מודגמת סינתזה יעילה בת שלושה שלבים של גליקופולימרים פלואורסצנטיים מבוססי RAFT, המורכבת מהכנת גליקומונומר, קופולימריזציה ופוסט-שינוי. ניתן להשתמש בפרוטוקול זה להכנת גליקופולימרים סטטיסטיים מבוססי RAFT עם מבנים רצויים.
מאמר שיטה
מודגמת סינתזה יעילה בת שלושה שלבים של גליקופולימרים פלואורסצנטיים מבוססי RAFT, המורכבת מהכנת גליקומונומר, קופולימריזציה ופוסט-שינוי. ניתן להשתמש בפרוטוקול זה להכנת גליקופולימרים סטטיסטיים מבוססי RAFT עם מבנים רצויים.
glycopolymers סינטטי הם כלים אינסטרומנטליים ותכליתיים המשמשים בתחומי מחקר ביו-רפואיים ביוכימי ושונים. דוגמא לסינתזה קלילה ויעילה של glycopolymers הסטטיסטי ניאון מבוקר היטב באמצעות שרשרת העברה בנוסף פיצול הפיכה פילמור מבוסס (הרפסודה) הוא הוכיח. הסינתזה מתחילה בהכנת methacrylamide 2-lactobionamidoethyl מכיל β-גלקטוז-glycomonomer מתקבל על ידי תגובה של lactobionolactone וN - methacrylamide (2-aminoethyl) (AEMA). methacrylamide 2-Gluconamidoethyl (GAEMA) משמש כאנלוגי מבני חסר β-galactoside מסוף. תגובת copolymerization תיווך הרפסודה הבאה כרוכה בשלושה מונומרים שונים: N - acrylamide (2-hydroxyethyl) כspacer, AEMA כיעד לתיוג הקרינה נוסף, וglycomonomers. סובלני של מערכות מימיות, סוכן הרפסודה המשמש בתגובה הוא (חומצת 4-cyanopentanoic) -4-dithiobenzoate.dispersities נמוך (≤1.32), יצירות קופולימר צפויות, ושחזור גבוה של polymerizations נצפו בין המוצרים. פולימרים פלורסנט מתקבלים על ידי שינוי glycopolymers עם succinimidyl אסתר carboxyfluorescein מיקוד הקבוצות הפונקציונליות האמינים הראשוני על AEMA. ספציפיות קטינים מחייבות של glycopolymers כתוצאה מכך הם אומתו על ידי בדיקה עם חרוזים agarose מקביל מצופים בקטיני glycoepitope הכרה ספציפיים. בגלל הקלות של הסינתזה, השליטה ההדוקה של יצירות המוצר והשחזור הטוב של התגובה, פרוטוקול זה יכול להיות מתורגם להכנת glycopolymers מבוססת רפסודה אחרת עם מבנים וקומפוזיציות ספציפיים, כרצונכם.
בשני העשורים האחרונים, חקירות עם glycopolymers הסינתטי עברו התפתחות איטית אך מתמשכת, מפגינות פוטנציאל משמעותי לבחינת מנגנוני זיהומיות הכוללים מחקר המתמקד בקטיני הכרת תהליכי 1-3. מאז glycopolymers הסינתטי בעל moieties סוכר multivalent תערוכה efficacies קטינים מחייבים הרבה יותר גבוה, בהשוואה לפחמימות חד ערכי, הם ביקוש גדול בתחום glycobiology 3. עניין מיוחד במחקר קליני הוא השימוש בglycopolymers ניאון כדי לאפיין את החיידקים בתיווך הקטינים מחייבים עם פחמימות זמינות על משטחים אנושיים נשימה תא וגליקופרוטאין הרירי. בתחילת לימודים חוץ גופית מועסק glycopolymers מבוסס polyacrylamide זמין מסחרי בבדיקות מחייבות חיידקים. כמה מבדיקות אלה הראו תוצאות מבטיחות, אך העלה חששות בנוגע ל, סטיות obtainability, והרבה-הרבה-בשני polמשקל מולקולרי Ymer ותוכן glycoepitope. פרוטוקול ובמעבדה חסכוני פותח אשר יספק לשליטה מספקת של תוכן מבנה, גודל, וטוהר glycopolymers הסינתטי מיקוד קטיני חיידקים.
