פרוש הזברה (Taeniopygiaguttata) הוא אורגניזם מודל בעל ערך; עם זאת, שלבים מוקדמים של התפתחות פרוש הזברה לא נחקרו בהרחבה. הפרוטוקול מתאר כיצד לנתח עוברים מוקדמים ליישומים התפתחותיים ומולקולריים.
מאמר שיטה
פרוש הזברה (Taeniopygiaguttata) הוא אורגניזם מודל בעל ערך; עם זאת, שלבים מוקדמים של התפתחות פרוש הזברה לא נחקרו בהרחבה. הפרוטוקול מתאר כיצד לנתח עוברים מוקדמים ליישומים התפתחותיים ומולקולריים.
פינק הזברה (guttata Taeniopygia) הפך אורגניזם מודל חשוב יותר ויותר בתחומים רבים של מחקר, כולל רעלים 1, 2, 3 התנהגות, וזיכרון ולמידת 4,5,6. כציפור השיר רק עם הגנום רצף, יש פינק הזברה פוטנציאל גדול לשימוש במחקרים התפתחותיים; עם זאת, מוקדם של פיתוח פינק זברה השלבים לא נחקרו היטב. היעדר המחקר בפיתוח פינק זברה ניתן לייחס את הקושי שלו לנתח את הביצה הקטנה ועובר. השיטה לנתיחה הבאה ממזערת את ניזק לרקמות עוברית, המאפשר חקירה של מורפולוגיה וביטוי גנים בכל שלבי התפתחות עוברית. זה מאפשר גם שדה בהיר והדמיה באיכות הקרינה של עוברים, השתמש בהליכים מולקולריים כגון הכלאה באתרו (ISH), מבחני התפשטות תאים, ומיצוי RNA למבחנים כמותיים כגון ריאה כמותייםl-Time PCR (qtRT-PCR). טכניקה זו מאפשרת לחוקרים ללמוד שלבים מוקדמים של פיתוח, שהיו קשה בעבר לגישה.
המטרה הכללית של טכניקה זו היא להשיג פינק זברה עוברים (guttata Taeniopygia) החל מהשלבים המוקדמים של עובר לשימוש במגוון רחב של מחקרים התפתחותיים. זברה פינק הפכו אורגניזם מודל ציפור שיר הדומיננטי והיה בשימוש נרחב במגוון תחומים, ובם רעלים 1,2, התנהגות 3, זיכרון ולמידת 4,5,6, neuroanatomy ההשוואתי 7,8, והתפתחות שפת 9,10 . כציפור השיר רק עם הגנום רצף, פינק הזברה מאפשר מחקר מולקולרי והגנטי של סדר הציפורי השיר, אשר מייצג מעל 50% ממיני ציפורים ידועים 11, 12,13.
למרות השימוש במבוגרים ופנקו זברה לנוער במגוון רחב של תחומים, כמה מחקרים שבוצעו בעוברים פינק זברה, במיוחד בשלבים מוקדמים של פיתוח. זו ניתן לייחס לגודל הקטן של הביצים שלהםnd עוברים, והמעמד החדש שלהם כ14,15,16 אורגניזם מודל למחקרים בהם את העוף (Gallus Gallus domesticus) שימש בעבר כ17,18,19,20,21 מערכת מודל דומיננטית. עם זאת, כלומדים שאינם קולניים, תרנגולות אינן מערכת מודל מתאימה ללימוד הבסיס הגנטי של למידה ווקאלית, פיתוח של למידה ווקאלית, תורשתיות, התנהגות, ומעגלי הגרעינים הבזליים-קליפת המוח המעורב בלמידה מוטורית 10.
חשוב לציין כי עוברים פינק זברה הם הרבה יותר עדין ויותר בקלות נפגע מעובר חומוס במהלך נתיחה ונהלים מולקולריים. בפרט, נדרשת זהירות רבה יותר בעת ביצוע פעולות permeabilization על עוברים פינק זברה. דטרגנטים חזקים ואנזימים שלא יפגעו עובר אפרוח יכולים לפגוע בעוברים פינק זברה. במונחים של טיפול באופן כללי, יש צורך לשים את הביצים פינק זברה בכוסות קטנות לפני ההשמה בחממהכדי למנוע מהם לפרוץ כאשר מתגלגלים במהלך דגירה.
