הרשמה ל-JoVE נדרשת לצפייה בתוכן זה. התחברו או התחילו בגרסת ניסיון בחינם.

מאמר שיטה

טיהור וקפל שוב לעמילואיד סיבים של (שלו)

14K צפיות

⸱

DOI:

10.3791/53432

⸱

19 בדצמבר 2015

 ,  ,  , 

במאמר זה

סיכום

שיטה כרומטוגרפית דו-שלבית מתוארת לטיהור חלבון Shadoo רקומביננטי המתבטא כגופי הכללה ב-Escherichia coli, כמו גם פרוטוקול לסיבית Shadoo מטוהר למבני עמילואיד.

תקציר

מערכת ביטוי coli Escherichia היא כלי רב עוצמה לייצור חלבונים רקומביננטיים האיקריוטים. אנחנו משתמשים בו כדי לייצר Shadoo, חלבון השייך למשפחת הפריון. שיטת chromatographic לטיהור 6 -tagged Shadoo רקומביננטי (שלו) הביעה כגופי הכללה מתואר. גופי הכללתם בsolubilized 8 M אוריאה ומחויב לטור Ni 2 + -charged לבצע כרומטוגרפיה זיקת יון. חלבוני Bound הם eluted על ידי שיפוע של imidazole. שברים המכילים חלבון Shadoo נתונים לכרומטוגרפיה הדרת הגודל להשיג חלבון נקי במיוחד. בShadoo הצעד מטוהר הסופי desalted להסיר מלחים, אוריאה וimidazole. חלבון Shadoo רקומביננטי הוא מגיב חשוב למחקרים ביו-פיסיקליים וביוכימיים של הפרעות קונפורמציה חלבון המתרחשות במחלות הפריון. דיווחים רבים הראו כי מחלות ניווניות הפריון מקורן בתצהיר של דקירהle, הורה סיבי עמילואיד. פרוטוקולי מדגם מתארים כיצד לרעוד Shadoo לסיבי עמילואיד בחומץ וניטראלי / PHS הבסיסי מוצגים. השיטות על איך לייצר ולרעוד Shadoo יכול להקל על מחקר במעבדות עובדות על מחלות הפריון, שכן הוא מאפשר לייצור כמויות הגדולות של חלבון באופן מהיר ועלות נמוך.

מבוא

מחלות ניווניות הפריון, הכוללות אנצפלופתיה שור ספגת בבקר, כבשים ומרוסקים במחלת קרויצפלד-יעקב בבני אדם, הן קטלניות וחשוכות מרפא. מחלות הפריון מתאפיינות בשינויי קונפורמציה חלבון הפריון הסלולרי של בעיקר מורכבים מα-סלילים, ל- β גיליון הצלב מועשר עמילואיד קונפורמיסט 1,2. צלב-β-מבנים מכילים צפופים וβ גליונות כמו גבישים-הורה מאוד התייצבו עם קשרי מימן 3,4. amyloids הפריון יכול לשכפל את עצמו בשל β-הגדילים בקצה הגובר המספקים תבנית לגיוס והמרת יחידת חלבון monomeric.

על פי "חלבון רק" ההשערה, קונפורמיסט עמילואיד חלבון הפריון שלו הגורם המדבק הבלעדי. עם ....

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

פרוטוקול

1. דור של ביטוי פלסמיד וShadoo

הערה: חלבון Shadoo עכברי גן המקודד (Shadoo 25-122), היה subcloned לתוך וקטור ביטוי PET-28 11. שיבוט זה הפך לE. coli SoluBL21 זן חיידקים, להביע חלבון Shadoo עם תג N-מסוף hexahistidine, (HHHHHHHHHHSSGHIDDDDKHMKGGRGGARGSARGVRGGARGASRVRVRP APRYGSSLRVAAAGAAAGAAAGVAAGLATGSGWRRTSGPGELGLEDDENGAMGGNGTDRGVYSYWAWTSG) כפי שהוסבר בעבר 11. פלסמיד ניתן לבקש מהמחברים. המשקל המולקולרי של Shadoo מחושב מרצף חומצות אמינו שלה הוא 12,243.2 Da.