בחיפוש אחר גישה סינתטית מתאימה לglycopolymers, טכניקת פילמור חדשה יחסית נבדקה באמצעות סוג של פילמור הרדיקלי המבוקר שהעסיק בשרשרת העברה בנוסף פיצול הפיכה סוכנים (רפסודה) 4. לאחרונה ריאגנטים רפסודה כגון כבר בשימוש בכמה הכנות glycopolymer 5-7. בהשוואה לפרוטוקולי הכנת glycopolymer אחרים, polymerizations תיווך הרפסודה להפגין כמה יתרונות, כולל הסובלנות למגוון של מבני מונומר ותנאי תגובה, תאימות פוטנציאלית עם תמיסות מימיות, וdispersity גודל הנמוך של המוצרים פולימריים הרצויים 8,9. עניין בולט הם פרוטוקולים להכנת הרפסודה-baglycopolymers SED תלת-רכיב, המאפשר שליטה על יצירות של מונומרים שונים, כל אחד מהם עשוי להיות פונקציות שונות 10-13. עם זאת, רוב מאמצי מחקר הקודמים או חסר anomeric פחמימות תליון 10, או מועסק על צעד polymerizations וכתוצאה מכך קופולימרים תלת-בלוק, שמורכב מhomopolymers קשור קוולנטית, לעתים קרובות המשמשים למטרות שונות מפולימרים סטטיסטיים שקופולימרים בי הרצף של מונומר שאריות אחרי שלטון 9-13 סטטיסטי.
לאחרונה, (חומצת 4-cyanopentanoic) העסקת מתחם רפסודת thiocarbonylthio -4-dithiobenzoate בסביבה מימית, ההכנה של קבוצת רפסודה מבוססת glycopolymers תלת-רכיב ליניארי הסטטיסטי המכיל סוכרים תליון ספציפיים ויישומם בחיידקים מחייבים בתיווך קטינים בדיקות דווחו 14. המטרה הכוללת של שיטה זו, שהוצגה באופן חזותי, היא להכין תלת-רכיבglycopolymers ניאון סטטיסטי באמצעות copolymerization שליטת רפסודה. בגלל הקלות של פרוטוקול פילמור צעד אחד, הבקרה הטובה על אורך הפולימר ויצירות, והשחזור הגבוה של התגובה, פרוטוקול זה יכול להיות מיושם בקלות לסינתזות מבוססת רפסודה אחרות של glycopolymers עם מבנים המבוקשים.
1. סינתזה של Glycomonomer 2-Lactobionamidoethyl Methacrylamide
2. סינתזה של מונומר 2-Gluconamidoethyl Methacrylamide
הערה: הכנת methacrylamide 2-gluconamidoethyl (GAEMA), שאינו בעלי סוכר תליון, הותאמה משיטה שפורסמה 15.
3. רפסודת Glycopolymer סינתזה
הערה: פולי-methacrylamide / acrylamide הסטטיסטית התוצאה (PMA) קופולימרים המכילים תליון -β-D-galactopyranosyl-D-gluconamide 4 O (lactobionamide) (משלב 3.2) או D-gluconamide (משלב 3.3), בהתאמה, הם הושג. לנוחיות דיון, שתי glycopolymers אלה מקוצרים כמו PMA-LAEMA וPMA-GAEMA, בהתאמה.
4. לאחר שינוי של Glycopolymers עם fluorophores
שים לב: בעקבות lyophilization, glycopolymers ניאון PMA-LAEMA-העמסה וPMA-GAEMA-והעמסת, בהתאמה, מתקבל.
5. אפיון של גלאיקופולימרים
6. בדיקות עקידת Glycopolymers סינטטי עם קטינים מצופים חרוזים agarose
סינתזה של glycomonomer
חומצת Lactobionic שימשה במסמך זה כדוגמא להכנת glycomonomers. תוך שימוש בשיטות בדיווח הראשוני על הסינתזה של LAEMA 11, תשואות מגוונות בהכנה עם טוהר מספק נצפו. שיטת הטיהור שונה באמצעות שרפים קטיון וחילופי אניון להסיר חומר unreacted ההתחלה הציע תשואת מוצר יציבה וטוהר גבוה, אשר אושר על ידי H 1 ו- 13 ספקטרוסקופיה NMR C (איור 1).