זברה פינק נוחות למחקרים התנהגותיים, בקלות ובשטף גדול מתרבים בכל ימות שנה בשבי, והם לומדים ווקאלי. מאפיינים אלו מאפשרים את השימוש של פינק זברה כדי לענות על הצורך לאורגניזם מודל המשלב פיתוח, גנטיקה, והיבטים התנהגותיים של שפה. ניתוחי שיטות, כמפורט להלן, בשילוב עם מדריך הזמני שפותח לאחרונה ספציפי לפנק זברה 22, להפיק את פינק הזברה אורגניזם מודל ההתפתחותי סטנדרטי שימושי יותר ויותר. עם זאת, קבלת עוברים בשלבים מוקדמים יכולה להיות מרתיעה. פרוטוקול זה מאפשר לחוקרים לקבל עוברים בראשית התפתחות בקלות. מחקרים חוקרים את ההתפתחות המוקדמת ואת הבסיס ההתפתחותי המולקולרי של התנהגויות מורכבות בפנקו זברה, או את השפעות טוקסיקולוגי בפיתוח בקטן אחרים, ציפורים passerine ימצאו המתודולוגיה לנתיחה זה שימושי.
הצהרת אתיקה: השיטות נערכו עם פרושים זברה מבויתים ממושבת הרבייה במכללת ויליאם ומרי. כל הנהלים בעקבות הנחיות RSPCA 23 ואושרו על ידי מכללת ויליאם וOLAW של מרי (משרד המעבדה צער בעלי חיים) צער בעלי החיים Assurance (# A3713-01) והיו לו אישור הוועדה מוסדי טיפול בבעלי חיים ושימוש (IACUC) (# 2013-06 -02-8721-Dacris).
1. אוסף ביצה ודגירה
2. ההסרה של עובר מביצה
3. ההפרדה העובר מרקמות חוץ עוברי
4. הנייד edu למניעת הפצת הנשק Assay. התאגדות ואיתור של edu בעוברי פינץ' זברה.
5. Edu "לחץ על" פרוטוקול תגובה
כל הצעדים הבאים מבוצעים בבקבוקוני זכוכית.
הצעדים נתחו באיור 1 מצביעים על הופעתו של העובר בזמן שמחובר לממברנה vitelline () ולהדגים את השיטה הנכונה כדי להפריד את העובר מן החלמון (ב '). העובר יכול להיות מזוהה על ידי האזור של צומת, שהוא הרבה יותר קל מאשר קרום vitelline. העובר עצמו הוא לעתים קרובות קשה להבחין עד החלמון הוא חתך משם. ברגע שהעובר הוא גזור מהביצה, זה יכול להיות קבוע או הבזק הוקפא לשימוש עתידי. אם הכלאה באתר מתוכנן לעובר גזור, יש צורך להסיר את קרום vitelline כי הוא דבק בעובר דרך האזור של צומת. איור 2 ממחיש את הנראות משופרות של העובר ברגע שקרום זה מוסר (ג), והדרך הנכונה לקלף את קרום vitelline (A, B). לאחר נתיחה וקיבעון, הר שלם הכלאה באתרו בוצע כפי שניתן לראות באיור 3 (, א ', ב', ב '') ואיור 4 (, א', ב ', ב') ואיור 5 (A, B, C) כדי לזהות הבדלים בorthodenticle homeobox 2 (ביטוי Otx2) בעוברים מבחינה התפתחותית שנחשפו למינונים נמוכים של מתיל כספי. איור 5 מראה תוצאות בדיקה תחושה, חוסר הפגנה של רקע. באיור 4, למרות היותו גזור מן הביצה באותה נקודת הזמן, את העובר מבחינה התפתחותית החשוף לתיל כספי (MeHg) התקדם שלב 5 22 (ב ', ב'), ואילו עובר השליטה פיתח לשלב 6 22 (, '). הקבוצה של עוברים גזורים ומוצגת באיור 4 נאספו מהקן ולקחה מן החממה באותו הזמן. למרות שחלק וריאציה טבעית נמצאת בפיתוח, המבוסס על נתונים נתיחה קודמים, אין זה סביר כי תנודות טמפרטורה בחממה יגרמו רק את העוברים מהתיל כספיים עמודים לדקה 2.4 להיות develo עיכב pmentally. ההבדלים בשלבים להצביע על שינויים בהתפשטות תאים בעוברים התפתחותית החשופים לתיל כספי.
