, כימיה ו(ביו), וכל ריאגנטים זמינים מסחרית. למרות שתוצאות מייצגות נוצרו מבידוד ואפיון של חלבון היתוך כימרי של Murine galectin-1/Human Fc (Gal-1hFc), ניתן להחיל את הפרוטוקול היעיל על בידוד של מולקולות אחרות בעלות שבר Fc, כגון נוגדנים, שברי Fc עצמם, או חלבוני היתוך Fc אחרים. השיפורים שלנו הפחיתו באופן דרמטי את זמן העיבוד (עד 4 שעות אך בדרך כלל ~ 9 שעות, לעומת 20 + שעות עבודה) תוך השגת התאוששות מוצר דומה או משופרת בהשוואה לשיטות סטנדרטיות.