סינתזת glycopolymer רפסודה ופוסט-שינוי של glycopolymers עם fluorophores
בניגוד לגוש-glycopolymers הכין דרך polymerizations הרפסודה יצא, פרוטוקול copolymerization צעד אחד זה מספק הפצת glycomonomer אחידה לאורך עמוד השדרה הפולימר. Glycopolymers מוצג כאן לכלול 20% mol של GLycomonomer, 77% mol של HEAA כspacer, ו -3% mol של AEMA כיעד לפוסט-שינויים (ראה איור 2). 1 H- ו -13 ספקטרוסקופיה C-NMR אישרו את המבנים של PMA-LAEMA וPMA-GAEMA (איורים 3 ו -4). כפי שניתן לראות בתרשים 5, כאשר זממו נגד פרופילי elution GPC של glycopolymer מסונתז ללא רפסודה, שני PMA-LAEMA וPMA-GAEMA יש dispersities נמוך, המוכיחים את יעילותה של גישת הרפסודה. כצפוי, יש PMA-GAEMA M קטן יותר מזה של n PMA-LAEMA בשל החוסר של PMA-GAEMA של סוכר תליון. ניתוח של הפחמימות וקבוצות פונקציונליות אמין ראשוני תוכן של glycopolymers הרפסודה גילה כי היחס של מונומרים בglycopolymers המוצר עולה בקנה אחד עם יחס stoichiometric של החל מונומרים מועסקים בתגובה בתיווך הרפסודה פילמור (טבלת 1). זה מסמל שליטה הדוקה של Compositio מונומרNS בglycopolymers המסונתזת, כפי שתוכנן.
תגובה של קבוצות פונקציונליות האמינים ראשוני עם fluorophores מופעלת היא טכניקה בשימוש נרחב בתיוג חלבון. טכניקה זו הועסקה כאן כדי לתייג glycopolymers המטוהר עם carboxyfluorescein. בעקבות הודעה שינוי-, פולימרים ניאון התקבלו (איור 6). אין השפלה של הפולימרים שכותרתו והעמסת בתגובה זוהתה על ידי ניתוח GPC (מידע לא מוצג).
כריכת בדיקות של glycopolymers הסינתטי עם חרוזים agarose מצופה קטינים
כדי להעריך את הספציפיות מחייבים קטינים של glycopolymers המסונתזת, חרוזים agarose קטינים מצופה עם סגוליות מחייבות פחמימות ידועות היה בשימוש קטינים. Erythrina Crista-גאלי (ECL), שהועסקו בניסויים, יש סגוליות מחייב כלפי β-D-galactoside. איור 7 א ממחיש באופן ברור כי PMA-LAEMA-פלורידהuorescein, המכיל β-D galactoside-כפחמימות תליון, הציג חזק מחייב עם קטיני ECL. לעומת זאת, השלילי מחייב ECL של PMA-GAEMA-העמסת glycopolymer, שאינו בעלי סוכר תליון, מוצג באיור 7. תוצאה זו מדגימה את היעילות וזיקה המחייבות של glycopolymer הניאון המסונתזת.

איור 1. מוקצה 1 H- (א) ו- 13 C-NMR (ב) ספקטרום (D 2 O) לLAEMA. (נתון זה שונה מואנג et al. 14) אנא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של זה דמות.

איור 2. איור סכמטי של הסינתזה של glycopolymer ניאון PMA-LAEMA מכיל β-galactoside כסוכר התליון. אנא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של דמות זו.

איור 3. מוקצה H- () ו -13 C-NMR ספקטרום (ב) (ד 2 O) לglycopolymer PMA-LAEMA. 1 (נתון זה שונה מואנג et al. 14) טיעוןse לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של דמות זו.

איור 4. מוקצה 1 H- () ו -13 C-NMR ספקטרום (ב) (ד 2 O) לPMA-GAEMA. (נתון זה שונה מואנג et al. 14) אנא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של נתון זה.