לפני הנתיחה, edu הוזרק ליום 2 ביצים ואיפשר לדגירת הלילה. לאחר נתיחה וקיבעון של השלב 16 22 עובר, edu היה דמיינו באמצעות "לחץ על" כימיה, המאפשר זיהוי של תאים מתרבים כפי שניתן לראות באיור 6 (A, B, C). חשוב לעקוב בקפידה נקודות זמן בעת ביצוע ביצים באינקובטור ובמהלך הניתוחים, כמו חשיפה לתיל כספי או ביצוע assay edu עלול לשבש התקדמות התפתחותית. ההזרקה המוקדמת בוצעה ביום 0, אשר היה היום של איסוף כמפורט בשלב 1.3. העובר הזה היה גזור כ 38 שעות מאוחר יותר (שלב 7 22). שיעור ההישרדות נמצא כ 90% (שיעור זהה עובר בקרה), כל עוד סכום ההזרקה היה תחת 478 NL.
"Jove_content"> מתודולוגיה לנתיחה זו מאפשרת גם להפקת RNA באיכות גבוהה. לאחר לנתח שלב 16 22 עוברים, מיצוי RNA בוצע על פי הפרוטוקול של היצרן ללא אופטימיזציה הנדרשת, כפי שניתן לראות באיור 7. הסרת קרום vitelline הייתה מיותרת להפקת RNA, ומאוחר יותר יישומי qRT-PCR.
הערה: כל נתוני העובר הם בכיוון, כך שהאזורים הקדמי והאחוריים הם בחלק העליון והתחתון של התמונות, בהתאמה.

איור 1. נוהל איתור ולנתח עוברים פינק זברה, שלבי 1-10 22. אתר עובר על ידי בעדינות מגלגל את החלמון עד לבן הדיסק הקלוש הוא לכאורה (א '). ברגעעובר נמצא במרכזו של החלמון, החלמון הוא גזור באופן הדרגתי (ב ') שבו החתך הראשון מקל על לחץ של קרום vitelline (1) וקיצוצים שלאחר מכן (2) גובל באזור של צומת (ZJ) שהוא דבק בקרום vitelline. ברים סולם מייצגים 1 מ"מ.

איור 2. הסרת קרום vitelline ונראות של מבנים עובריים. בעקבות ההסרה של העובר מהחלמון, עובר מקום בצלחת פטרי המכילה 4% PFA. אם הכלאה באתר צריכה להתבצע, נראות של המבנים העובריים היא חיוניות ויכולות להיות מושגת על ידי הסרת קרום vitelline (א '). גריפ קרום vitelline עם קנס נוסף הטה מלקחיים ובעדינות לקלף אותו מעובר על ידי טיפול בעובר באופן ישיר בקצה החיצוני, במידת צורך(ב). הסרת קרום vitelline מגבירה בהירות של מבנים עובריים, ומאפשרת לעוברים להיות צילמו או מעובד עם הכלאה באתרו (C). ברים סולם מייצגים 1 מ"מ. אנא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של דמות זו.

איור 3. הר שלם הכלאה באתרו שבוצע על העוברים פינק זברה התפתחותית חשופים לתיל כספי. דפוסי ביטוי של orthodenticle homeobox 2 (Otx2) התאפיינו בעוברים שנחשפו ל0.0 תיל כספי עמודים לדקה (, ') ו2.4 תיל כספי עמודים לדקה (ב', ב ' ') באמצעות דיאטת הורים. המטלותrsal () וביטוי הגחון (א ') של Otx2 גלוי לאורך שלפוחית המוח התיכון והאופטי בשלב 22 12. עוברי קבוצת הטיפול נותחו באותה נקודת הזמן, אבל היו עיכוב התפתחותי כפי שניתן לראות בגב (B) ומבט הגחון (ב ') של מבני ראש, אשר אופייניים לשלב 11 22 קיצורים:. MB, המוח התיכון; אופ, שלפוחית אופטית. ברים סולם מייצגים 1 מ"מ.