....

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

תוצאות

על 5-10 מ"ג חלבון Shadoo מטוהר של מתקבל לליטר תרבות חיידקים. יש צורך בטיהור שני שלבים כדי להשיג Shadoo רקומביננטי של טוהר גבוה. הצעד הראשון מתבצע על ידי כרומטוגרפיה זיקה עם טור -charged Ni 2 + ששומרת עליו-מתוייגים חלבונים. שברי eluted נתונים לSDS-PAGE ומוכתם בכחול מבריק Coomassie (איור 5 א). שברים המכילים חלבון Shadoo הם אספו ומטוהרים יותר על ידי כרומטוגרפיה גודל הדרה שמפרידה חלבונים על פי גודלם (משקל מולקולרי Shadoo הוא כ -12 KDA). שברים שנאספו על.......

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

דיון

פרוטוקול קל ויעיל לשני ביטוי וטיהור של כמות גדולה של חלבון Shadoo עכבר רקומביננטי מוצג. השיטה המתוארת מאפשרת solubilization וטיהור (6) -tagged חלבון רקומביננטי Shadoo מוצלחים. חשוב, כפי שציינו בכותרת, שכאשר באו לידי ביטוי בחיידק E. פרוקריוטים coli Shadoo מצטבר בגופי הכללה. לפני טיהור Shadoo, חיידקים צריכים להיות lysed ידי sonication במאגר המכיל טריטון X-100. בהמשך לכך יכולים להיות solubilized גופי הכללה בפתרון denaturing 8 M אוריאה. יתר על כן, כל תהליך.......

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

גילויים

למחברים אין מה לחשוף.

תודות

המחברים מבקשים להודות לנטלי דוד ודיוויד ווסטרוויי (אוניברסיטת אלברטה) על שסיפקו לנו Sho cDNA, כריסטוף שבלייה (INRA) לבניית פלסמיד, מישל ברמונט (INRA) על שסיפקו לנו חיידקי BL21Sol; כריסטין לונגין (INRA) על סיוע TEM ואדית פג'וט-אוגי (INRA) על הערות והגהה.

....

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

חומרים

רשימת החומרים שנעשה בהם שימוש במאמר זה
שםחברהמספר קטלוגהערות
AKTA FPLC GE, אמרשם# 1363
HiLoad 16/60 SuperdexGE Healthcare17-1069-01
HiTrap IMACGE HealthcareGE17-0920-05
HiPrep26/10 עמודת התפלהGE HealthcareGE17-5087-01
SoluBL21 מוכשר E. coliGenlantisC700200
pET-28b+Novogen69865-3
IPTGSigma-AldrichI6758
LB-Broth בינוניSigma-AldrichL3022
Eppendorf BiophotometarEppendorf550507804
Trito X-100Life Technologies85111
NiSO4Sigma-Aldrich656895
EDTASigma-AldrichE6758
Tris-HClSigma-AldrichRES3098T
מעכב פרוטאז טבליות קוקטיילRoche4693116001
NaClSigma-Aldrich746398
ImidazolSigma-AldrichI5513
Gdn-HClSigma-AldrichG4505
סמן גודל חלבון תרמו פישר סיינטיפיק26620

מקורות

  1. Biasini, E., Turnbaugh, J. A., Unterberger, U., Harris, D. A. Prion protein at the crossroads of physiology and disease. Trends in Neurosciences. 35, 92-103 (2012).
  2. Colby, D. W., Prusiner, S. B. De novo generation of prion strains. Nature Reviews. Microbiology. 9, 771....

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

הדפסות חוזרות והרשאות

גלה מאמרים נוספים

כרומטוגרפיית זיקה לניקלכרומטוגרפיית הפרדה גודליתקיפול מחדש של חלבוןמחלות פריוןביטוי ב-E. coliSDS-PAGEבדיקת Thioflavin T