5. עקבות כרומטוגרפיה חלחול ג'ל איור של PMA-GAEMA וPMA-LAEMA מבוססי רפסודה מוכנה עם וללא שימוש בסוכן רפסודה. בניגוד לPMA-LAEMA הוכן ללא רפסודת סוכן (כחול), RAFT- PMA-LAEMA מבוסס (ירוקה) יש dispersity נמוך בהרבה (M w / n M). מבוסס רפסודת PMA-GAEMA (אדום) וPMA-LAEMA יש פרופילי GPC דומים, אבל יש לי לשעבר n M קטן יותר בשל העדר סוכרים תליון. אנא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של דמות זו.

איור 6. PMA-LAEMA לפני ואחרי פוסט-שינוי עם fluorophore. (א) בהשוואה לglycopolymer הלבן שכותרתו אינו (צינור שמאלי), שכותרתו והעמסת PMA-LAEMA תערוכות צבע חזק צהוב (צינור מימין). (ב) תחת UV, PMA-LAEMA שאינו מסומן (צינור שמאלי, 1 מ"ג / מיליליטר PBS) הוא כהה ומציג ללא הקרינה, ואילו PMA-LAEMA כותרת והעמסת (צינור תקין, 1 מ"ג / מיליליטר PBS) מופעים הקרינה ירוקה חזקה.: "Target =" _ //www.jove.com/files/ftp_upload/52922/52922fig4large.jpg blank "> לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של דמות זו.

איור 7. קטיני Crista-גאלי Erythrina חרוזים agarose (ECL) -coated לאגד β-D-galactoside מכיל glycopolymers, ולא אלה לא בעל סוכר תליון. () PMA-LAEMA-והעמסת (3 מיקרוגרם) הפגינה חזקה מחייבת עם ECL , ואילו ב( ב) PMA-GAEMA-והעמסת, אשר ברשותה שום שאריות התליון β-D-galactoside, לא הראה שום מחייב עם חרוזים מצופים קטינים. בר סולם = 100 מיקרומטר.
טבלת 1. ערכי מיקוד של פרמטרים סינטטיים ויצירות בפועל של glycopolymers.) מיקוד ערכים, ערכים שהם רצויים של המוצרים; ב) DP, תואר של פילמור; ג) NA, אינו זמין. אנא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של דמות זו.
| DP ב | Dispersity | תוכן ממשי של glycomonomers % Mol | תוכן ממשי של אמין ראשוני % Mol | |
| מיקוד ערכים | 100 | <1.3 | 20 | 3 |
| PMA-LAEMA | 99 | 1.26 | 19 | 3.2 |
| PMA-GAEMA | 89 | 1.32 | NA ג | 2.7 |
פרוטוקול קליל ויעיל לglycopolymers מבוסס רפסודה תלת-רכיב ניאון, עם ובלי פחמימות תליון, והשימוש בם במבחן מחייב קטינים, באו לידי הביטוי בדוח זה. הפרוטוקול מתחיל עם הכנת LAEMA glycomonomers וGAEMA. דרך copolymerization שליטת רפסודת צעד אחד, glycopolymers עם תשואה לשחזור, הרכב מונומר צפוי וdispersity הנמוך, מתקבל. בעקבות פוסט-שינוי של glycopolymers עם succinimidyl אסתר carboxyfluorescein, המחייב של glycopolymer שכותרתו הניאון המתאים וכתוצאה מכך הוא קושי הניתן לבדיקה לסגולית מחייב קטיניה.
בשלבים הראשוניים של preparative glycomonomers שיועסקו בסינתזות glycopolymer לאחר מכן, חומצת lactobionic זמינה וgluconolactone נוצלו. בתאוריה, כל פחמימות של עניין, מmonosaccharides לאוליגוסכרידים המורכבים, יכולות להיות converteד לglycomonomers ידי conjugating סוכר היעד על קבוצת הידרוקסיל העיקרית על C6 של גלוקוז. בעקבות חמצון של שאריות גלוקוז צמצום, וההתייבשות הבאה שלה ללקטון, המוצר יכול להיות בקלות אז הגיב באמין הראשוני על AEMA כדי ליצור את glycomonomer המקביל. דוגמאות נוספות של מסלול זה ניתן לראות בדו"ח האחרון 14. יש לציין כי לפני ביצוע כל צעד פילמור, MEHQ, מעכב פילמור חזק, יש להסיר מכל הכנות מונומר וglycomonomer רק לפני השימוש. המטרה זו מושגת בקלות על ידי שימוש בכמות המינימלית של מתנול לפזר glycomonomer שבעל MEHQ לאחר מכן לטפל באופן מיידי את זה עם אצטון ב -20 ° C כדי לזרז את המוצר ללא מעכב בתשואה גבוהה.