איור 4. הר שלם באתר הכלאה בוצעה על העוברים פינק זברה התפתחותית החשופים לתיל כספי. דפוסי ביטוי של orthodenticle homeobox 2 (Otx2) אופיינו בשלב 6 22 אמברי מערכת הפעלה חשופה לתיל כספי 0.0 עמודים לדקה (, ') ושלב 5 22 עוברים שנחשפו ל2.4 תיל כספי עמודים לדקה (ב', ב ') באמצעות דיאטת הורים. קיצורים: בבוקר, בשולים קדמי של המזודרם; לא, notochord, המזודרם notochord; פו, proamnion, blastopore הקדמי; ps, תכונה ראשונית 22. ברים סולם מייצגים 1 מ"מ.

איור 5. הר שלם באתרם הכלאה בוצעה על עוברים פינק זברה באמצעות בדיקה תחושה. () שלב 5 22 עובר. (ב ') בשלב מוקדם 6 22 עובר. (C) שלב 11 עובר 22. ברים סולם מייצגים 1 מ"מ.
6 "src =" / files/ftp_upload/51596/51596fig6highres.jpg "/>
איור 6. התאגדות edu וtection דה בעוברים פינק זברה. Edu "לחץ" כימיה הייתה בשימוש כדי לזהות תאים מתרבים בשלב 16 22 עובר (A, B, C). Edu הוא שולב DNA במקום של תימידין 26, 27 והוא זוהה באמצעות לחץ כימיה 27. התפשטות היא נראית בבירור בקצוות לרוחב של somites, וtailbud. לוח מראה ריבוי המתרחש באופן בלעדי באחורי של העובר וגם מראה תאי שגשוג פרט. הלוח ב 'מציג את מיקומי שגשוג בכל העובר. לוח ג מראה האזור הקדמי, ומציג את telencephalon השגשוג מאוד (TE) ביתר פירוט. קיצורים: af, לקפל מי שפיר; FLB, ניצן forelimb; HLB, ניצן hindlimb; le, שלפוחית עדשה; ms, mesencephalon; הר, Metencephalon; OPC, גביע אופטי; הרשות, קשת בלוע; SM, המזודרם somite; שחפת, tailbud; te, telencephalon. ברים סולם מייצגים 1 מ"מ. אנא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של דמות זו.

איור 7. איכות של RNA המופק מעוברים גזורים פינק זברה. בקרה (0.0 עמודים לדקה) ו1.2 עוברי תיל כספיים עמודים לדקה נותחה ופלאש קפוא כפי שמתואר בשלב 3.8. כל נתיב מציג RNA המופק משני עוברים הומוגני מכל קבוצת טיפול.
פיתוח אחרונים של מדריך עובריים בימוי 22 וביאור הגנום לעשות פינק הזברה אורגניזם מודל רצוי למחקרים התפתחותיים. עם זאת, בגודל ושבריריות הקטן של העוברים פינק זברה, אשר נעו מ 3 עד 7 מ"מ בשלבי 1 - 10 22, יכולים לעשות והניתוחים קשים 11, 14. איתור והסרה נקיה עוברים מפני שטח של החלמון יכול להיות מאתגר. פרוטוקול זה מספק פירוט מספיק כדי לבצע את ההליך בקלות. פרוטוקול זה מדגים את השלבים הקריטיים, כי הם בדרך כלל לא ידועים, אך נחוצים כדי להבטיח לנתיחה מוצלחת. לדוגמא, זה הכרחי כדי להשאיר שכבה קטנה של חלמון בין העובר והגיליון לשקול נייר כדי למנוע דבק.
שני זיהוי וההסרה של העובר יכולים להיות קשים. כדי לפתור זיהוי העובר על פני השטח של החלמון, להאיר ישירות מעל החלמון אחרי זה ישהוסר מהביצה, ולהסתכל על החלמון בזווית של ° 45 למצוא את העובר. ברגע שהעובר נמצא, לחתוך את החלמון בשוקל נייר נזהר שלא לקרוע את העובר.
