פרוטוקול זה מתאר שיטת הכלאה מהירה ופשוטה באתרה אידיאלית למוח עם קידומת פרה-פורמלדהיד, ובכך מפחית את הצורך בשלבים מורכבים ממושכים תוך שימוש ברקמות קפואות טריות. השיטה מאומתת באמצעות זיהוי גן הקולטן סרוטונין 5-HT2A htr2a בחולדות.
מאמר שיטה
פרוטוקול זה מתאר שיטת הכלאה מהירה ופשוטה באתרה אידיאלית למוח עם קידומת פרה-פורמלדהיד, ובכך מפחית את הצורך בשלבים מורכבים ממושכים תוך שימוש ברקמות קפואות טריות. השיטה מאומתת באמצעות זיהוי גן הקולטן סרוטונין 5-HT2A htr2a בחולדות.
3,4-Methylenedioxymethamphetamine (MDMA; אקסטזי) עלולה לגרום לשינויים ספציפיים לאזור בביטוי mRNA סרוטונרגי עקב תסמונת סרוטונין חריפה (5-הידרוקסיטריפטמין; 5-HT). ניתן לבחון השערה זו באמצעות הכלאה באתרה כדי לזהות את גן הקולטן סרוטונין 5-HT2A htr2a. בעבר, הליכים כאלה, תוך שימוש בריבופרוב רדיואקטיבי, היו קשים בגלל זרימת העבודה המסובכת שדורשת מספר ימים לביצוע והקושי הנוסף שהטכניקה דרשה שימוש ברקמות קפואות טריות שנשמרו בסביבה נטולת RNase. לאחרונה, הפיתוח של בדיקות אוליגונוקלאוטידים קצרות פישט את הליכי ההכלאה באתרם ואיפשר שימוש בקטעי מוח עם קידומת פרפורמלדהיד, הזמינים יותר במעבדות. כאן, אנו מתארים פרוטוקול מפורט באמצעות בדיקות אוליגונוקלאוטידים לא רדיואקטיביות על רקמות המוח המקודמות. בדיקות הכלאה המשמשות למחקר זה כוללות dapB (גן חיידקי המקודד לדיהידרודיפיקולינט רדוקטאז), ppiB (גן משק בית המקודד לפפטידילפרוליל איזומראז B) ו-htr2a (גן סרוטונין המקודד לקולטני 5-HT2A). שיטה זו פשוטה יחסית, זולה, ניתנת לשחזור ודורשת פחות מיומיים להשלמתה.
תסמונת סרוטונין (5-הידרוקסיטריפטמין; 5-HT) היא הפרעה נוירולוגית חריפה הנגרמת על ידי תרופות מקדמות 5-HT כגון תרופות נוגדות דיכאון1, בעוד שהיא מתרחשת גם במצבים של שימוש ב-MDMA למטרות פנאי2. מנגנונים מולקולריים האחראים לשינויים במצב הרוח, ליקויי למידה וזיכרון המתרחשים בקשר לתסמונת החריפה אינם מובנים היטב3,4. הכלאה באתרה היא כלי מחקר רב עוצמה המאפשר זיהוי וכימות של mRNAs ספציפיים המתבטאים באופן פוטנציאלי ברמת תא בודד. הדרך הקונבנציונלית לבצע הכלאה באתרה היא להשתמש בריבופרוב בעל תווית רדיואקטיבית שעושה הכלאה ספציפית של הגן המעניין. עם זאת, החיסרון העיקרי הוא שהשיטה דורשת הכנת בדיקה ושלבי הכלאה מסובכים וגוזלי זמן, כמו גם גישה לרקמות קפואות טריות הנשמרות בסביבה נטולת RNase5,6.
בדיקות אוליגונוקלאוטידים פותחו לאחרונה כדי להכליא שברי RNA קצרים יותר מאלה הנדרשים לריבופרוב7. יתר על כן, הגשושיות מייצרות אות רקע נמוך מבלי להקריב את הספציפיות8. ניתן להשתמש בטכנולוגיית בדיקה חדשה זו שפותחה במקום הכלאה על רקמות מוח עם קידומת פרפורמלדהיד הזמינות בדרך כלל במעבדות אימונוציטוכימיות.