חיוני בכל תכנית פילמור רדיקלית, תשומת לב לפרטים וpurities מונומר הם הדגישו. כאופייני למערכת פילמור רפסודה, זה מורכב ממקור קיצוני, מגיב רפסודה, מונומר וממס. במצגת דמיין זו, מערכת פילמור הרפסודה בשלב יחיד מתוארת המתמקדת בייצור של קופולימרים סטטיסטיים שנוצרו מתערובת תגובה בעל שלושה מונומרים שונים בתמיסה מימית. שתי תגובות בתיווך רפסודה נפרדות מוצגות בי אחד מנצלת glycomonomer שבעל תליון, שאינה תחנה סופית הפחתת פחמימות (כלומר, β-D-גלקטוז), והשני, בעל polyol עם שאריות לא פחמימות קשורות. משותף לשתי תגובות בתיווך הרפסודה היו מונומרים בעל קבוצת הידרוקסיל ייחודי המשמשת כמולקולת spacer, ועוד בעלי אמין בחינם לפוסט-שינוי עם fluorophore אמינו-reactive.
מאז הנוכחות של חמצן בתערובת התגובה והסביבה פוגעת בפילמור תיווך רפסודה, הסרתה כדי לעקוב אחר הרמות מושגת בקלות באמצעות כמה הקפאה-אווהמחזורים אחר כך לידיד-הפשרה תוך שמירה על כלי תגובת צינור Schlenk תחת ואקום גבוה.
יש לציין כי היחס טוחנת של מונומרים שונים בתגובה יכול להיות מותאם לפי צורך. כמו כן, על ידי שינוי כמות סוכן הרפסודה משמשת, אורכו של הפולימרים וכתוצאה מכך יכול להיות נשלט על 18. עם זאת, היחס טוחנת סוכן הרפסודה ליוזם תמיד צריך להיות גדול יותר משני להבטיח dispersity הנמוך של המוצר. בתנאים אלה, את האבולוציה של copolymerization היא יציבה, והשחזור של התגובה הוא גבוה מאוד. עם זאת, אין זה סביר שמתקבל התפלגות אחידה לחלוטין של כל מונומרים המשתתפים בקופולימר סטטיסטי, בשל מהירויות פילמור השונות שלהם. אפיון ההפצה של מונומרים שונים בתוך הפולימר הוא עדיין מאוד מאתגר.
שיטת פוסט-השינוי, שהוצג כאן, היא שני amenabl הפשוט ויותרדואר לשימוש במגוון רחב יותר של תוויות ניאון, בהשוואה לפרוטוקולים אחרים להחיל glycopolymers תווית 2,11. אלה יכללו רבים של fluorophores האמין-reactive מסיס במים, נקודות קוונטיות, biotins, ואחרים. הם ספציפיות המחייבות של glycopolymers המסונתזת, שכותרתו לאימות בקלות באמצעות קטינים עם זיקות מחייבות ידועות. PMA-GAEMA בעל ללא סוכר תליון הוא שליטה שלילית מתאימה. Glycopolymers עם תוויות ניאון שונות שהוכנו באמצעות מסלול זה שימש בהצלחה בחקירות של קטינים בתיווך חיידקים מחייבים 14. כפי שהוצג, הכנה קלילה ויעילה זו של glycopolymers ניאון הסטטיסטי אמורה לספק פוטנציאל גדול למגוון רחב של מחקר glycobiological.
למחברים אין מה לחשוף.