אם יישומים נוספים כוללים הדמיה להבדלים אנטומיים, הכלאה באתר, או מבחני התפשטות תאים, חשוב להסיר את קרום vitelline בשלב 1 - 8 22 להדמיה טובה יותר של מבנים. אם נתקל בקשיים בעת הסרת החלמון או קרום vitelline בשלבים מוקדמים, לתקן את העובר בPFA 4% לפני שטיפה ב1X PBS להפחתת שבירות עוברית. על ידי הסרת ראשונה קרום vitelline במהלך הנתיחה כפי שתואר, מבנים גלויים לעין וללא שינוי בעוברים פינק זברה לאחר ביצוע הכלאה באתרו.
הגבלה של edu היא ממשל שכרכי מינון מעל 478 מוביל NL הרוג עוברי. עם זאת, טווח המינון העצום מאפשר varyinרמות גרם של תיוג תא שגשוג.
התגובה "לחץ" בשימוש בערכה זו היא הנחושת (AAC Cu (I)) (I) האיץ-alkyne-תזיד-cycloaddition. בתגובה הספציפית הזה, מולקולה אנלוגית תימידין המכיל alkyne (edu) משולבת באופן פעיל על ידי חלוקת תאים. קבוצת alkyne בedu בולטת החוצה ממבנה הסליל של ה-DNA, והוא זוהה על ידי חשיפה למולקולה אזיד מצומד למולקולה ירוקה, ניאון אשר נקשר לקבוצת alkyne בחינם. הקרינה הירוקה מראה תאים מתרבים לאחרונה בעובר. יו orthogonality של אזיד והקבוצות alkyne מונעים כתמים שאינם ספציפיים, כי מינים תגובתי אלה אינם נוכחים באופן טבעי ביצורים. כמו כן, כי ה-DNA לא צריך להיות מפוגל על מנת שהתגובה להתרחש, ניתוח ה-DNA תלוי נוסף יכול להיות מבוצע 27 בקלות.
מגבלה המובנית של שיטה זו היא בגודל הקטן וFragility של עוברים פינק זברה. הסרת קרום vitelline של עוברים בשלבים 1 - 15 22 יכול לגרום למבנים עובריים מזיקים אם אינו מבוצע בזהירות. עם זאת, פרוטוקול זה מפשט את השיטה לנתיחה, ומאפשר לחוקרים להשתמש בשלבים עובריים מוקדם לבחון אנומליות מבנית וביטוי גנים שלא נחקר בעבר בעומק. פרוטוקול זה מפותח את הדרך לשפע של מבחני סלולריים מולקולריים שיאפשר לחוקרים לקבוע את מקורותיה ההתפתחותי של פנוטיפים מבוגרים. לדוגמא, ניתן יהיה לבחון ביטוי גנים מעורב בלמידה ווקאלית בתנאים סביבתיים שונים או בעקבות טיפולים תרופתיים בשלבים המוקדמים של פיתוח 28, 29,30,31. למרות שלא הפגין במאמר זה, בשיטה זו פוטנציאל המאפשרת להליכים אחרים כגון רדיואקטיביים הכלאה באתרו על סעיפי זברה פינק רקמות וelectroporation / באובניתוח o 32, 33,34. בהתחשב בכך שפנק הזברה כבר נקבע כאורגניזם מודל חשוב בתוך גוף עצום של ספרות, במחקרים מסוג הזדמנויות שלא נוצל לקשר מנגנוני התפתחות בפיזיולוגיה והתנהגות בוגרים, בפרט התפתחות השפה 7, 9.
יש המחברים אין לחשוף.