כאן, אנו מתארים פרוטוקול להכלאה באתרה באמצעות בדיקות אוליגונוקלאוטידים על מוח חולדה עם קידומת פרפורמלדהיד ומשווים את הממצאים לאלה שצוינו במוח קפוא טרי5,6. פרוטוקול זה משמש לבדיקת ההשערה כי שימוש לרעה בחומרים MDMA גורם לשינויים בגן הקולטן 5-HT2A htr2a mRNA במוח. התחלנו את ההליך בטיפול ב-MDMA ואחריו זלוף רקמות פרפורמלדהיד של החיה, הכלאה באתרה של בדיקת thr2a וניתוח נתונים. שימו לב ש-dapB (הגן החיידקי המקודד לדיהידרודיפיקולינט רדוקטאז) משמש כבקרה שלילית, ו-ppiB (קידוד גן משק בית לפפטידילפרוליל איזומראז B) כבקרה חיובית.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
נהלי שימוש בבעלי חיים מתוארים להלן אושרו על ידי הוועדה המוסדית הטיפול בבעלי חיים והשימוש (IACUC) באוניברסיטת רוס לרפואת וטרינרית ואוניברסיטת פלורידה אטלנטיק. למרות טכניקות וכפפות סטריליות נדרשות, הסביבה נטול RNase אין צורך בעת השימוש בפרוטוקול זה.
1. הכנה
2. הכלאה והגברה
3. גילוי אותות
לכידת 4. תמונה
ניתוח חלקיקים 5. תמונה
חישוב 6. גיליון אלקטרוני
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
שימוש בבדיקות RNA oligonucleotide (<25 NT), הכלאה יכולה להתגלות כנקודות אדומות בתאי ההיפותלמוס הוכנו מהמוח הקפוא-התחילית paraformaldehyde וטרי. מולקולות mRNA htr2a נמצאות בכמה תאים (המסומנים בחצים מוצקים), אך לא לאחרים (חיצים פתוחים). הבחנו כי אין הבדל בין-התחילית paraformaldehyde והרקמות קפואים (איור 1). הכלאה מוצלחת ניתן להעריך ראשון בעין בלתי מזוינת (איור 2). מצאנו שהאזור שנבחר (מסומן בעיגולים) הכלאה עם הבדיקה dapB לא הראה ...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
אחד החששות העיקריים של בדיקת הכלאה באתרה הוא בחירת טכניקות מתאימות המשמשות לשימור RNA בגלל אנזימי RNase. ידוע כי אנזימים אלה נמצאים באופן נרחב בתאים ובסביבה מה שיכול להשפיע על התוצאות. עם זאת, ניתן להבחין במהירות בפעילות האנזים על ידי הנחת הרקמה בתמיסת הקרח היבש/אלכוהול5,12. למרות ששימור מהיר הוא קריטי להכלאה באמצעות ריבופרוב13, מעט ידוע על תנאי ניסוי לבדיקות אוליגונוקלאוטיד. במחקר זה באמצעות בדיקות אוליגונוקלאוטיד, מצאנו כי אין הבדל בין המוח הקידומתי פרפורמלדהיד לבין המוח הטרי שנשמר במהירו...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
המחברים מצהירים שאין להם אינטרסים כלכליים מתחרים.
מחקר זה נתמך על ידי מענק NIH (R15DA029863), מענק אוניברסיטת פלורידה אטלנטיק מחקר לתואר ראשון (M30014) ואוניברסיטת רוס של מענק מחקר לרפואת הווטרינרית. ברצוננו להודות למכון הלאומי לשימוש בסמים (Rockville, MD) למתן (±) 3,4-methylenedioxymethamphetamine (± MDMA) עבור עבודה זו.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| בדיקת בקרה שלילית RNAscope-DapB | אבחון תאים מתקדם, INC | 310098 | |
| RNAscope Pretreat 4 | אבחון תאים מתקדם, ערכת | ||
| אבחון תאים מתקדם | אדום | 310036 | |
| אבחון תאים מתקדם | Rn-Ppib | 313921 | |
| Htr2a | חולדהאבחון תאים מתקדם, INC | 300031 | |
| Cryostat | Leica | CM 1850 | |
| שייקר אופקי | VWR | 88032-088 | |
| תנור היברידיזציה | תרמו פישר סיינטיפיק | 222000 | |
| שקופית מיקרוסקופ סופרפרוסט פלוס | פישר סיינטיפיק | 12-550-15 | |
| עט הידרופובי | וקטור | H-4000 | |
| מיקרוסקופ | אולימפוס | פרוביס AX70 |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
בקש הרשאה לשימוש חוזר בטקסט או באיורים של מאמר JoVE זה
בקש הרשאה