עבודה זו נתמכה על ידי המעבדות הכימיות של תחנת הניסויים של אוניברסיטת מיזורי, ועל ידי איגוד סיסטיק פיברוזיס של מיזורי.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| <חזק>ריאגנט | |||
| חומצה לקטוביונית | סיגמא-אולדריץ | 153516-D-גלוקונולקטון | |
| סיגמא-אולדריץ' | G2164 | ||
| N-(2-הידרוקסיאתיל) אקרילאמיד (HEAA) | סיגמא-אולדריץ' | 697931 | |
| תפוז II מלח נתרן | סיגמא-אולדריץ' | O8126 | |
| הידרוקינון מונומתיל אתר (MEHQ) | סיגמא-אולדריץ' | 54050 | מעכב פילמור |
| N-(2-אמינואתיל) מתקרילאמיד הידרוכלוריד (AEMA) | Polysciences, Inc | 24833-5 | |
| Triethylamine | Fisher Scientific | BP-616 | |
| שרף חילופי אניונים IRN-78 בצורת הידרוקסיד, 80 רשת | Sigma-Aldrich | 10343-U | |
| שרף חילופי קטיון 50Wx8, 200 רשת | Sigma-Aldrich | 217514 | |
| תחמוצת אלומיניום, ~150 רשת | סיגמא-אולדריץ' | A1522 | סוג WN-6, ניטרלי, דרגת פעילות סופר I |
| נינהידרין | סיגמא-אולדריץ' | N4876 | תמיסת אתנול של 0.2% נינהידרין שימשה בבדיקה |
| 4-ציאנו-4-(פנילקרבונוטיואילתיו)חומצה פנטנואית | סיגמא-אולדריץ' | 722995 | סוכן רפסודיה |
| 4,4&פריים;-אזוביס (4-חומצה ציאנובלרית) | סיגמא-אולדריץ' | 11588 | יוזם פילמור |
| קרבוקסיפלואורסצאין סוקסינימידיל אסטר | Life Technologies | C1157 | |
| Erythrina Cristagalli לקטין מצופה חרוז אגרוז | מעבדות וקטור | AL-1143 | |
| Solvent | |||
| strong>dH2O | מיוצר על ידי מערכת טיהור המים Barnstead, 18 megOhm-cm | ||
| Isopropanol | Fisher Scientific | A461-4 | ACS דרגה או טובה יותר |
| מתנול | Fisher Scientific | A454-4 | ACS דרגה או טוב יותר |
| אתנול מוחלט | Fisher Scientific | BP2818-100 | ACS דרגה או טובה יותר |
| Dimethylformamide | Sigma-Aldrich | 22705 | ACS דרגה או טובה יותר |
| אצטון | פישר סיינטיפיק | A929-4 | ACS דרגה או טוב יותר |
| <חזק>ציוד | |||
| ממברנת דיאליזה (MWCO: 3,500) | Spectrum Labs | 132720 | |
| פוליאתילן גליקול תקן אנליטי | סטנדרטי Sigma-Aldrich | O2393 | |
| שלנק, 1 מ"ל | קווארק | מותאם אישית | |
| TSK-GEL G4000 PWxl | טוסו ביוסיינס | 8022 | משמש לניתוח GPC של הגליקופולימרים |
| Empower 3 עם חבילת GPC/SEC | HPLC של Waters Corporation | ||
| תאגיד | מצויד בגלאי מקדם שבירה (ווטרס 2414) וגלאי פלואורסצנטי (ווטרס 2475) | ||
| Avance III ספקטרומטר NMR 800 מגה-הרץ | מיקרוסקופ | ||
| BX43 | Olympus Corporation | משמש עם מסנן FITC במבחן קשירת הגליקופולימר | |
| Rotavap / Rotoevaporator | Heidolph | ||
| Fritted משפך דיסק | פישר סיינטיפיק | 10-310-109 | |
| Lyophilizer | Labconco | ||
| שקופית מיקרוסקופ אימונופלואורסצנטי | Polysciences | 18357-1 | |
| Revco Ultima Plus -80 ° C מקפיא | מפלסטיק תרמו סיינטיפיק | ||
| ומשאבת יד | משאבת | ||
| , כונן ישיר, מקסימה C פלוס | פישר מד | ||
| סרג'נט-וולש | |||
בקש הרשאה לשימוש חוזר בטקסט או באיורים של מאמר JoVE זה
בקש הרשאה