המחברים מודים למקורות המימון שלהם, תכנית הווארד יוז הרפואי במכון לתואר ראשון מדע חינוך למכללת ויליאם ומרי; נותן חסות לגרנט: NIH (MSS); מספר גרנט: R15NS067566. הם גם מכירים תמיכה ממכללת ויליאם ומרי, החוג לביולוגיה במכללה לאמנויות ומדעים לקבלת סיוע בטיפול בבעלי חיים.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| חממת | אנו משתמשים בחממת חלון חובה-בטור תמונה, דגם אוויר במחזור | ||
| ערכת הדמיה Click-iT EdU Alexa Fluor 488 | Invitrogen | C10337 | זיהוי התפשטות תאים. |
| מיקרוסקופ דיסקציה | אנו משתמשים בנימי Olympus SZ61 | ||
| 7 אינץ' Drummond עבור מזרק Nanoject II | Drummond | 3-00-203-G/X | |
| Drummond Nanoject II מיקרו-מזרק | Drummond | ||
| Dumont פינצטה #55 | World Precision Instruments | 14099 | |
| אתנול (EtOH) | |||
| 50 מ"ל שפופרת פלקון (פוליפרופילן)פישר | מדעי | 06-443-18 | |
| FastPrep Lysis Matrix H tubes | MP biomedicals | 6917-100 | משמש למיצוי RNA, המשמש להומוגניזציה של עוברים |
| מנורות תאורה סיבים אופטיים (תאורה בעוצמה גבוהה) | דולן-ג'נר תעשיות | פייבר-לייט MI-150 | |
| בקבוקוני זכוכית עם מכסה בורג (מטופל ב-DEPC) | פישר סיינטיפיק | 03-338A | |
| צינור מיקרוצנטריפוגה eppe (1.5 מ"ל) | פישר סיינטיפיק | 05-408-129 | |
| שמן מינרלי | סיגמא-אולדריץ' | M-8410 | |
| דוגמנות חימר | כל מותג | ||
| Narshige PB-7 חולץ מחט Narshige | |||
| Omni Bead Ruptor Homogenizer | OMNI International | 19-010 | משמש למיצוי RNA |
| 4% פרפורמלדהיד (4% PFA): 20 מ"ל 8% PFA (32 גרם פרפורמלדהיד, 350 מ"ל sdd H2O, התאם את ה-pH ל-7.6, 400 מ"ל sdd H2O), 20 מ"ל 2x PBS | קיבוע עוברים. זהירות, מזיק ואין לשאוף. | ||
| תמיסת מלח חוצץ פוספט (1x PBS): 200 מ"ל 10x PBS, 1,800 מ"ל Barnstead H2O, התאם את ה-pH ל-7.4 | |||
| תמיסת מלח חוצצת פוספט (10x PBS): 800 מ"ל Barnstead, 2.013 גרם KCL, 80.063 גרם NaCl, 2.722 גרם KH2PO4 monobasic, 14.196 גרם Na2HPO4 dibasic, 200 מ"ל Barnstead H2O, התאם את ה-pH ל-6.5 | |||
| תמיסת מלח חוצצת פוספט עם 0.1% Tween-20 (1x PTw): 1,800 מ"ל Barnstead H2O, 200 מ"ל 10x PBS, התאם את ה-pH ל-7.4, 2 מ"ל Tween-20 | |||
| 35 מ"ל צלחת פטרי מפלסטיק | פישר סיינטיפיק | 08-757-100A | |
| ניילון נצמד | כל מותג | ||
| Prepease RNA Spin Kit | PrepEase, Affymetrix | 78766 1 KT | משמש למיצוי RNA, המשמש להומוגניזציה של עוברים |
| תערובת תגובה: 875 μ l 1xPBS, 100 מ"מ 20 μ l CuSO4 (רכיב ערכה E), 5 μ l Alexa Fluor 488 azide (רכיב ערכה B), 100 μ l תוסף מאגר תגובה מדולל (רכיב ערכה F) | Invitrogen | C10337 | זיהוי התפשטות תאים. |
| sdd H2O | |||
| זרעים | אנו משתמשים בו כמיכל בעת דגירה של ביצים | ||
| אזמל נירוסטה | |||
| קופסת | אנו משתמשים ב-Abba פלסטיק פרוש Nestboxes | ||
| 4 מ"ל, כובע מרופד טפלון, בקבוקוני זכוכית | פישר סיינטיפיק | 02-912-352 | |
| פיפטות העברה (פוליאתילן) | פישר סיינטיפיק | 13-711-7M | |
| נייר שוקל 4 x 4 | פישר סיינטיפיק | 09-898-12B |